MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 2

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008538	AGTCAT	2	12	966	977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116662233
2	NC_008538	CGTCGA	2	12	1500	1511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662234
3	NC_008538	CGGTCA	2	12	3001	3012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662235
4	NC_008538	TTCGGC	2	12	5148	5159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662237
5	NC_008538	CCCGAC	2	12	9022	9033	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662240
6	NC_008538	CGGTGT	2	12	11454	11465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116662241
7	NC_008538	GGCCGG	2	12	11650	11661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116662241
8	NC_008538	TACCGG	2	12	13371	13382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662243
9	NC_008538	ATGATC	2	12	14003	14014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116662243
10	NC_008538	CAGCGT	2	12	16757	16768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662248
11	NC_008538	CGGTAC	2	12	19759	19770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662251
12	NC_008538	GATCCG	2	12	20099	20110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008538	GATCCG	2	12	23486	23497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662253
14	NC_008538	CGAGGG	2	12	24076	24087	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116662253
15	NC_008538	GACCAG	2	12	24794	24805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662253
16	NC_008538	GCACCG	2	12	26317	26328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008538	GACCCT	2	12	27079	27090	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662256
18	NC_008538	ACGCCG	2	12	27624	27635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662256
19	NC_008538	CCCGTC	2	12	27814	27825	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662257
20	NC_008538	GCCGGG	2	12	29245	29256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008538	ATCTTC	2	12	30062	30073	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116662259
22	NC_008538	TCCGCC	2	12	32161	32172	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662261
23	NC_008538	CGGCGC	2	12	33108	33119	0 %	0 %	50 %	50 %	116662261
24	NC_008538	CGCTGG	2	12	34956	34967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662263
25	NC_008538	GCTCCG	2	12	37012	37023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662265
26	NC_008538	GCCACG	2	12	38403	38414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662266
27	NC_008538	GCCACC	2	12	38526	38537	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662266
28	NC_008538	AGGCGA	2	12	38803	38814	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662266
29	NC_008538	GTTCAG	2	12	39382	39393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662267
30	NC_008538	CGGGTC	2	12	39406	39417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662267
31	NC_008538	CCCGTC	2	12	39580	39591	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662267
32	NC_008538	GCCCGG	2	12	40211	40222	0 %	0 %	50 %	50 %	116662267
33	NC_008538	GTCACC	2	12	44376	44387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662271
34	NC_008538	CGCGGG	2	12	47573	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116662275
35	NC_008538	AGCCTC	2	12	48293	48304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662275
36	NC_008538	TCACCA	2	12	48402	48413	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116662275
37	NC_008538	TTCCGT	2	12	52569	52580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116662280
38	NC_008538	GGCGCG	2	12	55194	55205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116662283
39	NC_008538	GTCCCG	2	12	59986	59997	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662287
40	NC_008538	CCAGGA	2	12	61421	61432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662287
41	NC_008538	GGGCCT	2	12	61733	61744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662287
42	NC_008538	GGACCT	2	12	65378	65389	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662290
43	NC_008538	CAGCTG	2	12	66271	66282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	304570605
44	NC_008538	GCAACG	2	12	69025	69036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662295
45	NC_008538	CCACAT	2	12	74042	74053	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116662299
46	NC_008538	CGGAAC	2	12	74233	74244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662299
47	NC_008538	GCTCAT	2	12	74843	74854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662299
48	NC_008538	GGCCGA	2	12	75706	75717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662300
49	NC_008538	CGAAAC	2	12	76740	76751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116662301
50	NC_008538	GGAGCG	2	12	76875	76886	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116662301
51	NC_008538	TCGCGC	2	12	82618	82629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662306
52	NC_008538	CTCATC	2	12	83154	83165	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116662306
53	NC_008538	ACCTCG	2	12	84203	84214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662308
54	NC_008538	CTCGTC	2	12	84310	84321	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116662308
55	NC_008538	CTACAA	2	12	86158	86169	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116662310
56	NC_008538	CATCGG	2	12	86401	86412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662310
57	NC_008538	ACCGAG	2	12	86723	86734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662310
58	NC_008538	GACGTC	2	12	88319	88330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008538	GCGTGC	2	12	89041	89052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662313
60	NC_008538	CTGCCG	2	12	92514	92525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662316
61	NC_008538	CCTCGC	2	12	92664	92675	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662317
62	NC_008538	GGCAAG	2	12	93815	93826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662318
63	NC_008538	CGGCTC	2	12	94327	94338	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662318
64	NC_008538	CAGCGG	2	12	94951	94962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662319
65	NC_008538	CCGCTG	2	12	99614	99625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662324
66	NC_008538	CATCGT	2	12	105642	105653	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662331
67	NC_008538	ACTGCT	2	12	107674	107685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116662333
68	NC_008538	CGACAG	2	12	110738	110749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662336
69	NC_008538	TGAGCT	2	12	115258	115269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.