MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 2

Total Repeats: 317

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008538	ATAG	2	8	50	57	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008538	ACCG	2	8	334	341	25 %	0 %	25 %	50 %	116662233
3	NC_008538	CGGG	2	8	418	425	0 %	0 %	75 %	25 %	116662233
4	NC_008538	GGGC	2	8	478	485	0 %	0 %	75 %	25 %	116662233
5	NC_008538	CGCT	2	8	926	933	0 %	25 %	25 %	50 %	116662233
6	NC_008538	TCAC	2	8	1128	1135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008538	CAGG	2	8	1228	1235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008538	CGGG	2	8	1441	1448	0 %	0 %	75 %	25 %	116662234
9	NC_008538	GGGT	2	8	1905	1912	0 %	25 %	75 %	0 %	116662234
10	NC_008538	TGCC	2	8	2531	2538	0 %	25 %	25 %	50 %	116662235
11	NC_008538	CATT	2	8	3073	3080	25 %	50 %	0 %	25 %	116662235
12	NC_008538	GGCG	2	8	3221	3228	0 %	0 %	75 %	25 %	116662235
13	NC_008538	TGCC	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	116662235
14	NC_008538	TGCT	2	8	3687	3694	0 %	50 %	25 %	25 %	116662235
15	NC_008538	GCGG	2	8	3846	3853	0 %	0 %	75 %	25 %	116662235
16	NC_008538	GCCG	2	8	5369	5376	0 %	0 %	50 %	50 %	116662237
17	NC_008538	CCTT	2	8	5461	5468	0 %	50 %	0 %	50 %	116662237
18	NC_008538	CACC	2	8	5553	5560	25 %	0 %	0 %	75 %	116662237
19	NC_008538	GTTT	2	8	6017	6024	0 %	75 %	25 %	0 %	116662237
20	NC_008538	ATCC	2	8	6555	6562	25 %	25 %	0 %	50 %	116662237
21	NC_008538	GCAG	2	8	6844	6851	25 %	0 %	50 %	25 %	116662238
22	NC_008538	TGCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	25 %	50 %	116662238
23	NC_008538	GAAG	2	8	7867	7874	50 %	0 %	50 %	0 %	116662238
24	NC_008538	CTGC	2	8	8356	8363	0 %	25 %	25 %	50 %	116662240
25	NC_008538	CGAT	2	8	9096	9103	25 %	25 %	25 %	25 %	116662240
26	NC_008538	CGGC	2	8	9114	9121	0 %	0 %	50 %	50 %	116662240
27	NC_008538	AGGC	2	8	9330	9337	25 %	0 %	50 %	25 %	116662240
28	NC_008538	GACA	2	8	9643	9650	50 %	0 %	25 %	25 %	116662240
29	NC_008538	TTGT	2	8	10115	10122	0 %	75 %	25 %	0 %	116662241
30	NC_008538	GGTC	2	8	10797	10804	0 %	25 %	50 %	25 %	116662241
31	NC_008538	ATGG	2	8	11390	11397	25 %	25 %	50 %	0 %	116662241
32	NC_008538	GCCA	2	8	12685	12692	25 %	0 %	25 %	50 %	116662242
33	NC_008538	CCGC	2	8	13310	13317	0 %	0 %	25 %	75 %	116662243
34	NC_008538	CTGC	2	8	13355	13362	0 %	25 %	25 %	50 %	116662243
35	NC_008538	AACC	2	8	13862	13869	50 %	0 %	0 %	50 %	116662243
36	NC_008538	GACA	2	8	14251	14258	50 %	0 %	25 %	25 %	116662243
37	NC_008538	CCTG	2	8	14471	14478	0 %	25 %	25 %	50 %	116662243
38	NC_008538	AGCC	2	8	14717	14724	25 %	0 %	25 %	50 %	116662244
39	NC_008538	CGGT	2	8	14876	14883	0 %	25 %	50 %	25 %	116662244
40	NC_008538	GTTT	2	8	14910	14917	0 %	75 %	25 %	0 %	116662244
41	NC_008538	GCTG	2	8	15042	15049	0 %	25 %	50 %	25 %	116662244
42	NC_008538	CGGC	2	8	15325	15332	0 %	0 %	50 %	50 %	116662245
43	NC_008538	CAGC	2	8	15825	15832	25 %	0 %	25 %	50 %	116662246
44	NC_008538	TCCC	2	8	15998	16005	0 %	25 %	0 %	75 %	116662246
45	NC_008538	GGAC	2	8	16325	16332	25 %	0 %	50 %	25 %	116662247
46	NC_008538	ACCG	2	8	16745	16752	25 %	0 %	25 %	50 %	116662248
47	NC_008538	AAGC	2	8	17892	17899	50 %	0 %	25 %	25 %	116662249
48	NC_008538	CGGA	2	8	18426	18433	25 %	0 %	50 %	25 %	116662250
49	NC_008538	TCCG	2	8	18634	18641	0 %	25 %	25 %	50 %	116662250
50	NC_008538	CGCC	2	8	18705	18712	0 %	0 %	25 %	75 %	116662250
51	NC_008538	ACCA	2	8	19361	19368	50 %	0 %	0 %	50 %	116662250
52	NC_008538	TGGC	2	8	19676	19683	0 %	25 %	50 %	25 %	116662250
53	NC_008538	ACGC	2	8	20201	20208	25 %	0 %	25 %	50 %	116662252
54	NC_008538	GGGT	2	8	20478	20485	0 %	25 %	75 %	0 %	116662252
55	NC_008538	GTGG	2	8	22062	22069	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008538	GGCC	2	8	22585	22592	0 %	0 %	50 %	50 %	116662253
57	NC_008538	GCCG	2	8	23101	23108	0 %	0 %	50 %	50 %	116662253
58	NC_008538	TCCG	2	8	23366	23373	0 %	25 %	25 %	50 %	116662253
59	NC_008538	GATC	2	8	23518	23525	25 %	25 %	25 %	25 %	116662253
60	NC_008538	CGTT	2	8	23643	23650	0 %	50 %	25 %	25 %	116662253
61	NC_008538	GTCG	2	8	23690	23697	0 %	25 %	50 %	25 %	116662253
62	NC_008538	ACGA	2	8	23907	23914	50 %	0 %	25 %	25 %	116662253
63	NC_008538	CGGG	2	8	24101	24108	0 %	0 %	75 %	25 %	116662253
64	NC_008538	GCCG	2	8	24310	24317	0 %	0 %	50 %	50 %	116662253
65	NC_008538	TCAT	2	8	24546	24553	25 %	50 %	0 %	25 %	116662253
66	NC_008538	CCTT	2	8	24760	24767	0 %	50 %	0 %	50 %	116662253
67	NC_008538	GCCA	2	8	24981	24988	25 %	0 %	25 %	50 %	116662253
68	NC_008538	GTTC	2	8	25497	25504	0 %	50 %	25 %	25 %	116662254
69	NC_008538	CGAT	2	8	25531	25538	25 %	25 %	25 %	25 %	116662254
70	NC_008538	GCCG	2	8	25790	25797	0 %	0 %	50 %	50 %	116662254
71	NC_008538	AACT	2	8	26169	26176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008538	CCCT	2	8	26345	26352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_008538	CCGG	2	8	26393	26400	0 %	0 %	50 %	50 %	116662255
74	NC_008538	GGAA	3	12	26426	26437	50 %	0 %	50 %	0 %	116662255
75	NC_008538	CCGG	2	8	26995	27002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008538	AAGA	2	8	27332	27339	75 %	0 %	25 %	0 %	116662256
77	NC_008538	GGCT	2	8	27416	27423	0 %	25 %	50 %	25 %	116662256
78	NC_008538	AGCC	2	8	27711	27718	25 %	0 %	25 %	50 %	116662256
79	NC_008538	CCAC	2	8	28003	28010	25 %	0 %	0 %	75 %	116662257
80	NC_008538	AGGA	2	8	28378	28385	50 %	0 %	50 %	0 %	116662257
81	NC_008538	CCGA	2	8	28467	28474	25 %	0 %	25 %	50 %	116662257
82	NC_008538	ACGG	2	8	28644	28651	25 %	0 %	50 %	25 %	116662257
83	NC_008538	CCAG	2	8	28664	28671	25 %	0 %	25 %	50 %	116662257
84	NC_008538	AACG	2	8	30181	30188	50 %	0 %	25 %	25 %	116662260
85	NC_008538	GTGC	2	8	30315	30322	0 %	25 %	50 %	25 %	116662260
86	NC_008538	CCGG	2	8	31406	31413	0 %	0 %	50 %	50 %	116662260
87	NC_008538	CCGG	2	8	31741	31748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008538	TTCA	2	8	31812	31819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008538	GACT	2	8	32130	32137	25 %	25 %	25 %	25 %	116662261
90	NC_008538	CCCT	2	8	32707	32714	0 %	25 %	0 %	75 %	116662261
91	NC_008538	TTGA	2	8	32809	32816	25 %	50 %	25 %	0 %	116662261
92	NC_008538	GAAC	2	8	33402	33409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008538	CCGG	2	8	33539	33546	0 %	0 %	50 %	50 %	116662262
94	NC_008538	CCGG	2	8	33637	33644	0 %	0 %	50 %	50 %	116662262
95	NC_008538	GTGG	2	8	34138	34145	0 %	25 %	75 %	0 %	116662263
96	NC_008538	TTCC	2	8	35054	35061	0 %	50 %	0 %	50 %	116662263
97	NC_008538	TCAA	2	8	35130	35137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008538	CCAG	2	8	35151	35158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008538	TGGG	2	8	35233	35240	0 %	25 %	75 %	0 %	116662264
100	NC_008538	GAAG	2	8	35976	35983	50 %	0 %	50 %	0 %	116662264
101	NC_008538	GCAG	2	8	36413	36420	25 %	0 %	50 %	25 %	116662264
102	NC_008538	CGTT	2	8	36824	36831	0 %	50 %	25 %	25 %	116662265
103	NC_008538	CCGG	2	8	36972	36979	0 %	0 %	50 %	50 %	116662265
104	NC_008538	GCCG	2	8	37457	37464	0 %	0 %	50 %	50 %	116662265
105	NC_008538	GCCG	2	8	38597	38604	0 %	0 %	50 %	50 %	116662266
106	NC_008538	GCCG	2	8	38651	38658	0 %	0 %	50 %	50 %	116662266
107	NC_008538	GTCG	2	8	38935	38942	0 %	25 %	50 %	25 %	116662267
108	NC_008538	GCCG	2	8	39277	39284	0 %	0 %	50 %	50 %	116662267
109	NC_008538	CCAG	2	8	39813	39820	25 %	0 %	25 %	50 %	116662267
110	NC_008538	GAGG	2	8	40015	40022	25 %	0 %	75 %	0 %	116662267
111	NC_008538	GTGG	2	8	40627	40634	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008538	GGGC	2	8	41023	41030	0 %	0 %	75 %	25 %	116662268
113	NC_008538	AAGG	2	8	41298	41305	50 %	0 %	50 %	0 %	116662268
114	NC_008538	GCCC	2	8	41732	41739	0 %	0 %	25 %	75 %	116662269
115	NC_008538	GCCG	2	8	42101	42108	0 %	0 %	50 %	50 %	116662269
116	NC_008538	CCCG	2	8	42907	42914	0 %	0 %	25 %	75 %	116662270
117	NC_008538	GCCT	2	8	43012	43019	0 %	25 %	25 %	50 %	116662270
118	NC_008538	CGGA	2	8	43045	43052	25 %	0 %	50 %	25 %	116662270
119	NC_008538	CGTT	2	8	43417	43424	0 %	50 %	25 %	25 %	116662271
120	NC_008538	GCAC	2	8	43581	43588	25 %	0 %	25 %	50 %	116662271
121	NC_008538	GACG	2	8	43731	43738	25 %	0 %	50 %	25 %	116662271
122	NC_008538	GGAT	2	8	44460	44467	25 %	25 %	50 %	0 %	116662271
123	NC_008538	GAAG	2	8	44483	44490	50 %	0 %	50 %	0 %	116662271
124	NC_008538	CGCC	2	8	44927	44934	0 %	0 %	25 %	75 %	116662271
125	NC_008538	AGGC	2	8	45279	45286	25 %	0 %	50 %	25 %	116662272
126	NC_008538	CTGG	2	8	45930	45937	0 %	25 %	50 %	25 %	116662273
127	NC_008538	ACCC	2	8	46413	46420	25 %	0 %	0 %	75 %	116662273
128	NC_008538	GGCC	2	8	46565	46572	0 %	0 %	50 %	50 %	116662274
129	NC_008538	GGCT	2	8	46679	46686	0 %	25 %	50 %	25 %	116662274
130	NC_008538	CACC	2	8	46942	46949	25 %	0 %	0 %	75 %	116662274
131	NC_008538	CTGG	2	8	46984	46991	0 %	25 %	50 %	25 %	116662274
132	NC_008538	TCGT	2	8	47384	47391	0 %	50 %	25 %	25 %	116662275
133	NC_008538	CTGC	2	8	47843	47850	0 %	25 %	25 %	50 %	116662275
134	NC_008538	GGCT	2	8	47948	47955	0 %	25 %	50 %	25 %	116662275
135	NC_008538	CCCG	2	8	48013	48020	0 %	0 %	25 %	75 %	116662275
136	NC_008538	ACTC	2	8	48433	48440	25 %	25 %	0 %	50 %	116662275
137	NC_008538	ATCC	2	8	48591	48598	25 %	25 %	0 %	50 %	116662276
138	NC_008538	CCCG	2	8	48879	48886	0 %	0 %	25 %	75 %	116662276
139	NC_008538	CAGG	2	8	49485	49492	25 %	0 %	50 %	25 %	116662277
140	NC_008538	CACC	2	8	50086	50093	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_008538	GCCG	2	8	50094	50101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008538	TGGG	2	8	50102	50109	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008538	GCAC	2	8	50470	50477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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284	NC_008538	CGGC	2	8	104324	104331	0 %	0 %	50 %	50 %	116662327
285	NC_008538	GGGC	2	8	104333	104340	0 %	0 %	75 %	25 %	116662327
286	NC_008538	GGGC	2	8	104462	104469	0 %	0 %	75 %	25 %	116662328
287	NC_008538	TCCC	2	8	104499	104506	0 %	25 %	0 %	75 %	116662328
288	NC_008538	GCTG	2	8	104539	104546	0 %	25 %	50 %	25 %	116662328
289	NC_008538	CGTG	2	8	104870	104877	0 %	25 %	50 %	25 %	116662328
290	NC_008538	CGAC	2	8	105422	105429	25 %	0 %	25 %	50 %	116662330
291	NC_008538	TGCT	2	8	105736	105743	0 %	50 %	25 %	25 %	116662331
292	NC_008538	GCTG	2	8	105987	105994	0 %	25 %	50 %	25 %	116662331
293	NC_008538	GCAG	2	8	106449	106456	25 %	0 %	50 %	25 %	116662331
294	NC_008538	CGTG	2	8	106457	106464	0 %	25 %	50 %	25 %	116662331
295	NC_008538	GGAG	2	8	107030	107037	25 %	0 %	75 %	0 %	116662332
296	NC_008538	CGAA	2	8	107050	107057	50 %	0 %	25 %	25 %	116662332
297	NC_008538	AGCA	2	8	107347	107354	50 %	0 %	25 %	25 %	116662332
298	NC_008538	CGCC	2	8	107887	107894	0 %	0 %	25 %	75 %	116662333
299	NC_008538	GCCC	2	8	108292	108299	0 %	0 %	25 %	75 %	116662333
300	NC_008538	TCCA	2	8	108458	108465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
301	NC_008538	GATG	2	8	108841	108848	25 %	25 %	50 %	0 %	116662334
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304	NC_008538	CAGC	2	8	109760	109767	25 %	0 %	25 %	50 %	116662335
305	NC_008538	CGAC	2	8	110039	110046	25 %	0 %	25 %	50 %	116662335
306	NC_008538	GACG	2	8	110247	110254	25 %	0 %	50 %	25 %	116662335
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310	NC_008538	CGAG	2	8	113253	113260	25 %	0 %	50 %	25 %	116662338
311	NC_008538	GCCC	2	8	113556	113563	0 %	0 %	25 %	75 %	116662338
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315	NC_008538	GGCC	2	8	114243	114250	0 %	0 %	50 %	50 %	116662339
316	NC_008538	TCGC	2	8	114579	114586	0 %	25 %	25 %	50 %	116662340
317	NC_008538	TCGG	2	8	114600	114607	0 %	25 %	50 %	25 %	116662340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.