MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008537	GCAGCT	2	12	918	929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662074
2	NC_008537	GGCACC	2	12	1477	1488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662074
3	NC_008537	GCCCGG	2	12	1567	1578	0 %	0 %	50 %	50 %	116662074
4	NC_008537	CGGCCG	2	12	5070	5081	0 %	0 %	50 %	50 %	116662077
5	NC_008537	GGTCGT	2	12	5990	6001	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116662078
6	NC_008537	CCCGAC	2	12	6227	6238	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662079
7	NC_008537	TGCCGT	2	12	14958	14969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662088
8	NC_008537	CGCGGT	2	12	20045	20056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662093
9	NC_008537	GCCAGC	2	12	26618	26629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662104
10	NC_008537	TGCGTT	2	12	29602	29613	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116662106
11	NC_008537	GATGGT	2	12	39452	39463	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116662115
12	NC_008537	GGTCAA	2	12	39548	39559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116662115
13	NC_008537	CTCGGG	2	12	39902	39913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662116
14	NC_008537	CATCGG	2	12	40636	40647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662116
15	NC_008537	CCCTGG	2	12	40701	40712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662116
16	NC_008537	CGGCGC	2	12	40909	40920	0 %	0 %	50 %	50 %	116662116
17	NC_008537	CCCGCC	3	18	41863	41880	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	116662117
18	NC_008537	GCCCAT	2	12	41884	41895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662117
19	NC_008537	CGTGCA	2	12	42678	42689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662117
20	NC_008537	GGGCGT	2	12	44425	44436	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	116662120
21	NC_008537	CTCGGC	2	12	44909	44920	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662120
22	NC_008537	CCCCGG	2	12	46587	46598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116662121
23	NC_008537	GTCCTG	3	18	47545	47562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662122
24	NC_008537	GGCCAT	2	12	48419	48430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662123
25	NC_008537	GCGGTG	2	12	50624	50635	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	116662126
26	NC_008537	CCGGTC	2	12	52052	52063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662126
27	NC_008537	CTGGGA	2	12	53213	53224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116662128
28	NC_008537	GACGCC	2	12	54813	54824	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662130
29	NC_008537	GCGGCC	2	12	55372	55383	0 %	0 %	50 %	50 %	116662131
30	NC_008537	GCCTGG	2	12	61140	61151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662136
31	NC_008537	GTCGTG	2	12	62377	62388	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116662137
32	NC_008537	GTTCCT	2	12	62732	62743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116662138
33	NC_008537	TGGCCG	2	12	65474	65485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662140
34	NC_008537	CGAGGA	2	12	66833	66844	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662142
35	NC_008537	CAGATA	2	12	67026	67037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116662142
36	NC_008537	CACGGC	2	12	67047	67058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662142
37	NC_008537	GCCGAT	2	12	70156	70167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662145
38	NC_008537	CTGGGC	2	12	71299	71310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662145
39	NC_008537	CGCCCG	2	12	74981	74992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116662149
40	NC_008537	GCCGGA	2	12	76026	76037	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662150
41	NC_008537	GATCCG	2	12	80182	80193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662154
42	NC_008537	CGAGGG	2	12	80772	80783	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116662154
43	NC_008537	GACCAG	2	12	81490	81501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662154
44	NC_008537	GACCCT	2	12	83775	83786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662157
45	NC_008537	ACGCCG	2	12	84320	84331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662157
46	NC_008537	CCCGTC	2	12	84510	84521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662158
47	NC_008537	ATCTTC	2	12	86758	86769	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116662160
48	NC_008537	TCCGCC	2	12	88857	88868	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662162
49	NC_008537	CGGCGC	2	12	89804	89815	0 %	0 %	50 %	50 %	116662162
50	NC_008537	CGCTGG	2	12	91652	91663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662164
51	NC_008537	GCTCCG	2	12	93708	93719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662166
52	NC_008537	GCCACG	2	12	95099	95110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116662167
53	NC_008537	GCCACC	2	12	95222	95233	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662167
54	NC_008537	AGGCGA	2	12	95499	95510	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116662167
55	NC_008537	GTTCAG	2	12	96078	96089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662168
56	NC_008537	CGGGTC	2	12	96102	96113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662168
57	NC_008537	CCCGTC	2	12	96276	96287	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116662168
58	NC_008537	GCCCGG	2	12	96907	96918	0 %	0 %	50 %	50 %	116662168
59	NC_008537	GTCACC	2	12	101072	101083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662172
60	NC_008537	CGCGGG	2	12	104269	104280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116662176
61	NC_008537	AGCCTC	2	12	104989	105000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116662176
62	NC_008537	TCACCA	2	12	105098	105109	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116662176
63	NC_008537	TTCCCC	2	12	107569	107580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116662177
64	NC_008537	TGCTGA	2	12	108864	108875	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116662179
65	NC_008537	TCCCGG	2	12	111393	111404	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662183
66	NC_008537	CATCGA	2	12	112154	112165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116662184
67	NC_008537	CTCACC	2	12	113311	113322	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	116662185
68	NC_008537	GCGGAC	2	12	114492	114503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662187
69	NC_008537	ATGCCG	2	12	114783	114794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662187
70	NC_008537	GCGGTC	2	12	118744	118755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662191
71	NC_008537	CGCTGC	2	12	119368	119379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662192
72	NC_008537	TTCCTG	2	12	119463	119474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116662192
73	NC_008537	GTCCTG	2	12	120966	120977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662193
74	NC_008537	CGTCGC	2	12	121568	121579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662193
75	NC_008537	AGCCAG	2	12	124727	124738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662196
76	NC_008537	GCCGCT	2	12	128286	128297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116662199
77	NC_008537	GACCCC	2	12	128724	128735	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116662199
78	NC_008537	CAGCGT	2	12	128874	128885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662199
79	NC_008537	GCTGGA	2	12	130095	130106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116662201
80	NC_008537	CGGCCG	2	12	130932	130943	0 %	0 %	50 %	50 %	116662203
81	NC_008537	CCAGGG	2	12	132198	132209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662203
82	NC_008537	TCAGGG	2	12	132892	132903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116662204
83	NC_008537	CAAAAG	2	12	133903	133914	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116662205
84	NC_008537	GCTACG	2	12	133952	133963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116662205
85	NC_008537	GCCGAA	2	12	135251	135262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662208
86	NC_008537	CTGAAT	2	12	140292	140303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116662213
87	NC_008537	GGTCGA	2	12	141664	141675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116662214
88	NC_008537	GTCAAA	2	12	144860	144871	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116662216
89	NC_008537	AACACG	2	12	146004	146015	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116662216
90	NC_008537	TCACCC	2	12	146269	146280	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	116662216
91	NC_008537	GGTGGA	2	12	146737	146748	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116662217
92	NC_008537	CGCGGC	2	12	149949	149960	0 %	0 %	50 %	50 %	116662221
93	NC_008537	AGGACC	2	12	150337	150348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116662221
94	NC_008537	GTGGCG	2	12	150739	150750	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	116662222
95	NC_008537	CCGGTG	2	12	150847	150858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662222
96	NC_008537	GGCCTT	2	12	151068	151079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116662222
97	NC_008537	GATGGC	2	12	151236	151247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116662222
98	NC_008537	GGCCAG	2	12	151706	151717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662223
99	NC_008537	CGTGGC	2	12	153508	153519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116662225
100	NC_008537	GGTGAG	2	12	153608	153619	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116662225
101	NC_008537	GGCAGC	2	12	155092	155103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116662226
102	NC_008537	TGACGA	2	12	155761	155772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116662227
103	NC_008537	TCAGCA	2	12	158400	158411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116662230

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.