MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008537	CCGG	2	8	5869	5876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008537	CGAA	2	8	6723	6730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008537	CTGT	2	8	6764	6771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008537	GGCC	2	8	13150	13157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008537	CCCG	2	8	13250	13257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008537	AAAC	2	8	22638	22645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008537	TTCA	2	8	22658	22665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008537	GGAT	2	8	25525	25532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008537	GCTC	2	8	27917	27924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008537	ACCG	2	8	28687	28694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008537	CGAA	2	8	36461	36468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008537	CGGC	2	8	36479	36486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008537	GCGG	2	8	36779	36786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008537	CCCT	2	8	43970	43977	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_008537	TCGC	2	8	45171	45178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008537	CGTC	2	8	45451	45458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008537	GGTT	2	8	45504	45511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008537	GCCG	2	8	45642	45649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008537	ACGG	2	8	46873	46880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008537	ATGA	2	8	47254	47261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008537	GCCG	2	8	47268	47275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008537	TCAG	2	8	47286	47293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008537	CCGC	2	8	47297	47304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_008537	CGGC	2	8	47870	47877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008537	GACG	2	8	47899	47906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008537	CAGA	2	8	47946	47953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008537	AGGC	2	8	48030	48037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008537	GCGG	2	8	48261	48268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008537	GGGC	2	8	48623	48630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008537	CGGG	2	8	49437	49444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008537	CGGG	2	8	52611	52618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008537	CCAT	2	8	54286	54293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008537	CGGA	2	8	57036	57043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008537	GCCC	2	8	59441	59448	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008537	AGCC	2	8	59672	59679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008537	GGCG	3	12	59925	59936	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008537	CAGG	2	8	60154	60161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008537	CGGC	2	8	62045	62052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008537	GTGC	2	8	62711	62718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008537	TCCT	2	8	64011	64018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008537	GGCC	2	8	75054	75061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008537	CGGG	2	8	75255	75262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008537	AACT	2	8	82865	82872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008537	CCCT	2	8	83041	83048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_008537	CCGG	2	8	83691	83698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008537	CCGG	2	8	88437	88444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008537	TTCA	2	8	88508	88515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008537	GAAC	2	8	90098	90105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008537	TCAA	2	8	91826	91833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008537	CCAG	2	8	91847	91854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008537	GTGG	2	8	97323	97330	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008537	ATCC	2	8	105287	105294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008537	CCCG	2	8	105575	105582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008537	CGTC	2	8	105711	105718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008537	GCGG	2	8	105719	105726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008537	GGCA	2	8	105894	105901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008537	CCCG	2	8	106022	106029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008537	GAAG	2	8	108337	108344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008537	CCGG	2	8	110955	110962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008537	GGTG	3	12	130902	130913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008537	GTAA	2	8	134470	134477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008537	CGGC	2	8	141839	141846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008537	ACGC	2	8	142337	142344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008537	GGTT	2	8	146350	146357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008537	TCGT	2	8	148395	148402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008537	CGGG	2	8	149707	149714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008537	CCGG	2	8	149724	149731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008537	GCAG	2	8	150566	150573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008537	TGGC	2	8	150641	150648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008537	CGCT	2	8	153963	153970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008537	CCGG	2	8	157452	157459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.