MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 26353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008533	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516053
2	NC_008533	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516053
3	NC_008533	GTA	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516053
4	NC_008533	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516053
5	NC_008533	GGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516053
6	NC_008533	TTA	2	6	490	495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516053
7	NC_008533	TTA	2	6	566	571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516053
8	NC_008533	GAT	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516053
9	NC_008533	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516053
10	NC_008533	GAG	2	6	787	792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516053
11	NC_008533	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516053
12	NC_008533	ATA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516053
13	NC_008533	AAT	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516053
14	NC_008533	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008533	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008533	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516939
17	NC_008533	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516939
18	NC_008533	CTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516939
19	NC_008533	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516939
20	NC_008533	GTA	2	6	1773	1778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516939
21	NC_008533	ATT	2	6	1953	1958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516939
22	NC_008533	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516939
23	NC_008533	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516939
24	NC_008533	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516939
25	NC_008533	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516939
26	NC_008533	GTT	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516939
27	NC_008533	GAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516939
28	NC_008533	CAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516939
29	NC_008533	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008533	TTG	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515850
31	NC_008533	TGT	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515850
32	NC_008533	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515850
33	NC_008533	ATT	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515850
34	NC_008533	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516338
35	NC_008533	GCA	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516338
36	NC_008533	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516338
37	NC_008533	TGA	3	9	3320	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516338
38	NC_008533	TTC	2	6	3505	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516338
39	NC_008533	AGA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516338
40	NC_008533	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516338
41	NC_008533	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516338
42	NC_008533	GAA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516338
43	NC_008533	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516338
44	NC_008533	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516338
45	NC_008533	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516338
46	NC_008533	AGC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516338
47	NC_008533	TAT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516338
48	NC_008533	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516338
49	NC_008533	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516338
50	NC_008533	TAA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008533	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515731
52	NC_008533	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515731
53	NC_008533	GAT	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515731
54	NC_008533	CAG	2	6	4511	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515731
55	NC_008533	TAT	2	6	4539	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515731
56	NC_008533	GTT	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515731
57	NC_008533	CAT	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515731
58	NC_008533	GAT	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515731
59	NC_008533	ACT	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515731
60	NC_008533	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
61	NC_008533	CTA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516151
62	NC_008533	AGA	2	6	4896	4901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
63	NC_008533	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
64	NC_008533	TGG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516151
65	NC_008533	GCA	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516151
66	NC_008533	GAA	2	6	5188	5193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
67	NC_008533	GAG	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516151
68	NC_008533	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
69	NC_008533	AGA	2	6	5529	5534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
70	NC_008533	TGA	2	6	5655	5660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
71	NC_008533	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
72	NC_008533	AGA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
73	NC_008533	AGA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
74	NC_008533	ATT	2	6	5953	5958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
75	NC_008533	GGA	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516151
76	NC_008533	CGT	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516151
77	NC_008533	ACA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516151
78	NC_008533	TGT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516151
79	NC_008533	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516151
80	NC_008533	TGA	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
81	NC_008533	TGA	4	12	6546	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
82	NC_008533	TGA	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
83	NC_008533	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
84	NC_008533	GTA	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
85	NC_008533	CGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516151
86	NC_008533	TGT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516151
87	NC_008533	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
88	NC_008533	TGA	2	6	6975	6980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
89	NC_008533	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516151
90	NC_008533	CCG	2	6	7126	7131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116516151
91	NC_008533	ACA	2	6	7238	7243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516151
92	NC_008533	ACT	3	9	7390	7398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516151
93	NC_008533	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
94	NC_008533	TTA	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
95	NC_008533	GTA	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516151
96	NC_008533	ATA	2	6	8030	8035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516151
97	NC_008533	ATT	2	6	8087	8092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
98	NC_008533	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516151
99	NC_008533	TTA	2	6	8224	8229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516151
100	NC_008533	TCT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008533	AAT	2	6	8300	8305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008533	TAA	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008533	CGT	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515542
104	NC_008533	TGC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515542
105	NC_008533	GCA	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515542
106	NC_008533	AGA	2	6	8574	8579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515542
107	NC_008533	AAT	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515979
108	NC_008533	CGT	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515979
109	NC_008533	TGA	2	6	8649	8654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515979
110	NC_008533	TAT	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515979
111	NC_008533	TGA	2	6	8812	8817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515979
112	NC_008533	TGC	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515979
113	NC_008533	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515979
114	NC_008533	TTA	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516840
115	NC_008533	GAA	2	6	9012	9017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516840
116	NC_008533	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516840
117	NC_008533	AAG	2	6	9049	9054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516840
118	NC_008533	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515953
119	NC_008533	TTG	2	6	9091	9096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515953
120	NC_008533	GTC	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515953
121	NC_008533	TTA	2	6	9168	9173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515953
122	NC_008533	TAG	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515953
123	NC_008533	ATC	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515953
124	NC_008533	CAA	2	6	9419	9424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515953
125	NC_008533	AAG	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515953
126	NC_008533	ATC	2	6	9492	9497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515953
127	NC_008533	GAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515953
128	NC_008533	ACT	2	6	9691	9696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515953
129	NC_008533	AAG	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515953
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131	NC_008533	ATA	2	6	9896	9901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515953
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261	NC_008533	CTA	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_008533	TGA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008533	TAA	2	6	20689	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_008533	GAA	2	6	20710	20715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008533	TTA	3	9	20857	20865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_008533	GAG	2	6	20913	20918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_008533	TCC	2	6	20942	20947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_008533	GAA	2	6	21122	21127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008533	TGA	2	6	21216	21221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_008533	ATT	2	6	21223	21228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_008533	GTG	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_008533	TTA	2	6	21406	21411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_008533	TTG	2	6	21471	21476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_008533	GAT	2	6	21524	21529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_008533	ATT	2	6	21693	21698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_008533	TAG	2	6	29657	29662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NC_008533	ATA	2	6	29699	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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