MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 2716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008533	AT	3	6	546	551	50 %	50 %	0 %	0 %	116516053
2	NC_008533	AG	3	6	1576	1581	50 %	0 %	50 %	0 %	116516939
3	NC_008533	AG	3	6	1988	1993	50 %	0 %	50 %	0 %	116516939
4	NC_008533	AT	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	116516338
5	NC_008533	AC	3	6	4300	4305	50 %	0 %	0 %	50 %	116515731
6	NC_008533	GA	3	6	5445	5450	50 %	0 %	50 %	0 %	116516151
7	NC_008533	AG	3	6	6195	6200	50 %	0 %	50 %	0 %	116516151
8	NC_008533	AT	3	6	6384	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	116516151
9	NC_008533	CT	3	6	9754	9759	0 %	50 %	0 %	50 %	116515953
10	NC_008533	GA	3	6	10786	10791	50 %	0 %	50 %	0 %	116516781
11	NC_008533	TA	3	6	11589	11594	50 %	50 %	0 %	0 %	116516781
12	NC_008533	CT	3	6	12980	12985	0 %	50 %	0 %	50 %	116515587
13	NC_008533	GA	3	6	14137	14142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008533	CT	3	6	14152	14157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008533	GA	3	6	15012	15017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008533	AT	3	6	15858	15863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008533	CT	3	6	15889	15894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008533	AC	3	6	16379	16384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008533	AC	3	6	16548	16553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008533	GA	3	6	16826	16831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008533	AG	3	6	17295	17300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008533	TC	3	6	17787	17792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008533	TG	3	6	18176	18181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008533	GA	3	6	18327	18332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008533	GA	3	6	18623	18628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008533	CT	3	6	18739	18744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008533	GA	3	6	18946	18951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008533	TA	3	6	19741	19746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008533	GA	3	6	19761	19766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008533	TC	3	6	20257	20262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008533	TA	3	6	21942	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008533	TG	3	6	23661	23666	0 %	50 %	50 %	0 %	116515772
33	NC_008533	GA	3	6	24169	24174	50 %	0 %	50 %	0 %	116516620
34	NC_008533	TG	3	6	24215	24220	0 %	50 %	50 %	0 %	116516620
35	NC_008533	TG	3	6	24695	24700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008533	GA	3	6	24900	24905	50 %	0 %	50 %	0 %	116515930
37	NC_008533	TA	3	6	25281	25286	50 %	50 %	0 %	0 %	116516859
38	NC_008533	GT	3	6	25886	25891	0 %	50 %	50 %	0 %	116516243
39	NC_008533	GA	3	6	26939	26944	50 %	0 %	50 %	0 %	116516243
40	NC_008533	AG	3	6	27427	27432	50 %	0 %	50 %	0 %	116515462
41	NC_008533	CT	3	6	27839	27844	0 %	50 %	0 %	50 %	116516295
42	NC_008533	TA	3	6	27976	27981	50 %	50 %	0 %	0 %	116516295
43	NC_008533	CT	3	6	28428	28433	0 %	50 %	0 %	50 %	116515789
44	NC_008533	AT	3	6	28615	28620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008533	GA	3	6	28752	28757	50 %	0 %	50 %	0 %	116516609
46	NC_008533	TG	3	6	29929	29934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008533	AG	3	6	34427	34432	50 %	0 %	50 %	0 %	116515315
48	NC_008533	AT	3	6	34600	34605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008533	AG	3	6	34811	34816	50 %	0 %	50 %	0 %	116516491
50	NC_008533	AC	3	6	34846	34851	50 %	0 %	0 %	50 %	116516491
51	NC_008533	AG	3	6	34854	34859	50 %	0 %	50 %	0 %	116516491
52	NC_008533	AG	3	6	34878	34883	50 %	0 %	50 %	0 %	116516491
53	NC_008533	GA	3	6	35517	35522	50 %	0 %	50 %	0 %	116516491
54	NC_008533	GC	3	6	35563	35568	0 %	0 %	50 %	50 %	116516491
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60	NC_008533	AG	3	6	38283	38288	50 %	0 %	50 %	0 %	116515915
61	NC_008533	AT	3	6	39081	39086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008533	GA	3	6	39171	39176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008533	TG	3	6	41413	41418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008533	TA	3	6	41779	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_008533	CT	3	6	43805	43810	0 %	50 %	0 %	50 %	116516510
68	NC_008533	CT	3	6	44700	44705	0 %	50 %	0 %	50 %	116515701
69	NC_008533	TC	3	6	46319	46324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008533	AG	3	6	46546	46551	50 %	0 %	50 %	0 %	116516503
71	NC_008533	AG	3	6	46559	46564	50 %	0 %	50 %	0 %	116516503
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87	NC_008533	CT	3	6	60061	60066	0 %	50 %	0 %	50 %	116516623
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89	NC_008533	GA	3	6	62715	62720	50 %	0 %	50 %	0 %	116517042
90	NC_008533	GT	3	6	62984	62989	0 %	50 %	50 %	0 %	116517042
91	NC_008533	TA	3	6	64506	64511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008533	AT	5	10	64634	64643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008533	AT	3	6	65070	65075	50 %	50 %	0 %	0 %	116515951
94	NC_008533	TG	3	6	65719	65724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_008533	TA	3	6	70483	70488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008533	GA	3	6	70633	70638	50 %	0 %	50 %	0 %	116515512
100	NC_008533	CT	3	6	71112	71117	0 %	50 %	0 %	50 %	116515512
101	NC_008533	GA	3	6	71806	71811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008533	CT	3	6	72214	72219	0 %	50 %	0 %	50 %	116517175
103	NC_008533	TA	3	6	73026	73031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_008533	TG	3	6	76875	76880	0 %	50 %	50 %	0 %	116516800
108	NC_008533	TC	3	6	76886	76891	0 %	50 %	0 %	50 %	116516800
109	NC_008533	CT	3	6	77449	77454	0 %	50 %	0 %	50 %	116516800
110	NC_008533	AG	4	8	78862	78869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_008533	GA	3	6	83829	83834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008533	AT	3	6	84562	84567	50 %	50 %	0 %	0 %	116515418
114	NC_008533	GA	3	6	85178	85183	50 %	0 %	50 %	0 %	116515418
115	NC_008533	CT	3	6	85559	85564	0 %	50 %	0 %	50 %	116515418
116	NC_008533	TG	3	6	85627	85632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008533	TC	3	6	86609	86614	0 %	50 %	0 %	50 %	116515746
118	NC_008533	TA	3	6	86982	86987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008533	GA	3	6	87830	87835	50 %	0 %	50 %	0 %	116515415
120	NC_008533	CA	3	6	88546	88551	50 %	0 %	0 %	50 %	116515415
121	NC_008533	CT	3	6	88855	88860	0 %	50 %	0 %	50 %	116516742
122	NC_008533	TC	3	6	89235	89240	0 %	50 %	0 %	50 %	116516742
123	NC_008533	TG	3	6	89715	89720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008533	AT	3	6	89777	89782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008533	AC	3	6	92090	92095	50 %	0 %	0 %	50 %	116517133
126	NC_008533	GA	3	6	93397	93402	50 %	0 %	50 %	0 %	116516138
127	NC_008533	CA	4	8	93904	93911	50 %	0 %	0 %	50 %	116516874
128	NC_008533	TG	4	8	94266	94273	0 %	50 %	50 %	0 %	116516874
129	NC_008533	CT	3	6	94463	94468	0 %	50 %	0 %	50 %	116516874
130	NC_008533	GA	3	6	94623	94628	50 %	0 %	50 %	0 %	116516874
131	NC_008533	GA	3	6	95410	95415	50 %	0 %	50 %	0 %	116515571
132	NC_008533	GT	3	6	95554	95559	0 %	50 %	50 %	0 %	116515571
133	NC_008533	CT	3	6	95766	95771	0 %	50 %	0 %	50 %	116516361
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135	NC_008533	CT	3	6	96470	96475	0 %	50 %	0 %	50 %	116515726
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137	NC_008533	TA	4	8	96760	96767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008533	AG	3	6	100987	100992	50 %	0 %	50 %	0 %	116517199
139	NC_008533	AT	3	6	101883	101888	50 %	50 %	0 %	0 %	116515790
140	NC_008533	GA	3	6	102715	102720	50 %	0 %	50 %	0 %	116516525
141	NC_008533	GA	4	8	103232	103239	50 %	0 %	50 %	0 %	116516124
142	NC_008533	TA	3	6	104935	104940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_008533	TC	3	6	107710	107715	0 %	50 %	0 %	50 %	116516985
146	NC_008533	AG	4	8	108015	108022	50 %	0 %	50 %	0 %	116516985
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