MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	AAAGG	2	10	1965	1974	60 %	0 %	40 %	0 %	116626974
2	NC_008532	CAAAT	2	10	2302	2311	60 %	20 %	0 %	20 %	116626974
3	NC_008532	TGATT	2	10	2588	2597	20 %	60 %	20 %	0 %	116626974
4	NC_008532	GAGAT	2	10	6975	6984	40 %	20 %	40 %	0 %	116626979
5	NC_008532	TTATG	2	10	8782	8791	20 %	60 %	20 %	0 %	116626979
6	NC_008532	TCAGA	2	10	10565	10574	40 %	20 %	20 %	20 %	116626981
7	NC_008532	CAGTA	2	10	14103	14112	40 %	20 %	20 %	20 %	116626986
8	NC_008532	GGTAA	2	10	14183	14192	40 %	20 %	40 %	0 %	116626986
9	NC_008532	CTAGT	2	10	26860	26869	20 %	40 %	20 %	20 %	116626991
10	NC_008532	CAATC	2	10	27196	27205	40 %	20 %	0 %	40 %	116626992
11	NC_008532	ATTCA	2	10	28285	28294	40 %	40 %	0 %	20 %	116626992
12	NC_008532	TGATT	2	10	29504	29513	20 %	60 %	20 %	0 %	116626993
13	NC_008532	TTTTG	2	10	31132	31141	0 %	80 %	20 %	0 %	116626994
14	NC_008532	ATGAA	2	10	32485	32494	60 %	20 %	20 %	0 %	116626995
15	NC_008532	GTAGA	2	10	33850	33859	40 %	20 %	40 %	0 %	116626997
16	NC_008532	AAATG	2	10	39962	39971	60 %	20 %	20 %	0 %	116627000
17	NC_008532	AAAAT	2	10	42137	42146	80 %	20 %	0 %	0 %	116627003
18	NC_008532	TCAAA	2	10	43391	43400	60 %	20 %	0 %	20 %	116627003
19	NC_008532	TTGAT	2	10	46361	46370	20 %	60 %	20 %	0 %	116627006
20	NC_008532	GAAGC	2	10	49319	49328	40 %	0 %	40 %	20 %	116627008
21	NC_008532	GCTTG	2	10	50937	50946	0 %	40 %	40 %	20 %	116627011
22	NC_008532	TAGCT	2	10	64159	64168	20 %	40 %	20 %	20 %	116627023
23	NC_008532	TTGAT	2	10	66232	66241	20 %	60 %	20 %	0 %	116627025
24	NC_008532	CAAAT	2	10	75244	75253	60 %	20 %	0 %	20 %	116627026
25	NC_008532	CGAAT	2	10	77582	77591	40 %	20 %	20 %	20 %	116627027
26	NC_008532	AGAAA	2	10	77637	77646	80 %	0 %	20 %	0 %	116627027
27	NC_008532	TCAAA	2	10	78517	78526	60 %	20 %	0 %	20 %	116627027
28	NC_008532	AAGAT	2	10	79819	79828	60 %	20 %	20 %	0 %	116627030
29	NC_008532	TCAGC	2	10	85974	85983	20 %	20 %	20 %	40 %	116627035
30	NC_008532	AAACC	2	10	90750	90759	60 %	0 %	0 %	40 %	116627037
31	NC_008532	GCTTC	2	10	98232	98241	0 %	40 %	20 %	40 %	116627043
32	NC_008532	AAGCC	2	10	98361	98370	40 %	0 %	20 %	40 %	116627043
33	NC_008532	CTGTT	2	10	98441	98450	0 %	60 %	20 %	20 %	116627043
34	NC_008532	AAATA	2	10	101413	101422	80 %	20 %	0 %	0 %	116627049
35	NC_008532	AAATG	2	10	102646	102655	60 %	20 %	20 %	0 %	116627051
36	NC_008532	AACAA	2	10	104409	104418	80 %	0 %	0 %	20 %	116627053
37	NC_008532	CACAC	2	10	104543	104552	40 %	0 %	0 %	60 %	116627053
38	NC_008532	GTAGT	2	10	106900	106909	20 %	40 %	40 %	0 %	116627056
39	NC_008532	GGTTG	2	10	107033	107042	0 %	40 %	60 %	0 %	116627056
40	NC_008532	GACGA	2	10	110136	110145	40 %	0 %	40 %	20 %	116627057
41	NC_008532	ATTAT	2	10	110532	110541	40 %	60 %	0 %	0 %	116627057
42	NC_008532	TTGAA	2	10	111773	111782	40 %	40 %	20 %	0 %	116627060
43	NC_008532	TTTAT	2	10	115001	115010	20 %	80 %	0 %	0 %	116627063
44	NC_008532	GTAAT	2	10	115015	115024	40 %	40 %	20 %	0 %	116627063
45	NC_008532	TCCTT	2	10	115297	115306	0 %	60 %	0 %	40 %	116627064
46	NC_008532	GATTC	2	10	117440	117449	20 %	40 %	20 %	20 %	116627065
47	NC_008532	CTGAA	2	10	119962	119971	40 %	20 %	20 %	20 %	116627067
48	NC_008532	TGATT	2	10	123709	123718	20 %	60 %	20 %	0 %	116627070
49	NC_008532	TTTGA	2	10	124939	124948	20 %	60 %	20 %	0 %	116627071
50	NC_008532	TCTGT	2	10	130716	130725	0 %	60 %	20 %	20 %	116627077
51	NC_008532	CGGTT	2	10	131691	131700	0 %	40 %	40 %	20 %	116627078
52	NC_008532	CAGTT	2	10	133836	133845	20 %	40 %	20 %	20 %	116627081
53	NC_008532	AAGGT	2	10	134058	134067	40 %	20 %	40 %	0 %	116627081
54	NC_008532	TTAGT	2	10	134307	134316	20 %	60 %	20 %	0 %	116627081
55	NC_008532	GTATC	2	10	136536	136545	20 %	40 %	20 %	20 %	116627083
56	NC_008532	AAAGG	2	10	138365	138374	60 %	0 %	40 %	0 %	116627084
57	NC_008532	GGATG	2	10	153277	153286	20 %	20 %	60 %	0 %	116627087
58	NC_008532	GGTTT	2	10	161449	161458	0 %	60 %	40 %	0 %	116627093
59	NC_008532	TTTGG	2	10	164729	164738	0 %	60 %	40 %	0 %	116627097
60	NC_008532	AAGGT	2	10	164755	164764	40 %	20 %	40 %	0 %	116627097
61	NC_008532	CTGGT	2	10	166336	166345	0 %	40 %	40 %	20 %	116627097
62	NC_008532	TGATT	2	10	167855	167864	20 %	60 %	20 %	0 %	116627099
63	NC_008532	GAGAT	2	10	168907	168916	40 %	20 %	40 %	0 %	116627099
64	NC_008532	ATTGA	2	10	169212	169221	40 %	40 %	20 %	0 %	116627099
65	NC_008532	AATGA	2	10	172281	172290	60 %	20 %	20 %	0 %	116627102
66	NC_008532	GGTTG	2	10	173968	173977	0 %	40 %	60 %	0 %	116627103
67	NC_008532	AAGTA	2	10	177051	177060	60 %	20 %	20 %	0 %	116627107
68	NC_008532	CGTAG	2	10	181365	181374	20 %	20 %	40 %	20 %	116627113
69	NC_008532	GTCTT	2	10	185433	185442	0 %	60 %	20 %	20 %	116627117
70	NC_008532	AAGTT	2	10	185784	185793	40 %	40 %	20 %	0 %	116627117
71	NC_008532	CTCAG	2	10	188579	188588	20 %	20 %	20 %	40 %	116627120
72	NC_008532	AGCTT	2	10	195423	195432	20 %	40 %	20 %	20 %	116627124
73	NC_008532	TCCAA	2	10	197831	197840	40 %	20 %	0 %	40 %	116627126
74	NC_008532	TTGGT	2	10	199994	200003	0 %	60 %	40 %	0 %	116627129
75	NC_008532	TTGCC	2	10	200425	200434	0 %	40 %	20 %	40 %	116627130
76	NC_008532	CAAGT	2	10	203065	203074	40 %	20 %	20 %	20 %	116627132
77	NC_008532	TTGGT	2	10	203290	203299	0 %	60 %	40 %	0 %	116627132
78	NC_008532	ATCGT	2	10	207148	207157	20 %	40 %	20 %	20 %	116627136
79	NC_008532	TGGCT	2	10	214510	214519	0 %	40 %	40 %	20 %	116627142
80	NC_008532	TTTCT	2	10	219157	219166	0 %	80 %	0 %	20 %	116627147
81	NC_008532	TGGTA	2	10	219310	219319	20 %	40 %	40 %	0 %	116627147
82	NC_008532	TTTCT	2	10	219352	219361	0 %	80 %	0 %	20 %	116627147
83	NC_008532	CAATC	2	10	219808	219817	40 %	20 %	0 %	40 %	116627148
84	NC_008532	AGTTC	2	10	224294	224303	20 %	40 %	20 %	20 %	116627153
85	NC_008532	TTTGG	2	10	225375	225384	0 %	60 %	40 %	0 %	116627155
86	NC_008532	ATGGG	2	10	227844	227853	20 %	20 %	60 %	0 %	116627157
87	NC_008532	CAACA	2	10	227990	227999	60 %	0 %	0 %	40 %	116627157
88	NC_008532	GCAAC	2	10	228272	228281	40 %	0 %	20 %	40 %	116627157
89	NC_008532	GCTTT	2	10	230342	230351	0 %	60 %	20 %	20 %	116627158
90	NC_008532	ATCAA	2	10	232382	232391	60 %	20 %	0 %	20 %	116627161
91	NC_008532	TGTCA	3	15	235025	235039	20 %	40 %	20 %	20 %	116627163
92	NC_008532	TGGTT	2	10	236129	236138	0 %	60 %	40 %	0 %	116627164
93	NC_008532	CCATG	2	10	236272	236281	20 %	20 %	20 %	40 %	116627164
94	NC_008532	AAATT	2	10	238939	238948	60 %	40 %	0 %	0 %	116627165
95	NC_008532	TGGAT	2	10	239755	239764	20 %	40 %	40 %	0 %	116627167
96	NC_008532	ATAAA	2	10	242010	242019	80 %	20 %	0 %	0 %	116627169
97	NC_008532	ATTGA	2	10	245071	245080	40 %	40 %	20 %	0 %	116627171
98	NC_008532	TTTGA	2	10	245344	245353	20 %	60 %	20 %	0 %	116627171
99	NC_008532	GAAGA	2	10	247225	247234	60 %	0 %	40 %	0 %	116627171
100	NC_008532	TCTTA	2	10	251126	251135	20 %	60 %	0 %	20 %	116627174
101	NC_008532	GCCAG	2	10	255784	255793	20 %	0 %	40 %	40 %	116627180
102	NC_008532	TTTGG	2	10	258266	258275	0 %	60 %	40 %	0 %	116627184
103	NC_008532	GATTT	2	10	259709	259718	20 %	60 %	20 %	0 %	116627185
104	NC_008532	TGTCC	2	10	261273	261282	0 %	40 %	20 %	40 %	116627188
105	NC_008532	GTGAT	2	10	262830	262839	20 %	40 %	40 %	0 %	116627190
106	NC_008532	TCCTT	2	10	263466	263475	0 %	60 %	0 %	40 %	116627191
107	NC_008532	ATGAA	2	10	272248	272257	60 %	20 %	20 %	0 %	116627202
108	NC_008532	GTTTA	2	10	277671	277680	20 %	60 %	20 %	0 %	116627203
109	NC_008532	TGGTA	2	10	277747	277756	20 %	40 %	40 %	0 %	116627203
110	NC_008532	TTCTT	2	10	285007	285016	0 %	80 %	0 %	20 %	116627213
111	NC_008532	GATGT	2	10	286846	286855	20 %	40 %	40 %	0 %	116627216
112	NC_008532	ATTTA	2	10	287592	287601	40 %	60 %	0 %	0 %	116627216
113	NC_008532	ATTTT	2	10	288822	288831	20 %	80 %	0 %	0 %	116627216
114	NC_008532	ATTCC	2	10	289243	289252	20 %	40 %	0 %	40 %	116627216
115	NC_008532	TTGAT	2	10	290887	290896	20 %	60 %	20 %	0 %	116627217
116	NC_008532	AAACT	2	10	291715	291724	60 %	20 %	0 %	20 %	116627218
117	NC_008532	CTTTT	2	10	292412	292421	0 %	80 %	0 %	20 %	116627218
118	NC_008532	TTGAT	2	10	292922	292931	20 %	60 %	20 %	0 %	116627219
119	NC_008532	TATCG	2	10	297665	297674	20 %	40 %	20 %	20 %	116627223
120	NC_008532	GTCTT	2	10	299021	299030	0 %	60 %	20 %	20 %	116627224
121	NC_008532	TTTGG	2	10	299838	299847	0 %	60 %	40 %	0 %	116627225
122	NC_008532	AATTC	2	10	300672	300681	40 %	40 %	0 %	20 %	116627226
123	NC_008532	GACTT	2	10	301670	301679	20 %	40 %	20 %	20 %	116627227
124	NC_008532	CAGGA	2	10	301809	301818	40 %	0 %	40 %	20 %	116627227
125	NC_008532	GTTTT	2	10	304152	304161	0 %	80 %	20 %	0 %	116627229
126	NC_008532	TCAAG	2	10	305048	305057	40 %	20 %	20 %	20 %	116627229
127	NC_008532	CATTC	2	10	308958	308967	20 %	40 %	0 %	40 %	116627232
128	NC_008532	CCAAG	2	10	313969	313978	40 %	0 %	20 %	40 %	116627236
129	NC_008532	AAAGG	2	10	314018	314027	60 %	0 %	40 %	0 %	116627236
130	NC_008532	CCAGA	2	10	314483	314492	40 %	0 %	20 %	40 %	116627237
131	NC_008532	AAGCT	2	10	314823	314832	40 %	20 %	20 %	20 %	116627237
132	NC_008532	GAGAC	2	10	314850	314859	40 %	0 %	40 %	20 %	116627237
133	NC_008532	AAGTT	2	10	321391	321400	40 %	40 %	20 %	0 %	116627246
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