MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 4790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	AGTA	2	8	449	456	50 %	25 %	25 %	0 %	116626973
2	NC_008532	GTTT	2	8	676	683	0 %	75 %	25 %	0 %	116626973
3	NC_008532	TGAA	2	8	879	886	50 %	25 %	25 %	0 %	116626973
4	NC_008532	TGCT	2	8	1404	1411	0 %	50 %	25 %	25 %	116626973
5	NC_008532	ATTA	2	8	1820	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	116626974
6	NC_008532	TGAA	2	8	2551	2558	50 %	25 %	25 %	0 %	116626974
7	NC_008532	ACTT	2	8	2613	2620	25 %	50 %	0 %	25 %	116626974
8	NC_008532	AATT	2	8	2728	2735	50 %	50 %	0 %	0 %	116626974
9	NC_008532	TATG	2	8	2860	2867	25 %	50 %	25 %	0 %	116626975
10	NC_008532	AAAT	3	12	4620	4631	75 %	25 %	0 %	0 %	116626977
11	NC_008532	TCGT	2	8	4937	4944	0 %	50 %	25 %	25 %	116626977
12	NC_008532	ATCT	2	8	6020	6027	25 %	50 %	0 %	25 %	116626978
13	NC_008532	TACT	2	8	6299	6306	25 %	50 %	0 %	25 %	116626978
14	NC_008532	GGAA	2	8	6816	6823	50 %	0 %	50 %	0 %	116626979
15	NC_008532	CAGC	2	8	7424	7431	25 %	0 %	25 %	50 %	116626979
16	NC_008532	CAAA	2	8	8077	8084	75 %	0 %	0 %	25 %	116626979
17	NC_008532	AAGC	2	8	8089	8096	50 %	0 %	25 %	25 %	116626979
18	NC_008532	TTGG	2	8	8294	8301	0 %	50 %	50 %	0 %	116626979
19	NC_008532	CCTT	2	8	9439	9446	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
20	NC_008532	TTGA	2	8	9542	9549	25 %	50 %	25 %	0 %	116626979
21	NC_008532	AAGA	2	8	9797	9804	75 %	0 %	25 %	0 %	116626979
22	NC_008532	TAAG	2	8	9895	9902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008532	GAAG	2	8	10525	10532	50 %	0 %	50 %	0 %	116626981
24	NC_008532	TCTA	2	8	10670	10677	25 %	50 %	0 %	25 %	116626981
25	NC_008532	TAGC	2	8	10954	10961	25 %	25 %	25 %	25 %	116626983
26	NC_008532	ATTA	2	8	11159	11166	50 %	50 %	0 %	0 %	116626983
27	NC_008532	GTCT	2	8	11566	11573	0 %	50 %	25 %	25 %	116626983
28	NC_008532	ACCT	2	8	12689	12696	25 %	25 %	0 %	50 %	116626984
29	NC_008532	TCAA	2	8	12912	12919	50 %	25 %	0 %	25 %	116626984
30	NC_008532	AAGC	2	8	13824	13831	50 %	0 %	25 %	25 %	116626985
31	NC_008532	TATG	2	8	13895	13902	25 %	50 %	25 %	0 %	116626985
32	NC_008532	CCTT	2	8	13966	13973	0 %	50 %	0 %	50 %	116626985
33	NC_008532	CCTT	2	8	14449	14456	0 %	50 %	0 %	50 %	116626986
34	NC_008532	GATG	2	8	14965	14972	25 %	25 %	50 %	0 %	116626986
35	NC_008532	AACC	2	8	15010	15017	50 %	0 %	0 %	50 %	116626986
36	NC_008532	AAGA	2	8	15314	15321	75 %	0 %	25 %	0 %	116626986
37	NC_008532	GTTT	2	8	16311	16318	0 %	75 %	25 %	0 %	116626987
38	NC_008532	GTTG	2	8	16431	16438	0 %	50 %	50 %	0 %	116626987
39	NC_008532	GTCC	2	8	16737	16744	0 %	25 %	25 %	50 %	116626987
40	NC_008532	TCTT	2	8	16762	16769	0 %	75 %	0 %	25 %	116626987
41	NC_008532	TTCT	2	8	17299	17306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008532	AACT	2	8	17397	17404	50 %	25 %	0 %	25 %	116626988
43	NC_008532	CAAC	2	8	17455	17462	50 %	0 %	0 %	50 %	116626988
44	NC_008532	GATT	2	8	17511	17518	25 %	50 %	25 %	0 %	116626988
45	NC_008532	TGAT	2	8	17589	17596	25 %	50 %	25 %	0 %	116626988
46	NC_008532	CCTA	2	8	17829	17836	25 %	25 %	0 %	50 %	116626988
47	NC_008532	GCTC	2	8	17956	17963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008532	TCTT	2	8	18569	18576	0 %	75 %	0 %	25 %	116626989
49	NC_008532	TCAC	2	8	18622	18629	25 %	25 %	0 %	50 %	116626989
50	NC_008532	AATT	2	8	18745	18752	50 %	50 %	0 %	0 %	116626989
51	NC_008532	CAGT	2	8	18766	18773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008532	ATTT	2	8	19344	19351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008532	GTGA	2	8	19554	19561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008532	AGCG	2	8	19725	19732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008532	TGGT	2	8	20390	20397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008532	AGCC	2	8	20606	20613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008532	GTAA	2	8	20881	20888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008532	ATAG	2	8	20895	20902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008532	GCGA	2	8	21209	21216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008532	ATTC	2	8	22074	22081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008532	CTAA	2	8	22428	22435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008532	CTGA	2	8	22701	22708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008532	TAGG	2	8	23083	23090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008532	GCGT	2	8	25067	25074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008532	GGTT	2	8	26254	26261	0 %	50 %	50 %	0 %	116626990
66	NC_008532	TGAT	2	8	26331	26338	25 %	50 %	25 %	0 %	116626990
67	NC_008532	TTGT	2	8	26614	26621	0 %	75 %	25 %	0 %	116626991
68	NC_008532	TAAA	2	8	26945	26952	75 %	25 %	0 %	0 %	116626991
69	NC_008532	ATTT	2	8	28549	28556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008532	CAAT	2	8	28873	28880	50 %	25 %	0 %	25 %	116626993
71	NC_008532	GTTG	2	8	28952	28959	0 %	50 %	50 %	0 %	116626993
72	NC_008532	TTGA	2	8	29280	29287	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
73	NC_008532	TGAT	2	8	29293	29300	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
74	NC_008532	TGAT	2	8	29473	29480	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
75	NC_008532	CAAT	2	8	30758	30765	50 %	25 %	0 %	25 %	116626994
76	NC_008532	CAAC	2	8	31212	31219	50 %	0 %	0 %	50 %	116626994
77	NC_008532	AACT	2	8	31317	31324	50 %	25 %	0 %	25 %	116626994
78	NC_008532	GAAA	2	8	33059	33066	75 %	0 %	25 %	0 %	116626996
79	NC_008532	AATG	2	8	33591	33598	50 %	25 %	25 %	0 %	116626996
80	NC_008532	GTTT	2	8	34313	34320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008532	TTCT	2	8	34669	34676	0 %	75 %	0 %	25 %	116626998
82	NC_008532	TTGA	2	8	34889	34896	25 %	50 %	25 %	0 %	116626998
83	NC_008532	TTTG	2	8	35288	35295	0 %	75 %	25 %	0 %	116626999
84	NC_008532	CTTT	2	8	35383	35390	0 %	75 %	0 %	25 %	116626999
85	NC_008532	TTCA	2	8	35730	35737	25 %	50 %	0 %	25 %	116626999
86	NC_008532	TACT	2	8	35795	35802	25 %	50 %	0 %	25 %	116626999
87	NC_008532	GCAA	2	8	35885	35892	50 %	0 %	25 %	25 %	116626999
88	NC_008532	GATT	2	8	37637	37644	25 %	50 %	25 %	0 %	116626999
89	NC_008532	TGAA	2	8	38173	38180	50 %	25 %	25 %	0 %	116626999
90	NC_008532	CCAA	2	8	38473	38480	50 %	0 %	0 %	50 %	116626999
91	NC_008532	CAAG	2	8	38731	38738	50 %	0 %	25 %	25 %	116626999
92	NC_008532	GAGT	2	8	38867	38874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008532	CCAA	2	8	40010	40017	50 %	0 %	0 %	50 %	116627000
94	NC_008532	ATTG	2	8	40247	40254	25 %	50 %	25 %	0 %	116627000
95	NC_008532	ACTT	2	8	40308	40315	25 %	50 %	0 %	25 %	116627000
96	NC_008532	TTGA	2	8	40329	40336	25 %	50 %	25 %	0 %	116627000
97	NC_008532	TGCT	2	8	40711	40718	0 %	50 %	25 %	25 %	116627001
98	NC_008532	GTAT	2	8	40936	40943	25 %	50 %	25 %	0 %	116627001
99	NC_008532	ACTC	2	8	41077	41084	25 %	25 %	0 %	50 %	116627001
100	NC_008532	GTTT	2	8	41753	41760	0 %	75 %	25 %	0 %	116627002
101	NC_008532	TGAA	2	8	42091	42098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008532	AGAA	2	8	42117	42124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008532	TTGG	2	8	42218	42225	0 %	50 %	50 %	0 %	116627003
104	NC_008532	AAAG	2	8	43294	43301	75 %	0 %	25 %	0 %	116627003
105	NC_008532	CCAA	2	8	43332	43339	50 %	0 %	0 %	50 %	116627003
106	NC_008532	TCCG	2	8	43468	43475	0 %	25 %	25 %	50 %	116627003
107	NC_008532	CTTT	2	8	43741	43748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008532	CAAC	2	8	43926	43933	50 %	0 %	0 %	50 %	116627004
109	NC_008532	GATT	2	8	43982	43989	25 %	50 %	25 %	0 %	116627004
110	NC_008532	TGAT	2	8	44060	44067	25 %	50 %	25 %	0 %	116627004
111	NC_008532	AATC	2	8	44475	44482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008532	TGGT	2	8	45295	45302	0 %	50 %	50 %	0 %	116627005
113	NC_008532	ACCT	2	8	45939	45946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008532	AGCA	2	8	46718	46725	50 %	0 %	25 %	25 %	116627006
115	NC_008532	GCGA	2	8	47523	47530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008532	AGTT	2	8	47710	47717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008532	CTAT	2	8	48387	48394	25 %	50 %	0 %	25 %	116627008
118	NC_008532	CAGA	2	8	48993	49000	50 %	0 %	25 %	25 %	116627008
119	NC_008532	AAAC	2	8	49576	49583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008532	CTAT	2	8	50510	50517	25 %	50 %	0 %	25 %	116627010
121	NC_008532	AATA	2	8	50710	50717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008532	AATA	2	8	50925	50932	75 %	25 %	0 %	0 %	116627011
123	NC_008532	ACAA	2	8	51190	51197	75 %	0 %	0 %	25 %	116627011
124	NC_008532	TTGA	2	8	51828	51835	25 %	50 %	25 %	0 %	116627011
125	NC_008532	TTGA	2	8	51954	51961	25 %	50 %	25 %	0 %	116627011
126	NC_008532	CTCA	2	8	52080	52087	25 %	25 %	0 %	50 %	116627011
127	NC_008532	AGGA	2	8	52284	52291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008532	ATGA	2	8	52380	52387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008532	TGTA	2	8	53305	53312	25 %	50 %	25 %	0 %	116627012
130	NC_008532	AGAT	2	8	53347	53354	50 %	25 %	25 %	0 %	116627012
131	NC_008532	CAAG	2	8	53581	53588	50 %	0 %	25 %	25 %	116627012
132	NC_008532	CATC	2	8	53935	53942	25 %	25 %	0 %	50 %	116627012
133	NC_008532	TGAT	2	8	54258	54265	25 %	50 %	25 %	0 %	116627012
134	NC_008532	CTGG	2	8	55439	55446	0 %	25 %	50 %	25 %	116627014
135	NC_008532	GCAG	2	8	55525	55532	25 %	0 %	50 %	25 %	116627014
136	NC_008532	TTCG	2	8	56842	56849	0 %	50 %	25 %	25 %	116627015
137	NC_008532	AGCG	2	8	57670	57677	25 %	0 %	50 %	25 %	116627015
138	NC_008532	TTGA	2	8	58272	58279	25 %	50 %	25 %	0 %	116627016
139	NC_008532	AGAT	2	8	58330	58337	50 %	25 %	25 %	0 %	116627016
140	NC_008532	AGTG	2	8	58439	58446	25 %	25 %	50 %	0 %	116627016
141	NC_008532	GTAG	2	8	58751	58758	25 %	25 %	50 %	0 %	116627017
142	NC_008532	AGTC	2	8	59118	59125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008532	TTAT	2	8	59496	59503	25 %	75 %	0 %	0 %	116627018
144	NC_008532	GCAG	2	8	59789	59796	25 %	0 %	50 %	25 %	116627019
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