MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 2354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	AC	3	6	2341	2346	50 %	0 %	0 %	50 %	116626974
2	NC_008532	AG	3	6	2834	2839	50 %	0 %	50 %	0 %	116626975
3	NC_008532	CT	3	6	3100	3105	0 %	50 %	0 %	50 %	116626975
4	NC_008532	GA	3	6	3239	3244	50 %	0 %	50 %	0 %	116626975
5	NC_008532	TC	3	6	7217	7222	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
6	NC_008532	CA	3	6	7495	7500	50 %	0 %	0 %	50 %	116626979
7	NC_008532	TC	3	6	8002	8007	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
8	NC_008532	CT	3	6	8976	8981	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
9	NC_008532	TC	3	6	9681	9686	0 %	50 %	0 %	50 %	116626979
10	NC_008532	TA	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008532	TG	3	6	13586	13591	0 %	50 %	50 %	0 %	116626985
12	NC_008532	GA	3	6	13744	13749	50 %	0 %	50 %	0 %	116626985
13	NC_008532	CT	3	6	15395	15400	0 %	50 %	0 %	50 %	116626986
14	NC_008532	AC	3	6	15816	15821	50 %	0 %	0 %	50 %	116626986
15	NC_008532	TC	3	6	16064	16069	0 %	50 %	0 %	50 %	116626987
16	NC_008532	AT	3	6	17423	17428	50 %	50 %	0 %	0 %	116626988
17	NC_008532	AT	3	6	17500	17505	50 %	50 %	0 %	0 %	116626988
18	NC_008532	CA	3	6	18304	18309	50 %	0 %	0 %	50 %	116626989
19	NC_008532	TC	3	6	18367	18372	0 %	50 %	0 %	50 %	116626989
20	NC_008532	GA	3	6	18921	18926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008532	AG	3	6	19010	19015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008532	AG	3	6	19217	19222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008532	AT	3	6	19854	19859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008532	CT	3	6	19885	19890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008532	AC	3	6	20375	20380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008532	AC	3	6	20544	20549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008532	AG	3	6	21316	21321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008532	CT	3	6	21430	21435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008532	TC	3	6	21808	21813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008532	AT	3	6	22008	22013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008532	GA	3	6	22347	22352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008532	TA	3	6	22401	22406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008532	GA	3	6	22642	22647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008532	CT	3	6	22758	22763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008532	GA	3	6	22965	22970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008532	GA	3	6	23780	23785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008532	AT	3	6	23880	23885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008532	AT	3	6	24309	24314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008532	TA	3	6	24899	24904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008532	AT	3	6	24988	24993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008532	AG	3	6	29633	29638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008532	AG	3	6	33903	33908	50 %	0 %	50 %	0 %	116626997
43	NC_008532	AT	3	6	34307	34312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008532	TG	3	6	34330	34335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008532	AT	3	6	35309	35314	50 %	50 %	0 %	0 %	116626999
46	NC_008532	AT	3	6	35903	35908	50 %	50 %	0 %	0 %	116626999
47	NC_008532	TG	3	6	36678	36683	0 %	50 %	50 %	0 %	116626999
48	NC_008532	TA	3	6	39025	39030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008532	TC	3	6	39164	39169	0 %	50 %	0 %	50 %	116627000
50	NC_008532	TC	3	6	39212	39217	0 %	50 %	0 %	50 %	116627000
51	NC_008532	CT	3	6	40053	40058	0 %	50 %	0 %	50 %	116627000
52	NC_008532	CA	3	6	40263	40268	50 %	0 %	0 %	50 %	116627000
53	NC_008532	TG	3	6	40377	40382	0 %	50 %	50 %	0 %	116627000
54	NC_008532	TG	3	6	40755	40760	0 %	50 %	50 %	0 %	116627001
55	NC_008532	TG	3	6	40765	40770	0 %	50 %	50 %	0 %	116627001
56	NC_008532	TG	3	6	40884	40889	0 %	50 %	50 %	0 %	116627001
57	NC_008532	CA	3	6	42676	42681	50 %	0 %	0 %	50 %	116627003
58	NC_008532	AT	3	6	43894	43899	50 %	50 %	0 %	0 %	116627004
59	NC_008532	AT	3	6	43971	43976	50 %	50 %	0 %	0 %	116627004
60	NC_008532	GA	3	6	44316	44321	50 %	0 %	50 %	0 %	116627004
61	NC_008532	AT	3	6	45453	45458	50 %	50 %	0 %	0 %	116627005
62	NC_008532	TC	3	6	45991	45996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008532	AC	3	6	46106	46111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008532	TC	4	8	46817	46824	0 %	50 %	0 %	50 %	116627006
65	NC_008532	GT	3	6	48447	48452	0 %	50 %	50 %	0 %	116627008
66	NC_008532	GT	3	6	48835	48840	0 %	50 %	50 %	0 %	116627008
67	NC_008532	CT	3	6	48950	48955	0 %	50 %	0 %	50 %	116627008
68	NC_008532	CT	3	6	49040	49045	0 %	50 %	0 %	50 %	116627008
69	NC_008532	CA	3	6	49113	49118	50 %	0 %	0 %	50 %	116627008
70	NC_008532	AC	3	6	49164	49169	50 %	0 %	0 %	50 %	116627008
71	NC_008532	GA	3	6	49500	49505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008532	TC	4	8	49529	49536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008532	CA	3	6	49872	49877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008532	TC	3	6	51781	51786	0 %	50 %	0 %	50 %	116627011
75	NC_008532	AT	3	6	52526	52531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008532	TA	3	6	52708	52713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008532	GT	3	6	53152	53157	0 %	50 %	50 %	0 %	116627012
78	NC_008532	AG	3	6	54889	54894	50 %	0 %	50 %	0 %	116627013
79	NC_008532	TC	3	6	56243	56248	0 %	50 %	0 %	50 %	116627015
80	NC_008532	AG	3	6	56831	56836	50 %	0 %	50 %	0 %	116627015
81	NC_008532	AC	3	6	57843	57848	50 %	0 %	0 %	50 %	116627015
82	NC_008532	GA	3	6	58018	58023	50 %	0 %	50 %	0 %	116627015
83	NC_008532	TC	4	8	58099	58106	0 %	50 %	0 %	50 %	116627015
84	NC_008532	TG	4	8	59590	59597	0 %	50 %	50 %	0 %	116627018
85	NC_008532	TA	3	6	60449	60454	50 %	50 %	0 %	0 %	116627019
86	NC_008532	AG	3	6	60656	60661	50 %	0 %	50 %	0 %	116627019
87	NC_008532	TG	3	6	61344	61349	0 %	50 %	50 %	0 %	116627019
88	NC_008532	TA	3	6	62078	62083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008532	AT	3	6	62198	62203	50 %	50 %	0 %	0 %	116627021
90	NC_008532	AT	3	6	62678	62683	50 %	50 %	0 %	0 %	116627021
91	NC_008532	CA	3	6	63485	63490	50 %	0 %	0 %	50 %	116627023
92	NC_008532	AT	3	6	64573	64578	50 %	50 %	0 %	0 %	116627023
93	NC_008532	AG	3	6	65981	65986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008532	GA	3	6	66583	66588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008532	AG	3	6	66672	66677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008532	AG	3	6	66879	66884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008532	AT	3	6	67516	67521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008532	CT	3	6	67547	67552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008532	AC	3	6	68037	68042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008532	AC	3	6	68206	68211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008532	AG	3	6	68978	68983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008532	CT	3	6	69092	69097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008532	TC	3	6	69470	69475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008532	AT	3	6	69670	69675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008532	GA	3	6	70009	70014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008532	TA	3	6	70063	70068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008532	GA	3	6	70304	70309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008532	CT	3	6	70420	70425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008532	GA	3	6	70627	70632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008532	GA	3	6	71442	71447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008532	AT	3	6	71542	71547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008532	TA	3	6	72779	72784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008532	AT	3	6	73022	73027	50 %	50 %	0 %	0 %	116627026
114	NC_008532	AG	3	6	73197	73202	50 %	0 %	50 %	0 %	116627026
115	NC_008532	GA	3	6	73212	73217	50 %	0 %	50 %	0 %	116627026
116	NC_008532	CT	3	6	73304	73309	0 %	50 %	0 %	50 %	116627026
117	NC_008532	AT	3	6	73538	73543	50 %	50 %	0 %	0 %	116627026
118	NC_008532	CT	3	6	74824	74829	0 %	50 %	0 %	50 %	116627026
119	NC_008532	AT	3	6	75435	75440	50 %	50 %	0 %	0 %	116627026
120	NC_008532	GA	3	6	77220	77225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008532	CA	3	6	77437	77442	50 %	0 %	0 %	50 %	116627027
122	NC_008532	TA	3	6	78914	78919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008532	GA	3	6	80471	80476	50 %	0 %	50 %	0 %	116627031
124	NC_008532	TG	3	6	80534	80539	0 %	50 %	50 %	0 %	116627031
125	NC_008532	AT	3	6	81030	81035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008532	AC	3	6	82305	82310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008532	AC	3	6	82657	82662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008532	CA	3	6	83452	83457	50 %	0 %	0 %	50 %	116627032
129	NC_008532	GA	4	8	85023	85030	50 %	0 %	50 %	0 %	116627034
130	NC_008532	CA	3	6	85345	85350	50 %	0 %	0 %	50 %	116627034
131	NC_008532	AT	3	6	85737	85742	50 %	50 %	0 %	0 %	116627035
132	NC_008532	AG	3	6	85854	85859	50 %	0 %	50 %	0 %	116627035
133	NC_008532	AT	3	6	86167	86172	50 %	50 %	0 %	0 %	116627036
134	NC_008532	GC	3	6	87175	87180	0 %	0 %	50 %	50 %	116627036
135	NC_008532	CT	3	6	92654	92659	0 %	50 %	0 %	50 %	116627039
136	NC_008532	TC	3	6	93089	93094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008532	TC	3	6	93628	93633	0 %	50 %	0 %	50 %	116627040
138	NC_008532	AC	3	6	95263	95268	50 %	0 %	0 %	50 %	116627040
139	NC_008532	GA	3	6	95559	95564	50 %	0 %	50 %	0 %	116627041
140	NC_008532	TA	3	6	97207	97212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008532	GA	3	6	97937	97942	50 %	0 %	50 %	0 %	116627043
142	NC_008532	GT	3	6	100394	100399	0 %	50 %	50 %	0 %	116627048
143	NC_008532	TC	3	6	100419	100424	0 %	50 %	0 %	50 %	116627048
144	NC_008532	TG	3	6	101064	101069	0 %	50 %	50 %	0 %	116627049
145	NC_008532	AT	3	6	101428	101433	50 %	50 %	0 %	0 %	116627050
146	NC_008532	TC	3	6	101821	101826	0 %	50 %	0 %	50 %	116627050
147	NC_008532	CT	3	6	102829	102834	0 %	50 %	0 %	50 %	116627051
148	NC_008532	TA	4	8	104389	104396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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