MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 chromosome

Total Repeats: 738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008531	TTGTAT	2	12	3864	3875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617178
2	NC_008531	CTGATA	2	12	5231	5242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617179
3	NC_008531	TATATT	2	12	6298	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116617179
4	NC_008531	ACTGTA	2	12	7428	7439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617180
5	NC_008531	ACAAGC	2	12	7967	7978	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116617180
6	NC_008531	TGAAGA	2	12	8195	8206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617180
7	NC_008531	ATTAAT	2	12	20897	20908	50 %	50 %	0 %	0 %	116617191
8	NC_008531	AACAAA	2	12	22557	22568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008531	TTATTG	2	12	30068	30079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617193
10	NC_008531	AATTAA	2	12	30154	30165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116617193
11	NC_008531	AAAATA	2	12	33071	33082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116617196
12	NC_008531	ATATGT	2	12	33158	33169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617197
13	NC_008531	TAAACC	2	12	33656	33667	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008531	TGATTT	2	12	36376	36387	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617199
15	NC_008531	CAAATG	2	12	38875	38886	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617202
16	NC_008531	TACCAT	2	12	40662	40673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116617203
17	NC_008531	AAAAGT	2	12	41206	41217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617203
18	NC_008531	TATTGC	2	12	44620	44631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617208
19	NC_008531	GGTAAA	2	12	46065	46076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617210
20	NC_008531	ACAGCA	2	12	49541	49552	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116617213
21	NC_008531	TAGCAA	2	12	49581	49592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617213
22	NC_008531	AGCATT	2	12	50140	50151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617213
23	NC_008531	GCAAGA	2	12	51007	51018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116617214
24	NC_008531	TGGCTG	2	12	56476	56487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617220
25	NC_008531	AATCTT	2	12	67090	67101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617233
26	NC_008531	TAATTG	2	12	67275	67286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617233
27	NC_008531	TTGCCA	2	12	68463	68474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617235
28	NC_008531	TGGATC	2	12	73397	73408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617238
29	NC_008531	GTAAAT	2	12	74209	74220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617240
30	NC_008531	TTATAG	2	12	75664	75675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008531	TAAGAT	2	12	78211	78222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617248
32	NC_008531	AAGATA	2	12	80394	80405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008531	GGTGCT	2	12	81270	81281	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617252
34	NC_008531	TGAAAC	2	12	86915	86926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617256
35	NC_008531	ATGATA	2	12	89336	89347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617259
36	NC_008531	AATAAA	2	12	89875	89886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008531	TTAGAT	2	12	92609	92620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617261
38	NC_008531	TTGCTA	2	12	101379	101390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617271
39	NC_008531	AATATT	2	12	101669	101680	50 %	50 %	0 %	0 %	116617271
40	NC_008531	AGAATA	2	12	101697	101708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617271
41	NC_008531	AGAGAA	2	12	103967	103978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008531	ATAAAA	2	12	108649	108660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008531	TGGTGA	2	12	110510	110521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617282
44	NC_008531	TAAAAT	2	12	115955	115966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008531	CATGAA	2	12	120838	120849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617291
46	NC_008531	TTAATG	2	12	126717	126728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617297
47	NC_008531	AAGCAC	2	12	133364	133375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008531	TATGAA	2	12	145222	145233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617313
49	NC_008531	TGTTAA	2	12	147246	147257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617314
50	NC_008531	TTAGAA	2	12	147412	147423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617314
51	NC_008531	GTAAAG	2	12	147904	147915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008531	AACAAA	2	12	148292	148303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008531	TGAGGA	2	12	159440	159451	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116617317
54	NC_008531	TTGAGG	2	12	159859	159870	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617317
55	NC_008531	GCTATT	2	12	161491	161502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617318
56	NC_008531	TAAAAT	2	12	163148	163159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116617319
57	NC_008531	ATGTTG	2	12	173412	173423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617329
58	NC_008531	TGCATC	2	12	173536	173547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617329
59	NC_008531	ATTGAA	2	12	176199	176210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617335
60	NC_008531	CTGTTG	2	12	177438	177449	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116617338
61	NC_008531	TATCGA	2	12	178239	178250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617340
62	NC_008531	ATTGTT	2	12	178866	178877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617341
63	NC_008531	TAAAGG	2	12	179973	179984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116617343
64	NC_008531	CTTGGA	2	12	181086	181097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617346
65	NC_008531	TTTATT	2	12	191088	191099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116617360
66	NC_008531	AAAATG	2	12	197695	197706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617368
67	NC_008531	TCGATG	2	12	198348	198359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617369
68	NC_008531	TCACAG	2	12	208500	208511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116617378
69	NC_008531	GATACA	2	12	209744	209755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617379
70	NC_008531	CTTTAT	2	12	212117	212128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116617381
71	NC_008531	TTAATT	2	12	218988	218999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116617387
72	NC_008531	AGGAGC	2	12	221286	221297	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116617389
73	NC_008531	CGAAGC	2	12	221495	221506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116617390
74	NC_008531	GTATGG	2	12	226561	226572	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116617397
75	NC_008531	TAAGGT	2	12	229017	229028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617401
76	NC_008531	GGCTTG	2	12	229054	229065	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617401
77	NC_008531	ATTTTG	2	12	229358	229369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617402
78	NC_008531	GTGAAG	2	12	229983	229994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116617403
79	NC_008531	AAGATA	2	12	234578	234589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617409
80	NC_008531	AATTGA	2	12	234816	234827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617409
81	NC_008531	GCATTT	2	12	235476	235487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617410
82	NC_008531	TTTTAT	2	12	236203	236214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116617411
83	NC_008531	CAATTT	2	12	240682	240693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617415
84	NC_008531	ATTTTA	2	12	247635	247646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008531	ATTTTG	2	12	249094	249105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617421
86	NC_008531	ATTTGG	2	12	251166	251177	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617423
87	NC_008531	ATGAAA	2	12	256813	256824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116617428
88	NC_008531	CTAACG	2	12	259158	259169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116617430
89	NC_008531	GTTCCT	2	12	261370	261381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116617432
90	NC_008531	GCATTT	2	12	262532	262543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617433
91	NC_008531	ATTTTG	2	12	263032	263043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617434
92	NC_008531	GCATTC	2	12	264034	264045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116617436
93	NC_008531	GGTTTC	2	12	266046	266057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008531	TTGCAA	2	12	267086	267097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617440
95	NC_008531	AAATAT	2	12	269635	269646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008531	CAAACA	2	12	274098	274109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116617447
97	NC_008531	TGATAT	2	12	274518	274529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617448
98	NC_008531	GAAAAA	2	12	277117	277128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116617448
99	NC_008531	CTTCAA	2	12	281182	281193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116617452
100	NC_008531	ACAGAA	2	12	283661	283672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116617454
101	NC_008531	CATGGC	2	12	284983	284994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116617454
102	NC_008531	GATTAT	2	12	287951	287962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617457
103	NC_008531	AATATG	2	12	289156	289167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617458
104	NC_008531	TTAACA	2	12	296057	296068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116617465
105	NC_008531	TTAAAC	2	12	296812	296823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116617466
106	NC_008531	ATTGGT	2	12	309676	309687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617480
107	NC_008531	TTTCAG	2	12	314038	314049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617483
108	NC_008531	TCATAT	2	12	317218	317229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116617486
109	NC_008531	AGATAT	2	12	317360	317371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617487
110	NC_008531	TAATTT	2	12	320488	320499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008531	GTATCG	2	12	323307	323318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116617495
112	NC_008531	TGGATT	2	12	327623	327634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617499
113	NC_008531	ATGGTA	2	12	329846	329857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617502
114	NC_008531	TGGGCA	2	12	330396	330407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116617502
115	NC_008531	TTGTTC	2	12	335585	335596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116617507
116	NC_008531	ATTGGT	2	12	335689	335700	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116617507
117	NC_008531	TCATTT	2	12	338224	338235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116617509
118	NC_008531	CAGTTT	2	12	345074	345085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617514
119	NC_008531	AATTAT	2	12	347180	347191	50 %	50 %	0 %	0 %	116617515
120	NC_008531	ATATGA	2	12	347964	347975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617516
121	NC_008531	GGTGCT	2	12	351206	351217	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116617517
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124	NC_008531	GTTGGT	2	12	363454	363465	0 %	50 %	50 %	0 %	116617528
125	NC_008531	TGCTAT	2	12	364443	364454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617528
126	NC_008531	TGGACA	2	12	367937	367948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116617531
127	NC_008531	AATGTT	2	12	369689	369700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116617533
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131	NC_008531	AAAAAG	2	12	380972	380983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116617542
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228	NC_008531	TTGGTG	2	12	623316	623327	0 %	50 %	50 %	0 %	116617768
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230	NC_008531	TGATCT	2	12	630354	630365	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116617774
231	NC_008531	ATGTTT	2	12	631850	631861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116617775
232	NC_008531	GAAGCT	2	12	633526	633537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116617776
233	NC_008531	GTTGAA	2	12	633959	633970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116617777
234	NC_008531	TGCAAA	2	12	637132	637143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116617780
235	NC_008531	AAATTG	2	12	641096	641107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116617784
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254	NC_008531	TAACTG	2	12	707663	707674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116617844
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347	NC_008531	AATGAA	2	12	984154	984165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_008531	TAGTTG	2	12	986116	986127	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116618093
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351	NC_008531	TGCGTG	2	12	996773	996784	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116618099
352	NC_008531	TAAATT	2	12	1001021	1001032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_008531	TTAATT	2	12	1002528	1002539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116618106
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445	NC_008531	AAATGT	2	12	1223171	1223182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116618327
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448	NC_008531	ACCTGC	2	12	1228002	1228013	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116618333
449	NC_008531	TGTAAT	2	12	1230657	1230668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116618336
450	NC_008531	TGTACG	2	12	1235204	1235215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116618341
451	NC_008531	ACTTGA	2	12	1236344	1236355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618341
452	NC_008531	TGTTTA	2	12	1245260	1245271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116618350
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454	NC_008531	ACTGAT	2	12	1246873	1246884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618351
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456	NC_008531	TCATCC	2	12	1257460	1257471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116618366
457	NC_008531	GTTGCT	2	12	1265786	1265797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116618377
458	NC_008531	AAAAAT	2	12	1268992	1269003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_008531	CTAGTA	2	12	1270060	1270071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618381
460	NC_008531	CATCAA	2	12	1270315	1270326	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116618382
461	NC_008531	ACCAAC	2	12	1271048	1271059	50 %	0 %	0 %	50 %	116618382
462	NC_008531	AGGATG	2	12	1274115	1274126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116618385
463	NC_008531	ACTACC	2	12	1274536	1274547	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116618385
464	NC_008531	ACCATC	2	12	1275259	1275270	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116618385
465	NC_008531	TGCTGG	2	12	1277234	1277245	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116618386
466	NC_008531	ACTTGA	2	12	1281564	1281575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618391
467	NC_008531	GTTATC	2	12	1282466	1282477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116618391
468	NC_008531	GTTCAC	2	12	1286580	1286591	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116618397
469	NC_008531	TGTCAA	2	12	1297786	1297797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618408
470	NC_008531	TACCAC	2	12	1303101	1303112	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116618412
471	NC_008531	TAATGA	2	12	1304912	1304923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116618414
472	NC_008531	GCAACT	2	12	1308136	1308147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_008531	AATATC	2	12	1309614	1309625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618416
474	NC_008531	AAACAA	2	12	1309909	1309920	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116618416
475	NC_008531	ATTTTA	2	12	1313973	1313984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_008531	ATCCCC	2	12	1317364	1317375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
477	NC_008531	TAGCAA	2	12	1322467	1322478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116618433
478	NC_008531	ATAAAA	3	18	1324605	1324622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116618435
479	NC_008531	TAACGA	2	12	1327462	1327473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116618437
480	NC_008531	ATACCA	2	12	1334547	1334558	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116618445
481	NC_008531	ACAGTT	2	12	1336353	1336364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618447
482	NC_008531	TTCATT	2	12	1340427	1340438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116618450
483	NC_008531	ATTGTT	2	12	1340682	1340693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116618450
484	NC_008531	TCTTCA	2	12	1342396	1342407	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116618453
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486	NC_008531	TGTATC	2	12	1344853	1344864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116618457
487	NC_008531	TATTTT	2	12	1344923	1344934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_008531	TAAACA	2	12	1345732	1345743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116618458
489	NC_008531	GCTTGT	2	12	1346136	1346147	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116618458
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491	NC_008531	TATCTT	2	12	1348664	1348675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116618459
492	NC_008531	TGAATC	2	12	1349559	1349570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618459
493	NC_008531	TTAGCA	2	12	1351837	1351848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116618462
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496	NC_008531	TGTGTT	2	12	1355422	1355433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116618465
497	NC_008531	AGAAAA	2	12	1361090	1361101	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116618470
498	NC_008531	ATCCAG	2	12	1361882	1361893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116618472
499	NC_008531	CAATCG	2	12	1363627	1363638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116618473
500	NC_008531	ACAATT	2	12	1368618	1368629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116618479

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