MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008531	AACAAA	2	12	22557	22568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008531	TAAACC	2	12	33656	33667	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008531	TTATAG	2	12	75664	75675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008531	AAGATA	2	12	80394	80405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008531	AATAAA	2	12	89875	89886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008531	AGAGAA	2	12	103967	103978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008531	ATAAAA	2	12	108649	108660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008531	TAAAAT	2	12	115955	115966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008531	AAGCAC	2	12	133364	133375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008531	GTAAAG	2	12	147904	147915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008531	AACAAA	2	12	148292	148303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008531	ATTTTA	2	12	247635	247646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008531	GGTTTC	2	12	266046	266057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008531	AAATAT	2	12	269635	269646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008531	TAATTT	2	12	320488	320499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008531	TCATAG	2	12	388704	388715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008531	TTTAAT	2	12	430885	430896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008531	GAAGAG	2	12	477481	477492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008531	TATTTT	2	12	527408	527419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008531	TTTTTG	2	12	557069	557080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008531	ATTTTA	2	12	681991	682002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008531	ATTGTA	2	12	691567	691578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008531	AAATAT	2	12	706827	706838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008531	AACACG	2	12	811488	811499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008531	AAGAAT	2	12	817297	817308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008531	AGTTAA	2	12	845768	845779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008531	ATTAAA	2	12	870976	870987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008531	GGTTAT	2	12	887218	887229	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008531	ATTAAA	2	12	909719	909730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008531	GTTTTA	2	12	955042	955053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008531	TAAAAT	2	12	956564	956575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008531	GTTTTT	2	12	976306	976317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008531	AATGAA	2	12	984154	984165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008531	TAAATT	2	12	1001021	1001032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008531	CAAATA	2	12	1013302	1013313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008531	TAAAAT	2	12	1024243	1024254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008531	TAATGA	2	12	1024711	1024722	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008531	AAAAAG	2	12	1044066	1044077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008531	AAATAT	2	12	1053076	1053087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008531	CAAATA	2	12	1060839	1060850	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008531	AATTTT	2	12	1067397	1067408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008531	TGAGAT	2	12	1095231	1095242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008531	AATATG	2	12	1131864	1131875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008531	AATGAA	2	12	1153505	1153516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008531	CTTTTT	2	12	1179267	1179278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008531	CTATGC	2	12	1218258	1218269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008531	TAAAAA	2	12	1220493	1220504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008531	AAAAAT	2	12	1268992	1269003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008531	GCAACT	2	12	1308136	1308147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008531	ATTTTA	2	12	1313973	1313984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008531	ATCCCC	2	12	1317364	1317375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008531	TATTTT	2	12	1344923	1344934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008531	CAATAC	2	12	1449089	1449100	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008531	TAAAAG	2	12	1471237	1471248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008531	TTAAAT	2	12	1522493	1522504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008531	AATTTT	2	12	1547100	1547111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008531	GTTTTT	2	12	1557780	1557791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008531	TTATAA	2	12	1608865	1608876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008531	TATGGA	2	12	1663328	1663339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008531	TTTGTT	2	12	1682254	1682265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008531	TTTTAT	2	12	1764405	1764416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008531	TTTGTT	2	12	1807776	1807787	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008531	CCTTTA	2	12	1808163	1808174	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008531	AAATCA	2	12	1851606	1851617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008531	ATCAAC	2	12	1868739	1868750	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008531	CTTATA	2	12	1868866	1868877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008531	AAATAA	2	12	1871841	1871852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008531	TTCAAA	2	12	1881978	1881989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008531	AAAAGA	2	12	1888577	1888588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008531	AATAAA	2	12	1902838	1902849	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008531	CGTCAT	2	12	1933885	1933896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008531	ATAAAC	2	12	1966650	1966661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008531	ATTTTA	2	12	2012294	2012305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.