MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	TATTT	2	10	10174	10183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008530	TATAA	2	10	11180	11189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008530	CTTTG	2	10	20537	20546	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008530	GCTAA	2	10	25062	25071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008530	CAATA	2	10	38945	38954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008530	ATTAA	2	10	46501	46510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008530	ATAAA	2	10	67685	67694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008530	CAATA	2	10	101003	101012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008530	TGAAG	2	10	105131	105140	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008530	AAATA	2	10	114815	114824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008530	TAAGT	2	10	114883	114892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008530	GAATA	2	10	116421	116430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008530	TTAAA	2	10	129409	129418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008530	TAGAA	2	10	131488	131497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008530	ATTTC	2	10	136047	136056	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008530	CAATT	2	10	141884	141893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008530	TGTTA	2	10	185590	185599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008530	CTTTC	2	10	202644	202653	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008530	AGAAT	2	10	218862	218871	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008530	ATTTT	2	10	220493	220502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008530	CTTGG	2	10	223687	223696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008530	TAAAA	2	10	226421	226430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008530	TAAAT	2	10	227122	227131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008530	ATTTA	2	10	240888	240897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008530	AAAAG	2	10	260959	260968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008530	AAATT	2	10	262615	262624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008530	CTTTA	2	10	272207	272216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008530	CAATA	2	10	276338	276347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008530	TGAAT	2	10	283107	283116	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008530	ATTAG	2	10	284292	284301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008530	TAAAT	2	10	285384	285393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008530	CTTTT	2	10	291834	291843	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008530	AGAAA	2	10	314810	314819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008530	TAAAA	2	10	332831	332840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008530	TAAAA	2	10	352588	352597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008530	TTAAA	2	10	359392	359401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008530	TGATA	2	10	365776	365785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008530	GAAAA	2	10	377384	377393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008530	TATAC	2	10	386666	386675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008530	CTTTT	2	10	425102	425111	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008530	TTATT	2	10	427400	427409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008530	ATATT	2	10	435018	435027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008530	GTAAA	2	10	443739	443748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008530	ATATA	2	10	477393	477402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008530	GGTAA	2	10	477856	477865	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008530	TCGTG	2	10	478673	478682	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008530	TAAGG	2	10	480746	480755	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008530	TTGAA	2	10	481256	481265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008530	TAGAT	2	10	485756	485765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008530	TTTAA	2	10	502653	502662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008530	ATTAT	2	10	512760	512769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008530	TTTGT	2	10	516864	516873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008530	TAAAA	2	10	528792	528801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008530	ATTTT	2	10	534319	534328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008530	AGAAA	2	10	534395	534404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008530	CTTTT	2	10	535843	535852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008530	TATGA	2	10	535878	535887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008530	CAAAA	2	10	539382	539391	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008530	TTGAA	2	10	540990	540999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008530	TTAAA	2	10	550127	550136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008530	GAAAA	2	10	557400	557409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008530	GAAAA	2	10	561599	561608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008530	TAAAA	2	10	567887	567896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008530	GTTTA	2	10	576810	576819	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008530	TAAAA	2	10	592911	592920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008530	AAATT	2	10	600727	600736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008530	TAAAT	2	10	604891	604900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008530	TTCAT	2	10	612860	612869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008530	AAGTC	2	10	614334	614343	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008530	GTATA	2	10	640575	640584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008530	AAATT	2	10	640813	640822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008530	TAAAT	2	10	644977	644986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008530	TTCAT	2	10	652946	652955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008530	AAGTC	2	10	654420	654429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008530	GTATA	2	10	680661	680670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008530	TAATA	2	10	712133	712142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008530	TTGAA	2	10	722921	722930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008530	TAAAC	2	10	751543	751552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008530	AAAAT	2	10	755983	755992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008530	TTTTA	2	10	767073	767082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008530	TTACT	2	10	774338	774347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008530	AAGAA	2	10	806685	806694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008530	TTCTT	2	10	806709	806718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008530	TTAAT	2	10	813822	813831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008530	TTATT	2	10	828731	828740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008530	AAAAG	2	10	845675	845684	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008530	TAAAA	2	10	853396	853405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008530	GATAT	2	10	855663	855672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008530	TATTT	2	10	876359	876368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008530	ATAAA	2	10	880627	880636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008530	CAGGG	2	10	881496	881505	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008530	GTTTT	2	10	885795	885804	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008530	TAAAT	2	10	901736	901745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008530	GAAAG	2	10	915844	915853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008530	TTTAG	2	10	922549	922558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008530	CTATT	2	10	931323	931332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008530	AATTA	2	10	949102	949111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008530	TATAA	2	10	960132	960141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008530	TAAAA	2	10	960181	960190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008530	ATATT	2	10	960672	960681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008530	AATTG	2	10	962347	962356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008530	TCATT	2	10	965870	965879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008530	TTAAG	2	10	968474	968483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008530	AAACA	2	10	976469	976478	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008530	CTAAA	2	10	979757	979766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008530	AAATT	2	10	984344	984353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008530	TTTGT	2	10	984803	984812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008530	ATTTA	2	10	987189	987198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008530	TGTTT	2	10	989253	989262	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008530	TTTAA	2	10	991378	991387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008530	TTACT	2	10	991531	991540	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008530	ATAAA	2	10	993239	993248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008530	TACAT	2	10	1005525	1005534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008530	ATATA	2	10	1006034	1006043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008530	ATCTT	2	10	1023953	1023962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008530	TATAT	2	10	1029998	1030007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008530	TGCTA	2	10	1049294	1049303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008530	TTAAA	2	10	1054373	1054382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008530	CATTA	2	10	1054551	1054560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008530	TATTT	2	10	1054649	1054658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008530	AAAAC	2	10	1056281	1056290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008530	ATTGT	2	10	1064524	1064533	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008530	GGAAA	2	10	1066461	1066470	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008530	TTTCA	2	10	1067916	1067925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008530	AAAAG	2	10	1071754	1071763	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008530	CTTTT	2	10	1072981	1072990	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008530	TTTAT	2	10	1085156	1085165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008530	TACTA	2	10	1092990	1092999	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008530	ATTAA	2	10	1100270	1100279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008530	TGCCT	2	10	1108531	1108540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008530	TAATA	2	10	1114580	1114589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008530	TTGTA	2	10	1135228	1135237	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008530	TAATC	2	10	1135503	1135512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008530	TCTTT	2	10	1183325	1183334	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008530	TATTT	2	10	1193618	1193627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008530	GAACA	2	10	1198327	1198336	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008530	ATTCC	2	10	1198350	1198359	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_008530	CAAAA	2	10	1212058	1212067	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008530	CTTTA	2	10	1236655	1236664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008530	CAAGT	2	10	1251835	1251844	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008530	AAATG	2	10	1251877	1251886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008530	TTTCT	2	10	1260966	1260975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008530	AAACT	2	10	1261311	1261320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008530	ATTAT	2	10	1261322	1261331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008530	TAAAT	2	10	1262068	1262077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008530	TCTTG	2	10	1263356	1263365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008530	TAGTA	2	10	1263443	1263452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008530	GTTTT	2	10	1264348	1264357	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_008530	TTCAA	2	10	1563706	1563715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_008530	CCTTA	2	10	1564216	1564225	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.