MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 1231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	TAATG	2	10	1725	1734	40 %	40 %	20 %	0 %	116628685
2	NC_008530	GTTAA	2	10	3137	3146	40 %	40 %	20 %	0 %	116628686
3	NC_008530	TTGAA	2	10	3258	3267	40 %	40 %	20 %	0 %	116628687
4	NC_008530	CAGAC	2	10	7240	7249	40 %	0 %	20 %	40 %	116628689
5	NC_008530	GTTTA	2	10	10733	10742	20 %	60 %	20 %	0 %	116628693
6	NC_008530	CTAAT	2	10	10763	10772	40 %	40 %	0 %	20 %	116628693
7	NC_008530	AAAAT	2	10	11684	11693	80 %	20 %	0 %	0 %	116628694
8	NC_008530	AATCT	2	10	12131	12140	40 %	40 %	0 %	20 %	116628694
9	NC_008530	TCCAT	2	10	15722	15731	20 %	40 %	0 %	40 %	116628697
10	NC_008530	GATTA	2	10	18102	18111	40 %	40 %	20 %	0 %	116628699
11	NC_008530	ATTTT	2	10	19553	19562	20 %	80 %	0 %	0 %	116628700
12	NC_008530	CATAT	2	10	20872	20881	40 %	40 %	0 %	20 %	116628701
13	NC_008530	CTTAC	2	10	24625	24634	20 %	40 %	0 %	40 %	116628705
14	NC_008530	TTTTA	2	10	25405	25414	20 %	80 %	0 %	0 %	116628706
15	NC_008530	TCCAG	2	10	26361	26370	20 %	20 %	20 %	40 %	116628707
16	NC_008530	AGCCC	2	10	26433	26442	20 %	0 %	20 %	60 %	116628707
17	NC_008530	TGCCT	2	10	27610	27619	0 %	40 %	20 %	40 %	116628709
18	NC_008530	AGAAA	2	10	29033	29042	80 %	0 %	20 %	0 %	116628711
19	NC_008530	AATTG	2	10	31159	31168	40 %	40 %	20 %	0 %	116628712
20	NC_008530	TTTAT	2	10	31337	31346	20 %	80 %	0 %	0 %	116628712
21	NC_008530	AAAGG	2	10	32177	32186	60 %	0 %	40 %	0 %	116628713
22	NC_008530	GAGTA	2	10	34821	34830	40 %	20 %	40 %	0 %	116628716
23	NC_008530	GTGAA	2	10	37777	37786	40 %	20 %	40 %	0 %	116628720
24	NC_008530	GAAGT	2	10	41748	41757	40 %	20 %	40 %	0 %	116628723
25	NC_008530	GTGAA	2	10	42728	42737	40 %	20 %	40 %	0 %	116628724
26	NC_008530	AGCTG	2	10	43644	43653	20 %	20 %	40 %	20 %	116628725
27	NC_008530	GAAAT	2	10	45314	45323	60 %	20 %	20 %	0 %	116628725
28	NC_008530	AAGAC	2	10	46984	46993	60 %	0 %	20 %	20 %	116628726
29	NC_008530	TAACT	2	10	47588	47597	40 %	40 %	0 %	20 %	116628726
30	NC_008530	TACAA	2	10	49531	49540	60 %	20 %	0 %	20 %	116628726
31	NC_008530	TCACT	2	10	50921	50930	20 %	40 %	0 %	40 %	116628726
32	NC_008530	GAATG	2	10	54687	54696	40 %	20 %	40 %	0 %	116628726
33	NC_008530	TGACT	2	10	55109	55118	20 %	40 %	20 %	20 %	116628726
34	NC_008530	ACAAT	2	10	55873	55882	60 %	20 %	0 %	20 %	116628726
35	NC_008530	ACGGT	2	10	56062	56071	20 %	20 %	40 %	20 %	116628726
36	NC_008530	GAAAA	2	10	66215	66224	80 %	0 %	20 %	0 %	116628731
37	NC_008530	TATTT	2	10	66346	66355	20 %	80 %	0 %	0 %	116628731
38	NC_008530	ATGCA	2	10	67287	67296	40 %	20 %	20 %	20 %	116628732
39	NC_008530	GCAGT	2	10	68329	68338	20 %	20 %	40 %	20 %	116628733
40	NC_008530	TTAAT	2	10	69425	69434	40 %	60 %	0 %	0 %	116628735
41	NC_008530	CATTT	2	10	71008	71017	20 %	60 %	0 %	20 %	116628736
42	NC_008530	AGGAT	2	10	74071	74080	40 %	20 %	40 %	0 %	116628737
43	NC_008530	CTTTT	2	10	74188	74197	0 %	80 %	0 %	20 %	116628738
44	NC_008530	TTTTC	2	10	77121	77130	0 %	80 %	0 %	20 %	116628741
45	NC_008530	AGGTA	2	10	77625	77634	40 %	20 %	40 %	0 %	116628741
46	NC_008530	GCTTA	2	10	80227	80236	20 %	40 %	20 %	20 %	116628743
47	NC_008530	TTTTA	2	10	80973	80982	20 %	80 %	0 %	0 %	116628744
48	NC_008530	ACTAT	2	10	81268	81277	40 %	40 %	0 %	20 %	116628744
49	NC_008530	AAGTT	2	10	81772	81781	40 %	40 %	20 %	0 %	116628744
50	NC_008530	CAGAT	2	10	82238	82247	40 %	20 %	20 %	20 %	116628745
51	NC_008530	CCAAT	2	10	83681	83690	40 %	20 %	0 %	40 %	116628746
52	NC_008530	TAAGT	2	10	85018	85027	40 %	40 %	20 %	0 %	116628747
53	NC_008530	AAAAG	2	10	85571	85580	80 %	0 %	20 %	0 %	116628748
54	NC_008530	AGATA	2	10	85730	85739	60 %	20 %	20 %	0 %	116628748
55	NC_008530	AGTAA	2	10	86466	86475	60 %	20 %	20 %	0 %	116628749
56	NC_008530	GCCAA	2	10	89590	89599	40 %	0 %	20 %	40 %	116628752
57	NC_008530	AGAAA	2	10	92694	92703	80 %	0 %	20 %	0 %	116628756
58	NC_008530	AATTT	2	10	93958	93967	40 %	60 %	0 %	0 %	116628758
59	NC_008530	AAGAT	2	10	97576	97585	60 %	20 %	20 %	0 %	116628761
60	NC_008530	AAAAG	2	10	102250	102259	80 %	0 %	20 %	0 %	116628766
61	NC_008530	TCTTG	2	10	102733	102742	0 %	60 %	20 %	20 %	116628767
62	NC_008530	AAGTA	2	10	102833	102842	60 %	20 %	20 %	0 %	116628767
63	NC_008530	TTACT	2	10	104759	104768	20 %	60 %	0 %	20 %	116628770
64	NC_008530	TTTCA	2	10	107772	107781	20 %	60 %	0 %	20 %	116628773
65	NC_008530	AAAAT	2	10	107965	107974	80 %	20 %	0 %	0 %	116628773
66	NC_008530	CAAAA	2	10	110470	110479	80 %	0 %	0 %	20 %	116628776
67	NC_008530	ATGAT	2	10	113086	113095	40 %	40 %	20 %	0 %	116628779
68	NC_008530	TGCTT	2	10	113222	113231	0 %	60 %	20 %	20 %	116628779
69	NC_008530	TTTGC	2	10	114424	114433	0 %	60 %	20 %	20 %	116628780
70	NC_008530	ATTAT	2	10	115979	115988	40 %	60 %	0 %	0 %	116628781
71	NC_008530	TTGTC	2	10	118711	118720	0 %	60 %	20 %	20 %	116628784
72	NC_008530	ATCAA	2	10	120519	120528	60 %	20 %	0 %	20 %	116628785
73	NC_008530	TTAGG	2	10	122021	122030	20 %	40 %	40 %	0 %	116628787
74	NC_008530	ATTTA	2	10	127274	127283	40 %	60 %	0 %	0 %	116628791
75	NC_008530	GTTTT	2	10	128205	128214	0 %	80 %	20 %	0 %	116628791
76	NC_008530	AGTTA	2	10	128894	128903	40 %	40 %	20 %	0 %	116628791
77	NC_008530	TTTTG	2	10	128980	128989	0 %	80 %	20 %	0 %	116628791
78	NC_008530	GAAAA	2	10	129592	129601	80 %	0 %	20 %	0 %	116628792
79	NC_008530	TTTAG	2	10	130263	130272	20 %	60 %	20 %	0 %	116628792
80	NC_008530	AAGAA	2	10	130399	130408	80 %	0 %	20 %	0 %	116628793
81	NC_008530	GTGTG	2	10	132573	132582	0 %	40 %	60 %	0 %	116628794
82	NC_008530	ACTTA	2	10	133093	133102	40 %	40 %	0 %	20 %	116628795
83	NC_008530	TTAAA	2	10	135679	135688	60 %	40 %	0 %	0 %	116628799
84	NC_008530	TAAGC	2	10	137018	137027	40 %	20 %	20 %	20 %	116628800
85	NC_008530	ATTCC	2	10	138621	138630	20 %	40 %	0 %	40 %	116628802
86	NC_008530	TTTTG	2	10	138905	138914	0 %	80 %	20 %	0 %	116628802
87	NC_008530	TCTTT	2	10	140934	140943	0 %	80 %	0 %	20 %	116628805
88	NC_008530	AAGAA	2	10	148037	148046	80 %	0 %	20 %	0 %	116628813
89	NC_008530	AATTC	2	10	149343	149352	40 %	40 %	0 %	20 %	116628813
90	NC_008530	AATTG	2	10	150247	150256	40 %	40 %	20 %	0 %	116628814
91	NC_008530	GATTG	2	10	152270	152279	20 %	40 %	40 %	0 %	116628816
92	NC_008530	TACTT	2	10	152693	152702	20 %	60 %	0 %	20 %	116628816
93	NC_008530	TGTGA	2	10	155040	155049	20 %	40 %	40 %	0 %	116628818
94	NC_008530	ATAAA	2	10	155350	155359	80 %	20 %	0 %	0 %	116628818
95	NC_008530	ACTAC	2	10	159845	159854	40 %	20 %	0 %	40 %	116628820
96	NC_008530	GATCA	2	10	161006	161015	40 %	20 %	20 %	20 %	116628820
97	NC_008530	GTCCA	2	10	161081	161090	20 %	20 %	20 %	40 %	116628820
98	NC_008530	TAAAT	2	10	162429	162438	60 %	40 %	0 %	0 %	116628820
99	NC_008530	TCAAC	2	10	162572	162581	40 %	20 %	0 %	40 %	116628820
100	NC_008530	TTAAA	2	10	162653	162662	60 %	40 %	0 %	0 %	116628820
101	NC_008530	TACTT	2	10	162670	162679	20 %	60 %	0 %	20 %	116628820
102	NC_008530	ACTTT	2	10	163289	163298	20 %	60 %	0 %	20 %	116628820
103	NC_008530	AAGTT	2	10	163721	163730	40 %	40 %	20 %	0 %	116628821
104	NC_008530	GATCA	2	10	164887	164896	40 %	20 %	20 %	20 %	116628821
105	NC_008530	AACCA	2	10	165193	165202	60 %	0 %	0 %	40 %	116628821
106	NC_008530	TAACT	2	10	165438	165447	40 %	40 %	0 %	20 %	116628821
107	NC_008530	ACTTT	2	10	167633	167642	20 %	60 %	0 %	20 %	116628821
108	NC_008530	TTAAG	2	10	167753	167762	40 %	40 %	20 %	0 %	116628821
109	NC_008530	TAACT	2	10	168024	168033	40 %	40 %	0 %	20 %	116628821
110	NC_008530	AATTA	2	10	168360	168369	60 %	40 %	0 %	0 %	116628821
111	NC_008530	CATTT	2	10	173064	173073	20 %	60 %	0 %	20 %	116628822
112	NC_008530	TAAGG	2	10	173885	173894	40 %	20 %	40 %	0 %	162139892
113	NC_008530	TAAAG	2	10	174191	174200	60 %	20 %	20 %	0 %	162139892
114	NC_008530	TAAAT	2	10	175134	175143	60 %	40 %	0 %	0 %	116628824
115	NC_008530	AAGCA	2	10	175415	175424	60 %	0 %	20 %	20 %	116628824
116	NC_008530	ATTAC	2	10	178880	178889	40 %	40 %	0 %	20 %	116628826
117	NC_008530	TTAGT	2	10	184900	184909	20 %	60 %	20 %	0 %	116628829
118	NC_008530	TGATT	2	10	185171	185180	20 %	60 %	20 %	0 %	116628829
119	NC_008530	GGAAA	2	10	185188	185197	60 %	0 %	40 %	0 %	116628829
120	NC_008530	AATTA	2	10	187305	187314	60 %	40 %	0 %	0 %	116628830
121	NC_008530	CATAA	2	10	189358	189367	60 %	20 %	0 %	20 %	116628831
122	NC_008530	AACAA	2	10	194238	194247	80 %	0 %	0 %	20 %	116628838
123	NC_008530	AAGTA	2	10	194934	194943	60 %	20 %	20 %	0 %	116628838
124	NC_008530	TGAAT	2	10	197807	197816	40 %	40 %	20 %	0 %	116628840
125	NC_008530	AAGTG	2	10	199331	199340	40 %	20 %	40 %	0 %	116628842
126	NC_008530	TGTGA	2	10	199759	199768	20 %	40 %	40 %	0 %	116628842
127	NC_008530	AGTGA	2	10	200713	200722	40 %	20 %	40 %	0 %	116628843
128	NC_008530	AGCTA	2	10	200728	200737	40 %	20 %	20 %	20 %	116628843
129	NC_008530	AACTT	2	10	200952	200961	40 %	40 %	0 %	20 %	116628844
130	NC_008530	GGTTG	2	10	201606	201615	0 %	40 %	60 %	0 %	116628845
131	NC_008530	ACTTA	2	10	203958	203967	40 %	40 %	0 %	20 %	116628848
132	NC_008530	AAGCT	2	10	205435	205444	40 %	20 %	20 %	20 %	116628850
133	NC_008530	GAAAA	2	10	205869	205878	80 %	0 %	20 %	0 %	116628850
134	NC_008530	ATGAA	2	10	206431	206440	60 %	20 %	20 %	0 %	116628851
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