MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus gasseri ATCC 33323 chromosome

Total Repeats: 25422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008530	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
2	NC_008530	GGA	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628684
3	NC_008530	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
4	NC_008530	AAG	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
5	NC_008530	AGC	2	6	536	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628684
6	NC_008530	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628684
7	NC_008530	TTA	2	6	718	723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628684
8	NC_008530	TAA	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628684
9	NC_008530	TAG	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628684
10	NC_008530	TTC	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628684
11	NC_008530	TGA	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628684
12	NC_008530	CAA	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628684
13	NC_008530	AAG	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
14	NC_008530	AAG	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628684
15	NC_008530	TTG	2	6	1300	1305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628684
16	NC_008530	TGG	2	6	1379	1384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628684
17	NC_008530	AGC	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628684
18	NC_008530	TTC	2	6	1743	1748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628685
19	NC_008530	TGA	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
20	NC_008530	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
21	NC_008530	GTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628685
22	NC_008530	ATT	2	6	2101	2106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
23	NC_008530	GTC	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628685
24	NC_008530	TAA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628685
25	NC_008530	TCA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628685
26	NC_008530	TAA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628685
27	NC_008530	TAG	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
28	NC_008530	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
29	NC_008530	CTA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628685
30	NC_008530	TCT	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628685
31	NC_008530	GTA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628685
32	NC_008530	GAA	3	9	2608	2616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628685
33	NC_008530	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628685
34	NC_008530	ATT	2	6	2710	2715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628685
35	NC_008530	TCT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628686
36	NC_008530	GGT	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628686
37	NC_008530	TCG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628686
38	NC_008530	AAG	2	6	3545	3550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
39	NC_008530	AGA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
40	NC_008530	ATT	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
41	NC_008530	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628687
42	NC_008530	ATA	2	6	3815	3820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628687
43	NC_008530	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628687
44	NC_008530	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628687
45	NC_008530	TTA	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
46	NC_008530	ACT	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628687
47	NC_008530	TTA	2	6	4184	4189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628687
48	NC_008530	GAT	2	6	4190	4195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628687
49	NC_008530	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628687
50	NC_008530	ATC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628687
51	NC_008530	AAC	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628687
52	NC_008530	CTG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628687
53	NC_008530	AGA	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
54	NC_008530	GCA	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628688
55	NC_008530	TAG	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
56	NC_008530	ACC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628688
57	NC_008530	ATT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
58	NC_008530	ATA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628688
59	NC_008530	TGA	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
60	NC_008530	GTC	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
61	NC_008530	GGT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628688
62	NC_008530	CGG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628688
63	NC_008530	TGG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628688
64	NC_008530	GTA	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
65	NC_008530	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
66	NC_008530	GAA	2	6	4904	4909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
67	NC_008530	GAC	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628688
68	NC_008530	AAG	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
69	NC_008530	TGA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628688
70	NC_008530	AAC	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628688
71	NC_008530	TGT	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
72	NC_008530	CTT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628688
73	NC_008530	TTG	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
74	NC_008530	CTG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
75	NC_008530	AAG	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628688
76	NC_008530	ACA	2	6	5655	5660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628688
77	NC_008530	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
78	NC_008530	ATT	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628688
79	NC_008530	GTT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628688
80	NC_008530	TCG	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628688
81	NC_008530	AGG	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628688
82	NC_008530	CGT	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628689
83	NC_008530	TTG	2	6	6562	6567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628689
84	NC_008530	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628689
85	NC_008530	ATG	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
86	NC_008530	GAC	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628689
87	NC_008530	CCA	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628689
88	NC_008530	TAC	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628689
89	NC_008530	GGC	2	6	7035	7040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116628689
90	NC_008530	GTT	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628689
91	NC_008530	TGA	2	6	7232	7237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
92	NC_008530	CTT	2	6	7382	7387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628689
93	NC_008530	AAG	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
94	NC_008530	TTA	2	6	7435	7440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628689
95	NC_008530	AAG	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
96	NC_008530	TGA	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
97	NC_008530	ATT	2	6	7539	7544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628689
98	NC_008530	GAT	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
99	NC_008530	TGA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
100	NC_008530	TGA	2	6	7916	7921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
101	NC_008530	GTG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628689
102	NC_008530	GAT	2	6	7974	7979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
103	NC_008530	TCT	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628689
104	NC_008530	AAG	2	6	8058	8063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
105	NC_008530	GAT	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
106	NC_008530	TCT	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628689
107	NC_008530	CGT	2	6	8253	8258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628689
108	NC_008530	ACT	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628689
109	NC_008530	ATG	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
110	NC_008530	GCA	2	6	8406	8411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628689
111	NC_008530	GTG	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628689
112	NC_008530	AGT	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
113	NC_008530	TGA	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
114	NC_008530	TGA	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
115	NC_008530	TGA	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
116	NC_008530	ATG	2	6	8782	8787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
117	NC_008530	GAA	2	6	8793	8798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
118	NC_008530	TGA	2	6	8804	8809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628689
119	NC_008530	AGA	2	6	8822	8827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628689
120	NC_008530	TAA	2	6	8832	8837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628689
121	NC_008530	ATC	2	6	9051	9056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628690
122	NC_008530	GTT	2	6	9111	9116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628690
123	NC_008530	GAA	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628690
124	NC_008530	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628690
125	NC_008530	GTC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628690
126	NC_008530	TAA	2	6	9356	9361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628691
127	NC_008530	TGT	2	6	9362	9367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628691
128	NC_008530	TTG	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628691
129	NC_008530	GTG	2	6	9481	9486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628691
130	NC_008530	ATG	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628691
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