MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 chromosome

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008529	ATAAA	2	10	8832	8841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008529	GCGGG	2	10	15478	15487	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008529	ATTAA	2	10	19332	19341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008529	GAAGG	2	10	20899	20908	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008529	TACCT	2	10	30359	30368	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008529	GACCG	2	10	30370	30379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008529	CATTG	2	10	34582	34591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008529	GATAA	2	10	42394	42403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008529	GAAAA	2	10	43498	43507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008529	TCGTG	2	10	44790	44799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008529	GGCAG	2	10	45191	45200	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008529	GGGAG	2	10	46005	46014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008529	TTGAA	2	10	47370	47379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008529	AGCAA	2	10	48393	48402	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008529	CTTTT	2	10	48606	48615	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008529	GCTTT	2	10	53744	53753	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008529	ACAAA	2	10	60714	60723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008529	ACAAA	2	10	60735	60744	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008529	TCTTA	2	10	65797	65806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008529	AAGTT	2	10	65978	65987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008529	TAAAA	2	10	76284	76293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008529	CTGCG	2	10	81407	81416	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008529	TCTTG	2	10	81461	81470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008529	TCTTT	2	10	87039	87048	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008529	GATGT	2	10	96042	96051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008529	TAAAA	2	10	106567	106576	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008529	CAAAA	2	10	114078	114087	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008529	TATGC	2	10	116453	116462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008529	ACTTT	2	10	130288	130297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008529	ATCAA	2	10	132166	132175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008529	TATTT	2	10	133434	133443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008529	TATTG	2	10	136607	136616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008529	GATGA	2	10	146342	146351	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008529	TGCTT	2	10	148577	148586	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008529	CTTCA	2	10	155530	155539	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008529	ATCTA	2	10	160039	160048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008529	ATTAT	2	10	160208	160217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008529	GAAAA	2	10	183658	183667	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008529	TGCTT	2	10	183764	183773	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008529	TCTTT	2	10	188342	188351	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008529	TATTG	2	10	201481	201490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008529	CTCAA	2	10	201757	201766	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008529	AAATT	2	10	210375	210384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008529	CAGGC	2	10	211132	211141	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008529	TAAAA	2	10	213787	213796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008529	AAAAC	2	10	215131	215140	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008529	TTAAT	2	10	216882	216891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008529	TTACT	2	10	217028	217037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008529	TGCCA	2	10	218007	218016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008529	ATTCA	2	10	218613	218622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008529	GAATT	2	10	218926	218935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008529	AGATC	2	10	219572	219581	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008529	ACGGC	2	10	225640	225649	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008529	CAAAT	2	10	232971	232980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008529	CAGTT	2	10	237735	237744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008529	GAAAA	2	10	243520	243529	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008529	CTTTT	2	10	254933	254942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008529	GAACT	2	10	259890	259899	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008529	TTGAT	2	10	260970	260979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008529	AAAAG	2	10	260994	261003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008529	TGTGA	2	10	263847	263856	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008529	GGCCG	2	10	266172	266181	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008529	AAAAG	2	10	272010	272019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008529	TAAGG	2	10	284480	284489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008529	AAGAG	2	10	297854	297863	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008529	CTCTT	2	10	297868	297877	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008529	AAAAG	2	10	297922	297931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008529	CTTTA	2	10	299575	299584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008529	CAACC	2	10	323162	323171	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_008529	CTTTT	2	10	325425	325434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008529	AGGAA	2	10	340905	340914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008529	ATCAG	2	10	359156	359165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008529	TAATG	2	10	359472	359481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008529	GACAA	2	10	360194	360203	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008529	TCTTT	2	10	377856	377865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008529	CCAGC	2	10	407278	407287	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_008529	AATAT	2	10	408215	408224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008529	TTCTA	2	10	418064	418073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008529	AAAAT	2	10	429214	429223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008529	ACTTA	2	10	429345	429354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008529	AGAGG	2	10	469980	469989	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008529	TTCAT	2	10	471137	471146	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008529	AAAAG	2	10	487609	487618	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008529	AACAA	2	10	490687	490696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008529	TTCTT	2	10	492982	492991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008529	AGGAA	2	10	494601	494610	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008529	CGGGG	2	10	508505	508514	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008529	GGGCA	2	10	510788	510797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008529	TTTTC	2	10	529261	529270	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008529	TAAAT	2	10	531605	531614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008529	AAAAG	2	10	538100	538109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008529	CTTTT	2	10	551412	551421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008529	CCGGG	2	10	559103	559112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008529	GTATA	2	10	575801	575810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008529	AATAA	2	10	575881	575890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008529	CCGGT	2	10	610973	610982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008529	AAAAT	2	10	621428	621437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008529	TTTTA	2	10	632569	632578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008529	TTTTC	2	10	658597	658606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008529	ACTTT	2	10	661427	661436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008529	ACAAA	2	10	666288	666297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008529	TCGGG	2	10	668143	668152	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008529	TAAAT	2	10	669066	669075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008529	TGCAA	2	10	669104	669113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008529	TTAGC	2	10	669219	669228	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008529	TTTTC	2	10	676670	676679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008529	AAGAA	2	10	679417	679426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008529	TGATG	2	10	681073	681082	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008529	TCGTG	2	10	684350	684359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008529	GGCAG	2	10	684751	684760	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008529	GGGAG	2	10	685805	685814	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008529	TTGAA	2	10	687170	687179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008529	ATTTT	2	10	688447	688456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008529	AAAAG	2	10	690004	690013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008529	TGTTT	2	10	690061	690070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008529	CCAAG	2	10	690337	690346	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008529	ATAGA	2	10	705320	705329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008529	CAGGC	2	10	713313	713322	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008529	AGCAA	2	10	713726	713735	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008529	CAGGC	2	10	715274	715283	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008529	AGCCG	2	10	715612	715621	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008529	GTTTT	2	10	723829	723838	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008529	AAATA	2	10	729361	729370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008529	CTTTT	2	10	729398	729407	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008529	CTTTT	2	10	733270	733279	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008529	TACAA	2	10	739151	739160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008529	CAAGC	2	10	743716	743725	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008529	TTTTA	2	10	746384	746393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008529	GTAGA	2	10	757684	757693	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008529	CAAAA	2	10	760386	760395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008529	TAAAA	2	10	767035	767044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008529	TTCGT	2	10	770055	770064	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008529	TCTTT	2	10	777271	777280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008529	GATTT	2	10	778482	778491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008529	CCCTT	2	10	787009	787018	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008529	TTTTA	2	10	787910	787919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008529	TCGTG	2	10	793571	793580	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008529	GGCAG	2	10	793972	793981	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008529	GGGAG	2	10	795024	795033	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008529	TTGAA	2	10	796389	796398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008529	TGTTT	2	10	802439	802448	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008529	GGTAA	2	10	806328	806337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008529	CAAGG	2	10	817157	817166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008529	GCCGC	2	10	817743	817752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_008529	GGCCA	2	10	818285	818294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008529	AAAAT	2	10	821504	821513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008529	ATGTG	2	10	823565	823574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008529	CTAAA	2	10	824594	824603	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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351	NC_008529	CTTTT	2	10	1811929	1811938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
352	NC_008529	CAAAA	2	10	1812849	1812858	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
353	NC_008529	AAACA	2	10	1819902	1819911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
354	NC_008529	AAAGC	2	10	1822617	1822626	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
355	NC_008529	AATAT	2	10	1825264	1825273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.