MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	TAATAT	2	12	33139	33150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008527	TGAAAA	2	12	34493	34504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008527	TAAAAT	2	12	42235	42246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008527	TAAAAA	2	12	70892	70903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008527	AATAGC	2	12	103946	103957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008527	TAAAAA	2	12	130334	130345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008527	ACCTGG	2	12	141046	141057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008527	TTATTT	2	12	163832	163843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008527	TATAAA	2	12	168065	168076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008527	TGATTT	2	12	180286	180297	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008527	TAAAAA	2	12	210268	210279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008527	TCAAAA	2	12	215190	215201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008527	TGATTG	2	12	242574	242585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008527	ATTCTA	2	12	252353	252364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008527	CTTAAC	2	12	255968	255979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008527	TTTAAC	2	12	256912	256923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008527	AAAACA	2	12	257105	257116	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008527	TGATAT	2	12	264978	264989	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008527	AAATAC	2	12	278454	278465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008527	TTTAAA	2	12	296547	296558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008527	AAGTTT	2	12	327525	327536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008527	TTGTTT	2	12	327964	327975	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008527	TAAAAT	2	12	393087	393098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008527	AAAGCT	2	12	397378	397389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008527	ATTATG	2	12	398851	398862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008527	TAAAAA	2	12	412043	412054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008527	ATGAAA	2	12	436628	436639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008527	TTTTTA	2	12	441464	441475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008527	TTGAAA	2	12	441993	442004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008527	TTTTAA	2	12	447110	447121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008527	ACACCG	2	12	447203	447214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008527	AAATTT	2	12	466014	466025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008527	TGTTTT	2	12	470286	470297	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008527	AAAATA	2	12	482903	482914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008527	TTATTT	2	12	483249	483260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008527	GCTTTT	2	12	484714	484725	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008527	TGGAAG	2	12	522887	522898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008527	GAAAAA	2	12	528218	528229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008527	AAAAAT	2	12	528263	528274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008527	GAAATT	2	12	531723	531734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008527	GGTTAA	2	12	589913	589924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008527	TGTTAA	2	12	600102	600113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008527	TATATT	2	12	617091	617102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008527	TAAATA	2	12	617464	617475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008527	AAGTAG	2	12	620792	620803	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008527	TAATTT	2	12	641508	641519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008527	ACTTGC	2	12	642000	642011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008527	GAAAAA	2	12	653235	653246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008527	AAGAAA	2	12	656942	656953	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008527	TATAAA	2	12	671588	671599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008527	GAATCA	2	12	693555	693566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008527	TTTAGT	2	12	704781	704792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008527	AAAAAT	2	12	705362	705373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008527	AATAAA	2	12	738637	738648	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008527	GTTTTT	2	12	746969	746980	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008527	AATAAA	2	12	753883	753894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008527	CCTAAG	2	12	754460	754471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008527	ATTTGA	2	12	765757	765768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008527	TTATTT	2	12	770036	770047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008527	AGAATG	2	12	775746	775757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008527	TCGCAA	2	12	782081	782092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008527	CATTGA	2	12	810756	810767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008527	TTAACT	2	12	810829	810840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008527	ATTCCA	2	12	817774	817785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008527	TTCAGG	2	12	818619	818630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008527	TCAAAA	2	12	837014	837025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008527	GGAGAA	2	12	862542	862553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008527	AGTAAC	2	12	863436	863447	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008527	AATTTA	2	12	883787	883798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008527	AAGCTT	2	12	884968	884979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008527	TACTTA	2	12	903799	903810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008527	AAAAAG	2	12	906752	906763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008527	TATAAA	2	12	915346	915357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008527	ATAACC	2	12	921573	921584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008527	TTTCTT	2	12	922670	922681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008527	ATTTTG	2	12	940213	940224	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008527	GCTTTA	2	12	942205	942216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008527	TATAAG	2	12	992041	992052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008527	GAGAAA	2	12	1015964	1015975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008527	GATTTG	2	12	1020121	1020132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008527	ATAAAA	2	12	1024863	1024874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008527	AACGGA	2	12	1072369	1072380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008527	TTAAAA	2	12	1078696	1078707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008527	AGCAAA	2	12	1081137	1081148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008527	CTTTTC	2	12	1085138	1085149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008527	TTTTCC	2	12	1138676	1138687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008527	ATAAAA	2	12	1146554	1146565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008527	TCTTTT	2	12	1146588	1146599	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008527	CTTTTT	2	12	1196409	1196420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008527	AGAAAT	2	12	1204027	1204038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008527	TTAAAT	2	12	1217293	1217304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008527	TTTTTA	2	12	1226213	1226224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008527	GCAACA	2	12	1245428	1245439	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008527	TATGAA	2	12	1246020	1246031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008527	TTATTT	2	12	1254732	1254743	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008527	TTTAAT	2	12	1271677	1271688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008527	ATAATC	2	12	1290969	1290980	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008527	TCAACT	2	12	1293237	1293248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008527	AAACCA	2	12	1296638	1296649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008527	ATAAAA	2	12	1300042	1300053	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008527	TTCATT	2	12	1302609	1302620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008527	TTTTTC	2	12	1324474	1324485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008527	ATAATG	2	12	1347325	1347336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008527	ATTTTA	2	12	1365698	1365709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008527	TAAAAA	2	12	1376607	1376618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008527	CTTTTT	2	12	1386302	1386313	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008527	TTTGAA	2	12	1401931	1401942	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008527	TCAAAT	2	12	1428984	1428995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008527	TTTATT	2	12	1431942	1431953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008527	AAAATA	2	12	1440346	1440357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008527	TTTTTA	2	12	1447057	1447068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008527	ATTTAT	2	12	1448283	1448294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008527	AATCAT	2	12	1463650	1463661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008527	TTCAAT	2	12	1472657	1472668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008527	ATATCA	2	12	1502067	1502078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008527	TTGCAT	2	12	1504731	1504742	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008527	ATATTA	2	12	1508207	1508218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008527	TAGAAA	2	12	1513439	1513450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008527	ATTTGT	2	12	1519871	1519882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008527	GCATTA	2	12	1543522	1543533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008527	TTTTTC	2	12	1561283	1561294	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008527	TATTTT	2	12	1567158	1567169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008527	ATTTAT	2	12	1570571	1570582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008527	TATATT	2	12	1577241	1577252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008527	CTTTTT	2	12	1577398	1577409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008527	TGATTT	3	18	1577561	1577578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008527	TTTTTC	2	12	1586936	1586947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008527	TTTACA	2	12	1599229	1599240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008527	TAAAAA	2	12	1610697	1610708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.