MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	TTGCTG	2	12	562	573	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116510844
2	NC_008527	TTGAAG	2	12	1771	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116510845
3	NC_008527	TGAAAG	2	12	2074	2085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116510845
4	NC_008527	ATGTTG	2	12	4558	4569	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116510846
5	NC_008527	TCAAAA	2	12	7147	7158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116510847
6	NC_008527	AAAATG	2	12	7298	7309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116510847
7	NC_008527	AAAGAT	2	12	11374	11385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116510850
8	NC_008527	TAAAAA	2	12	12893	12904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116510852
9	NC_008527	TTGACA	2	12	16877	16888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116510854
10	NC_008527	AAATCA	2	12	20250	20261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116510858
11	NC_008527	GCGTGA	2	12	24223	24234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116510861
12	NC_008527	ATCTTC	2	12	24384	24395	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116510861
13	NC_008527	TTTTAA	2	12	35083	35094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510871
14	NC_008527	TATATT	2	12	35249	35260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116510871
15	NC_008527	TGTTTG	2	12	38466	38477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116510877
16	NC_008527	GATAAT	2	12	40060	40071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116510879
17	NC_008527	TCAGAG	2	12	40279	40290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116510879
18	NC_008527	AAGGAA	2	12	40338	40349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116510879
19	NC_008527	TTCACC	2	12	44999	45010	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116510883
20	NC_008527	CTTCAA	2	12	49259	49270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116510886
21	NC_008527	TATAAA	2	12	50159	50170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116510887
22	NC_008527	GGTCAG	2	12	53222	53233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116510891
23	NC_008527	TTGCTT	2	12	55176	55187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116510893
24	NC_008527	TTGTTT	2	12	55485	55496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116510893
25	NC_008527	TCCAAG	2	12	58975	58986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116510896
26	NC_008527	ACAAGA	2	12	61143	61154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116510897
27	NC_008527	TAGGCT	2	12	61272	61283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116510898
28	NC_008527	AAGTTC	2	12	70601	70612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116510908
29	NC_008527	ATTTGC	2	12	72807	72818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116510911
30	NC_008527	AAGCAA	2	12	72911	72922	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116510911
31	NC_008527	GGGAAT	2	12	73947	73958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116510912
32	NC_008527	ATCAAA	2	12	76047	76058	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116510915
33	NC_008527	TTTTCG	2	12	77036	77047	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116510916
34	NC_008527	AAAACC	2	12	78684	78695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116510918
35	NC_008527	TGGACG	2	12	79175	79186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116510918
36	NC_008527	TGGGAC	2	12	81390	81401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116510922
37	NC_008527	CAGTTG	2	12	82252	82263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116510923
38	NC_008527	AGCTGA	2	12	85647	85658	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116510925
39	NC_008527	TTTATC	2	12	88436	88447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116510927
40	NC_008527	TGAACT	2	12	93787	93798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116510932
41	NC_008527	TATGGG	2	12	99165	99176	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116510935
42	NC_008527	TTCATA	2	12	120090	120101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116510958
43	NC_008527	ATTGCT	2	12	122119	122130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116510960
44	NC_008527	TGCAGC	2	12	122202	122213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116510960
45	NC_008527	TCATAA	2	12	125597	125608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116510967
46	NC_008527	CAAAAG	2	12	125959	125970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116510968
47	NC_008527	GTTTAA	2	12	126650	126661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116510969
48	NC_008527	CAAACC	2	12	129528	129539	50 %	0 %	0 %	50 %	116510972
49	NC_008527	ATTAAT	2	12	133668	133679	50 %	50 %	0 %	0 %	116510975
50	NC_008527	TATAAT	2	12	134103	134114	50 %	50 %	0 %	0 %	116510975
51	NC_008527	GTGACT	2	12	139722	139733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116510977
52	NC_008527	TAACTT	2	12	140093	140104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116510977
53	NC_008527	ATAATT	2	12	149475	149486	50 %	50 %	0 %	0 %	116510988
54	NC_008527	TTGCTT	2	12	155821	155832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116510995
55	NC_008527	GCTTAT	2	12	157194	157205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116510996
56	NC_008527	GTAAAG	2	12	161104	161115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116510998
57	NC_008527	GAATAC	2	12	163922	163933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511003
58	NC_008527	TTTGAA	2	12	164373	164384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116511003
59	NC_008527	TTCAGC	2	12	168694	168705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116511008
60	NC_008527	ATTGGG	2	12	169695	169706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116511008
61	NC_008527	AAATAG	2	12	172029	172040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511010
62	NC_008527	AATCGA	2	12	172484	172495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511011
63	NC_008527	TACCAT	2	12	176381	176392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116511015
64	NC_008527	ATGTTT	2	12	176432	176443	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116511015
65	NC_008527	CGAAGT	2	12	179686	179697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116511018
66	NC_008527	AGAAGT	2	12	181627	181638	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116511020
67	NC_008527	GACTTT	2	12	181702	181713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116511020
68	NC_008527	GAAGGT	2	12	187043	187054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116511028
69	NC_008527	GAAAAC	2	12	187586	187597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116511028
70	NC_008527	CTGAAT	2	12	188119	188130	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116511029
71	NC_008527	GCAAAA	2	12	188490	188501	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116511029
72	NC_008527	AAAAGC	2	12	188531	188542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116511029
73	NC_008527	TAAAAA	2	12	190846	190857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116511031
74	NC_008527	GGACTT	2	12	191674	191685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116511032
75	NC_008527	TTGCTT	2	12	193510	193521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116511034
76	NC_008527	AAGAAC	2	12	195105	195116	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116511035
77	NC_008527	GAAAAT	2	12	197127	197138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511037
78	NC_008527	GATAAG	2	12	198183	198194	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116511038
79	NC_008527	TATTGA	2	12	200400	200411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116511040
80	NC_008527	GGTTAT	2	12	200725	200736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116511041
81	NC_008527	ACTTTC	2	12	205888	205899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116511045
82	NC_008527	CTTGTT	2	12	209834	209845	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116511048
83	NC_008527	TGAAAA	2	12	212030	212041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511050
84	NC_008527	ACGTAA	2	12	228410	228421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511070
85	NC_008527	CGTAAA	2	12	228435	228446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511070
86	NC_008527	CCAGCC	2	12	231281	231292	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116511073
87	NC_008527	TGGAAT	2	12	232254	232265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116511074
88	NC_008527	AAGCTC	2	12	239722	239733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116511079
89	NC_008527	GTCATT	2	12	244680	244691	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116511081
90	NC_008527	AAGGCC	2	12	249881	249892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116511085
91	NC_008527	TAACGA	2	12	251236	251247	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511086
92	NC_008527	TGGCAT	2	12	252146	252157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116511088
93	NC_008527	TTTGAT	2	12	253785	253796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116511090
94	NC_008527	ATTTCC	2	12	264035	264046	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116511101
95	NC_008527	TGTATC	2	12	264644	264655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116511101
96	NC_008527	TGGTGC	2	12	272575	272586	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116511109
97	NC_008527	GGCTCA	2	12	272690	272701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116511109
98	NC_008527	AAAAAC	2	12	277929	277940	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116511114
99	NC_008527	GTCTTG	2	12	278073	278084	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116511114
100	NC_008527	TCAAAA	2	12	280247	280258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116511116
101	NC_008527	CTTGGT	2	12	291477	291488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116511133
102	NC_008527	TCTTTT	2	12	294240	294251	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116511137
103	NC_008527	ATTTTT	2	12	304045	304056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116511149
104	NC_008527	CCAACA	2	12	311124	311135	50 %	0 %	0 %	50 %	116511155
105	NC_008527	AACATC	2	12	312938	312949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116511157
106	NC_008527	AGGGAT	2	12	314909	314920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116511159
107	NC_008527	TTGCTG	2	12	330140	330151	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116511175
108	NC_008527	TAATTA	2	12	330741	330752	50 %	50 %	0 %	0 %	116511175
109	NC_008527	GATTTT	3	18	334540	334557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116511179
110	NC_008527	TTGCTT	2	12	335641	335652	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116511181
111	NC_008527	ATGATT	2	12	336774	336785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116511181
112	NC_008527	GAAAAT	2	12	336864	336875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511181
113	NC_008527	GAAAAA	2	12	337674	337685	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116511182
114	NC_008527	AAAAAG	2	12	342032	342043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116511187
115	NC_008527	TTTTTG	2	12	344079	344090	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116511190
116	NC_008527	ATTTTT	2	12	347030	347041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116511194
117	NC_008527	AAAATG	2	12	355753	355764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511201
118	NC_008527	AAATAA	2	12	359021	359032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116511203
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220	NC_008527	AAGTTC	2	12	606174	606185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116511435
221	NC_008527	TTGAAG	2	12	610508	610519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116511439
222	NC_008527	TAAAAA	2	12	613058	613069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116511442
223	NC_008527	ATCAGA	2	12	613421	613432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116511442
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226	NC_008527	GAATAA	2	12	636683	636694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116511466
227	NC_008527	CGTTTG	2	12	639668	639679	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116511467
228	NC_008527	TTGGAC	2	12	640560	640571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116511467
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455	NC_008527	ATGTAT	2	12	1337454	1337465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116512145
456	NC_008527	GAATTT	2	12	1338973	1338984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116512145
457	NC_008527	AACTTT	2	12	1354590	1354601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116512153
458	NC_008527	TTTCTA	2	12	1359160	1359171	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116512158
459	NC_008527	CTTTTT	2	12	1361865	1361876	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116512159
460	NC_008527	AATCAA	2	12	1365311	1365322	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116512162
461	NC_008527	GTTCCG	2	12	1367359	1367370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116512164
462	NC_008527	TAATAG	2	12	1367924	1367935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116512164
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469	NC_008527	CCAAAA	2	12	1391112	1391123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116512185
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474	NC_008527	GCAATC	2	12	1415302	1415313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116512210
475	NC_008527	ATATTA	2	12	1417890	1417901	50 %	50 %	0 %	0 %	116512212
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480	NC_008527	CCTGAT	2	12	1438667	1438678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116512231
481	NC_008527	TGATCC	2	12	1438687	1438698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116512231
482	NC_008527	GATCCA	2	12	1438706	1438717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116512231
483	NC_008527	CCTGAT	2	12	1438721	1438732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116512231
484	NC_008527	GATCCA	2	12	1438742	1438753	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116512231
485	NC_008527	AATTTT	2	12	1443612	1443623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116512236
486	NC_008527	GTTTTG	2	12	1447121	1447132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116512240
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488	NC_008527	TTGCTT	2	12	1448866	1448877	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116512242
489	NC_008527	AATATA	2	12	1453284	1453295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116512248
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493	NC_008527	ATATCG	2	12	1469264	1469275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116512263
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