MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 1987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	AAAGT	2	10	4081	4090	60 %	20 %	20 %	0 %	116510846
2	NC_008527	GTCTT	2	10	4776	4785	0 %	60 %	20 %	20 %	116510846
3	NC_008527	GAAAA	2	10	7694	7703	80 %	0 %	20 %	0 %	116510847
4	NC_008527	AAATG	2	10	12023	12032	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008527	ATGGT	2	10	12877	12886	20 %	40 %	40 %	0 %	116510852
6	NC_008527	GAAAA	2	10	14014	14023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008527	ATTTT	2	10	15279	15288	20 %	80 %	0 %	0 %	116510854
8	NC_008527	TGCGA	2	10	16534	16543	20 %	20 %	40 %	20 %	116510854
9	NC_008527	TACTT	2	10	17179	17188	20 %	60 %	0 %	20 %	116510854
10	NC_008527	TGATT	2	10	19246	19255	20 %	60 %	20 %	0 %	116510857
11	NC_008527	TTTGG	2	10	22600	22609	0 %	60 %	40 %	0 %	116510860
12	NC_008527	TGGTA	2	10	24541	24550	20 %	40 %	40 %	0 %	116510861
13	NC_008527	TAAAT	2	10	25085	25094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008527	CTTAA	2	10	25599	25608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008527	AAGTC	2	10	25740	25749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008527	TGGCT	2	10	26538	26547	0 %	40 %	40 %	20 %	116510862
17	NC_008527	ATTTT	2	10	26633	26642	20 %	80 %	0 %	0 %	116510862
18	NC_008527	AGAGA	2	10	27551	27560	60 %	0 %	40 %	0 %	116510862
19	NC_008527	CAAAA	2	10	27899	27908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008527	TATAA	2	10	35425	35434	60 %	40 %	0 %	0 %	116510871
21	NC_008527	TAGAG	2	10	36745	36754	40 %	20 %	40 %	0 %	116510874
22	NC_008527	TAAGC	2	10	37491	37500	40 %	20 %	20 %	20 %	116510875
23	NC_008527	TTTAA	2	10	37829	37838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008527	TGGAT	2	10	38054	38063	20 %	40 %	40 %	0 %	116510876
25	NC_008527	AAAAG	2	10	38520	38529	80 %	0 %	20 %	0 %	116510877
26	NC_008527	TCAAA	2	10	38688	38697	60 %	20 %	0 %	20 %	116510877
27	NC_008527	TAATC	2	10	39905	39914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008527	GTGAG	2	10	40260	40269	20 %	20 %	60 %	0 %	116510879
29	NC_008527	AGTAA	2	10	40963	40972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008527	TTTAT	2	10	41301	41310	20 %	80 %	0 %	0 %	116510880
31	NC_008527	AATTA	2	10	41675	41684	60 %	40 %	0 %	0 %	116510880
32	NC_008527	ATTAT	2	10	41948	41957	40 %	60 %	0 %	0 %	116510880
33	NC_008527	AATCA	2	10	43788	43797	60 %	20 %	0 %	20 %	116510882
34	NC_008527	TTTAA	2	10	44383	44392	40 %	60 %	0 %	0 %	116510882
35	NC_008527	GCTTG	2	10	47469	47478	0 %	40 %	40 %	20 %	116510885
36	NC_008527	TCCAT	2	10	47820	47829	20 %	40 %	0 %	40 %	116510885
37	NC_008527	AAAAT	2	10	51732	51741	80 %	20 %	0 %	0 %	116510889
38	NC_008527	AGTTT	2	10	53939	53948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008527	ATTAA	2	10	54714	54723	60 %	40 %	0 %	0 %	116510892
40	NC_008527	GTCTT	2	10	54985	54994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008527	CAAAT	2	10	57418	57427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008527	CAAGC	2	10	59822	59831	40 %	0 %	20 %	40 %	116510896
43	NC_008527	CCATT	2	10	62062	62071	20 %	40 %	0 %	40 %	116510898
44	NC_008527	TACTA	2	10	62935	62944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008527	ACAAG	2	10	63285	63294	60 %	0 %	20 %	20 %	116510900
46	NC_008527	TCCAA	2	10	63441	63450	40 %	20 %	0 %	40 %	116510900
47	NC_008527	AATAT	2	10	63685	63694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008527	TGAGT	2	10	65806	65815	20 %	40 %	40 %	0 %	116510902
49	NC_008527	TGAAA	2	10	66322	66331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008527	AATTT	2	10	68748	68757	40 %	60 %	0 %	0 %	116510906
51	NC_008527	ACTGG	2	10	69579	69588	20 %	20 %	40 %	20 %	116510907
52	NC_008527	GTAAA	2	10	71372	71381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008527	TTATT	2	10	72366	72375	20 %	80 %	0 %	0 %	116510911
54	NC_008527	TCTTT	2	10	73552	73561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008527	TTGCT	2	10	73853	73862	0 %	60 %	20 %	20 %	116510912
56	NC_008527	ACGAG	2	10	75184	75193	40 %	0 %	40 %	20 %	116510914
57	NC_008527	TGAGT	2	10	75227	75236	20 %	40 %	40 %	0 %	116510914
58	NC_008527	GCAGA	2	10	75842	75851	40 %	0 %	40 %	20 %	116510915
59	NC_008527	TTTTA	2	10	78396	78405	20 %	80 %	0 %	0 %	116510918
60	NC_008527	AAGCT	2	10	78569	78578	40 %	20 %	20 %	20 %	116510918
61	NC_008527	TGGAT	2	10	79564	79573	20 %	40 %	40 %	0 %	116510919
62	NC_008527	ATAAA	2	10	81953	81962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008527	CAAGA	2	10	82950	82959	60 %	0 %	20 %	20 %	116510924
64	NC_008527	ATAGA	2	10	83821	83830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008527	AAAGA	2	10	87439	87448	80 %	0 %	20 %	0 %	116510926
66	NC_008527	AGAGT	2	10	87849	87858	40 %	20 %	40 %	0 %	116510927
67	NC_008527	TGGTT	2	10	88522	88531	0 %	60 %	40 %	0 %	116510927
68	NC_008527	ATTTG	2	10	88857	88866	20 %	60 %	20 %	0 %	116510928
69	NC_008527	TATGA	2	10	91134	91143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008527	TCGTA	2	10	91589	91598	20 %	40 %	20 %	20 %	116510930
71	NC_008527	TTATA	2	10	92354	92363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008527	GATTT	2	10	95442	95451	20 %	60 %	20 %	0 %	116510932
73	NC_008527	TCAAA	2	10	97872	97881	60 %	20 %	0 %	20 %	116510935
74	NC_008527	TCGCA	2	10	101501	101510	20 %	20 %	20 %	40 %	116510939
75	NC_008527	TATTC	2	10	102335	102344	20 %	60 %	0 %	20 %	116510940
76	NC_008527	TTTTA	2	10	104509	104518	20 %	80 %	0 %	0 %	116510943
77	NC_008527	AATAA	2	10	105450	105459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008527	CTCTA	2	10	105666	105675	20 %	40 %	0 %	40 %	116510944
79	NC_008527	AAATG	2	10	108314	108323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008527	TATTT	2	10	108571	108580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008527	ATTTT	2	10	109152	109161	20 %	80 %	0 %	0 %	116510947
82	NC_008527	TTGTC	2	10	109532	109541	0 %	60 %	20 %	20 %	116510947
83	NC_008527	TATAT	2	10	110272	110281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008527	TAGAG	2	10	111744	111753	40 %	20 %	40 %	0 %	116510951
85	NC_008527	ATTTG	2	10	113554	113563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008527	GCTCC	2	10	113857	113866	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008527	TAAAA	2	10	113930	113939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008527	TGGAT	2	10	114059	114068	20 %	40 %	40 %	0 %	116510952
89	NC_008527	GAAGG	2	10	114138	114147	40 %	0 %	60 %	0 %	116510952
90	NC_008527	AATTA	2	10	115040	115049	60 %	40 %	0 %	0 %	116510952
91	NC_008527	ATTTT	2	10	115946	115955	20 %	80 %	0 %	0 %	116510953
92	NC_008527	TTTTC	2	10	117250	117259	0 %	80 %	0 %	20 %	116510954
93	NC_008527	CCAAA	2	10	117795	117804	60 %	0 %	0 %	40 %	116510954
94	NC_008527	TGGCT	2	10	118760	118769	0 %	40 %	40 %	20 %	116510956
95	NC_008527	CAAAT	2	10	119339	119348	60 %	20 %	0 %	20 %	116510957
96	NC_008527	TTTTA	2	10	119611	119620	20 %	80 %	0 %	0 %	116510957
97	NC_008527	TTTTA	2	10	119941	119950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008527	CAGGT	2	10	121814	121823	20 %	20 %	40 %	20 %	116510960
99	NC_008527	GTTTG	2	10	121875	121884	0 %	60 %	40 %	0 %	116510960
100	NC_008527	TTATT	2	10	123329	123338	20 %	80 %	0 %	0 %	116510963
101	NC_008527	TTTAC	2	10	123849	123858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008527	TTGTT	2	10	124796	124805	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008527	TAAAA	2	10	125176	125185	80 %	20 %	0 %	0 %	116510966
104	NC_008527	TAACA	2	10	130845	130854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008527	TTAAC	2	10	132709	132718	40 %	40 %	0 %	20 %	116510975
106	NC_008527	AAACA	2	10	133465	133474	80 %	0 %	0 %	20 %	116510975
107	NC_008527	GAAAT	2	10	134221	134230	60 %	20 %	20 %	0 %	116510975
108	NC_008527	TTCAC	2	10	136591	136600	20 %	40 %	0 %	40 %	116510975
109	NC_008527	TTCAC	2	10	136876	136885	20 %	40 %	0 %	40 %	116510975
110	NC_008527	AAGAA	2	10	137944	137953	80 %	0 %	20 %	0 %	116510975
111	NC_008527	AAAAC	2	10	138385	138394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008527	TGTTT	2	10	138418	138427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008527	AATAT	2	10	139657	139666	60 %	40 %	0 %	0 %	116510977
114	NC_008527	AAAGA	2	10	139794	139803	80 %	0 %	20 %	0 %	116510977
115	NC_008527	AAATA	2	10	140044	140053	80 %	20 %	0 %	0 %	116510977
116	NC_008527	GAAAA	2	10	140481	140490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008527	CTTCC	2	10	140621	140630	0 %	40 %	0 %	60 %	116510978
118	NC_008527	TAATT	2	10	140823	140832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008527	ATGGA	2	10	142341	142350	40 %	20 %	40 %	0 %	116510981
120	NC_008527	TACAG	2	10	142676	142685	40 %	20 %	20 %	20 %	116510981
121	NC_008527	TAATT	2	10	153078	153087	40 %	60 %	0 %	0 %	116510992
122	NC_008527	TACAA	2	10	154020	154029	60 %	20 %	0 %	20 %	116510993
123	NC_008527	TTTTA	2	10	154780	154789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008527	TGATT	2	10	156398	156407	20 %	60 %	20 %	0 %	116510995
125	NC_008527	GATTG	2	10	157790	157799	20 %	40 %	40 %	0 %	116510996
126	NC_008527	TAAAA	2	10	159795	159804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008527	AGCCA	2	10	159895	159904	40 %	0 %	20 %	40 %	116510998
128	NC_008527	TTGGC	2	10	160790	160799	0 %	40 %	40 %	20 %	116510998
129	NC_008527	AAAGT	2	10	161666	161675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008527	AATTT	2	10	161825	161834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008527	ATTTA	2	10	165133	165142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008527	CCAAA	2	10	166928	166937	60 %	0 %	0 %	40 %	116511005
133	NC_008527	GTAAA	2	10	169125	169134	60 %	20 %	20 %	0 %	116511008
134	NC_008527	AAATT	2	10	170279	170288	60 %	40 %	0 %	0 %	116511009
135	NC_008527	TAAAT	2	10	172072	172081	60 %	40 %	0 %	0 %	116511011
136	NC_008527	TCCTT	2	10	177466	177475	0 %	60 %	0 %	40 %	116511017
137	NC_008527	AAAAT	2	10	177481	177490	80 %	20 %	0 %	0 %	116511017
138	NC_008527	ACTAA	2	10	177520	177529	60 %	20 %	0 %	20 %	116511017
139	NC_008527	AAAAG	2	10	178020	178029	80 %	0 %	20 %	0 %	116511017
140	NC_008527	GAAAG	2	10	180398	180407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008527	TAAAA	2	10	183114	183123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_008527	TTTCA	2	10	324253	324262	20 %	60 %	0 %	20 %	116511168
271	NC_008527	ATTTG	2	10	325847	325856	20 %	60 %	20 %	0 %	116511170
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