MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008527	AAATG	2	10	12023	12032	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008527	GAAAA	2	10	14014	14023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008527	TAAAT	2	10	25085	25094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008527	CTTAA	2	10	25599	25608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008527	AAGTC	2	10	25740	25749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008527	CAAAA	2	10	27899	27908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008527	TTTAA	2	10	37829	37838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008527	TAATC	2	10	39905	39914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008527	AGTAA	2	10	40963	40972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008527	AGTTT	2	10	53939	53948	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008527	GTCTT	2	10	54985	54994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008527	CAAAT	2	10	57418	57427	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008527	TACTA	2	10	62935	62944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008527	AATAT	2	10	63685	63694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008527	TGAAA	2	10	66322	66331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008527	GTAAA	2	10	71372	71381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008527	TCTTT	2	10	73552	73561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008527	ATAAA	2	10	81953	81962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008527	ATAGA	2	10	83821	83830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008527	TATGA	2	10	91134	91143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008527	TTATA	2	10	92354	92363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008527	AATAA	2	10	105450	105459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008527	AAATG	2	10	108314	108323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008527	TATTT	2	10	108571	108580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008527	TATAT	2	10	110272	110281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008527	ATTTG	2	10	113554	113563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008527	GCTCC	2	10	113857	113866	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008527	TAAAA	2	10	113930	113939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008527	TTTTA	2	10	119941	119950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008527	TTTAC	2	10	123849	123858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008527	TTGTT	2	10	124796	124805	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008527	TAACA	2	10	130845	130854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008527	AAAAC	2	10	138385	138394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008527	TGTTT	2	10	138418	138427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008527	GAAAA	2	10	140481	140490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008527	TAATT	2	10	140823	140832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008527	TTTTA	2	10	154780	154789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008527	TAAAA	2	10	159795	159804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008527	AAAGT	2	10	161666	161675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008527	AATTT	2	10	161825	161834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008527	ATTTA	2	10	165133	165142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008527	GAAAG	2	10	180398	180407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008527	TAAAA	2	10	183114	183123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008527	AAAGT	2	10	185339	185348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008527	ATTAT	2	10	187678	187687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008527	TAATT	2	10	201584	201593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008527	AGTTT	2	10	213811	213820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008527	TCTAT	2	10	224465	224474	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008527	TGACT	2	10	225347	225356	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008527	TAAAA	2	10	226136	226145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008527	AAAAT	2	10	229409	229418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008527	TGAAT	2	10	229511	229520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008527	TTTTA	2	10	233207	233216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008527	TTGGC	2	10	236535	236544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008527	ATGCC	2	10	236890	236899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008527	TTCGT	2	10	237275	237284	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008527	TTGAT	2	10	237511	237520	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008527	GCTAT	2	10	239579	239588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008527	TATTT	2	10	240917	240926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008527	AAAAT	2	10	241944	241953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008527	AGAAA	2	10	242416	242425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008527	TTTAT	2	10	255625	255634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008527	CAAAG	2	10	262475	262484	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008527	AAATA	2	10	277745	277754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008527	AAATT	2	10	280510	280519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008527	ATATT	2	10	284550	284559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008527	ATTTT	2	10	286294	286303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008527	AGTTT	2	10	286615	286624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008527	AAAAG	2	10	292693	292702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008527	AAATG	2	10	302711	302720	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008527	AAATA	2	10	302815	302824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008527	AATGA	2	10	304406	304415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008527	AAAGA	2	10	307689	307698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008527	ATTGA	2	10	311694	311703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008527	CTTAT	2	10	313943	313952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008527	TAAAA	2	10	326191	326200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008527	TTTTG	2	10	346094	346103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008527	TAAAA	2	10	353310	353319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008527	TAAAT	2	10	364190	364199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008527	TAAAA	2	10	371222	371231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008527	ATATA	2	10	372173	372182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008527	CTTTC	2	10	378523	378532	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008527	ATTAA	2	10	382957	382966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008527	TATAA	2	10	384700	384709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008527	ATCAT	2	10	390037	390046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008527	CTTTG	2	10	396395	396404	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008527	TTTTA	2	10	398290	398299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008527	TAAAA	2	10	403496	403505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008527	TTATA	2	10	417326	417335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008527	AAATC	2	10	428286	428295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008527	AAAAG	2	10	445660	445669	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008527	CTTAT	2	10	445753	445762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008527	AGGTT	2	10	456752	456761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008527	CAAAC	2	10	467877	467886	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_008527	AAATA	2	10	472018	472027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008527	CTATT	2	10	474559	474568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008527	CTAAT	2	10	480598	480607	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008527	TATAG	2	10	481071	481080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008527	CTATT	2	10	482826	482835	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008527	AAAAT	2	10	483216	483225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008527	TAATT	2	10	483229	483238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008527	GAACA	2	10	485108	485117	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008527	TATGG	2	10	485528	485537	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008527	ATTTT	2	10	492063	492072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008527	TTTTG	2	10	495237	495246	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008527	TTATT	2	10	496980	496989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008527	AGGAT	2	10	497890	497899	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008527	TTGAG	2	10	507648	507657	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008527	AAATG	2	10	513452	513461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008527	TATAA	2	10	513486	513495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008527	AGGAG	2	10	518863	518872	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008527	TCGTG	2	10	519273	519282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008527	AGGGA	2	10	522781	522790	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008527	TGTAG	2	10	523258	523267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008527	ATTTT	2	10	524545	524554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008527	TTATG	2	10	530483	530492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008527	TCAAC	2	10	531805	531814	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008527	CAATC	2	10	531943	531952	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008527	ATTAA	2	10	532663	532672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008527	TAAAA	2	10	532852	532861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008527	ACAAA	2	10	541054	541063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008527	TTATT	2	10	543838	543847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008527	AGAAA	2	10	545876	545885	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008527	ATTAT	2	10	567516	567525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008527	CTATT	2	10	571952	571961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008527	TTTGT	2	10	572599	572608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008527	AATTC	2	10	574066	574075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008527	ATTCA	2	10	575643	575652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008527	AAAAT	2	10	580246	580255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008527	ATAAA	2	10	582499	582508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008527	GCTTA	2	10	585269	585278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008527	ATTAT	2	10	589832	589841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008527	TTATG	2	10	596023	596032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008527	ATATT	2	10	600855	600864	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008527	AATTA	2	10	609590	609599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008527	AAAGG	2	10	609605	609614	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008527	ATATA	2	10	615496	615505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008527	CTAGA	2	10	620701	620710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008527	TTCAG	2	10	623286	623295	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008527	TTCAT	2	10	623350	623359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008527	CTCTT	2	10	626198	626207	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008527	AAATA	2	10	630399	630408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008527	TGATA	2	10	630500	630509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008527	AAAAT	2	10	634247	634256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008527	AAGGA	2	10	641737	641746	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008527	GATGC	2	10	643172	643181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_008527	GGGTT	2	10	652861	652870	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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