MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 7362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	116493575
2	NC_008526	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	116493575
3	NC_008526	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	116493575
4	NC_008526	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	116493575
5	NC_008526	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	116493575
6	NC_008526	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	116493575
7	NC_008526	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	116493575
8	NC_008526	AAAC	2	8	1453	1460	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008526	CTAA	2	8	2739	2746	50 %	25 %	0 %	25 %	116493576
10	NC_008526	TAAT	2	8	3240	3247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008526	GGCC	2	8	3499	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	116493577
12	NC_008526	AATC	2	8	3650	3657	50 %	25 %	0 %	25 %	116493578
13	NC_008526	TGAC	2	8	4070	4077	25 %	25 %	25 %	25 %	116493578
14	NC_008526	AAGA	2	8	4906	4913	75 %	0 %	25 %	0 %	116493579
15	NC_008526	CCAG	2	8	4958	4965	25 %	0 %	25 %	50 %	116493579
16	NC_008526	GCTG	2	8	5088	5095	0 %	25 %	50 %	25 %	116493579
17	NC_008526	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	116493579
18	NC_008526	TGTT	2	8	6827	6834	0 %	75 %	25 %	0 %	116493579
19	NC_008526	TTGA	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	116493579
20	NC_008526	ATGA	2	8	7076	7083	50 %	25 %	25 %	0 %	116493580
21	NC_008526	GATT	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	116493580
22	NC_008526	CGGT	2	8	7446	7453	0 %	25 %	50 %	25 %	116493580
23	NC_008526	CTTG	2	8	8683	8690	0 %	50 %	25 %	25 %	116493580
24	NC_008526	ACGG	2	8	9085	9092	25 %	0 %	50 %	25 %	116493580
25	NC_008526	TTTG	2	8	9625	9632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008526	TTTC	2	8	9813	9820	0 %	75 %	0 %	25 %	116493581
27	NC_008526	GACA	2	8	9984	9991	50 %	0 %	25 %	25 %	116493581
28	NC_008526	ATCA	2	8	10309	10316	50 %	25 %	0 %	25 %	116493581
29	NC_008526	GCAA	2	8	10441	10448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008526	TTGG	2	8	10835	10842	0 %	50 %	50 %	0 %	116493582
31	NC_008526	CGTA	2	8	11656	11663	25 %	25 %	25 %	25 %	116493584
32	NC_008526	AACC	2	8	11824	11831	50 %	0 %	0 %	50 %	116493584
33	NC_008526	AAAT	2	8	12607	12614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008526	GCTG	2	8	12806	12813	0 %	25 %	50 %	25 %	116493586
35	NC_008526	CAAT	2	8	13246	13253	50 %	25 %	0 %	25 %	116493586
36	NC_008526	ACTT	2	8	13686	13693	25 %	50 %	0 %	25 %	116493586
37	NC_008526	CTGG	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	116493586
38	NC_008526	TTCT	2	8	14532	14539	0 %	75 %	0 %	25 %	116493586
39	NC_008526	CAAT	2	8	14570	14577	50 %	25 %	0 %	25 %	116493586
40	NC_008526	CTAA	2	8	16523	16530	50 %	25 %	0 %	25 %	116493590
41	NC_008526	ACAA	2	8	16956	16963	75 %	0 %	0 %	25 %	116493591
42	NC_008526	AAAG	2	8	17134	17141	75 %	0 %	25 %	0 %	116493591
43	NC_008526	TGTT	2	8	17353	17360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008526	AAGC	2	8	17412	17419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008526	GACT	2	8	17710	17717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008526	AAAC	2	8	17796	17803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008526	TAAT	2	8	19234	19241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008526	ACAG	2	8	19761	19768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008526	AAGA	2	8	19999	20006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008526	GGTA	2	8	20161	20168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008526	CAAC	2	8	20706	20713	50 %	0 %	0 %	50 %	116493594
52	NC_008526	CAAA	2	8	22382	22389	75 %	0 %	0 %	25 %	116493595
53	NC_008526	AGAC	2	8	22701	22708	50 %	0 %	25 %	25 %	116493595
54	NC_008526	AAGA	2	8	23124	23131	75 %	0 %	25 %	0 %	116493595
55	NC_008526	CTGC	2	8	23891	23898	0 %	25 %	25 %	50 %	116493595
56	NC_008526	AGCC	2	8	24524	24531	25 %	0 %	25 %	50 %	116493596
57	NC_008526	TTAC	2	8	25297	25304	25 %	50 %	0 %	25 %	116493597
58	NC_008526	TGGT	2	8	25403	25410	0 %	50 %	50 %	0 %	116493597
59	NC_008526	AATT	2	8	25759	25766	50 %	50 %	0 %	0 %	116493598
60	NC_008526	ATTT	2	8	26193	26200	25 %	75 %	0 %	0 %	116493598
61	NC_008526	GGTT	2	8	26420	26427	0 %	50 %	50 %	0 %	116493598
62	NC_008526	ATTG	2	8	26739	26746	25 %	50 %	25 %	0 %	116493599
63	NC_008526	TGCC	2	8	27308	27315	0 %	25 %	25 %	50 %	116493600
64	NC_008526	GCAA	2	8	27601	27608	50 %	0 %	25 %	25 %	116493600
65	NC_008526	ATTT	2	8	28256	28263	25 %	75 %	0 %	0 %	116493601
66	NC_008526	ATGA	2	8	28536	28543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008526	AGCA	2	8	29145	29152	50 %	0 %	25 %	25 %	116493602
68	NC_008526	AAGC	2	8	30302	30309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008526	GCAA	2	8	30480	30487	50 %	0 %	25 %	25 %	116493604
70	NC_008526	TTCA	2	8	31482	31489	25 %	50 %	0 %	25 %	116493604
71	NC_008526	AGCA	2	8	31808	31815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008526	ATTT	2	8	31856	31863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008526	GATT	2	8	33635	33642	25 %	50 %	25 %	0 %	116493607
74	NC_008526	AAGG	2	8	33717	33724	50 %	0 %	50 %	0 %	116493607
75	NC_008526	GCCG	2	8	34287	34294	0 %	0 %	50 %	50 %	116493607
76	NC_008526	AGAA	2	8	34626	34633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008526	TACT	2	8	35840	35847	25 %	50 %	0 %	25 %	116493609
78	NC_008526	TATT	2	8	36316	36323	25 %	75 %	0 %	0 %	116493610
79	NC_008526	TAGT	2	8	36815	36822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008526	TAGT	2	8	38003	38010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008526	CCCA	2	8	39773	39780	25 %	0 %	0 %	75 %	116493615
82	NC_008526	CGAA	2	8	39985	39992	50 %	0 %	25 %	25 %	116493615
83	NC_008526	GCTG	2	8	40421	40428	0 %	25 %	50 %	25 %	116493615
84	NC_008526	GATT	2	8	40613	40620	25 %	50 %	25 %	0 %	116493615
85	NC_008526	AACC	2	8	41214	41221	50 %	0 %	0 %	50 %	116493616
86	NC_008526	ATAG	2	8	41752	41759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008526	TTAT	2	8	42940	42947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008526	ACAT	2	8	43044	43051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008526	CGAT	2	8	43175	43182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008526	ATGA	2	8	43270	43277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008526	TCAT	2	8	44612	44619	25 %	50 %	0 %	25 %	116493620
92	NC_008526	AATC	2	8	44928	44935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008526	ATCC	2	8	45048	45055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008526	CAAT	2	8	45133	45140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008526	GTCA	2	8	45434	45441	25 %	25 %	25 %	25 %	116493621
96	NC_008526	AATG	2	8	45665	45672	50 %	25 %	25 %	0 %	116493622
97	NC_008526	TAAT	2	8	45805	45812	50 %	50 %	0 %	0 %	116493622
98	NC_008526	GAAA	2	8	46046	46053	75 %	0 %	25 %	0 %	116493622
99	NC_008526	AAAT	2	8	46087	46094	75 %	25 %	0 %	0 %	116493622
100	NC_008526	CAAA	2	8	46285	46292	75 %	0 %	0 %	25 %	116493622
101	NC_008526	AAAG	2	8	46343	46350	75 %	0 %	25 %	0 %	116493622
102	NC_008526	TCAA	2	8	49875	49882	50 %	25 %	0 %	25 %	116493626
103	NC_008526	CGCT	2	8	50067	50074	0 %	25 %	25 %	50 %	116493626
104	NC_008526	CTAT	2	8	50339	50346	25 %	50 %	0 %	25 %	116493627
105	NC_008526	CTAG	2	8	50561	50568	25 %	25 %	25 %	25 %	116493627
106	NC_008526	ACTA	2	8	50846	50853	50 %	25 %	0 %	25 %	116493628
107	NC_008526	AAAT	2	8	51189	51196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008526	TAGG	2	8	51227	51234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008526	TGAT	2	8	51962	51969	25 %	50 %	25 %	0 %	116493629
110	NC_008526	CAAA	2	8	52023	52030	75 %	0 %	0 %	25 %	116493629
111	NC_008526	AAAT	2	8	52332	52339	75 %	25 %	0 %	0 %	116493629
112	NC_008526	TATT	2	8	52942	52949	25 %	75 %	0 %	0 %	116493629
113	NC_008526	TTGA	2	8	53239	53246	25 %	50 %	25 %	0 %	116493629
114	NC_008526	AACA	2	8	53339	53346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008526	TGAA	2	8	53518	53525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008526	TGAA	2	8	53560	53567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008526	CCGC	2	8	53662	53669	0 %	0 %	25 %	75 %	116493630
118	NC_008526	TGAG	2	8	54385	54392	25 %	25 %	50 %	0 %	116493630
119	NC_008526	TGCG	2	8	54993	55000	0 %	25 %	50 %	25 %	116493630
120	NC_008526	GTTA	2	8	55201	55208	25 %	50 %	25 %	0 %	116493631
121	NC_008526	TTTG	2	8	55511	55518	0 %	75 %	25 %	0 %	116493631
122	NC_008526	GTGC	2	8	55691	55698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008526	GTCA	2	8	55901	55908	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
124	NC_008526	GTTC	2	8	56373	56380	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
125	NC_008526	GTTG	2	8	56902	56909	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
126	NC_008526	TTAA	2	8	57147	57154	50 %	50 %	0 %	0 %	116493632
127	NC_008526	TGGC	2	8	57195	57202	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
128	NC_008526	TAGC	2	8	57304	57311	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
129	NC_008526	GCTG	2	8	57361	57368	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
130	NC_008526	CTGT	2	8	57576	57583	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
131	NC_008526	AGGT	2	8	57693	57700	25 %	25 %	50 %	0 %	116493632
132	NC_008526	TTGG	2	8	57875	57882	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
133	NC_008526	TCGT	2	8	58219	58226	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
134	NC_008526	CAGT	2	8	58783	58790	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
135	NC_008526	CTTT	2	8	58849	58856	0 %	75 %	0 %	25 %	116493632
136	NC_008526	GGAA	2	8	59807	59814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008526	TAAG	2	8	60127	60134	50 %	25 %	25 %	0 %	116493634
138	NC_008526	TAAA	2	8	60320	60327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008526	GTTG	2	8	60458	60465	0 %	50 %	50 %	0 %	116493635
140	NC_008526	GACA	2	8	60575	60582	50 %	0 %	25 %	25 %	116493635
141	NC_008526	CATC	2	8	60646	60653	25 %	25 %	0 %	50 %	116493635
142	NC_008526	ATTG	2	8	62206	62213	25 %	50 %	25 %	0 %	116493637
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144	NC_008526	GACA	2	8	63715	63722	50 %	0 %	25 %	25 %	116493638
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