MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 5939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	116493575
2	NC_008526	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	116493575
3	NC_008526	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	116493575
4	NC_008526	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	116493575
5	NC_008526	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	116493575
6	NC_008526	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	116493575
7	NC_008526	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	116493575
8	NC_008526	CTAA	2	8	2739	2746	50 %	25 %	0 %	25 %	116493576
9	NC_008526	GGCC	2	8	3499	3506	0 %	0 %	50 %	50 %	116493577
10	NC_008526	AATC	2	8	3650	3657	50 %	25 %	0 %	25 %	116493578
11	NC_008526	TGAC	2	8	4070	4077	25 %	25 %	25 %	25 %	116493578
12	NC_008526	AAGA	2	8	4906	4913	75 %	0 %	25 %	0 %	116493579
13	NC_008526	CCAG	2	8	4958	4965	25 %	0 %	25 %	50 %	116493579
14	NC_008526	GCTG	2	8	5088	5095	0 %	25 %	50 %	25 %	116493579
15	NC_008526	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	116493579
16	NC_008526	TGTT	2	8	6827	6834	0 %	75 %	25 %	0 %	116493579
17	NC_008526	TTGA	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	116493579
18	NC_008526	ATGA	2	8	7076	7083	50 %	25 %	25 %	0 %	116493580
19	NC_008526	GATT	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	116493580
20	NC_008526	CGGT	2	8	7446	7453	0 %	25 %	50 %	25 %	116493580
21	NC_008526	CTTG	2	8	8683	8690	0 %	50 %	25 %	25 %	116493580
22	NC_008526	ACGG	2	8	9085	9092	25 %	0 %	50 %	25 %	116493580
23	NC_008526	TTTC	2	8	9813	9820	0 %	75 %	0 %	25 %	116493581
24	NC_008526	GACA	2	8	9984	9991	50 %	0 %	25 %	25 %	116493581
25	NC_008526	ATCA	2	8	10309	10316	50 %	25 %	0 %	25 %	116493581
26	NC_008526	TTGG	2	8	10835	10842	0 %	50 %	50 %	0 %	116493582
27	NC_008526	CGTA	2	8	11656	11663	25 %	25 %	25 %	25 %	116493584
28	NC_008526	AACC	2	8	11824	11831	50 %	0 %	0 %	50 %	116493584
29	NC_008526	GCTG	2	8	12806	12813	0 %	25 %	50 %	25 %	116493586
30	NC_008526	CAAT	2	8	13246	13253	50 %	25 %	0 %	25 %	116493586
31	NC_008526	ACTT	2	8	13686	13693	25 %	50 %	0 %	25 %	116493586
32	NC_008526	CTGG	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	116493586
33	NC_008526	TTCT	2	8	14532	14539	0 %	75 %	0 %	25 %	116493586
34	NC_008526	CAAT	2	8	14570	14577	50 %	25 %	0 %	25 %	116493586
35	NC_008526	CTAA	2	8	16523	16530	50 %	25 %	0 %	25 %	116493590
36	NC_008526	ACAA	2	8	16956	16963	75 %	0 %	0 %	25 %	116493591
37	NC_008526	AAAG	2	8	17134	17141	75 %	0 %	25 %	0 %	116493591
38	NC_008526	CAAC	2	8	20706	20713	50 %	0 %	0 %	50 %	116493594
39	NC_008526	CAAA	2	8	22382	22389	75 %	0 %	0 %	25 %	116493595
40	NC_008526	AGAC	2	8	22701	22708	50 %	0 %	25 %	25 %	116493595
41	NC_008526	AAGA	2	8	23124	23131	75 %	0 %	25 %	0 %	116493595
42	NC_008526	CTGC	2	8	23891	23898	0 %	25 %	25 %	50 %	116493595
43	NC_008526	AGCC	2	8	24524	24531	25 %	0 %	25 %	50 %	116493596
44	NC_008526	TTAC	2	8	25297	25304	25 %	50 %	0 %	25 %	116493597
45	NC_008526	TGGT	2	8	25403	25410	0 %	50 %	50 %	0 %	116493597
46	NC_008526	AATT	2	8	25759	25766	50 %	50 %	0 %	0 %	116493598
47	NC_008526	ATTT	2	8	26193	26200	25 %	75 %	0 %	0 %	116493598
48	NC_008526	GGTT	2	8	26420	26427	0 %	50 %	50 %	0 %	116493598
49	NC_008526	ATTG	2	8	26739	26746	25 %	50 %	25 %	0 %	116493599
50	NC_008526	TGCC	2	8	27308	27315	0 %	25 %	25 %	50 %	116493600
51	NC_008526	GCAA	2	8	27601	27608	50 %	0 %	25 %	25 %	116493600
52	NC_008526	ATTT	2	8	28256	28263	25 %	75 %	0 %	0 %	116493601
53	NC_008526	AGCA	2	8	29145	29152	50 %	0 %	25 %	25 %	116493602
54	NC_008526	GCAA	2	8	30480	30487	50 %	0 %	25 %	25 %	116493604
55	NC_008526	TTCA	2	8	31482	31489	25 %	50 %	0 %	25 %	116493604
56	NC_008526	GATT	2	8	33635	33642	25 %	50 %	25 %	0 %	116493607
57	NC_008526	AAGG	2	8	33717	33724	50 %	0 %	50 %	0 %	116493607
58	NC_008526	GCCG	2	8	34287	34294	0 %	0 %	50 %	50 %	116493607
59	NC_008526	TACT	2	8	35840	35847	25 %	50 %	0 %	25 %	116493609
60	NC_008526	TATT	2	8	36316	36323	25 %	75 %	0 %	0 %	116493610
61	NC_008526	CCCA	2	8	39773	39780	25 %	0 %	0 %	75 %	116493615
62	NC_008526	CGAA	2	8	39985	39992	50 %	0 %	25 %	25 %	116493615
63	NC_008526	GCTG	2	8	40421	40428	0 %	25 %	50 %	25 %	116493615
64	NC_008526	GATT	2	8	40613	40620	25 %	50 %	25 %	0 %	116493615
65	NC_008526	AACC	2	8	41214	41221	50 %	0 %	0 %	50 %	116493616
66	NC_008526	TCAT	2	8	44612	44619	25 %	50 %	0 %	25 %	116493620
67	NC_008526	GTCA	2	8	45434	45441	25 %	25 %	25 %	25 %	116493621
68	NC_008526	AATG	2	8	45665	45672	50 %	25 %	25 %	0 %	116493622
69	NC_008526	TAAT	2	8	45805	45812	50 %	50 %	0 %	0 %	116493622
70	NC_008526	GAAA	2	8	46046	46053	75 %	0 %	25 %	0 %	116493622
71	NC_008526	AAAT	2	8	46087	46094	75 %	25 %	0 %	0 %	116493622
72	NC_008526	CAAA	2	8	46285	46292	75 %	0 %	0 %	25 %	116493622
73	NC_008526	AAAG	2	8	46343	46350	75 %	0 %	25 %	0 %	116493622
74	NC_008526	TCAA	2	8	49875	49882	50 %	25 %	0 %	25 %	116493626
75	NC_008526	CGCT	2	8	50067	50074	0 %	25 %	25 %	50 %	116493626
76	NC_008526	CTAT	2	8	50339	50346	25 %	50 %	0 %	25 %	116493627
77	NC_008526	CTAG	2	8	50561	50568	25 %	25 %	25 %	25 %	116493627
78	NC_008526	ACTA	2	8	50846	50853	50 %	25 %	0 %	25 %	116493628
79	NC_008526	TGAT	2	8	51962	51969	25 %	50 %	25 %	0 %	116493629
80	NC_008526	CAAA	2	8	52023	52030	75 %	0 %	0 %	25 %	116493629
81	NC_008526	AAAT	2	8	52332	52339	75 %	25 %	0 %	0 %	116493629
82	NC_008526	TATT	2	8	52942	52949	25 %	75 %	0 %	0 %	116493629
83	NC_008526	TTGA	2	8	53239	53246	25 %	50 %	25 %	0 %	116493629
84	NC_008526	CCGC	2	8	53662	53669	0 %	0 %	25 %	75 %	116493630
85	NC_008526	TGAG	2	8	54385	54392	25 %	25 %	50 %	0 %	116493630
86	NC_008526	TGCG	2	8	54993	55000	0 %	25 %	50 %	25 %	116493630
87	NC_008526	GTTA	2	8	55201	55208	25 %	50 %	25 %	0 %	116493631
88	NC_008526	TTTG	2	8	55511	55518	0 %	75 %	25 %	0 %	116493631
89	NC_008526	GTCA	2	8	55901	55908	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
90	NC_008526	GTTC	2	8	56373	56380	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
91	NC_008526	GTTG	2	8	56902	56909	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
92	NC_008526	TTAA	2	8	57147	57154	50 %	50 %	0 %	0 %	116493632
93	NC_008526	TGGC	2	8	57195	57202	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
94	NC_008526	TAGC	2	8	57304	57311	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
95	NC_008526	GCTG	2	8	57361	57368	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
96	NC_008526	CTGT	2	8	57576	57583	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
97	NC_008526	AGGT	2	8	57693	57700	25 %	25 %	50 %	0 %	116493632
98	NC_008526	TTGG	2	8	57875	57882	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
99	NC_008526	TCGT	2	8	58219	58226	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
100	NC_008526	CAGT	2	8	58783	58790	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
101	NC_008526	CTTT	2	8	58849	58856	0 %	75 %	0 %	25 %	116493632
102	NC_008526	TAAG	2	8	60127	60134	50 %	25 %	25 %	0 %	116493634
103	NC_008526	GTTG	2	8	60458	60465	0 %	50 %	50 %	0 %	116493635
104	NC_008526	GACA	2	8	60575	60582	50 %	0 %	25 %	25 %	116493635
105	NC_008526	CATC	2	8	60646	60653	25 %	25 %	0 %	50 %	116493635
106	NC_008526	ATTG	2	8	62206	62213	25 %	50 %	25 %	0 %	116493637
107	NC_008526	ATCA	2	8	62244	62251	50 %	25 %	0 %	25 %	116493637
108	NC_008526	GACA	2	8	63715	63722	50 %	0 %	25 %	25 %	116493638
109	NC_008526	AGCA	2	8	66243	66250	50 %	0 %	25 %	25 %	116493642
110	NC_008526	GTGA	2	8	66282	66289	25 %	25 %	50 %	0 %	116493642
111	NC_008526	AGCA	2	8	66739	66746	50 %	0 %	25 %	25 %	116493642
112	NC_008526	GGCA	2	8	66763	66770	25 %	0 %	50 %	25 %	116493642
113	NC_008526	CCTA	2	8	66778	66785	25 %	25 %	0 %	50 %	116493642
114	NC_008526	GATG	2	8	67283	67290	25 %	25 %	50 %	0 %	116493642
115	NC_008526	TAAA	2	8	67598	67605	75 %	25 %	0 %	0 %	116493642
116	NC_008526	TTGC	2	8	67668	67675	0 %	50 %	25 %	25 %	116493643
117	NC_008526	ATCG	2	8	68197	68204	25 %	25 %	25 %	25 %	116493644
118	NC_008526	CTGA	2	8	69001	69008	25 %	25 %	25 %	25 %	116493645
119	NC_008526	CTAC	2	8	69087	69094	25 %	25 %	0 %	50 %	116493645
120	NC_008526	TGCC	2	8	70045	70052	0 %	25 %	25 %	50 %	116493646
121	NC_008526	TTGT	2	8	70054	70061	0 %	75 %	25 %	0 %	116493646
122	NC_008526	AAGT	2	8	70410	70417	50 %	25 %	25 %	0 %	116493646
123	NC_008526	GCAA	2	8	71590	71597	50 %	0 %	25 %	25 %	116493647
124	NC_008526	GCCA	2	8	72058	72065	25 %	0 %	25 %	50 %	116493648
125	NC_008526	GATA	2	8	72282	72289	50 %	25 %	25 %	0 %	116493648
126	NC_008526	TGCT	2	8	72370	72377	0 %	50 %	25 %	25 %	116493648
127	NC_008526	CTTT	2	8	72530	72537	0 %	75 %	0 %	25 %	116493649
128	NC_008526	AATT	2	8	72547	72554	50 %	50 %	0 %	0 %	116493649
129	NC_008526	GTTT	2	8	73220	73227	0 %	75 %	25 %	0 %	116493649
130	NC_008526	AATC	2	8	73394	73401	50 %	25 %	0 %	25 %	116493650
131	NC_008526	CAAG	2	8	73730	73737	50 %	0 %	25 %	25 %	116493650
132	NC_008526	AAGC	2	8	74126	74133	50 %	0 %	25 %	25 %	116493650
133	NC_008526	TTAT	2	8	76066	76073	25 %	75 %	0 %	0 %	116493651
134	NC_008526	GTTT	2	8	76511	76518	0 %	75 %	25 %	0 %	116493652
135	NC_008526	GCGA	2	8	78332	78339	25 %	0 %	50 %	25 %	116493653
136	NC_008526	TGGT	2	8	78378	78385	0 %	50 %	50 %	0 %	116493653
137	NC_008526	TTGA	2	8	78393	78400	25 %	50 %	25 %	0 %	116493653
138	NC_008526	CTGG	2	8	78818	78825	0 %	25 %	50 %	25 %	116493653
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