MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 38752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008526	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008526	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
4	NC_008526	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493575
5	NC_008526	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
6	NC_008526	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493575
7	NC_008526	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493575
8	NC_008526	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493575
9	NC_008526	TAA	2	6	590	595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493575
10	NC_008526	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493575
11	NC_008526	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493575
12	NC_008526	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
13	NC_008526	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493575
14	NC_008526	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493575
15	NC_008526	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
16	NC_008526	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493575
17	NC_008526	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493575
18	NC_008526	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008526	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008526	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493576
21	NC_008526	AAC	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
22	NC_008526	AAT	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493576
23	NC_008526	TCA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
24	NC_008526	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
25	NC_008526	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
26	NC_008526	GAA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493576
27	NC_008526	CAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493576
28	NC_008526	GCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493576
29	NC_008526	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493576
30	NC_008526	TCA	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493576
31	NC_008526	AGC	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008526	TGA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008526	TTG	2	6	2958	2963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008526	AAT	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008526	AGT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008526	GAC	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008526	ACA	2	6	3323	3328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493577
38	NC_008526	GAG	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493577
39	NC_008526	GAT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493577
40	NC_008526	TGC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493578
41	NC_008526	ACA	2	6	3583	3588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
42	NC_008526	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
43	NC_008526	TCA	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
44	NC_008526	AAC	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
45	NC_008526	GCG	2	6	3918	3923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493578
46	NC_008526	AGC	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
47	NC_008526	AGC	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
48	NC_008526	ATC	2	6	4034	4039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
49	NC_008526	GTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
50	NC_008526	TGC	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493578
51	NC_008526	AGC	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493578
52	NC_008526	GAT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493578
53	NC_008526	GTT	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
54	NC_008526	CAA	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493578
55	NC_008526	CAC	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493578
56	NC_008526	TGT	2	6	4481	4486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493578
57	NC_008526	ACC	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493578
58	NC_008526	ATC	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493578
59	NC_008526	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493578
60	NC_008526	TGA	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008526	AGG	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008526	GGC	2	6	4941	4946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
63	NC_008526	ATG	2	6	4952	4957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
64	NC_008526	AGC	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493579
65	NC_008526	CAT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493579
66	NC_008526	TGA	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
67	NC_008526	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493579
68	NC_008526	GGT	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
69	NC_008526	CGG	4	12	5247	5258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
70	NC_008526	GTG	2	6	5342	5347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
71	NC_008526	TAC	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493579
72	NC_008526	GAT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
73	NC_008526	ACC	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493579
74	NC_008526	GGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
75	NC_008526	TTG	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493579
76	NC_008526	CAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
77	NC_008526	GGC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
78	NC_008526	GAT	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
79	NC_008526	GAT	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493579
80	NC_008526	CGG	2	6	5906	5911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
81	NC_008526	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
82	NC_008526	GGC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493579
83	NC_008526	ACA	2	6	6173	6178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
84	NC_008526	ATT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493579
85	NC_008526	TCG	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493579
86	NC_008526	TGG	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493579
87	NC_008526	GAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493579
88	NC_008526	TTG	2	6	6469	6474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493579
89	NC_008526	GCC	2	6	6537	6542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493579
90	NC_008526	GAA	2	6	6592	6597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493579
91	NC_008526	GCC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493579
92	NC_008526	GAC	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493579
93	NC_008526	AAC	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493579
94	NC_008526	GAG	2	6	6902	6907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008526	GAT	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
96	NC_008526	CGG	2	6	7058	7063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493580
97	NC_008526	AAG	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493580
98	NC_008526	TTG	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493580
99	NC_008526	TGC	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493580
100	NC_008526	CAA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493580
101	NC_008526	ATG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
102	NC_008526	GTT	2	6	7391	7396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493580
103	NC_008526	GAC	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
104	NC_008526	CCG	2	6	7469	7474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493580
105	NC_008526	CGG	2	6	7579	7584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493580
106	NC_008526	TGG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493580
107	NC_008526	ATC	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
108	NC_008526	TCG	2	6	8005	8010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493580
109	NC_008526	TGA	2	6	8089	8094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
110	NC_008526	ATC	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
111	NC_008526	AGC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
112	NC_008526	TCA	2	6	8311	8316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
113	NC_008526	ATC	2	6	8318	8323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
114	NC_008526	AGA	2	6	8346	8351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493580
115	NC_008526	AAG	2	6	8427	8432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493580
116	NC_008526	TCA	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493580
117	NC_008526	ATG	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
118	NC_008526	ATG	2	6	8580	8585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
119	NC_008526	CTT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493580
120	NC_008526	CAA	2	6	8602	8607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493580
121	NC_008526	GCA	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
122	NC_008526	ATG	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493580
123	NC_008526	TCT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493580
124	NC_008526	GTT	2	6	8783	8788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493580
125	NC_008526	GCA	2	6	8823	8828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
126	NC_008526	AAT	2	6	8870	8875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493580
127	NC_008526	CAC	2	6	9181	9186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493580
128	NC_008526	GAC	2	6	9305	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
129	NC_008526	CGA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
130	NC_008526	GCA	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
131	NC_008526	CTG	2	6	9408	9413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493580
132	NC_008526	GCA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493580
133	NC_008526	AAT	2	6	9537	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493580
134	NC_008526	TAA	2	6	9544	9549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008526	GAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493581
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137	NC_008526	TAA	2	6	9876	9881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493581
138	NC_008526	TGA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493581
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142	NC_008526	TCC	2	6	10357	10362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008526	AGA	2	6	10455	10460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008526	TGC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008526	AGG	2	6	10519	10524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008526	TTG	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493582
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155	NC_008526	CGC	2	6	10975	10980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_008526	ATC	2	6	11122	11127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493583
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184	NC_008526	ATT	2	6	12754	12759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_008526	ATT	2	6	15691	15696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_008526	ATA	2	6	15889	15894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_008526	TCA	2	6	34569	34574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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