MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 2630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008526	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	116493575
3	NC_008526	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	116493575
4	NC_008526	AT	4	8	1573	1580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008526	GC	4	8	4111	4118	0 %	0 %	50 %	50 %	116493578
6	NC_008526	GC	3	6	4285	4290	0 %	0 %	50 %	50 %	116493578
7	NC_008526	GC	3	6	5565	5570	0 %	0 %	50 %	50 %	116493579
8	NC_008526	AT	3	6	6576	6581	50 %	50 %	0 %	0 %	116493579
9	NC_008526	AT	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	116493580
10	NC_008526	GC	3	6	9676	9681	0 %	0 %	50 %	50 %	116493581
11	NC_008526	TG	3	6	10303	10308	0 %	50 %	50 %	0 %	116493581
12	NC_008526	GT	3	6	10682	10687	0 %	50 %	50 %	0 %	116493582
13	NC_008526	TG	3	6	11569	11574	0 %	50 %	50 %	0 %	116493584
14	NC_008526	AT	3	6	12170	12175	50 %	50 %	0 %	0 %	116493585
15	NC_008526	CG	3	6	12502	12507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008526	TA	3	6	12694	12699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008526	CA	3	6	13650	13655	50 %	0 %	0 %	50 %	116493586
18	NC_008526	TG	3	6	15542	15547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008526	GA	3	6	15616	15621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008526	AT	3	6	16210	16215	50 %	50 %	0 %	0 %	116493589
21	NC_008526	TC	3	6	17459	17464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008526	TG	3	6	17563	17568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008526	AG	3	6	18050	18055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008526	CA	3	6	18358	18363	50 %	0 %	0 %	50 %	116493592
25	NC_008526	GT	3	6	19061	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008526	AT	3	6	19240	19245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008526	AC	3	6	19284	19289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008526	GA	3	6	22153	22158	50 %	0 %	50 %	0 %	116493595
29	NC_008526	GC	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	116493595
30	NC_008526	GC	3	6	23066	23071	0 %	0 %	50 %	50 %	116493595
31	NC_008526	AT	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	116493596
32	NC_008526	TG	3	6	24884	24889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008526	TG	3	6	26062	26067	0 %	50 %	50 %	0 %	116493598
34	NC_008526	GT	3	6	27760	27765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008526	CG	3	6	28332	28337	0 %	0 %	50 %	50 %	116493601
36	NC_008526	TG	3	6	28930	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	116493602
37	NC_008526	GT	3	6	29065	29070	0 %	50 %	50 %	0 %	116493602
38	NC_008526	CT	3	6	29356	29361	0 %	50 %	0 %	50 %	116493602
39	NC_008526	CG	3	6	29468	29473	0 %	0 %	50 %	50 %	116493602
40	NC_008526	CA	3	6	30417	30422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008526	TC	3	6	31097	31102	0 %	50 %	0 %	50 %	116493604
42	NC_008526	TA	3	6	31934	31939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008526	AG	3	6	32381	32386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008526	CG	3	6	34437	34442	0 %	0 %	50 %	50 %	116493607
45	NC_008526	AG	3	6	36544	36549	50 %	0 %	50 %	0 %	116493610
46	NC_008526	AG	3	6	36957	36962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008526	CA	3	6	37265	37270	50 %	0 %	0 %	50 %	116493611
48	NC_008526	GA	3	6	38024	38029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008526	AG	3	6	38451	38456	50 %	0 %	50 %	0 %	116493613
50	NC_008526	AT	3	6	38994	38999	50 %	50 %	0 %	0 %	116493614
51	NC_008526	GT	3	6	42414	42419	0 %	50 %	50 %	0 %	116493617
52	NC_008526	TC	3	6	42722	42727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008526	GA	4	8	44458	44465	50 %	0 %	50 %	0 %	116493620
54	NC_008526	CA	3	6	44909	44914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008526	AG	3	6	46797	46802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008526	CA	3	6	47105	47110	50 %	0 %	0 %	50 %	116493623
57	NC_008526	TA	3	6	48598	48603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008526	TC	3	6	48713	48718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008526	CA	3	6	50810	50815	50 %	0 %	0 %	50 %	116493628
60	NC_008526	CT	3	6	51582	51587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008526	GA	3	6	53758	53763	50 %	0 %	50 %	0 %	116493630
62	NC_008526	CA	3	6	55446	55451	50 %	0 %	0 %	50 %	116493631
63	NC_008526	GA	3	6	55683	55688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008526	TG	3	6	58704	58709	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
65	NC_008526	CT	3	6	58878	58883	0 %	50 %	0 %	50 %	116493632
66	NC_008526	CT	3	6	59267	59272	0 %	50 %	0 %	50 %	116493633
67	NC_008526	AT	3	6	59648	59653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008526	GC	3	6	63364	63369	0 %	0 %	50 %	50 %	116493638
69	NC_008526	TG	3	6	63541	63546	0 %	50 %	50 %	0 %	116493638
70	NC_008526	TG	3	6	64509	64514	0 %	50 %	50 %	0 %	116493639
71	NC_008526	AG	3	6	64736	64741	50 %	0 %	50 %	0 %	116493639
72	NC_008526	TA	3	6	64882	64887	50 %	50 %	0 %	0 %	116493639
73	NC_008526	AG	3	6	65321	65326	50 %	0 %	50 %	0 %	116493640
74	NC_008526	AT	3	6	65332	65337	50 %	50 %	0 %	0 %	116493640
75	NC_008526	CG	3	6	66083	66088	0 %	0 %	50 %	50 %	116493642
76	NC_008526	AG	4	8	69528	69535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008526	CA	3	6	69576	69581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008526	TA	3	6	74389	74394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008526	GA	3	6	74621	74626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008526	TC	3	6	74633	74638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008526	CT	3	6	74747	74752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008526	GC	3	6	74755	74760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008526	TG	4	8	74862	74869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008526	TG	3	6	74976	74981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008526	TG	3	6	78226	78231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008526	CG	3	6	78720	78725	0 %	0 %	50 %	50 %	116493653
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88	NC_008526	GT	3	6	79658	79663	0 %	50 %	50 %	0 %	116493655
89	NC_008526	GA	3	6	80325	80330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008526	CA	3	6	80419	80424	50 %	0 %	0 %	50 %	116493656
91	NC_008526	TA	3	6	81141	81146	50 %	50 %	0 %	0 %	116493658
92	NC_008526	TA	3	6	83135	83140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008526	AT	3	6	83256	83261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008526	AT	3	6	83544	83549	50 %	50 %	0 %	0 %	116493661
95	NC_008526	AT	4	8	83934	83941	50 %	50 %	0 %	0 %	116493661
96	NC_008526	AG	3	6	85324	85329	50 %	0 %	50 %	0 %	116493663
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98	NC_008526	CG	3	6	86171	86176	0 %	0 %	50 %	50 %	116493664
99	NC_008526	GC	3	6	89579	89584	0 %	0 %	50 %	50 %	116493668
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103	NC_008526	GA	3	6	92675	92680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008526	CG	3	6	92790	92795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008526	GC	3	6	93415	93420	0 %	0 %	50 %	50 %	116493671
106	NC_008526	TG	3	6	94677	94682	0 %	50 %	50 %	0 %	116493672
107	NC_008526	AT	3	6	97194	97199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008526	CT	3	6	97250	97255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008526	AC	3	6	97619	97624	50 %	0 %	0 %	50 %	116493676
110	NC_008526	TA	3	6	98318	98323	50 %	50 %	0 %	0 %	116493677
111	NC_008526	GA	3	6	100420	100425	50 %	0 %	50 %	0 %	116493678
112	NC_008526	AT	3	6	100786	100791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008526	AT	3	6	102479	102484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008526	GT	3	6	104314	104319	0 %	50 %	50 %	0 %	116493682
115	NC_008526	CA	3	6	108411	108416	50 %	0 %	0 %	50 %	116493687
116	NC_008526	CG	3	6	111434	111439	0 %	0 %	50 %	50 %	116493689
117	NC_008526	GC	3	6	112455	112460	0 %	0 %	50 %	50 %	116493690
118	NC_008526	CG	3	6	113323	113328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008526	CA	3	6	113542	113547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008526	GC	3	6	117443	117448	0 %	0 %	50 %	50 %	116493693
121	NC_008526	TG	3	6	117526	117531	0 %	50 %	50 %	0 %	116493693
122	NC_008526	GC	3	6	118756	118761	0 %	0 %	50 %	50 %	116493694
123	NC_008526	AT	3	6	119648	119653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008526	CG	3	6	119783	119788	0 %	0 %	50 %	50 %	116493695
125	NC_008526	GC	3	6	119982	119987	0 %	0 %	50 %	50 %	116493695
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127	NC_008526	AG	3	6	121548	121553	50 %	0 %	50 %	0 %	116493695
128	NC_008526	CA	3	6	122023	122028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008526	CG	3	6	124909	124914	0 %	0 %	50 %	50 %	116493698
130	NC_008526	CG	3	6	125408	125413	0 %	0 %	50 %	50 %	116493698
131	NC_008526	TA	3	6	127198	127203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008526	GC	3	6	127954	127959	0 %	0 %	50 %	50 %	116493701
133	NC_008526	AC	3	6	129335	129340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008526	TA	3	6	129341	129346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008526	AG	3	6	132402	132407	50 %	0 %	50 %	0 %	116493704
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137	NC_008526	CG	3	6	135165	135170	0 %	0 %	50 %	50 %	116493706
138	NC_008526	GC	3	6	136153	136158	0 %	0 %	50 %	50 %	116493707
139	NC_008526	TA	3	6	138729	138734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008526	GC	3	6	138979	138984	0 %	0 %	50 %	50 %	116493709
141	NC_008526	CG	3	6	139423	139428	0 %	0 %	50 %	50 %	116493709
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144	NC_008526	TG	3	6	142691	142696	0 %	50 %	50 %	0 %	116493713
145	NC_008526	AT	3	6	143888	143893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008526	AC	3	6	145163	145168	50 %	0 %	0 %	50 %	116493716
147	NC_008526	GA	3	6	145433	145438	50 %	0 %	50 %	0 %	116493716
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