MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008513	TTTATA	2	12	8023	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008513	AAATTT	2	12	10619	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008513	GATAAT	2	12	24095	24106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008513	TATAAA	2	12	28210	28221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008513	ATTTTT	2	12	31658	31669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008513	TAAAAG	2	12	32169	32180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008513	TAAAAA	2	12	37167	37178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008513	ATTTTT	2	12	41592	41603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008513	TTAAAT	2	12	44712	44723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008513	ATTAAT	2	12	53923	53934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008513	TAATTT	2	12	54211	54222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008513	TATAAA	2	12	54488	54499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008513	ATTTTA	2	12	54671	54682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008513	ATATTT	2	12	54779	54790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008513	ATAATT	2	12	58528	58539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008513	ATTTTA	2	12	58570	58581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008513	ATTTTT	2	12	58902	58913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008513	ATTTAT	2	12	69204	69215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008513	TATAAT	2	12	69925	69936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008513	TTAAAT	2	12	83976	83987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008513	ATATTT	2	12	84243	84254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008513	TTTTAT	2	12	88715	88726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008513	ATATTT	2	12	95805	95816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008513	TTCTTT	2	12	98625	98636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008513	ATATTA	2	12	107013	107024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008513	AAATAT	2	12	127212	127223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008513	TATAAT	2	12	135223	135234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008513	ATAATT	2	12	138437	138448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008513	ATTTTA	2	12	148050	148061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008513	ATTTTT	2	12	152425	152436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008513	TAAAAT	2	12	158045	158056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008513	ATTTTT	2	12	161614	161625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008513	AATATT	2	12	166147	166158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008513	AATATT	2	12	168948	168959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008513	ATTATA	2	12	169783	169794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008513	TATTAA	2	12	170491	170502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008513	ATTAAA	2	12	172302	172313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008513	ATATTT	2	12	172879	172890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008513	ATATTT	2	12	183094	183105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008513	TATTTA	2	12	183294	183305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008513	ATATTT	2	12	183567	183578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008513	TATTTA	2	12	186100	186111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008513	AAAATT	2	12	189919	189930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008513	TAATAT	3	18	192729	192746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008513	TAATAT	2	12	192762	192773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008513	TTAAAT	2	12	194174	194185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008513	AATTAT	2	12	195151	195162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008513	ATATAA	2	12	208415	208426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008513	TTATTT	2	12	211741	211752	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008513	ATATTT	2	12	211815	211826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008513	ATTTTT	2	12	213948	213959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008513	AAAAAT	2	12	214036	214047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008513	TATAAA	2	12	214053	214064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008513	AATTGA	2	12	219040	219051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008513	AATATT	2	12	226725	226736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008513	AATATT	2	12	228144	228155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008513	TTTAAT	2	12	234292	234303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008513	TAAATT	2	12	244181	244192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008513	ATTTAT	2	12	244809	244820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008513	AACTAT	2	12	245773	245784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008513	TAAATT	2	12	252824	252835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008513	AATTTA	2	12	252844	252855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008513	TAAAAA	2	12	252989	253000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008513	TATTTT	2	12	268791	268802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008513	AAAGAA	2	12	270566	270577	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008513	TAAATA	2	12	270741	270752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008513	AAATAT	2	12	270907	270918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008513	TAAAAT	2	12	274403	274414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008513	TAAAAA	2	12	275103	275114	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008513	AATATA	2	12	284627	284638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008513	AAAAAT	2	12	284738	284749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008513	TAAAAT	2	12	284801	284812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008513	TATTTT	2	12	286992	287003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008513	GAATAA	2	12	290426	290437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008513	TAAAAA	2	12	291578	291589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008513	TTATAT	3	18	292027	292044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008513	ATATTT	2	12	298536	298547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008513	ATTTTT	2	12	312837	312848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008513	ATTAAA	2	12	315439	315450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008513	TAAAAA	2	12	325026	325037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008513	ATTAAA	2	12	330847	330858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008513	AAAATA	2	12	331568	331579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008513	TTAAAA	2	12	337195	337206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008513	AATAAA	2	12	337389	337400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008513	AAAAAC	2	12	337994	338005	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008513	CAATTT	2	12	350661	350672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008513	TAAAAA	2	12	352897	352908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008513	TAAAAA	2	12	364300	364311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008513	AATTTT	2	12	375225	375236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008513	TTATAT	2	12	379804	379815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008513	ATATTA	2	12	381322	381333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008513	TTTAAA	2	12	394104	394115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008513	TTATAT	2	12	394955	394966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008513	ATTAAA	2	12	400359	400370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008513	TAAAAA	2	12	403681	403692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008513	TATAAA	2	12	409677	409688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008513	TAAAAA	2	12	409753	409764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008513	TAAATT	2	12	411855	411866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008513	ATTTTT	2	12	416292	416303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.