MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008513	TTTA	2	8	4418	4425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008513	ATTT	2	8	4491	4498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008513	ATAA	2	8	7049	7056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008513	TATT	2	8	7101	7108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008513	AATA	2	8	7361	7368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008513	TAAA	2	8	7729	7736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008513	TAAA	2	8	7998	8005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008513	TAAA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008513	TTCT	2	8	10641	10648	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008513	ATTT	2	8	11060	11067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008513	TTTA	2	8	12803	12810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008513	TAAT	2	8	12885	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008513	TAGT	2	8	14306	14313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008513	TTAT	2	8	14336	14343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008513	TAAA	2	8	14347	14354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008513	TAAA	2	8	17127	17134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008513	TAAT	2	8	17288	17295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008513	TTAA	2	8	19795	19802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008513	ATTA	2	8	28293	28300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008513	TAGA	2	8	30631	30638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008513	ATGT	2	8	31715	31722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008513	CTAA	2	8	31825	31832	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008513	CTAC	2	8	32124	32131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008513	ATAA	2	8	32269	32276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008513	TAAA	2	8	32288	32295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008513	AAAT	2	8	32330	32337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008513	ATTA	2	8	32512	32519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008513	TAAA	2	8	33530	33537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008513	TAAA	2	8	37077	37084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008513	ATTT	2	8	39348	39355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008513	ATAA	3	12	39404	39415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008513	ATTT	2	8	42815	42822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008513	TAAT	2	8	44129	44136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008513	TAAA	2	8	44149	44156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008513	ATTT	2	8	44244	44251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008513	TATT	2	8	44391	44398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008513	TATT	2	8	48385	48392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008513	AATT	2	8	48526	48533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008513	TGTT	2	8	48619	48626	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008513	TTAT	2	8	53755	53762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008513	ATTT	2	8	54510	54517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008513	TAAA	2	8	54570	54577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008513	AATA	2	8	54616	54623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008513	ATAA	2	8	54639	54646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008513	TAAA	2	8	54748	54755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008513	ATTA	2	8	55263	55270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008513	AAAT	2	8	55394	55401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008513	AAAT	2	8	57266	57273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008513	TTTA	2	8	57280	57287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008513	TAAT	2	8	57305	57312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008513	TATT	2	8	57865	57872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008513	TTTA	2	8	58496	58503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008513	ATTA	2	8	58955	58962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008513	ATTT	2	8	59024	59031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008513	ATTT	2	8	59139	59146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008513	ATTA	2	8	60865	60872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008513	TAAT	2	8	60874	60881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008513	TAAA	2	8	60907	60914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008513	TTGT	2	8	61037	61044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008513	AATT	2	8	67794	67801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008513	ATTT	2	8	67854	67861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008513	TATT	2	8	69146	69153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008513	ATAA	2	8	69158	69165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008513	TTAA	2	8	69166	69173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008513	ATTT	2	8	69948	69955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008513	ATTT	2	8	70117	70124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008513	ATTT	2	8	70155	70162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008513	TTAA	2	8	77271	77278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008513	ATTA	2	8	78791	78798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008513	ATAA	2	8	78862	78869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008513	TATT	2	8	78906	78913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008513	TTTA	2	8	83871	83878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008513	TAAA	2	8	83909	83916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008513	AATT	2	8	83952	83959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008513	TAAA	2	8	84134	84141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008513	AAAT	2	8	84157	84164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008513	TAAA	2	8	84229	84236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008513	ATTT	3	12	87975	87986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008513	AATA	2	8	92492	92499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008513	ATTA	2	8	92566	92573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008513	ATTT	2	8	92868	92875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008513	AATT	2	8	95831	95838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008513	TATT	2	8	95850	95857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008513	TAAT	2	8	97460	97467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008513	TAAA	2	8	97571	97578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008513	ATTA	2	8	98542	98549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008513	ATTT	2	8	102977	102984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008513	TTAT	2	8	104009	104016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008513	TTTA	2	8	106873	106880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008513	TAAG	2	8	108762	108769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008513	AATA	2	8	108790	108797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008513	TTAA	2	8	110973	110980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008513	AATT	2	8	111064	111071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008513	TTAA	2	8	111073	111080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008513	TATT	3	12	111499	111510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008513	ATAA	2	8	111534	111541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008513	ATAA	2	8	111558	111565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008513	ATTT	2	8	111566	111573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008513	ATTT	2	8	114203	114210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008513	ATTA	2	8	123113	123120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008513	TCTA	2	8	123377	123384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008513	TAGA	2	8	123392	123399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008513	TAAA	2	8	127260	127267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008513	TTAT	2	8	129358	129365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008513	TTTA	2	8	130251	130258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008513	CTTC	2	8	130270	130277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008513	TTTA	2	8	135210	135217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008513	ATAA	2	8	135235	135242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008513	TAAT	3	12	137999	138010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008513	ATAA	2	8	138057	138064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008513	TCAA	2	8	139227	139234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008513	ATTT	2	8	139278	139285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008513	ATAA	2	8	139308	139315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008513	TAAT	2	8	139320	139327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008513	TAAT	2	8	139414	139421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008513	TTGT	2	8	139494	139501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008513	ATGA	2	8	146139	146146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008513	TTAA	2	8	146225	146232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008513	TAAA	2	8	147720	147727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008513	TAAT	2	8	147867	147874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008513	ATTA	3	12	147927	147938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008513	ATAA	2	8	147984	147991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008513	ATTA	2	8	148085	148092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008513	ATTT	2	8	148239	148246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008513	ATTT	2	8	149164	149171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008513	TTTA	2	8	149177	149184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008513	ATTT	2	8	149360	149367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008513	TTTA	2	8	152221	152228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008513	AATT	2	8	152503	152510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008513	GAAA	2	8	158674	158681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008513	TTTG	2	8	158795	158802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008513	TAAT	2	8	161355	161362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008513	AATG	2	8	161365	161372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008513	TAAT	2	8	161414	161421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008513	TTAT	2	8	161501	161508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008513	TTAA	2	8	161685	161692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008513	ATTT	2	8	161715	161722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008513	TATT	2	8	162698	162705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008513	TGTA	2	8	165058	165065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008513	TATT	2	8	165082	165089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008513	TAAT	2	8	165113	165120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008513	ATAA	2	8	165141	165148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008513	TAAT	2	8	166045	166052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008513	AAAT	2	8	167041	167048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008513	ATTT	2	8	167062	167069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008513	TAAA	2	8	167224	167231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008513	AAAT	2	8	168992	168999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008513	TATT	2	8	170414	170421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008513	TTTA	2	8	170438	170445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008513	TTTA	2	8	172271	172278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008513	ATTA	2	8	177768	177775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008513	TATT	2	8	177801	177808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008513	TAAA	2	8	177869	177876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008513	TAAT	2	8	177917	177924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.