MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 6024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008513	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
2	NC_008513	AGG	2	6	153	158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514951
3	NC_008513	GGT	2	6	199	204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514951
4	NC_008513	ATT	2	6	224	229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
5	NC_008513	ATT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
6	NC_008513	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
7	NC_008513	ATA	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
8	NC_008513	ATT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
9	NC_008513	CTG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514951
10	NC_008513	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514951
11	NC_008513	AAG	2	6	519	524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
12	NC_008513	ATG	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
13	NC_008513	ACC	2	6	603	608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514951
14	NC_008513	AAC	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514951
15	NC_008513	ATT	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
16	NC_008513	AAT	2	6	849	854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
17	NC_008513	TCA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
18	NC_008513	ATT	2	6	916	921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
19	NC_008513	CTA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
20	NC_008513	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
21	NC_008513	ACT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
22	NC_008513	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
23	NC_008513	TGA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
24	NC_008513	GTA	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
25	NC_008513	ATT	3	9	1308	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
26	NC_008513	TGA	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
27	NC_008513	ACT	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
28	NC_008513	GAT	2	6	1375	1380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
29	NC_008513	TAT	2	6	1446	1451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
30	NC_008513	TAA	3	9	1482	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
31	NC_008513	TTA	2	6	1604	1609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
32	NC_008513	GAA	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
33	NC_008513	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
34	NC_008513	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
35	NC_008513	TCT	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
36	NC_008513	CTA	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
37	NC_008513	AAT	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
38	NC_008513	CGG	2	6	2076	2081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514952
39	NC_008513	CAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
40	NC_008513	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
41	NC_008513	TAT	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
42	NC_008513	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
43	NC_008513	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
44	NC_008513	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
45	NC_008513	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514952
46	NC_008513	ATT	3	9	2383	2391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
47	NC_008513	ACT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
48	NC_008513	TAA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
49	NC_008513	ATT	2	6	2555	2560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
50	NC_008513	TAT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
51	NC_008513	AAT	2	6	2600	2605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
52	NC_008513	TTA	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
53	NC_008513	TAT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
54	NC_008513	ATT	2	6	2630	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
55	NC_008513	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
56	NC_008513	CTT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
57	NC_008513	AGG	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514952
58	NC_008513	TAA	3	9	2845	2853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
59	NC_008513	ATT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
60	NC_008513	TTC	2	6	2932	2937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
61	NC_008513	TTA	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
62	NC_008513	AGA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514952
63	NC_008513	TCT	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
64	NC_008513	GCT	2	6	3224	3229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514952
65	NC_008513	TAA	2	6	3292	3297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
66	NC_008513	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
67	NC_008513	TAT	2	6	3561	3566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
68	NC_008513	TAT	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
69	NC_008513	ATT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
70	NC_008513	ACC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514952
71	NC_008513	ATT	2	6	3835	3840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
72	NC_008513	ATA	2	6	3912	3917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
73	NC_008513	AAC	2	6	4006	4011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514952
74	NC_008513	TCC	2	6	4033	4038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116514952
75	NC_008513	TCA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
76	NC_008513	TCC	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116514952
77	NC_008513	CTG	3	9	4101	4109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514952
78	NC_008513	ACT	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
79	NC_008513	ATG	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514952
80	NC_008513	CAT	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
81	NC_008513	TGA	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514952
82	NC_008513	TAT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
83	NC_008513	ATT	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
84	NC_008513	TAA	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
85	NC_008513	TTA	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
86	NC_008513	AAT	2	6	4712	4717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
87	NC_008513	TCT	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514953
88	NC_008513	ATT	2	6	4761	4766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
89	NC_008513	ATA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
90	NC_008513	CGT	2	6	4897	4902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514953
91	NC_008513	TAA	2	6	4940	4945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
92	NC_008513	ATT	3	9	4973	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
93	NC_008513	AAT	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
94	NC_008513	AAT	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
95	NC_008513	TAA	3	9	5050	5058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
96	NC_008513	TGT	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514953
97	NC_008513	ATT	2	6	5138	5143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
98	NC_008513	ATT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514953
99	NC_008513	AAT	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
100	NC_008513	TAA	2	6	5536	5541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
101	NC_008513	TAA	2	6	5578	5583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514953
102	NC_008513	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514954
103	NC_008513	CAA	2	6	5901	5906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514954
104	NC_008513	ATA	2	6	6009	6014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514954
105	NC_008513	AGA	2	6	6098	6103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514954
106	NC_008513	GGA	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514954
107	NC_008513	GTT	2	6	6264	6269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116514954
108	NC_008513	AAT	2	6	6296	6301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514954
109	NC_008513	TCT	2	6	6302	6307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514954
110	NC_008513	ATC	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514954
111	NC_008513	TAA	2	6	6346	6351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514954
112	NC_008513	ATT	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514954
113	NC_008513	TTA	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514954
114	NC_008513	GTA	2	6	6501	6506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514954
115	NC_008513	AAT	2	6	6542	6547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514954
116	NC_008513	AAG	2	6	6585	6590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514954
117	NC_008513	TAA	3	9	6732	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514954
118	NC_008513	TGG	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514954
119	NC_008513	ATT	2	6	6751	6756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514954
120	NC_008513	ATA	2	6	7307	7312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514955
121	NC_008513	TAA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514956
122	NC_008513	TAT	2	6	7577	7582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514956
123	NC_008513	AAT	2	6	7608	7613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514956
124	NC_008513	ATA	2	6	7666	7671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514956
125	NC_008513	ATT	2	6	7674	7679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514956
126	NC_008513	ACT	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514957
127	NC_008513	CTT	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514957
128	NC_008513	TAA	2	6	8343	8348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514957
129	NC_008513	ATT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514957
130	NC_008513	TTA	2	6	8393	8398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514957
131	NC_008513	AAT	2	6	8420	8425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514957
132	NC_008513	ATT	2	6	8438	8443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514957
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