MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	AATTT	2	10	874	883	40 %	60 %	0 %	0 %	116334903
2	NC_008512	ATTAA	2	10	952	961	60 %	40 %	0 %	0 %	116334903
3	NC_008512	TAAAA	2	10	1020	1029	80 %	20 %	0 %	0 %	116334903
4	NC_008512	ATTTT	2	10	1635	1644	20 %	80 %	0 %	0 %	116334904
5	NC_008512	AGATT	2	10	1902	1911	40 %	40 %	20 %	0 %	116334904
6	NC_008512	TTATA	2	10	2282	2291	40 %	60 %	0 %	0 %	116334904
7	NC_008512	TATTT	2	10	2882	2891	20 %	80 %	0 %	0 %	116334905
8	NC_008512	TAATA	2	10	3006	3015	60 %	40 %	0 %	0 %	116334905
9	NC_008512	AATTT	2	10	3376	3385	40 %	60 %	0 %	0 %	116334905
10	NC_008512	AAAAT	2	10	5665	5674	80 %	20 %	0 %	0 %	116334909
11	NC_008512	AAATT	2	10	5692	5701	60 %	40 %	0 %	0 %	116334909
12	NC_008512	TAAAA	2	10	5809	5818	80 %	20 %	0 %	0 %	116334910
13	NC_008512	AAAAT	2	10	6477	6486	80 %	20 %	0 %	0 %	116334910
14	NC_008512	AATTT	2	10	6638	6647	40 %	60 %	0 %	0 %	116334911
15	NC_008512	AAAAT	2	10	8029	8038	80 %	20 %	0 %	0 %	116334912
16	NC_008512	TAAAA	2	10	8817	8826	80 %	20 %	0 %	0 %	116334913
17	NC_008512	TGATG	2	10	10062	10071	20 %	40 %	40 %	0 %	116334915
18	NC_008512	TTTTA	2	10	11162	11171	20 %	80 %	0 %	0 %	116334915
19	NC_008512	AAAAT	2	10	11487	11496	80 %	20 %	0 %	0 %	116334916
20	NC_008512	TAAAA	2	10	12245	12254	80 %	20 %	0 %	0 %	116334916
21	NC_008512	ATTAT	2	10	12679	12688	40 %	60 %	0 %	0 %	116334916
22	NC_008512	TAAAA	2	10	12935	12944	80 %	20 %	0 %	0 %	116334916
23	NC_008512	TAAAA	2	10	13275	13284	80 %	20 %	0 %	0 %	116334917
24	NC_008512	TTATT	2	10	13344	13353	20 %	80 %	0 %	0 %	116334917
25	NC_008512	TTAAT	2	10	13739	13748	40 %	60 %	0 %	0 %	116334917
26	NC_008512	AATTT	2	10	13949	13958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008512	ATAAA	2	10	14110	14119	80 %	20 %	0 %	0 %	116334919
28	NC_008512	AGTTT	2	10	14431	14440	20 %	60 %	20 %	0 %	116334919
29	NC_008512	TTAAA	2	10	14614	14623	60 %	40 %	0 %	0 %	116334919
30	NC_008512	TAAAA	2	10	14777	14786	80 %	20 %	0 %	0 %	116334919
31	NC_008512	TACAA	2	10	15310	15319	60 %	20 %	0 %	20 %	116334920
32	NC_008512	ATTTT	2	10	15888	15897	20 %	80 %	0 %	0 %	116334920
33	NC_008512	ATTTT	2	10	15969	15978	20 %	80 %	0 %	0 %	116334920
34	NC_008512	ATAAA	2	10	16007	16016	80 %	20 %	0 %	0 %	116334920
35	NC_008512	TAATA	2	10	16655	16664	60 %	40 %	0 %	0 %	116334921
36	NC_008512	AAAAT	2	10	17609	17618	80 %	20 %	0 %	0 %	116334923
37	NC_008512	AAAAT	2	10	19193	19202	80 %	20 %	0 %	0 %	116334925
38	NC_008512	TTAAT	2	10	19307	19316	40 %	60 %	0 %	0 %	116334925
39	NC_008512	ATTTA	2	10	19353	19362	40 %	60 %	0 %	0 %	116334925
40	NC_008512	ATTTT	2	10	20557	20566	20 %	80 %	0 %	0 %	116334925
41	NC_008512	ATTAA	2	10	20629	20638	60 %	40 %	0 %	0 %	116334925
42	NC_008512	TTATT	2	10	21164	21173	20 %	80 %	0 %	0 %	116334925
43	NC_008512	AGAAT	2	10	21424	21433	60 %	20 %	20 %	0 %	116334925
44	NC_008512	TAATT	2	10	22010	22019	40 %	60 %	0 %	0 %	116334926
45	NC_008512	TAATT	2	10	23348	23357	40 %	60 %	0 %	0 %	116334927
46	NC_008512	GAAAT	2	10	24172	24181	60 %	20 %	20 %	0 %	116334927
47	NC_008512	ATTTT	2	10	24857	24866	20 %	80 %	0 %	0 %	116334928
48	NC_008512	TAAAA	2	10	25882	25891	80 %	20 %	0 %	0 %	116334930
49	NC_008512	CATTG	2	10	25958	25967	20 %	40 %	20 %	20 %	116334930
50	NC_008512	ATTAT	2	10	26044	26053	40 %	60 %	0 %	0 %	116334930
51	NC_008512	AAATT	2	10	26124	26133	60 %	40 %	0 %	0 %	116334930
52	NC_008512	ATTTT	2	10	26190	26199	20 %	80 %	0 %	0 %	116334930
53	NC_008512	TTAAT	2	10	27253	27262	40 %	60 %	0 %	0 %	116334931
54	NC_008512	AAAAT	2	10	27334	27343	80 %	20 %	0 %	0 %	116334931
55	NC_008512	AATCA	2	10	27378	27387	60 %	20 %	0 %	20 %	116334931
56	NC_008512	ATTTT	2	10	28684	28693	20 %	80 %	0 %	0 %	116334932
57	NC_008512	TATTT	2	10	28761	28770	20 %	80 %	0 %	0 %	116334932
58	NC_008512	ATATT	2	10	28960	28969	40 %	60 %	0 %	0 %	116334932
59	NC_008512	TTTAA	2	10	30240	30249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008512	ATTTT	2	10	30291	30300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008512	AATTT	2	10	32881	32890	40 %	60 %	0 %	0 %	116334936
62	NC_008512	TTAAT	2	10	33306	33315	40 %	60 %	0 %	0 %	116334937
63	NC_008512	ATTTT	2	10	33408	33417	20 %	80 %	0 %	0 %	116334937
64	NC_008512	AATTT	2	10	34453	34462	40 %	60 %	0 %	0 %	116334938
65	NC_008512	TTTTG	2	10	34475	34484	0 %	80 %	20 %	0 %	116334938
66	NC_008512	ATTTA	2	10	34859	34868	40 %	60 %	0 %	0 %	116334938
67	NC_008512	AGTTC	2	10	36549	36558	20 %	40 %	20 %	20 %	116334941
68	NC_008512	AAATA	2	10	36970	36979	80 %	20 %	0 %	0 %	116334941
69	NC_008512	AGTTT	2	10	37446	37455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008512	AATTT	2	10	39010	39019	40 %	60 %	0 %	0 %	116334943
71	NC_008512	TATAA	2	10	39089	39098	60 %	40 %	0 %	0 %	116334944
72	NC_008512	ATTTT	2	10	39163	39172	20 %	80 %	0 %	0 %	116334944
73	NC_008512	TTGTT	2	10	39398	39407	0 %	80 %	20 %	0 %	116334944
74	NC_008512	AAATT	2	10	39550	39559	60 %	40 %	0 %	0 %	116334944
75	NC_008512	AAATA	2	10	39620	39629	80 %	20 %	0 %	0 %	116334944
76	NC_008512	TAAAT	2	10	39837	39846	60 %	40 %	0 %	0 %	116334944
77	NC_008512	AAATT	2	10	40173	40182	60 %	40 %	0 %	0 %	116334945
78	NC_008512	ATTTT	2	10	40457	40466	20 %	80 %	0 %	0 %	116334945
79	NC_008512	TTTAT	2	10	40742	40751	20 %	80 %	0 %	0 %	116334945
80	NC_008512	CCATT	2	10	40887	40896	20 %	40 %	0 %	40 %	116334945
81	NC_008512	AATTA	2	10	40930	40939	60 %	40 %	0 %	0 %	116334945
82	NC_008512	GTTTT	2	10	41888	41897	0 %	80 %	20 %	0 %	116334947
83	NC_008512	ATTTA	2	10	42797	42806	40 %	60 %	0 %	0 %	116334949
84	NC_008512	TAAAT	2	10	42872	42881	60 %	40 %	0 %	0 %	116334949
85	NC_008512	ATTAT	2	10	43017	43026	40 %	60 %	0 %	0 %	116334949
86	NC_008512	ATTTA	2	10	43120	43129	40 %	60 %	0 %	0 %	116334949
87	NC_008512	CTTTT	2	10	43159	43168	0 %	80 %	0 %	20 %	116334950
88	NC_008512	TAAAA	2	10	44801	44810	80 %	20 %	0 %	0 %	116334951
89	NC_008512	AAAAT	2	10	45605	45614	80 %	20 %	0 %	0 %	116334952
90	NC_008512	ATTTT	2	10	46127	46136	20 %	80 %	0 %	0 %	116334952
91	NC_008512	TAATT	2	10	46860	46869	40 %	60 %	0 %	0 %	116334953
92	NC_008512	TTTCT	2	10	46925	46934	0 %	80 %	0 %	20 %	116334953
93	NC_008512	AAATA	2	10	47171	47180	80 %	20 %	0 %	0 %	116334953
94	NC_008512	ATTTT	2	10	47765	47774	20 %	80 %	0 %	0 %	116334953
95	NC_008512	ATTTT	2	10	48008	48017	20 %	80 %	0 %	0 %	116334954
96	NC_008512	TTTAA	2	10	48125	48134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008512	ATTGT	2	10	48745	48754	20 %	60 %	20 %	0 %	116334955
98	NC_008512	AATTA	2	10	49230	49239	60 %	40 %	0 %	0 %	116334956
99	NC_008512	TAAAA	2	10	49305	49314	80 %	20 %	0 %	0 %	116334956
100	NC_008512	TAATA	2	10	49502	49511	60 %	40 %	0 %	0 %	116334957
101	NC_008512	AAATT	2	10	49575	49584	60 %	40 %	0 %	0 %	116334957
102	NC_008512	TAATT	2	10	50120	50129	40 %	60 %	0 %	0 %	116334957
103	NC_008512	AAAAT	2	10	50684	50693	80 %	20 %	0 %	0 %	116334958
104	NC_008512	AATAA	2	10	52110	52119	80 %	20 %	0 %	0 %	116334961
105	NC_008512	AATTT	2	10	52515	52524	40 %	60 %	0 %	0 %	116334961
106	NC_008512	TAATT	2	10	52965	52974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008512	TTTAA	2	10	53618	53627	40 %	60 %	0 %	0 %	116334962
108	NC_008512	TATAA	2	10	53667	53676	60 %	40 %	0 %	0 %	116334962
109	NC_008512	ATTAA	2	10	53732	53741	60 %	40 %	0 %	0 %	116334962
110	NC_008512	TTTAT	2	10	56230	56239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008512	TTTTA	2	10	56314	56323	20 %	80 %	0 %	0 %	116334965
112	NC_008512	ATTAA	2	10	56640	56649	60 %	40 %	0 %	0 %	116334966
113	NC_008512	ATTTT	2	10	56656	56665	20 %	80 %	0 %	0 %	116334966
114	NC_008512	TTAAA	2	10	57979	57988	60 %	40 %	0 %	0 %	116334968
115	NC_008512	AAAAT	2	10	58033	58042	80 %	20 %	0 %	0 %	116334968
116	NC_008512	AAAAT	2	10	58562	58571	80 %	20 %	0 %	0 %	116334969
117	NC_008512	AATTT	2	10	59297	59306	40 %	60 %	0 %	0 %	116334969
118	NC_008512	TAATA	2	10	59523	59532	60 %	40 %	0 %	0 %	116334969
119	NC_008512	AATAG	2	10	59803	59812	60 %	20 %	20 %	0 %	116334969
120	NC_008512	AACAA	2	10	60217	60226	80 %	0 %	0 %	20 %	116334969
121	NC_008512	ATATA	2	10	60690	60699	60 %	40 %	0 %	0 %	116334969
122	NC_008512	TGAAA	2	10	60786	60795	60 %	20 %	20 %	0 %	116334969
123	NC_008512	TTAAA	2	10	60932	60941	60 %	40 %	0 %	0 %	116334969
124	NC_008512	TAAAT	2	10	61032	61041	60 %	40 %	0 %	0 %	116334969
125	NC_008512	TTAAA	2	10	61353	61362	60 %	40 %	0 %	0 %	116334970
126	NC_008512	ATTTT	2	10	61539	61548	20 %	80 %	0 %	0 %	116334970
127	NC_008512	ATATT	2	10	62139	62148	40 %	60 %	0 %	0 %	116334970
128	NC_008512	TTATT	2	10	62209	62218	20 %	80 %	0 %	0 %	116334970
129	NC_008512	ATTTG	2	10	62485	62494	20 %	60 %	20 %	0 %	116334970
130	NC_008512	AAAAT	2	10	62693	62702	80 %	20 %	0 %	0 %	116334970
131	NC_008512	TACAA	2	10	63427	63436	60 %	20 %	0 %	20 %	116334972
132	NC_008512	ATTTA	2	10	63814	63823	40 %	60 %	0 %	0 %	116334972
133	NC_008512	ATGGA	2	10	64178	64187	40 %	20 %	40 %	0 %	116334973
134	NC_008512	ATTTT	2	10	64191	64200	20 %	80 %	0 %	0 %	116334973
135	NC_008512	AAAAT	2	10	64204	64213	80 %	20 %	0 %	0 %	116334973
136	NC_008512	TAATA	2	10	64700	64709	60 %	40 %	0 %	0 %	116334973
137	NC_008512	TTTAT	2	10	67052	67061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008512	TTTAT	2	10	68157	68166	20 %	80 %	0 %	0 %	116334977
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140	NC_008512	TTTTA	2	10	68910	68919	20 %	80 %	0 %	0 %	116334977
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.