MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	AT	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	116334903
2	NC_008512	TA	3	6	1612	1617	50 %	50 %	0 %	0 %	116334904
3	NC_008512	AT	4	8	1788	1795	50 %	50 %	0 %	0 %	116334904
4	NC_008512	TA	3	6	2505	2510	50 %	50 %	0 %	0 %	116334904
5	NC_008512	AT	3	6	2926	2931	50 %	50 %	0 %	0 %	116334905
6	NC_008512	TA	5	10	3187	3196	50 %	50 %	0 %	0 %	116334905
7	NC_008512	TA	3	6	3265	3270	50 %	50 %	0 %	0 %	116334905
8	NC_008512	AT	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	116334905
9	NC_008512	TA	3	6	4281	4286	50 %	50 %	0 %	0 %	116334908
10	NC_008512	AT	3	6	5581	5586	50 %	50 %	0 %	0 %	116334909
11	NC_008512	TA	3	6	5885	5890	50 %	50 %	0 %	0 %	116334910
12	NC_008512	AT	3	6	5944	5949	50 %	50 %	0 %	0 %	116334910
13	NC_008512	TG	3	6	6009	6014	0 %	50 %	50 %	0 %	116334910
14	NC_008512	AT	5	10	6609	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	116334911
15	NC_008512	AT	3	6	7147	7152	50 %	50 %	0 %	0 %	116334911
16	NC_008512	TA	3	6	7419	7424	50 %	50 %	0 %	0 %	116334911
17	NC_008512	TA	3	6	7573	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	116334911
18	NC_008512	AT	3	6	8129	8134	50 %	50 %	0 %	0 %	116334913
19	NC_008512	TA	3	6	8539	8544	50 %	50 %	0 %	0 %	116334913
20	NC_008512	TA	3	6	8723	8728	50 %	50 %	0 %	0 %	116334913
21	NC_008512	TA	3	6	9199	9204	50 %	50 %	0 %	0 %	116334914
22	NC_008512	AT	3	6	9209	9214	50 %	50 %	0 %	0 %	116334914
23	NC_008512	TA	3	6	9700	9705	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
24	NC_008512	TA	3	6	9889	9894	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
25	NC_008512	TA	3	6	9992	9997	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
26	NC_008512	AT	3	6	10012	10017	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
27	NC_008512	TA	3	6	10268	10273	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
28	NC_008512	AT	4	8	10376	10383	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
29	NC_008512	AT	3	6	10390	10395	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
30	NC_008512	AT	3	6	10993	10998	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
31	NC_008512	TA	3	6	11170	11175	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
32	NC_008512	TA	3	6	11398	11403	50 %	50 %	0 %	0 %	116334915
33	NC_008512	TA	3	6	11526	11531	50 %	50 %	0 %	0 %	116334916
34	NC_008512	AT	3	6	12623	12628	50 %	50 %	0 %	0 %	116334916
35	NC_008512	TA	3	6	12888	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	116334916
36	NC_008512	TA	3	6	13258	13263	50 %	50 %	0 %	0 %	116334917
37	NC_008512	AT	3	6	13338	13343	50 %	50 %	0 %	0 %	116334917
38	NC_008512	TA	3	6	14351	14356	50 %	50 %	0 %	0 %	116334919
39	NC_008512	AT	3	6	14938	14943	50 %	50 %	0 %	0 %	116334919
40	NC_008512	TA	3	6	16344	16349	50 %	50 %	0 %	0 %	116334921
41	NC_008512	AT	3	6	16730	16735	50 %	50 %	0 %	0 %	116334921
42	NC_008512	TA	3	6	16848	16853	50 %	50 %	0 %	0 %	116334922
43	NC_008512	TA	3	6	16926	16931	50 %	50 %	0 %	0 %	116334922
44	NC_008512	AT	3	6	17395	17400	50 %	50 %	0 %	0 %	116334922
45	NC_008512	AT	3	6	17518	17523	50 %	50 %	0 %	0 %	116334923
46	NC_008512	TA	3	6	18028	18033	50 %	50 %	0 %	0 %	116334923
47	NC_008512	AT	3	6	18535	18540	50 %	50 %	0 %	0 %	116334924
48	NC_008512	AT	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
49	NC_008512	TA	3	6	19631	19636	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
50	NC_008512	TA	3	6	19763	19768	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
51	NC_008512	AT	3	6	20357	20362	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
52	NC_008512	AT	3	6	21022	21027	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
53	NC_008512	AT	3	6	21317	21322	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
54	NC_008512	AT	3	6	21695	21700	50 %	50 %	0 %	0 %	116334925
55	NC_008512	AT	3	6	22325	22330	50 %	50 %	0 %	0 %	116334926
56	NC_008512	AT	3	6	22947	22952	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
57	NC_008512	TA	3	6	22954	22959	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
58	NC_008512	TA	3	6	23118	23123	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
59	NC_008512	AT	3	6	23180	23185	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
60	NC_008512	AT	7	14	23660	23673	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
61	NC_008512	AT	3	6	24190	24195	50 %	50 %	0 %	0 %	116334927
62	NC_008512	AT	3	6	25270	25275	50 %	50 %	0 %	0 %	116334929
63	NC_008512	TA	4	8	25314	25321	50 %	50 %	0 %	0 %	116334930
64	NC_008512	TA	3	6	25720	25725	50 %	50 %	0 %	0 %	116334930
65	NC_008512	TA	3	6	25833	25838	50 %	50 %	0 %	0 %	116334930
66	NC_008512	TA	3	6	26690	26695	50 %	50 %	0 %	0 %	116334931
67	NC_008512	GA	3	6	27581	27586	50 %	0 %	50 %	0 %	116334931
68	NC_008512	TA	3	6	27868	27873	50 %	50 %	0 %	0 %	116334931
69	NC_008512	AT	3	6	27956	27961	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
70	NC_008512	TA	3	6	28057	28062	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
71	NC_008512	TA	3	6	28346	28351	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
72	NC_008512	TA	4	8	28379	28386	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
73	NC_008512	TA	3	6	28639	28644	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
74	NC_008512	TA	3	6	28794	28799	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
75	NC_008512	AT	3	6	28847	28852	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
76	NC_008512	TA	3	6	28942	28947	50 %	50 %	0 %	0 %	116334932
77	NC_008512	TA	3	6	29445	29450	50 %	50 %	0 %	0 %	116334933
78	NC_008512	AT	3	6	29509	29514	50 %	50 %	0 %	0 %	116334933
79	NC_008512	TA	3	6	29874	29879	50 %	50 %	0 %	0 %	116334933
80	NC_008512	AT	3	6	30400	30405	50 %	50 %	0 %	0 %	116334934
81	NC_008512	AT	3	6	31557	31562	50 %	50 %	0 %	0 %	116334934
82	NC_008512	AT	3	6	31837	31842	50 %	50 %	0 %	0 %	116334935
83	NC_008512	AT	3	6	32223	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	116334935
84	NC_008512	AT	3	6	32309	32314	50 %	50 %	0 %	0 %	116334935
85	NC_008512	TA	3	6	32322	32327	50 %	50 %	0 %	0 %	116334935
86	NC_008512	TA	3	6	32553	32558	50 %	50 %	0 %	0 %	116334936
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89	NC_008512	AT	3	6	33453	33458	50 %	50 %	0 %	0 %	116334937
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91	NC_008512	AT	3	6	35960	35965	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
92	NC_008512	TA	3	6	36149	36154	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
93	NC_008512	AT	3	6	36321	36326	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
94	NC_008512	TA	3	6	36370	36375	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
95	NC_008512	AT	3	6	36519	36524	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
96	NC_008512	AT	3	6	36570	36575	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
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101	NC_008512	AT	3	6	37158	37163	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
102	NC_008512	TA	3	6	37737	37742	50 %	50 %	0 %	0 %	116334942
103	NC_008512	AT	3	6	37990	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	116334942
104	NC_008512	TA	4	8	38100	38107	50 %	50 %	0 %	0 %	116334942
105	NC_008512	AT	3	6	39210	39215	50 %	50 %	0 %	0 %	116334944
106	NC_008512	AT	3	6	39225	39230	50 %	50 %	0 %	0 %	116334944
107	NC_008512	AT	3	6	39845	39850	50 %	50 %	0 %	0 %	116334944
108	NC_008512	AT	3	6	40521	40526	50 %	50 %	0 %	0 %	116334945
109	NC_008512	TA	3	6	41580	41585	50 %	50 %	0 %	0 %	116334946
110	NC_008512	TA	3	6	41929	41934	50 %	50 %	0 %	0 %	116334947
111	NC_008512	TA	4	8	41991	41998	50 %	50 %	0 %	0 %	116334947
112	NC_008512	AT	3	6	42062	42067	50 %	50 %	0 %	0 %	116334948
113	NC_008512	TA	3	6	42598	42603	50 %	50 %	0 %	0 %	116334949
114	NC_008512	AT	3	6	42644	42649	50 %	50 %	0 %	0 %	116334949
115	NC_008512	AT	3	6	42732	42737	50 %	50 %	0 %	0 %	116334949
116	NC_008512	AT	3	6	42825	42830	50 %	50 %	0 %	0 %	116334949
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121	NC_008512	AT	3	6	45144	45149	50 %	50 %	0 %	0 %	116334952
122	NC_008512	TA	3	6	45239	45244	50 %	50 %	0 %	0 %	116334952
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124	NC_008512	AT	3	6	45900	45905	50 %	50 %	0 %	0 %	116334952
125	NC_008512	TA	3	6	46069	46074	50 %	50 %	0 %	0 %	116334952
126	NC_008512	AT	3	6	46169	46174	50 %	50 %	0 %	0 %	116334952
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.