MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	T	8	8	9050	9057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008512	A	14	14	13905	13918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008512	A	12	12	13989	14000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008512	A	8	8	22384	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008512	T	17	17	22402	22418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008512	A	9	9	24537	24545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008512	A	8	8	24568	24575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008512	A	8	8	24591	24598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008512	T	10	10	24650	24659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008512	A	7	7	30203	30209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008512	T	9	9	30220	30228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008512	T	8	8	30271	30278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008512	T	10	10	30297	30306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008512	A	8	8	30307	30314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008512	A	6	6	35434	35439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008512	A	8	8	37217	37224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008512	T	6	6	37236	37241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008512	T	6	6	37269	37274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008512	A	11	11	37324	37334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008512	T	6	6	37338	37343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008512	A	9	9	37344	37352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008512	T	9	9	37388	37396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008512	A	13	13	37397	37409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008512	T	11	11	37512	37522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008512	A	11	11	37532	37542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008512	T	11	11	38180	38190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008512	A	6	6	38191	38196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008512	T	6	6	38220	38225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008512	T	9	9	38229	38237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008512	A	12	12	38267	38278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008512	A	12	12	41703	41714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008512	T	6	6	41724	41729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008512	T	8	8	41737	41744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008512	A	6	6	42493	42498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008512	A	6	6	42500	42505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008512	A	8	8	48089	48096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008512	A	8	8	48183	48190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008512	A	11	11	48552	48562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008512	T	6	6	48563	48568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008512	A	9	9	52998	53006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008512	T	8	8	53030	53037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008512	T	10	10	53039	53048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008512	A	9	9	53055	53063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008512	T	13	13	53097	53109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008512	T	8	8	53121	53128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008512	A	7	7	53138	53144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008512	T	7	7	53374	53380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008512	T	6	6	53460	53465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008512	T	8	8	53529	53536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008512	T	10	10	54367	54376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008512	A	7	7	54400	54406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008512	T	8	8	56254	56261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008512	T	7	7	65124	65130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008512	T	10	10	65133	65142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008512	A	9	9	65151	65159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008512	T	15	15	67069	67083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008512	A	9	9	67084	67092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008512	A	9	9	67122	67130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008512	A	9	9	67137	67145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008512	T	11	11	67149	67159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008512	T	10	10	67173	67182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008512	T	6	6	67234	67239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008512	A	6	6	67264	67269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008512	A	6	6	67284	67289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008512	A	6	6	67351	67356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008512	A	6	6	67411	67416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008512	T	9	9	67620	67628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008512	A	6	6	67678	67683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008512	T	6	6	67684	67689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008512	T	7	7	67722	67728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008512	A	6	6	67755	67760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008512	A	10	10	69543	69552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008512	T	6	6	79487	79492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008512	T	9	9	80568	80576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008512	A	11	11	80579	80589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008512	T	6	6	83591	83596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008512	A	7	7	83620	83626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008512	A	7	7	83830	83836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008512	A	6	6	83884	83889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008512	T	6	6	83890	83895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008512	T	7	7	83943	83949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008512	T	7	7	84290	84296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008512	A	6	6	84303	84308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008512	T	7	7	84325	84331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008512	T	10	10	84340	84349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008512	A	7	7	85561	85567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008512	T	15	15	93454	93468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008512	T	9	9	93502	93510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008512	A	8	8	97132	97139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008512	T	20	20	105399	105418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008512	T	6	6	106974	106979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008512	T	6	6	107315	107320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008512	T	6	6	108015	108020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008512	T	10	10	108114	108123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008512	T	6	6	108141	108146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008512	T	13	13	108425	108437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008512	A	6	6	108929	108934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008512	T	6	6	109100	109105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008512	T	9	9	109137	109145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008512	A	9	9	109514	109522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008512	T	8	8	109523	109530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008512	T	7	7	109537	109543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008512	T	6	6	109769	109774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008512	T	6	6	109844	109849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008512	T	8	8	109898	109905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008512	T	12	12	109978	109989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008512	T	7	7	116543	116549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008512	A	7	7	116550	116556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008512	T	9	9	116658	116666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008512	A	7	7	116667	116673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008512	A	8	8	146916	146923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008512	T	9	9	147000	147008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008512	A	6	6	147009	147014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008512	A	6	6	147028	147033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008512	T	9	9	158605	158613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008512	A	9	9	158614	158622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.