MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	AATC	2	8	642	649	50 %	25 %	0 %	25 %	116332446
2	NC_008511	CCAA	2	8	1054	1061	50 %	0 %	0 %	50 %	116332447
3	NC_008511	ATTT	2	8	1473	1480	25 %	75 %	0 %	0 %	116332447
4	NC_008511	TACA	2	8	1764	1771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008511	GAAA	2	8	2088	2095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008511	AACT	2	8	2258	2265	50 %	25 %	0 %	25 %	116332448
7	NC_008511	TTCC	2	8	2468	2475	0 %	50 %	0 %	50 %	116332448
8	NC_008511	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	116332449
9	NC_008511	TTTC	2	8	3223	3230	0 %	75 %	0 %	25 %	116332449
10	NC_008511	ATGG	2	8	3257	3264	25 %	25 %	50 %	0 %	116332449
11	NC_008511	GATC	2	8	3502	3509	25 %	25 %	25 %	25 %	116332449
12	NC_008511	TATT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	116332449
13	NC_008511	CGTT	2	8	3763	3770	0 %	50 %	25 %	25 %	116332449
14	NC_008511	CGCC	2	8	3784	3791	0 %	0 %	25 %	75 %	116332449
15	NC_008511	CCTT	2	8	3898	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
16	NC_008511	GGAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	75 %	0 %	116332449
17	NC_008511	TTCC	2	8	5031	5038	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
18	NC_008511	TTGG	2	8	5314	5321	0 %	50 %	50 %	0 %	116332449
19	NC_008511	GGAC	2	8	6058	6065	25 %	0 %	50 %	25 %	116332450
20	NC_008511	TTCG	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
21	NC_008511	TTGC	2	8	6321	6328	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
22	NC_008511	AATC	2	8	6363	6370	50 %	25 %	0 %	25 %	116332450
23	NC_008511	GTCT	2	8	6431	6438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008511	ACTT	2	8	6480	6487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008511	TTTC	2	8	6636	6643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008511	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	116332451
27	NC_008511	AAAG	2	8	7421	7428	75 %	0 %	25 %	0 %	116332451
28	NC_008511	TATC	2	8	7718	7725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008511	TGTT	2	8	7827	7834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008511	ACGA	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	116332452
31	NC_008511	GAAA	2	8	8869	8876	75 %	0 %	25 %	0 %	116332453
32	NC_008511	GTTT	2	8	9039	9046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008511	AATA	2	8	9453	9460	75 %	25 %	0 %	0 %	116332454
34	NC_008511	TGAT	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	116332454
35	NC_008511	TCTT	2	8	9668	9675	0 %	75 %	0 %	25 %	116332454
36	NC_008511	ATTT	2	8	9887	9894	25 %	75 %	0 %	0 %	116332454
37	NC_008511	CGAA	2	8	10494	10501	50 %	0 %	25 %	25 %	116332455
38	NC_008511	TAAG	2	8	10662	10669	50 %	25 %	25 %	0 %	116332455
39	NC_008511	GAAA	2	8	10697	10704	75 %	0 %	25 %	0 %	116332455
40	NC_008511	CAAA	2	8	10903	10910	75 %	0 %	0 %	25 %	116332455
41	NC_008511	ATCC	2	8	11043	11050	25 %	25 %	0 %	50 %	116332455
42	NC_008511	CAAA	2	8	11519	11526	75 %	0 %	0 %	25 %	116332455
43	NC_008511	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	116332456
44	NC_008511	CGGA	2	8	11893	11900	25 %	0 %	50 %	25 %	116332456
45	NC_008511	AAAG	2	8	13146	13153	75 %	0 %	25 %	0 %	116332457
46	NC_008511	GATC	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	116332457
47	NC_008511	TCAT	2	8	14177	14184	25 %	50 %	0 %	25 %	116332458
48	NC_008511	TTTC	2	8	14299	14306	0 %	75 %	0 %	25 %	116332458
49	NC_008511	ATTC	2	8	14989	14996	25 %	50 %	0 %	25 %	116332459
50	NC_008511	GAAA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	25 %	0 %	116332459
51	NC_008511	AAGG	2	8	15308	15315	50 %	0 %	50 %	0 %	116332459
52	NC_008511	AGGC	2	8	15444	15451	25 %	0 %	50 %	25 %	116332460
53	NC_008511	GAAT	2	8	15884	15891	50 %	25 %	25 %	0 %	116332460
54	NC_008511	TTGG	2	8	16300	16307	0 %	50 %	50 %	0 %	116332460
55	NC_008511	TTCG	2	8	16524	16531	0 %	50 %	25 %	25 %	116332461
56	NC_008511	AGAA	2	8	16789	16796	75 %	0 %	25 %	0 %	116332461
57	NC_008511	CTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	0 %	50 %	116332461
58	NC_008511	AACA	2	8	17804	17811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008511	ATTT	2	8	19786	19793	25 %	75 %	0 %	0 %	116332463
60	NC_008511	ATCA	2	8	19898	19905	50 %	25 %	0 %	25 %	116332463
61	NC_008511	GGAA	2	8	20005	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	116332463
62	NC_008511	GATT	2	8	21164	21171	25 %	50 %	25 %	0 %	116332464
63	NC_008511	TCAA	2	8	21241	21248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008511	TCCC	2	8	22009	22016	0 %	25 %	0 %	75 %	116332465
65	NC_008511	GGGA	2	8	22313	22320	25 %	0 %	75 %	0 %	116332465
66	NC_008511	ACTT	2	8	22407	22414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008511	GTTT	2	8	22839	22846	0 %	75 %	25 %	0 %	116332466
68	NC_008511	GATT	2	8	23161	23168	25 %	50 %	25 %	0 %	116332466
69	NC_008511	ATTG	2	8	23180	23187	25 %	50 %	25 %	0 %	116332466
70	NC_008511	TCAA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	116332466
71	NC_008511	AGAT	2	8	23817	23824	50 %	25 %	25 %	0 %	116332467
72	NC_008511	ACTT	2	8	24150	24157	25 %	50 %	0 %	25 %	116332467
73	NC_008511	TCAG	2	8	24295	24302	25 %	25 %	25 %	25 %	116332468
74	NC_008511	TAAT	2	8	24970	24977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008511	ATTT	2	8	25051	25058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008511	AGAA	2	8	26258	26265	75 %	0 %	25 %	0 %	116332469
77	NC_008511	TTTG	2	8	26519	26526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008511	GATC	2	8	26552	26559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008511	TTTG	2	8	26636	26643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008511	CGAA	2	8	26790	26797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008511	TCGG	2	8	26812	26819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008511	TAAA	2	8	28728	28735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008511	CAAT	2	8	28980	28987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008511	TAAT	2	8	29541	29548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008511	TAAA	2	8	29560	29567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008511	TGGC	2	8	29643	29650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008511	ATAG	2	8	29700	29707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008511	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116332471
89	NC_008511	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116332471
90	NC_008511	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116332471
91	NC_008511	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116332471
92	NC_008511	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116332471
93	NC_008511	AAAG	2	8	31015	31022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008511	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116332472
95	NC_008511	AAAT	2	8	31826	31833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008511	AAGT	2	8	31859	31866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008511	TTCG	2	8	32173	32180	0 %	50 %	25 %	25 %	116332473
98	NC_008511	TGTT	2	8	32690	32697	0 %	75 %	25 %	0 %	116332474
99	NC_008511	CGAT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	25 %	25 %	116332475
100	NC_008511	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116332475
101	NC_008511	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116332475
102	NC_008511	CTTC	2	8	34899	34906	0 %	50 %	0 %	50 %	116332476
103	NC_008511	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116332477
104	NC_008511	CTAT	2	8	35758	35765	25 %	50 %	0 %	25 %	116332477
105	NC_008511	AAGG	2	8	36345	36352	50 %	0 %	50 %	0 %	116332478
106	NC_008511	AAAG	2	8	37031	37038	75 %	0 %	25 %	0 %	116332479
107	NC_008511	CTTT	2	8	37134	37141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008511	AAGA	2	8	37786	37793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008511	GAAA	2	8	37978	37985	75 %	0 %	25 %	0 %	116332480
110	NC_008511	CCTA	2	8	38147	38154	25 %	25 %	0 %	50 %	116332480
111	NC_008511	GATC	2	8	38335	38342	25 %	25 %	25 %	25 %	116332480
112	NC_008511	TCTT	2	8	39486	39493	0 %	75 %	0 %	25 %	116332481
113	NC_008511	CGGT	2	8	39914	39921	0 %	25 %	50 %	25 %	116332481
114	NC_008511	ACTT	2	8	39983	39990	25 %	50 %	0 %	25 %	116332481
115	NC_008511	TTGT	2	8	40012	40019	0 %	75 %	25 %	0 %	116332481
116	NC_008511	GATT	2	8	40471	40478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008511	GGAA	2	8	40873	40880	50 %	0 %	50 %	0 %	116332482
118	NC_008511	ACGA	2	8	41685	41692	50 %	0 %	25 %	25 %	116332482
119	NC_008511	GTAA	2	8	41935	41942	50 %	25 %	25 %	0 %	116332482
120	NC_008511	AGCG	2	8	41995	42002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008511	AAAC	2	8	42177	42184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008511	GTTA	2	8	42681	42688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008511	TCGA	2	8	42833	42840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008511	AAGT	2	8	42954	42961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008511	TCGA	2	8	43161	43168	25 %	25 %	25 %	25 %	116332483
126	NC_008511	ATTT	2	8	43998	44005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008511	CAAT	2	8	45309	45316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008511	CGAT	2	8	45859	45866	25 %	25 %	25 %	25 %	116332484
129	NC_008511	TGAT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	25 %	0 %	116332485
130	NC_008511	AAAG	2	8	46601	46608	75 %	0 %	25 %	0 %	116332485
131	NC_008511	AAAT	2	8	47013	47020	75 %	25 %	0 %	0 %	116332485
132	NC_008511	TTAC	2	8	47284	47291	25 %	50 %	0 %	25 %	116332486
133	NC_008511	GAAA	2	8	47437	47444	75 %	0 %	25 %	0 %	116332486
134	NC_008511	GAAC	2	8	47787	47794	50 %	0 %	25 %	25 %	116332486
135	NC_008511	AAAG	2	8	48317	48324	75 %	0 %	25 %	0 %	116332487
136	NC_008511	GCTC	2	8	48627	48634	0 %	25 %	25 %	50 %	116332487
137	NC_008511	TCGA	2	8	48864	48871	25 %	25 %	25 %	25 %	116332487
138	NC_008511	GCAA	2	8	49315	49322	50 %	0 %	25 %	25 %	116332488
139	NC_008511	GACG	2	8	49600	49607	25 %	0 %	50 %	25 %	116332488
140	NC_008511	TTCT	2	8	49890	49897	0 %	75 %	0 %	25 %	116332488
141	NC_008511	TTTC	2	8	51146	51153	0 %	75 %	0 %	25 %	116332490
142	NC_008511	ACGT	2	8	51271	51278	25 %	25 %	25 %	25 %	116332490
143	NC_008511	TCAA	2	8	53193	53200	50 %	25 %	0 %	25 %	116332491
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145	NC_008511	TCGT	2	8	53544	53551	0 %	50 %	25 %	25 %	116332491
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