MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	AATC	2	8	642	649	50 %	25 %	0 %	25 %	116332446
2	NC_008511	CCAA	2	8	1054	1061	50 %	0 %	0 %	50 %	116332447
3	NC_008511	ATTT	2	8	1473	1480	25 %	75 %	0 %	0 %	116332447
4	NC_008511	AACT	2	8	2258	2265	50 %	25 %	0 %	25 %	116332448
5	NC_008511	TTCC	2	8	2468	2475	0 %	50 %	0 %	50 %	116332448
6	NC_008511	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	116332449
7	NC_008511	TTTC	2	8	3223	3230	0 %	75 %	0 %	25 %	116332449
8	NC_008511	ATGG	2	8	3257	3264	25 %	25 %	50 %	0 %	116332449
9	NC_008511	GATC	2	8	3502	3509	25 %	25 %	25 %	25 %	116332449
10	NC_008511	TATT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	116332449
11	NC_008511	CGTT	2	8	3763	3770	0 %	50 %	25 %	25 %	116332449
12	NC_008511	CGCC	2	8	3784	3791	0 %	0 %	25 %	75 %	116332449
13	NC_008511	CCTT	2	8	3898	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
14	NC_008511	GGAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	75 %	0 %	116332449
15	NC_008511	TTCC	2	8	5031	5038	0 %	50 %	0 %	50 %	116332449
16	NC_008511	TTGG	2	8	5314	5321	0 %	50 %	50 %	0 %	116332449
17	NC_008511	GGAC	2	8	6058	6065	25 %	0 %	50 %	25 %	116332450
18	NC_008511	TTCG	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
19	NC_008511	TTGC	2	8	6321	6328	0 %	50 %	25 %	25 %	116332450
20	NC_008511	AATC	2	8	6363	6370	50 %	25 %	0 %	25 %	116332450
21	NC_008511	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	116332451
22	NC_008511	AAAG	2	8	7421	7428	75 %	0 %	25 %	0 %	116332451
23	NC_008511	ACGA	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	116332452
24	NC_008511	GAAA	2	8	8869	8876	75 %	0 %	25 %	0 %	116332453
25	NC_008511	AATA	2	8	9453	9460	75 %	25 %	0 %	0 %	116332454
26	NC_008511	TGAT	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	116332454
27	NC_008511	TCTT	2	8	9668	9675	0 %	75 %	0 %	25 %	116332454
28	NC_008511	ATTT	2	8	9887	9894	25 %	75 %	0 %	0 %	116332454
29	NC_008511	CGAA	2	8	10494	10501	50 %	0 %	25 %	25 %	116332455
30	NC_008511	TAAG	2	8	10662	10669	50 %	25 %	25 %	0 %	116332455
31	NC_008511	GAAA	2	8	10697	10704	75 %	0 %	25 %	0 %	116332455
32	NC_008511	CAAA	2	8	10903	10910	75 %	0 %	0 %	25 %	116332455
33	NC_008511	ATCC	2	8	11043	11050	25 %	25 %	0 %	50 %	116332455
34	NC_008511	CAAA	2	8	11519	11526	75 %	0 %	0 %	25 %	116332455
35	NC_008511	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	116332456
36	NC_008511	CGGA	2	8	11893	11900	25 %	0 %	50 %	25 %	116332456
37	NC_008511	AAAG	2	8	13146	13153	75 %	0 %	25 %	0 %	116332457
38	NC_008511	GATC	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	116332457
39	NC_008511	TCAT	2	8	14177	14184	25 %	50 %	0 %	25 %	116332458
40	NC_008511	TTTC	2	8	14299	14306	0 %	75 %	0 %	25 %	116332458
41	NC_008511	ATTC	2	8	14989	14996	25 %	50 %	0 %	25 %	116332459
42	NC_008511	GAAA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	25 %	0 %	116332459
43	NC_008511	AAGG	2	8	15308	15315	50 %	0 %	50 %	0 %	116332459
44	NC_008511	AGGC	2	8	15444	15451	25 %	0 %	50 %	25 %	116332460
45	NC_008511	GAAT	2	8	15884	15891	50 %	25 %	25 %	0 %	116332460
46	NC_008511	TTGG	2	8	16300	16307	0 %	50 %	50 %	0 %	116332460
47	NC_008511	TTCG	2	8	16524	16531	0 %	50 %	25 %	25 %	116332461
48	NC_008511	AGAA	2	8	16789	16796	75 %	0 %	25 %	0 %	116332461
49	NC_008511	CTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	0 %	50 %	116332461
50	NC_008511	ATTT	2	8	19786	19793	25 %	75 %	0 %	0 %	116332463
51	NC_008511	ATCA	2	8	19898	19905	50 %	25 %	0 %	25 %	116332463
52	NC_008511	GGAA	2	8	20005	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	116332463
53	NC_008511	GATT	2	8	21164	21171	25 %	50 %	25 %	0 %	116332464
54	NC_008511	TCCC	2	8	22009	22016	0 %	25 %	0 %	75 %	116332465
55	NC_008511	GGGA	2	8	22313	22320	25 %	0 %	75 %	0 %	116332465
56	NC_008511	GTTT	2	8	22839	22846	0 %	75 %	25 %	0 %	116332466
57	NC_008511	GATT	2	8	23161	23168	25 %	50 %	25 %	0 %	116332466
58	NC_008511	ATTG	2	8	23180	23187	25 %	50 %	25 %	0 %	116332466
59	NC_008511	TCAA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	116332466
60	NC_008511	AGAT	2	8	23817	23824	50 %	25 %	25 %	0 %	116332467
61	NC_008511	ACTT	2	8	24150	24157	25 %	50 %	0 %	25 %	116332467
62	NC_008511	TCAG	2	8	24295	24302	25 %	25 %	25 %	25 %	116332468
63	NC_008511	AGAA	2	8	26258	26265	75 %	0 %	25 %	0 %	116332469
64	NC_008511	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116332471
65	NC_008511	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116332471
66	NC_008511	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116332471
67	NC_008511	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116332471
68	NC_008511	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116332471
69	NC_008511	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116332472
70	NC_008511	TTCG	2	8	32173	32180	0 %	50 %	25 %	25 %	116332473
71	NC_008511	TGTT	2	8	32690	32697	0 %	75 %	25 %	0 %	116332474
72	NC_008511	CGAT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	25 %	25 %	116332475
73	NC_008511	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116332475
74	NC_008511	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116332475
75	NC_008511	CTTC	2	8	34899	34906	0 %	50 %	0 %	50 %	116332476
76	NC_008511	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116332477
77	NC_008511	CTAT	2	8	35758	35765	25 %	50 %	0 %	25 %	116332477
78	NC_008511	AAGG	2	8	36345	36352	50 %	0 %	50 %	0 %	116332478
79	NC_008511	AAAG	2	8	37031	37038	75 %	0 %	25 %	0 %	116332479
80	NC_008511	GAAA	2	8	37978	37985	75 %	0 %	25 %	0 %	116332480
81	NC_008511	CCTA	2	8	38147	38154	25 %	25 %	0 %	50 %	116332480
82	NC_008511	GATC	2	8	38335	38342	25 %	25 %	25 %	25 %	116332480
83	NC_008511	TCTT	2	8	39486	39493	0 %	75 %	0 %	25 %	116332481
84	NC_008511	CGGT	2	8	39914	39921	0 %	25 %	50 %	25 %	116332481
85	NC_008511	ACTT	2	8	39983	39990	25 %	50 %	0 %	25 %	116332481
86	NC_008511	TTGT	2	8	40012	40019	0 %	75 %	25 %	0 %	116332481
87	NC_008511	GGAA	2	8	40873	40880	50 %	0 %	50 %	0 %	116332482
88	NC_008511	ACGA	2	8	41685	41692	50 %	0 %	25 %	25 %	116332482
89	NC_008511	GTAA	2	8	41935	41942	50 %	25 %	25 %	0 %	116332482
90	NC_008511	TCGA	2	8	43161	43168	25 %	25 %	25 %	25 %	116332483
91	NC_008511	CGAT	2	8	45859	45866	25 %	25 %	25 %	25 %	116332484
92	NC_008511	TGAT	2	8	46539	46546	25 %	50 %	25 %	0 %	116332485
93	NC_008511	AAAG	2	8	46601	46608	75 %	0 %	25 %	0 %	116332485
94	NC_008511	AAAT	2	8	47013	47020	75 %	25 %	0 %	0 %	116332485
95	NC_008511	TTAC	2	8	47284	47291	25 %	50 %	0 %	25 %	116332486
96	NC_008511	GAAA	2	8	47437	47444	75 %	0 %	25 %	0 %	116332486
97	NC_008511	GAAC	2	8	47787	47794	50 %	0 %	25 %	25 %	116332486
98	NC_008511	AAAG	2	8	48317	48324	75 %	0 %	25 %	0 %	116332487
99	NC_008511	GCTC	2	8	48627	48634	0 %	25 %	25 %	50 %	116332487
100	NC_008511	TCGA	2	8	48864	48871	25 %	25 %	25 %	25 %	116332487
101	NC_008511	GCAA	2	8	49315	49322	50 %	0 %	25 %	25 %	116332488
102	NC_008511	GACG	2	8	49600	49607	25 %	0 %	50 %	25 %	116332488
103	NC_008511	TTCT	2	8	49890	49897	0 %	75 %	0 %	25 %	116332488
104	NC_008511	TTTC	2	8	51146	51153	0 %	75 %	0 %	25 %	116332490
105	NC_008511	ACGT	2	8	51271	51278	25 %	25 %	25 %	25 %	116332490
106	NC_008511	TCAA	2	8	53193	53200	50 %	25 %	0 %	25 %	116332491
107	NC_008511	AGAA	2	8	53432	53439	75 %	0 %	25 %	0 %	116332491
108	NC_008511	TCGT	2	8	53544	53551	0 %	50 %	25 %	25 %	116332491
109	NC_008511	GGAC	2	8	53860	53867	25 %	0 %	50 %	25 %	116332491
110	NC_008511	TGAG	2	8	53943	53950	25 %	25 %	50 %	0 %	116332491
111	NC_008511	TGTT	2	8	55141	55148	0 %	75 %	25 %	0 %	116332493
112	NC_008511	TTAC	2	8	55983	55990	25 %	50 %	0 %	25 %	116332495
113	NC_008511	GGAA	2	8	56522	56529	50 %	0 %	50 %	0 %	116332495
114	NC_008511	ATTT	2	8	56764	56771	25 %	75 %	0 %	0 %	116332495
115	NC_008511	TGAT	2	8	57596	57603	25 %	50 %	25 %	0 %	116332496
116	NC_008511	AGTG	2	8	57641	57648	25 %	25 %	50 %	0 %	116332496
117	NC_008511	TCTT	2	8	57916	57923	0 %	75 %	0 %	25 %	116332496
118	NC_008511	TTGT	2	8	58166	58173	0 %	75 %	25 %	0 %	116332497
119	NC_008511	TTCC	2	8	58359	58366	0 %	50 %	0 %	50 %	116332497
120	NC_008511	TCAA	2	8	58389	58396	50 %	25 %	0 %	25 %	116332497
121	NC_008511	ATTT	2	8	60397	60404	25 %	75 %	0 %	0 %	116332499
122	NC_008511	CAAT	2	8	60757	60764	50 %	25 %	0 %	25 %	116332499
123	NC_008511	AAAG	2	8	61754	61761	75 %	0 %	25 %	0 %	116332500
124	NC_008511	ATCG	2	8	63429	63436	25 %	25 %	25 %	25 %	116332501
125	NC_008511	TCGG	2	8	63688	63695	0 %	25 %	50 %	25 %	116332501
126	NC_008511	CGGG	2	8	64507	64514	0 %	0 %	75 %	25 %	116332502
127	NC_008511	TTCT	2	8	65855	65862	0 %	75 %	0 %	25 %	116332503
128	NC_008511	TTTG	2	8	66639	66646	0 %	75 %	25 %	0 %	116332504
129	NC_008511	TTTC	2	8	67378	67385	0 %	75 %	0 %	25 %	116332504
130	NC_008511	ATGT	2	8	67567	67574	25 %	50 %	25 %	0 %	116332504
131	NC_008511	TTGA	2	8	67734	67741	25 %	50 %	25 %	0 %	116332504
132	NC_008511	AGAA	2	8	68127	68134	75 %	0 %	25 %	0 %	116332505
133	NC_008511	TTCT	2	8	68189	68196	0 %	75 %	0 %	25 %	116332505
134	NC_008511	ATTT	2	8	68382	68389	25 %	75 %	0 %	0 %	116332505
135	NC_008511	GATT	2	8	68414	68421	25 %	50 %	25 %	0 %	116332505
136	NC_008511	ATTC	2	8	68586	68593	25 %	50 %	0 %	25 %	116332505
137	NC_008511	GAAA	3	12	68692	68703	75 %	0 %	25 %	0 %	116332505
138	NC_008511	GACG	2	8	69075	69082	25 %	0 %	50 %	25 %	116332505
139	NC_008511	CAAA	2	8	69132	69139	75 %	0 %	0 %	25 %	116332505
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