MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	CT	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	116332446
2	NC_008511	GA	3	6	456	461	50 %	0 %	50 %	0 %	116332446
3	NC_008511	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	116332446
4	NC_008511	CT	3	6	901	906	0 %	50 %	0 %	50 %	116332447
5	NC_008511	CT	3	6	1311	1316	0 %	50 %	0 %	50 %	116332447
6	NC_008511	TA	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	116332447
7	NC_008511	TC	3	6	6231	6236	0 %	50 %	0 %	50 %	116332450
8	NC_008511	AT	3	6	8294	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	116332452
9	NC_008511	TC	3	6	8417	8422	0 %	50 %	0 %	50 %	116332452
10	NC_008511	TG	3	6	8498	8503	0 %	50 %	50 %	0 %	116332452
11	NC_008511	CA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	0 %	50 %	116332453
12	NC_008511	TA	3	6	8905	8910	50 %	50 %	0 %	0 %	116332453
13	NC_008511	GA	3	6	8993	8998	50 %	0 %	50 %	0 %	116332453
14	NC_008511	AG	3	6	9096	9101	50 %	0 %	50 %	0 %	116332454
15	NC_008511	GT	3	6	9598	9603	0 %	50 %	50 %	0 %	116332454
16	NC_008511	AC	3	6	11207	11212	50 %	0 %	0 %	50 %	116332455
17	NC_008511	CT	3	6	12775	12780	0 %	50 %	0 %	50 %	116332457
18	NC_008511	CG	3	6	12881	12886	0 %	0 %	50 %	50 %	116332457
19	NC_008511	TA	3	6	14590	14595	50 %	50 %	0 %	0 %	116332458
20	NC_008511	AG	3	6	15918	15923	50 %	0 %	50 %	0 %	116332460
21	NC_008511	TC	3	6	15928	15933	0 %	50 %	0 %	50 %	116332460
22	NC_008511	AG	3	6	16292	16297	50 %	0 %	50 %	0 %	116332460
23	NC_008511	AG	3	6	16380	16385	50 %	0 %	50 %	0 %	116332460
24	NC_008511	TC	3	6	16695	16700	0 %	50 %	0 %	50 %	116332461
25	NC_008511	GA	3	6	16754	16759	50 %	0 %	50 %	0 %	116332461
26	NC_008511	TC	3	6	16823	16828	0 %	50 %	0 %	50 %	116332461
27	NC_008511	AG	3	6	17216	17221	50 %	0 %	50 %	0 %	116332461
28	NC_008511	CT	3	6	17633	17638	0 %	50 %	0 %	50 %	116332461
29	NC_008511	CT	3	6	18336	18341	0 %	50 %	0 %	50 %	116332462
30	NC_008511	TA	3	6	18383	18388	50 %	50 %	0 %	0 %	116332462
31	NC_008511	AC	3	6	20600	20605	50 %	0 %	0 %	50 %	116332464
32	NC_008511	GA	4	8	21378	21385	50 %	0 %	50 %	0 %	116332465
33	NC_008511	GA	3	6	21847	21852	50 %	0 %	50 %	0 %	116332465
34	NC_008511	AT	3	6	23129	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	116332466
35	NC_008511	TC	3	6	23292	23297	0 %	50 %	0 %	50 %	116332466
36	NC_008511	GA	3	6	23405	23410	50 %	0 %	50 %	0 %	116332466
37	NC_008511	GA	3	6	23505	23510	50 %	0 %	50 %	0 %	116332466
38	NC_008511	GA	3	6	24165	24170	50 %	0 %	50 %	0 %	116332467
39	NC_008511	AT	3	6	24250	24255	50 %	50 %	0 %	0 %	116332468
40	NC_008511	AG	3	6	24788	24793	50 %	0 %	50 %	0 %	116332468
41	NC_008511	TC	3	6	25924	25929	0 %	50 %	0 %	50 %	116332469
42	NC_008511	AC	3	6	25971	25976	50 %	0 %	0 %	50 %	116332469
43	NC_008511	CT	3	6	25990	25995	0 %	50 %	0 %	50 %	116332469
44	NC_008511	AT	3	6	27789	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	116332470
45	NC_008511	TC	3	6	27985	27990	0 %	50 %	0 %	50 %	116332470
46	NC_008511	CT	3	6	28089	28094	0 %	50 %	0 %	50 %	116332470
47	NC_008511	TA	3	6	28813	28818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008511	GC	3	6	28947	28952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008511	AT	3	6	29250	29255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008511	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	116332471
51	NC_008511	GT	3	6	30873	30878	0 %	50 %	50 %	0 %	116332471
52	NC_008511	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	116332471
53	NC_008511	AT	3	6	32516	32521	50 %	50 %	0 %	0 %	116332473
54	NC_008511	CT	3	6	33136	33141	0 %	50 %	0 %	50 %	116332474
55	NC_008511	CT	3	6	33660	33665	0 %	50 %	0 %	50 %	116332475
56	NC_008511	CG	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	116332475
57	NC_008511	TG	3	6	34705	34710	0 %	50 %	50 %	0 %	116332476
58	NC_008511	AG	3	6	34798	34803	50 %	0 %	50 %	0 %	116332476
59	NC_008511	GC	3	6	34978	34983	0 %	0 %	50 %	50 %	116332476
60	NC_008511	GT	3	6	35314	35319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008511	TC	3	6	37049	37054	0 %	50 %	0 %	50 %	116332479
62	NC_008511	TC	3	6	37169	37174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008511	TC	3	6	37508	37513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008511	CG	3	6	37850	37855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008511	TA	3	6	37954	37959	50 %	50 %	0 %	0 %	116332480
66	NC_008511	TA	3	6	38112	38117	50 %	50 %	0 %	0 %	116332480
67	NC_008511	CT	3	6	38828	38833	0 %	50 %	0 %	50 %	116332480
68	NC_008511	AG	3	6	41509	41514	50 %	0 %	50 %	0 %	116332482
69	NC_008511	TA	3	6	42392	42397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008511	AT	3	6	42855	42860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008511	AT	3	6	42873	42878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008511	GT	3	6	43618	43623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008511	AT	3	6	46629	46634	50 %	50 %	0 %	0 %	116332485
74	NC_008511	AC	3	6	47049	47054	50 %	0 %	0 %	50 %	116332485
75	NC_008511	AT	3	6	47230	47235	50 %	50 %	0 %	0 %	116332486
76	NC_008511	CT	3	6	47451	47456	0 %	50 %	0 %	50 %	116332486
77	NC_008511	TA	3	6	49069	49074	50 %	50 %	0 %	0 %	116332488
78	NC_008511	GA	3	6	49139	49144	50 %	0 %	50 %	0 %	116332488
79	NC_008511	AG	3	6	50728	50733	50 %	0 %	50 %	0 %	116332489
80	NC_008511	TA	3	6	51409	51414	50 %	50 %	0 %	0 %	116332490
81	NC_008511	AT	3	6	52645	52650	50 %	50 %	0 %	0 %	116332491
82	NC_008511	TA	3	6	53625	53630	50 %	50 %	0 %	0 %	116332491
83	NC_008511	AT	3	6	54628	54633	50 %	50 %	0 %	0 %	116332492
84	NC_008511	TA	3	6	54663	54668	50 %	50 %	0 %	0 %	116332492
85	NC_008511	TC	3	6	55111	55116	0 %	50 %	0 %	50 %	116332493
86	NC_008511	TC	3	6	56356	56361	0 %	50 %	0 %	50 %	116332495
87	NC_008511	AT	3	6	56390	56395	50 %	50 %	0 %	0 %	116332495
88	NC_008511	TC	3	6	56830	56835	0 %	50 %	0 %	50 %	116332495
89	NC_008511	TA	3	6	57888	57893	50 %	50 %	0 %	0 %	116332496
90	NC_008511	AG	3	6	57977	57982	50 %	0 %	50 %	0 %	116332497
91	NC_008511	AG	3	6	58032	58037	50 %	0 %	50 %	0 %	116332497
92	NC_008511	TC	3	6	58660	58665	0 %	50 %	0 %	50 %	116332497
93	NC_008511	AG	3	6	60275	60280	50 %	0 %	50 %	0 %	116332499
94	NC_008511	CG	3	6	60922	60927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008511	TA	3	6	62743	62748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008511	AG	3	6	62823	62828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008511	AC	3	6	63904	63909	50 %	0 %	0 %	50 %	116332501
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99	NC_008511	AT	3	6	64805	64810	50 %	50 %	0 %	0 %	116332502
100	NC_008511	TC	3	6	65622	65627	0 %	50 %	0 %	50 %	116332503
101	NC_008511	AG	3	6	66103	66108	50 %	0 %	50 %	0 %	116332504
102	NC_008511	GA	4	8	66620	66627	50 %	0 %	50 %	0 %	116332504
103	NC_008511	GA	3	6	67182	67187	50 %	0 %	50 %	0 %	116332504
104	NC_008511	GC	3	6	67279	67284	0 %	0 %	50 %	50 %	116332504
105	NC_008511	CA	3	6	67344	67349	50 %	0 %	0 %	50 %	116332504
106	NC_008511	TC	3	6	67909	67914	0 %	50 %	0 %	50 %	116332504
107	NC_008511	TG	3	6	67920	67925	0 %	50 %	50 %	0 %	116332504
108	NC_008511	TC	3	6	68621	68626	0 %	50 %	0 %	50 %	116332505
109	NC_008511	TA	3	6	68888	68893	50 %	50 %	0 %	0 %	116332505
110	NC_008511	GA	3	6	69650	69655	50 %	0 %	50 %	0 %	116332506
111	NC_008511	CT	3	6	70414	70419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008511	AT	6	12	71187	71198	50 %	50 %	0 %	0 %	116332507
113	NC_008511	AT	3	6	71569	71574	50 %	50 %	0 %	0 %	116332507
114	NC_008511	AT	3	6	71595	71600	50 %	50 %	0 %	0 %	116332507
115	NC_008511	AG	3	6	72515	72520	50 %	0 %	50 %	0 %	116332507
116	NC_008511	GT	3	6	72745	72750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008511	AC	3	6	72764	72769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008511	AT	3	6	73453	73458	50 %	50 %	0 %	0 %	116332508
119	NC_008511	AT	3	6	75853	75858	50 %	50 %	0 %	0 %	116332510
120	NC_008511	TA	3	6	75863	75868	50 %	50 %	0 %	0 %	116332510
121	NC_008511	AT	3	6	76606	76611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008511	AG	3	6	76978	76983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008511	GA	3	6	77187	77192	50 %	0 %	50 %	0 %	116332511
124	NC_008511	GA	3	6	79245	79250	50 %	0 %	50 %	0 %	116332512
125	NC_008511	AT	3	6	79550	79555	50 %	50 %	0 %	0 %	116332513
126	NC_008511	GA	3	6	80040	80045	50 %	0 %	50 %	0 %	116332513
127	NC_008511	AG	3	6	80435	80440	50 %	0 %	50 %	0 %	116332513
128	NC_008511	AG	3	6	81240	81245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008511	TA	3	6	81487	81492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008511	TA	4	8	82852	82859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008511	AT	3	6	83030	83035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008511	CA	3	6	83088	83093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008511	GA	3	6	85534	85539	50 %	0 %	50 %	0 %	116332515
134	NC_008511	AG	3	6	85767	85772	50 %	0 %	50 %	0 %	116332515
135	NC_008511	AG	3	6	87607	87612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008511	CG	3	6	90517	90522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008511	TG	3	6	91031	91036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008511	TC	3	6	94930	94935	0 %	50 %	0 %	50 %	116332519
139	NC_008511	TA	3	6	96377	96382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008511	AT	3	6	96961	96966	50 %	50 %	0 %	0 %	116332521
141	NC_008511	CA	3	6	97306	97311	50 %	0 %	0 %	50 %	116332521
142	NC_008511	GA	3	6	97661	97666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008511	TC	3	6	98009	98014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008511	GA	4	8	98073	98080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008511	AG	3	6	98094	98099	50 %	0 %	50 %	0 %	116332522
146	NC_008511	GA	3	6	98153	98158	50 %	0 %	50 %	0 %	116332522
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.