MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008511	TA	3	6	28813	28818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008511	GC	3	6	28947	28952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008511	AT	3	6	29250	29255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008511	GT	3	6	35314	35319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008511	TC	3	6	37169	37174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008511	TC	3	6	37508	37513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008511	CG	3	6	37850	37855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008511	TA	3	6	42392	42397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008511	AT	3	6	42855	42860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008511	AT	3	6	42873	42878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008511	GT	3	6	43618	43623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008511	CG	3	6	60922	60927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008511	TA	3	6	62743	62748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008511	AG	3	6	62823	62828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008511	CT	3	6	70414	70419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008511	GT	3	6	72745	72750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008511	AC	3	6	72764	72769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008511	AT	3	6	76606	76611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008511	AG	3	6	76978	76983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008511	AG	3	6	81240	81245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008511	TA	3	6	81487	81492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008511	TA	4	8	82852	82859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008511	AT	3	6	83030	83035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008511	CA	3	6	83088	83093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008511	AG	3	6	87607	87612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008511	CG	3	6	90517	90522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008511	TG	3	6	91031	91036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008511	TA	3	6	96377	96382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008511	GA	3	6	97661	97666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008511	TC	3	6	98009	98014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008511	GA	4	8	98073	98080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008511	GA	3	6	98973	98978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008511	TG	3	6	107675	107680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008511	AG	3	6	111973	111978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008511	GA	3	6	118060	118065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008511	AT	3	6	124393	124398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008511	TC	3	6	128399	128404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008511	AT	3	6	128405	128410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008511	AG	3	6	133145	133150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008511	TA	3	6	142860	142865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008511	CA	3	6	154179	154184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008511	CT	3	6	154903	154908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008511	TC	3	6	155298	155303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008511	AT	3	6	157385	157390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008511	TC	3	6	161715	161720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008511	CT	3	6	162147	162152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008511	AG	3	6	162762	162767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008511	GA	3	6	164339	164344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008511	AT	3	6	178383	178388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008511	GA	4	8	181752	181759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008511	CA	3	6	199234	199239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008511	TC	3	6	205644	205649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008511	TA	3	6	219027	219032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008511	GA	3	6	224563	224568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008511	TC	3	6	224880	224885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008511	AG	3	6	224958	224963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008511	AT	4	8	227644	227651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008511	GT	3	6	228044	228049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008511	CT	3	6	229024	229029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008511	TC	3	6	229420	229425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008511	TC	3	6	229999	230004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008511	TC	3	6	230232	230237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008511	GA	3	6	232508	232513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008511	GA	3	6	232538	232543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008511	AG	3	6	233043	233048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008511	GA	3	6	234095	234100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008511	GT	3	6	236663	236668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008511	AC	3	6	237461	237466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008511	TC	3	6	240944	240949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008511	CG	3	6	241424	241429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008511	CT	3	6	243316	243321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008511	TC	3	6	246273	246278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008511	AC	3	6	247157	247162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008511	GT	3	6	247610	247615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008511	TG	3	6	248731	248736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008511	AG	3	6	253225	253230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008511	AG	3	6	253534	253539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008511	AT	3	6	254845	254850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008511	CT	3	6	261306	261311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008511	TC	3	6	262013	262018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008511	AG	3	6	262185	262190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008511	GA	3	6	271182	271187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008511	CA	3	6	271920	271925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008511	GA	3	6	276300	276305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008511	GA	3	6	280758	280763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008511	TA	3	6	281903	281908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008511	TC	3	6	282678	282683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008511	TA	3	6	284017	284022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008511	TA	3	6	284258	284263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008511	GT	3	6	294222	294227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008511	AT	3	6	295272	295277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008511	TA	4	8	295353	295360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008511	AT	3	6	295361	295366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.