MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	TCCGAC	2	12	281	292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116329800
2	NC_008510	AATTAG	2	12	9603	9614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329807
3	NC_008510	AAGTAA	2	12	14428	14439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116329809
4	NC_008510	CGGAAC	2	12	15821	15832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329810
5	NC_008510	TTGGGA	2	12	15876	15887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116329810
6	NC_008510	AAAGAG	2	12	16942	16953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329811
7	NC_008510	CGGAAT	2	12	17518	17529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116329811
8	NC_008510	CTTTTG	2	12	19888	19899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116329813
9	NC_008510	GAATAT	2	12	19989	20000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329814
10	NC_008510	GATTCC	2	12	22543	22554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116329816
11	NC_008510	TCAAAA	2	12	23019	23030	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116329816
12	NC_008510	TCTTCC	2	12	24700	24711	0 %	50 %	0 %	50 %	116329817
13	NC_008510	AAAGAA	2	12	30940	30951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116329819
14	NC_008510	GAAAAG	2	12	32369	32380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116329821
15	NC_008510	GAAACC	2	12	33672	33683	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116329823
16	NC_008510	TAGGGA	2	12	39730	39741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116329826
17	NC_008510	CAAGAA	2	12	48672	48683	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116329832
18	NC_008510	GTGGAA	2	12	50488	50499	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116329834
19	NC_008510	ATCAAA	2	12	51125	51136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116329835
20	NC_008510	TAAATT	2	12	53364	53375	50 %	50 %	0 %	0 %	116329837
21	NC_008510	CGAAAC	2	12	55601	55612	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116329838
22	NC_008510	CCAAAG	2	12	62735	62746	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116329843
23	NC_008510	CTTATG	2	12	66190	66201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116329846
24	NC_008510	ATTTTT	2	12	66335	66346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116329846
25	NC_008510	TAAAGT	2	12	67950	67961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329848
26	NC_008510	ATTCCG	2	12	69376	69387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116329849
27	NC_008510	TTGAAA	2	12	69929	69940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329849
28	NC_008510	AAATTG	2	12	75935	75946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329852
29	NC_008510	GAAATG	2	12	77726	77737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116329852
30	NC_008510	AAAACG	2	12	78092	78103	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116329852
31	NC_008510	CGATTC	2	12	79618	79629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116329855
32	NC_008510	TTCTAA	2	12	84220	84231	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116329860
33	NC_008510	ACTTTT	2	12	84311	84322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116329860
34	NC_008510	AAAAAC	2	12	84462	84473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116329860
35	NC_008510	CGATTC	2	12	91825	91836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116329868
36	NC_008510	ATCCGA	2	12	95802	95813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116329872
37	NC_008510	ATTTCA	2	12	105149	105160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116329876
38	NC_008510	CTTTTT	2	12	105879	105890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116329876
39	NC_008510	TATATC	2	12	106024	106035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116329876
40	NC_008510	TCGAAA	2	12	106112	106123	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116329876
41	NC_008510	CGAAGT	2	12	107973	107984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116329877
42	NC_008510	GATTTC	2	12	111372	111383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116329879
43	NC_008510	GGAATT	2	12	112620	112631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329880
44	NC_008510	TCTTTC	2	12	113269	113280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329881
45	NC_008510	TTTGAT	2	12	115980	115991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116329883
46	NC_008510	TTAATT	2	12	123552	123563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329891
47	NC_008510	AAAATG	2	12	126056	126067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116329892
48	NC_008510	CCTTTT	2	12	137135	137146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329900
49	NC_008510	TTATAA	2	12	139968	139979	50 %	50 %	0 %	0 %	116329902
50	NC_008510	TGGAAG	2	12	143427	143438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116329904
51	NC_008510	TACTCA	2	12	148725	148736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329907
52	NC_008510	AAGTAT	2	12	151376	151387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329909
53	NC_008510	GAGGAA	2	12	152161	152172	50 %	0 %	50 %	0 %	116329910
54	NC_008510	AATTCT	2	12	152596	152607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116329911
55	NC_008510	TCTTTC	2	12	153492	153503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329912
56	NC_008510	AAAAAT	2	12	154148	154159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116329912
57	NC_008510	TTTTCC	2	12	161348	161359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116329916
58	NC_008510	AACTAA	2	12	161968	161979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116329917
59	NC_008510	AATTCG	2	12	172876	172887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116329925
60	NC_008510	GTTGAA	2	12	173032	173043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116329925
61	NC_008510	ATTCCC	2	12	173295	173306	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116329925
62	NC_008510	AATTGC	2	12	175136	175147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116329927
63	NC_008510	ATTTTA	2	12	179487	179498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116329930
64	NC_008510	CCGAAG	2	12	181003	181014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116329931
65	NC_008510	AGCCAA	2	12	182622	182633	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116329932
66	NC_008510	CGATTC	2	12	184104	184115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116329933
67	NC_008510	GTAAAA	2	12	186548	186559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116329934
68	NC_008510	GAAAAA	2	12	187891	187902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116329934
69	NC_008510	AAAGAA	2	12	187928	187939	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116329934
70	NC_008510	AAGAAA	2	12	191605	191616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116329937
71	NC_008510	AGGTGA	2	12	192407	192418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116329939
72	NC_008510	GTATGC	2	12	202239	202250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116329949
73	NC_008510	GATTTT	2	12	204486	204497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116329951
74	NC_008510	ATTGAA	2	12	207124	207135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116329954
75	NC_008510	TTTATC	2	12	214911	214922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116329961
76	NC_008510	GAATCG	2	12	217380	217391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116329963
77	NC_008510	AAGTAA	2	12	218524	218535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116329963
78	NC_008510	TTCCAA	2	12	219328	219339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116329963
79	NC_008510	TTTTTC	2	12	223045	223056	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116329966
80	NC_008510	GATTTT	2	12	224665	224676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116329968
81	NC_008510	GATGGA	2	12	228420	228431	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116329974
82	NC_008510	TTTTCG	2	12	239024	239035	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116329984
83	NC_008510	CATGAG	2	12	240394	240405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116329985
84	NC_008510	TTCAGA	2	12	244210	244221	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116329988
85	NC_008510	CAAAAT	2	12	247212	247223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116329991
86	NC_008510	TCGTTT	2	12	252818	252829	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116329997
87	NC_008510	TATTTT	2	12	258024	258035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116330000
88	NC_008510	TCGAAT	2	12	259169	259180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116330000
89	NC_008510	GTTTTT	2	12	265927	265938	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116330004
90	NC_008510	CAAAAC	2	12	266622	266633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116330005
91	NC_008510	TCTTTC	2	12	270700	270711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116330008
92	NC_008510	TCAAAA	2	12	273655	273666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116330009
93	NC_008510	TTTTGA	2	12	274144	274155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116330009
94	NC_008510	CGGTTG	2	12	275254	275265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116330010
95	NC_008510	GCTCCG	2	12	280208	280219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116330013
96	NC_008510	ATTTAT	2	12	282069	282080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116330015
97	NC_008510	ACTTTA	2	12	286551	286562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116330020
98	NC_008510	ATTTTT	2	12	293536	293547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116330022
99	NC_008510	CCTTGG	2	12	293852	293863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116330022
100	NC_008510	GTCCGT	2	12	297361	297372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116330026
101	NC_008510	TGATCG	2	12	298455	298466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116330027
102	NC_008510	CGTTTT	2	12	305622	305633	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116330031
103	NC_008510	GAAAAG	2	12	311483	311494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116330035
104	NC_008510	GTCTTT	2	12	314855	314866	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116330036
105	NC_008510	TTCCGA	2	12	322276	322287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116330041
106	NC_008510	TATCGG	2	12	329719	329730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116330042
107	NC_008510	GATTCT	2	12	335034	335045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116330048
108	NC_008510	GGTTCC	2	12	335078	335089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116330048
109	NC_008510	TTTGTT	2	12	340207	340218	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116330050
110	NC_008510	AATTTT	2	12	341593	341604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116330051
111	NC_008510	TCGGAG	2	12	343399	343410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116330053
112	NC_008510	AGTTTA	2	12	343939	343950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116330053
113	NC_008510	GGGAAC	2	12	344768	344779	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116330053
114	NC_008510	GAAAAT	2	12	350054	350065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116330058
115	NC_008510	ATACGA	2	12	350184	350195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116330058
116	NC_008510	CTGTTT	2	12	350790	350801	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116330058
117	NC_008510	AAGAGG	2	12	352813	352824	50 %	0 %	50 %	0 %	116330060
118	NC_008510	AAAATT	2	12	356010	356021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116330062
119	NC_008510	CGATTC	2	12	358998	359009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116330063
120	NC_008510	TGTTTT	2	12	360914	360925	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116330064
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227	NC_008510	TTCGTT	2	12	739737	739748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116330329
228	NC_008510	TTACGT	2	12	741142	741153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116330329
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230	NC_008510	GATTCT	2	12	742250	742261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116330332
231	NC_008510	CCCGAT	2	12	746344	746355	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116330337
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337	NC_008510	CAAAAC	2	12	1031617	1031628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116330545
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340	NC_008510	CTTCGA	2	12	1059271	1059282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116330561
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342	NC_008510	GAATCG	2	12	1060886	1060897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116330562
343	NC_008510	CTTTTA	2	12	1062182	1062193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116330563
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