MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 3564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116329800
2	NC_008510	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008510	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116329801
4	NC_008510	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116329801
5	NC_008510	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116329801
6	NC_008510	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116329801
7	NC_008510	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116329802
8	NC_008510	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116329802
9	NC_008510	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116329803
10	NC_008510	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116329804
11	NC_008510	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116329805
12	NC_008510	TCGAT	2	10	9068	9077	20 %	40 %	20 %	20 %	116329806
13	NC_008510	GGATG	2	10	14292	14301	20 %	20 %	60 %	0 %	116329809
14	NC_008510	CAGCC	2	10	16438	16447	20 %	0 %	20 %	60 %	116329811
15	NC_008510	GATCG	2	10	16740	16749	20 %	20 %	40 %	20 %	116329811
16	NC_008510	TCTTT	2	10	16805	16814	0 %	80 %	0 %	20 %	116329811
17	NC_008510	AATCC	2	10	17159	17168	40 %	20 %	0 %	40 %	116329811
18	NC_008510	TATTT	2	10	18232	18241	20 %	80 %	0 %	0 %	116329812
19	NC_008510	TTTAG	2	10	19317	19326	20 %	60 %	20 %	0 %	116329813
20	NC_008510	TAAAG	2	10	19959	19968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008510	CATTC	2	10	21585	21594	20 %	40 %	0 %	40 %	116329815
22	NC_008510	TTTGA	2	10	21619	21628	20 %	60 %	20 %	0 %	116329815
23	NC_008510	CTTTT	2	10	21732	21741	0 %	80 %	0 %	20 %	116329815
24	NC_008510	ATTTC	2	10	22060	22069	20 %	60 %	0 %	20 %	116329816
25	NC_008510	CGGAT	2	10	22288	22297	20 %	20 %	40 %	20 %	116329816
26	NC_008510	CGTAT	2	10	23564	23573	20 %	40 %	20 %	20 %	116329816
27	NC_008510	CTTGC	2	10	23767	23776	0 %	40 %	20 %	40 %	116329816
28	NC_008510	TTTTC	2	10	23870	23879	0 %	80 %	0 %	20 %	116329816
29	NC_008510	GAAAA	2	10	28313	28322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008510	TCAAA	2	10	28427	28436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008510	GAATG	2	10	28461	28470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008510	CTTCT	2	10	30551	30560	0 %	60 %	0 %	40 %	116329819
33	NC_008510	AGAAA	2	10	33869	33878	80 %	0 %	20 %	0 %	116329823
34	NC_008510	ATAAA	2	10	34532	34541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008510	AAAAT	2	10	34754	34763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008510	TGTAT	2	10	36626	36635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008510	GTTCT	2	10	36763	36772	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008510	GTTGT	2	10	37081	37090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008510	TTTCT	2	10	40334	40343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008510	CGAAA	2	10	41042	41051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008510	AATTA	2	10	44472	44481	60 %	40 %	0 %	0 %	116329829
42	NC_008510	ATGAA	2	10	45196	45205	60 %	20 %	20 %	0 %	116329830
43	NC_008510	TGGAG	2	10	46376	46385	20 %	20 %	60 %	0 %	116329831
44	NC_008510	TTCAA	2	10	46789	46798	40 %	40 %	0 %	20 %	116329831
45	NC_008510	GTGAA	2	10	47547	47556	40 %	20 %	40 %	0 %	116329831
46	NC_008510	GTTCA	2	10	48121	48130	20 %	40 %	20 %	20 %	116329832
47	NC_008510	AACGA	2	10	51298	51307	60 %	0 %	20 %	20 %	116329835
48	NC_008510	TTTGA	2	10	51594	51603	20 %	60 %	20 %	0 %	116329836
49	NC_008510	TCGAT	2	10	53210	53219	20 %	40 %	20 %	20 %	116329837
50	NC_008510	GTATT	2	10	54169	54178	20 %	60 %	20 %	0 %	116329838
51	NC_008510	TTGAA	2	10	55706	55715	40 %	40 %	20 %	0 %	116329838
52	NC_008510	GATTG	2	10	55877	55886	20 %	40 %	40 %	0 %	116329838
53	NC_008510	AAAGG	2	10	57329	57338	60 %	0 %	40 %	0 %	116329840
54	NC_008510	ACGAA	2	10	57456	57465	60 %	0 %	20 %	20 %	116329840
55	NC_008510	GCAAA	2	10	58985	58994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008510	TTTCT	2	10	59870	59879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008510	AGCGA	2	10	60398	60407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008510	AAAAT	2	10	60695	60704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008510	CGGAT	2	10	61629	61638	20 %	20 %	40 %	20 %	116329842
60	NC_008510	ACCAA	2	10	63616	63625	60 %	0 %	0 %	40 %	116329844
61	NC_008510	GTTTT	2	10	65427	65436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008510	AGAAT	2	10	65500	65509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008510	GGTTG	2	10	66056	66065	0 %	40 %	60 %	0 %	116329846
64	NC_008510	TATCC	2	10	69228	69237	20 %	40 %	0 %	40 %	116329849
65	NC_008510	AAGGA	2	10	71174	71183	60 %	0 %	40 %	0 %	116329850
66	NC_008510	GGATT	2	10	73049	73058	20 %	40 %	40 %	0 %	116329850
67	NC_008510	TCGGA	2	10	73116	73125	20 %	20 %	40 %	20 %	116329850
68	NC_008510	TTTTG	2	10	74297	74306	0 %	80 %	20 %	0 %	116329851
69	NC_008510	TAAAA	2	10	74709	74718	80 %	20 %	0 %	0 %	116329851
70	NC_008510	AAAAT	2	10	74751	74760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008510	GTTAT	2	10	75143	75152	20 %	60 %	20 %	0 %	116329852
72	NC_008510	TTGAG	2	10	76118	76127	20 %	40 %	40 %	0 %	116329852
73	NC_008510	TCCGA	2	10	76656	76665	20 %	20 %	20 %	40 %	116329852
74	NC_008510	TGCAA	2	10	76723	76732	40 %	20 %	20 %	20 %	116329852
75	NC_008510	CTTCT	2	10	76859	76868	0 %	60 %	0 %	40 %	116329852
76	NC_008510	AAAAT	2	10	78128	78137	80 %	20 %	0 %	0 %	116329852
77	NC_008510	TCCGA	2	10	79691	79700	20 %	20 %	20 %	40 %	116329855
78	NC_008510	ATAAA	2	10	80138	80147	80 %	20 %	0 %	0 %	116329856
79	NC_008510	AGAAA	2	10	81909	81918	80 %	0 %	20 %	0 %	116329859
80	NC_008510	AAAAC	2	10	82316	82325	80 %	0 %	0 %	20 %	116329859
81	NC_008510	GGAAA	2	10	85096	85105	60 %	0 %	40 %	0 %	116329861
82	NC_008510	TTTGC	2	10	85542	85551	0 %	60 %	20 %	20 %	116329862
83	NC_008510	CTTTG	2	10	85648	85657	0 %	60 %	20 %	20 %	116329862
84	NC_008510	TTGGA	2	10	85663	85672	20 %	40 %	40 %	0 %	116329862
85	NC_008510	GTTCC	2	10	87823	87832	0 %	40 %	20 %	40 %	116329864
86	NC_008510	TTATT	2	10	87946	87955	20 %	80 %	0 %	0 %	116329865
87	NC_008510	TCAGA	2	10	89087	89096	40 %	20 %	20 %	20 %	116329866
88	NC_008510	GTTTT	2	10	89237	89246	0 %	80 %	20 %	0 %	116329867
89	NC_008510	TTTCA	2	10	91036	91045	20 %	60 %	0 %	20 %	116329868
90	NC_008510	CGAAA	2	10	91308	91317	60 %	0 %	20 %	20 %	116329868
91	NC_008510	GAAAA	2	10	92988	92997	80 %	0 %	20 %	0 %	116329869
92	NC_008510	TCAAA	2	10	93102	93111	60 %	20 %	0 %	20 %	116329869
93	NC_008510	GAATG	2	10	93136	93145	40 %	20 %	40 %	0 %	116329869
94	NC_008510	AAGAT	2	10	95217	95226	60 %	20 %	20 %	0 %	116329871
95	NC_008510	AAACC	2	10	95254	95263	60 %	0 %	0 %	40 %	116329871
96	NC_008510	TTCCG	2	10	96492	96501	0 %	40 %	20 %	40 %	116329872
97	NC_008510	ATTGT	2	10	96627	96636	20 %	60 %	20 %	0 %	116329872
98	NC_008510	TATAT	2	10	97787	97796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008510	ATTAA	2	10	98213	98222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008510	GAAAA	2	10	99182	99191	80 %	0 %	20 %	0 %	116329873
101	NC_008510	TCAAA	2	10	99296	99305	60 %	20 %	0 %	20 %	116329873
102	NC_008510	GAATG	2	10	99330	99339	40 %	20 %	40 %	0 %	116329873
103	NC_008510	GCCGC	2	10	102709	102718	0 %	0 %	40 %	60 %	116329874
104	NC_008510	GGTGC	2	10	103071	103080	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008510	TGAAA	2	10	103678	103687	60 %	20 %	20 %	0 %	116329875
106	NC_008510	ACCCC	2	10	103736	103745	20 %	0 %	0 %	80 %	116329875
107	NC_008510	TTTTC	2	10	103927	103936	0 %	80 %	0 %	20 %	116329875
108	NC_008510	GGAAA	2	10	104555	104564	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008510	CGTTT	2	10	104910	104919	0 %	60 %	20 %	20 %	116329876
110	NC_008510	GAAAT	2	10	105211	105220	60 %	20 %	20 %	0 %	116329876
111	NC_008510	ATTGC	2	10	105648	105657	20 %	40 %	20 %	20 %	116329876
112	NC_008510	GAATC	2	10	106039	106048	40 %	20 %	20 %	20 %	116329876
113	NC_008510	GGAAA	2	10	108111	108120	60 %	0 %	40 %	0 %	116329877
114	NC_008510	AATTT	2	10	108757	108766	40 %	60 %	0 %	0 %	116329877
115	NC_008510	CCTTT	2	10	112021	112030	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008510	CGATC	2	10	115315	115324	20 %	20 %	20 %	40 %	116329882
117	NC_008510	TCGAT	2	10	119028	119037	20 %	40 %	20 %	20 %	116329886
118	NC_008510	AAAGG	2	10	119856	119865	60 %	0 %	40 %	0 %	116329887
119	NC_008510	GAAAA	2	10	120233	120242	80 %	0 %	20 %	0 %	116329888
120	NC_008510	TTTTC	2	10	120914	120923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008510	AAAAT	2	10	120995	121004	80 %	20 %	0 %	0 %	116329889
122	NC_008510	AGCGC	2	10	121873	121882	20 %	0 %	40 %	40 %	116329889
123	NC_008510	ATTTT	2	10	122454	122463	20 %	80 %	0 %	0 %	116329890
124	NC_008510	AAATT	2	10	122797	122806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008510	TATAT	2	10	123122	123131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008510	AAAAT	2	10	123449	123458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008510	CAATG	2	10	124484	124493	40 %	20 %	20 %	20 %	116329891
128	NC_008510	AAAGT	2	10	124627	124636	60 %	20 %	20 %	0 %	116329891
129	NC_008510	ACTTT	2	10	125313	125322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008510	CGCTT	2	10	125735	125744	0 %	40 %	20 %	40 %	116329892
131	NC_008510	TCGGA	2	10	126781	126790	20 %	20 %	40 %	20 %	116329893
132	NC_008510	GAATT	2	10	127346	127355	40 %	40 %	20 %	0 %	116329893
133	NC_008510	GAGTT	2	10	127520	127529	20 %	40 %	40 %	0 %	116329894
134	NC_008510	AATCA	2	10	127915	127924	60 %	20 %	0 %	20 %	116329894
135	NC_008510	AACTC	2	10	128934	128943	40 %	20 %	0 %	40 %	116329894
136	NC_008510	AAGTA	2	10	129757	129766	60 %	20 %	20 %	0 %	116329895
137	NC_008510	CAAAA	2	10	129811	129820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008510	AAAAG	2	10	130568	130577	80 %	0 %	20 %	0 %	116329896
139	NC_008510	GCTCG	2	10	131052	131061	0 %	20 %	40 %	40 %	116329896
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272	NC_008510	CTTTT	2	10	244748	244757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_008510	GAACG	2	10	245820	245829	40 %	0 %	40 %	20 %	116329990
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276	NC_008510	AATCG	2	10	251046	251055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_008510	GTTTT	2	10	251201	251210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_008510	ATTGC	2	10	252022	252031	20 %	40 %	20 %	20 %	116329996
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281	NC_008510	CATTC	2	10	256767	256776	20 %	40 %	0 %	40 %	116329999
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285	NC_008510	GATTT	2	10	259575	259584	20 %	60 %	20 %	0 %	116330001
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287	NC_008510	GAAAA	2	10	261582	261591	80 %	0 %	20 %	0 %	116330002
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320	NC_008510	ATTTT	2	10	293984	293993	20 %	80 %	0 %	0 %	116330022
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383	NC_008510	CGTTT	2	10	357418	357427	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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393	NC_008510	GCGAA	2	10	368141	368150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_008510	TCGGC	2	10	368991	369000	0 %	20 %	40 %	40 %	116330068
395	NC_008510	AGATG	2	10	369175	369184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
396	NC_008510	AAGAT	2	10	370949	370958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_008510	TTCCA	2	10	376768	376777	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
401	NC_008510	ATGAT	2	10	377628	377637	40 %	40 %	20 %	0 %	116330071
402	NC_008510	GCGCG	2	10	378331	378340	0 %	0 %	60 %	40 %	116330071
403	NC_008510	CATTC	2	10	380107	380116	20 %	40 %	0 %	40 %	116330072
404	NC_008510	TTTGA	2	10	380141	380150	20 %	60 %	20 %	0 %	116330072
405	NC_008510	CTTTT	2	10	380254	380263	0 %	80 %	0 %	20 %	116330072
406	NC_008510	ATTTT	2	10	380440	380449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_008510	TGAAA	2	10	382249	382258	60 %	20 %	20 %	0 %	116330073
408	NC_008510	GAAGA	2	10	382852	382861	60 %	0 %	40 %	0 %	116330073
409	NC_008510	GTACT	2	10	383004	383013	20 %	40 %	20 %	20 %	116330073
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411	NC_008510	ATTTC	2	10	386013	386022	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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428	NC_008510	GAATC	2	10	404425	404434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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442	NC_008510	TTTAC	2	10	417250	417259	20 %	60 %	0 %	20 %	116330100
443	NC_008510	TTTGA	2	10	418025	418034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_008510	GCCAC	2	10	418326	418335	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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446	NC_008510	AACTG	2	10	420544	420553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
447	NC_008510	GAACT	2	10	420911	420920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
448	NC_008510	TGTAG	2	10	420963	420972	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
449	NC_008510	TCTTT	2	10	422631	422640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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456	NC_008510	TCCGA	2	10	436018	436027	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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