MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008510	TAAAG	2	10	19959	19968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008510	GAAAA	2	10	28313	28322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008510	TCAAA	2	10	28427	28436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008510	GAATG	2	10	28461	28470	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008510	ATAAA	2	10	34532	34541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008510	AAAAT	2	10	34754	34763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008510	TGTAT	2	10	36626	36635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008510	GTTCT	2	10	36763	36772	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008510	GTTGT	2	10	37081	37090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008510	TTTCT	2	10	40334	40343	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008510	CGAAA	2	10	41042	41051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008510	GCAAA	2	10	58985	58994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008510	TTTCT	2	10	59870	59879	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008510	AGCGA	2	10	60398	60407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008510	AAAAT	2	10	60695	60704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008510	GTTTT	2	10	65427	65436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008510	AGAAT	2	10	65500	65509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008510	AAAAT	2	10	74751	74760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008510	TATAT	2	10	97787	97796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008510	ATTAA	2	10	98213	98222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008510	GGTGC	2	10	103071	103080	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008510	GGAAA	2	10	104555	104564	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008510	CCTTT	2	10	112021	112030	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008510	TTTTC	2	10	120914	120923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008510	AAATT	2	10	122797	122806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008510	TATAT	2	10	123122	123131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008510	AAAAT	2	10	123449	123458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008510	ACTTT	2	10	125313	125322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008510	CAAAA	2	10	129811	129820	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008510	AAGTA	2	10	131310	131319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008510	TTGAA	2	10	134555	134564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008510	AATTT	2	10	147416	147425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008510	TAATA	2	10	148393	148402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008510	CAAAA	2	10	149464	149473	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008510	GCATT	2	10	164102	164111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008510	GAATA	2	10	164627	164636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008510	AGCGA	2	10	177592	177601	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008510	AGAAT	2	10	178195	178204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008510	AACGG	2	10	185941	185950	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008510	ATTCA	2	10	189905	189914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008510	TTTCA	2	10	193105	193114	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008510	TAAAA	2	10	193152	193161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008510	ATTTT	2	10	193277	193286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008510	TAGAT	2	10	193823	193832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008510	TACAA	2	10	206716	206725	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008510	CGATT	2	10	213420	213429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008510	ACTAT	2	10	214315	214324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008510	TGTAT	2	10	215959	215968	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008510	CTTTT	2	10	224157	224166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008510	GTATT	2	10	235847	235856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008510	CTTTT	2	10	244748	244757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008510	GATTG	2	10	249583	249592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008510	AATCG	2	10	251046	251055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008510	GTTTT	2	10	251201	251210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008510	AAACA	2	10	255310	255319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008510	AGCGA	2	10	257868	257877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008510	CAAAA	2	10	261550	261559	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008510	TCTTG	2	10	270242	270251	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008510	GTTTT	2	10	276853	276862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008510	TGAAA	2	10	282555	282564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008510	AAATA	2	10	282594	282603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008510	AAGTT	2	10	282658	282667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008510	GAGAA	2	10	283159	283168	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008510	TTTTC	2	10	283787	283796	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008510	GAATC	2	10	290674	290683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008510	AAATT	2	10	290734	290743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008510	GGCAT	2	10	292248	292257	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008510	ATTTT	2	10	296608	296617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008510	AAACG	2	10	297689	297698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008510	TTTTA	2	10	303128	303137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008510	CGATT	2	10	317890	317899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008510	ATTCG	2	10	322028	322037	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008510	TTGTA	2	10	324323	324332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008510	CACGA	2	10	328094	328103	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008510	TAGTA	2	10	328215	328224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008510	ATTTT	2	10	332353	332362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008510	ATCGA	2	10	334710	334719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008510	ATTTC	2	10	336633	336642	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008510	TCCAA	2	10	337237	337246	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008510	CACAA	2	10	338752	338761	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008510	GTTTT	2	10	338767	338776	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008510	GATTC	2	10	339542	339551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008510	TTCTT	2	10	345769	345778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008510	ATTTT	2	10	347700	347709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008510	AAAAT	2	10	349044	349053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008510	GGAAT	2	10	350888	350897	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008510	TACAT	2	10	353409	353418	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008510	TAATA	2	10	353509	353518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008510	ATTGC	2	10	356740	356749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008510	CGTTT	2	10	357418	357427	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008510	ATTCT	2	10	358028	358037	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008510	GCGAA	2	10	368141	368150	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008510	AGATG	2	10	369175	369184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008510	AAGAT	2	10	370949	370958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008510	ATATA	2	10	376464	376473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008510	TTCCA	2	10	376768	376777	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008510	ATTTT	2	10	380440	380449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008510	GAAAA	2	10	386002	386011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008510	ATTTC	2	10	386013	386022	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008510	TTTTC	2	10	389493	389502	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008510	TCCTA	2	10	392084	392093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008510	GTGTT	2	10	403471	403480	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008510	CTTTT	2	10	404250	404259	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008510	GAATC	2	10	404425	404434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008510	TATTT	2	10	404705	404714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008510	TTTCC	2	10	413322	413331	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008510	TTTGA	2	10	418025	418034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008510	GCCAC	2	10	418326	418335	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_008510	TCCGA	2	10	419223	419232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008510	AACTG	2	10	420544	420553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008510	GAACT	2	10	420911	420920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008510	TGTAG	2	10	420963	420972	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008510	TCTTT	2	10	422631	422640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008510	TGACA	2	10	428790	428799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008510	CGAAA	2	10	431734	431743	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008510	GCAAA	2	10	432731	432740	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008510	AATAT	2	10	434445	434454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008510	TCCGA	2	10	436018	436027	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008510	ACGAA	2	10	436618	436627	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008510	TCGGA	2	10	436904	436913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008510	AAATT	2	10	441214	441223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008510	TAAAA	2	10	442700	442709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008510	GATTC	2	10	443382	443391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008510	GGATA	2	10	446079	446088	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008510	GAATC	2	10	471328	471337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008510	TAAAA	2	10	471677	471686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008510	CAAAA	2	10	474504	474513	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008510	TTTAC	2	10	479836	479845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008510	AGGTT	2	10	495474	495483	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008510	CATAA	2	10	501148	501157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008510	AAAAC	2	10	512763	512772	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008510	GTAAT	2	10	530409	530418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008510	TGTTT	2	10	532480	532489	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008510	GATCC	2	10	533378	533387	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_008510	AAATG	2	10	534211	534220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008510	TTCAA	2	10	535690	535699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008510	CGGAT	2	10	537701	537710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008510	AAATC	2	10	540890	540899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008510	CGAAA	2	10	543013	543022	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008510	CGGGA	2	10	543289	543298	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008510	GAGCG	2	10	543465	543474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008510	TAAAA	2	10	552415	552424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008510	CTATT	2	10	557819	557828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008510	AGCGA	2	10	558234	558243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008510	TGAAT	2	10	560723	560732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008510	CGAAA	2	10	561584	561593	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008510	AAATC	2	10	561812	561821	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_008510	GATTT	2	10	563049	563058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008510	TATTT	2	10	567752	567761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008510	TTTTA	2	10	570833	570842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008510	GGAAC	2	10	571098	571107	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_008510	TTTTG	2	10	597649	597658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008510	TCCGA	2	10	600179	600188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_008510	TTATA	2	10	602216	602225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008510	AAAAG	2	10	602559	602568	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008510	TTAAG	2	10	617807	617816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008510	TTTGA	2	10	623115	623124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008510	AATTT	2	10	623661	623670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_008510	GTATG	2	10	630949	630958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008510	GATTT	2	10	635595	635604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_008510	TTTGA	2	10	667751	667760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_008510	GATCG	2	10	681077	681086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_008510	TTTGA	2	10	683168	683177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008510	AAAAT	2	10	687601	687610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_008510	ATCCT	2	10	699660	699669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_008510	AGAAA	2	10	1004263	1004272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_008510	CAATT	2	10	1004463	1004472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_008510	AGATG	2	10	1006675	1006684	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_008510	AAGAT	2	10	1008449	1008458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_008510	CTAAA	2	10	1008778	1008787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
275	NC_008510	ATTGA	2	10	1010536	1010545	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_008510	AAGCA	2	10	1011850	1011859	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_008510	AAATG	2	10	1012904	1012913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_008510	TCGCT	2	10	1031959	1031968	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_008510	CAAGG	2	10	1032358	1032367	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_008510	AGTTG	2	10	1037658	1037667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_008510	AACAA	2	10	1038380	1038389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_008510	TTTTG	2	10	1039407	1039416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_008510	TGAAA	2	10	1850733	1850742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_008510	CAAAA	2	10	1934087	1934096	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

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