MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 2634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116329800
2	NC_008510	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116329801
3	NC_008510	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116329801
4	NC_008510	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116329801
5	NC_008510	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116329801
6	NC_008510	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116329802
7	NC_008510	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116329802
8	NC_008510	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116329803
9	NC_008510	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116329804
10	NC_008510	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116329805
11	NC_008510	TCGAT	2	10	9068	9077	20 %	40 %	20 %	20 %	116329806
12	NC_008510	GGATG	2	10	14292	14301	20 %	20 %	60 %	0 %	116329809
13	NC_008510	CAGCC	2	10	16438	16447	20 %	0 %	20 %	60 %	116329811
14	NC_008510	GATCG	2	10	16740	16749	20 %	20 %	40 %	20 %	116329811
15	NC_008510	TCTTT	2	10	16805	16814	0 %	80 %	0 %	20 %	116329811
16	NC_008510	AATCC	2	10	17159	17168	40 %	20 %	0 %	40 %	116329811
17	NC_008510	TATTT	2	10	18232	18241	20 %	80 %	0 %	0 %	116329812
18	NC_008510	TTTAG	2	10	19317	19326	20 %	60 %	20 %	0 %	116329813
19	NC_008510	CATTC	2	10	21585	21594	20 %	40 %	0 %	40 %	116329815
20	NC_008510	TTTGA	2	10	21619	21628	20 %	60 %	20 %	0 %	116329815
21	NC_008510	CTTTT	2	10	21732	21741	0 %	80 %	0 %	20 %	116329815
22	NC_008510	ATTTC	2	10	22060	22069	20 %	60 %	0 %	20 %	116329816
23	NC_008510	CGGAT	2	10	22288	22297	20 %	20 %	40 %	20 %	116329816
24	NC_008510	CGTAT	2	10	23564	23573	20 %	40 %	20 %	20 %	116329816
25	NC_008510	CTTGC	2	10	23767	23776	0 %	40 %	20 %	40 %	116329816
26	NC_008510	TTTTC	2	10	23870	23879	0 %	80 %	0 %	20 %	116329816
27	NC_008510	CTTCT	2	10	30551	30560	0 %	60 %	0 %	40 %	116329819
28	NC_008510	AGAAA	2	10	33869	33878	80 %	0 %	20 %	0 %	116329823
29	NC_008510	AATTA	2	10	44472	44481	60 %	40 %	0 %	0 %	116329829
30	NC_008510	ATGAA	2	10	45196	45205	60 %	20 %	20 %	0 %	116329830
31	NC_008510	TGGAG	2	10	46376	46385	20 %	20 %	60 %	0 %	116329831
32	NC_008510	TTCAA	2	10	46789	46798	40 %	40 %	0 %	20 %	116329831
33	NC_008510	GTGAA	2	10	47547	47556	40 %	20 %	40 %	0 %	116329831
34	NC_008510	GTTCA	2	10	48121	48130	20 %	40 %	20 %	20 %	116329832
35	NC_008510	AACGA	2	10	51298	51307	60 %	0 %	20 %	20 %	116329835
36	NC_008510	TTTGA	2	10	51594	51603	20 %	60 %	20 %	0 %	116329836
37	NC_008510	TCGAT	2	10	53210	53219	20 %	40 %	20 %	20 %	116329837
38	NC_008510	GTATT	2	10	54169	54178	20 %	60 %	20 %	0 %	116329838
39	NC_008510	TTGAA	2	10	55706	55715	40 %	40 %	20 %	0 %	116329838
40	NC_008510	GATTG	2	10	55877	55886	20 %	40 %	40 %	0 %	116329838
41	NC_008510	AAAGG	2	10	57329	57338	60 %	0 %	40 %	0 %	116329840
42	NC_008510	ACGAA	2	10	57456	57465	60 %	0 %	20 %	20 %	116329840
43	NC_008510	CGGAT	2	10	61629	61638	20 %	20 %	40 %	20 %	116329842
44	NC_008510	ACCAA	2	10	63616	63625	60 %	0 %	0 %	40 %	116329844
45	NC_008510	GGTTG	2	10	66056	66065	0 %	40 %	60 %	0 %	116329846
46	NC_008510	TATCC	2	10	69228	69237	20 %	40 %	0 %	40 %	116329849
47	NC_008510	AAGGA	2	10	71174	71183	60 %	0 %	40 %	0 %	116329850
48	NC_008510	GGATT	2	10	73049	73058	20 %	40 %	40 %	0 %	116329850
49	NC_008510	TCGGA	2	10	73116	73125	20 %	20 %	40 %	20 %	116329850
50	NC_008510	TTTTG	2	10	74297	74306	0 %	80 %	20 %	0 %	116329851
51	NC_008510	TAAAA	2	10	74709	74718	80 %	20 %	0 %	0 %	116329851
52	NC_008510	GTTAT	2	10	75143	75152	20 %	60 %	20 %	0 %	116329852
53	NC_008510	TTGAG	2	10	76118	76127	20 %	40 %	40 %	0 %	116329852
54	NC_008510	TCCGA	2	10	76656	76665	20 %	20 %	20 %	40 %	116329852
55	NC_008510	TGCAA	2	10	76723	76732	40 %	20 %	20 %	20 %	116329852
56	NC_008510	CTTCT	2	10	76859	76868	0 %	60 %	0 %	40 %	116329852
57	NC_008510	AAAAT	2	10	78128	78137	80 %	20 %	0 %	0 %	116329852
58	NC_008510	TCCGA	2	10	79691	79700	20 %	20 %	20 %	40 %	116329855
59	NC_008510	ATAAA	2	10	80138	80147	80 %	20 %	0 %	0 %	116329856
60	NC_008510	AGAAA	2	10	81909	81918	80 %	0 %	20 %	0 %	116329859
61	NC_008510	AAAAC	2	10	82316	82325	80 %	0 %	0 %	20 %	116329859
62	NC_008510	GGAAA	2	10	85096	85105	60 %	0 %	40 %	0 %	116329861
63	NC_008510	TTTGC	2	10	85542	85551	0 %	60 %	20 %	20 %	116329862
64	NC_008510	CTTTG	2	10	85648	85657	0 %	60 %	20 %	20 %	116329862
65	NC_008510	TTGGA	2	10	85663	85672	20 %	40 %	40 %	0 %	116329862
66	NC_008510	GTTCC	2	10	87823	87832	0 %	40 %	20 %	40 %	116329864
67	NC_008510	TTATT	2	10	87946	87955	20 %	80 %	0 %	0 %	116329865
68	NC_008510	TCAGA	2	10	89087	89096	40 %	20 %	20 %	20 %	116329866
69	NC_008510	GTTTT	2	10	89237	89246	0 %	80 %	20 %	0 %	116329867
70	NC_008510	TTTCA	2	10	91036	91045	20 %	60 %	0 %	20 %	116329868
71	NC_008510	CGAAA	2	10	91308	91317	60 %	0 %	20 %	20 %	116329868
72	NC_008510	GAAAA	2	10	92988	92997	80 %	0 %	20 %	0 %	116329869
73	NC_008510	TCAAA	2	10	93102	93111	60 %	20 %	0 %	20 %	116329869
74	NC_008510	GAATG	2	10	93136	93145	40 %	20 %	40 %	0 %	116329869
75	NC_008510	AAGAT	2	10	95217	95226	60 %	20 %	20 %	0 %	116329871
76	NC_008510	AAACC	2	10	95254	95263	60 %	0 %	0 %	40 %	116329871
77	NC_008510	TTCCG	2	10	96492	96501	0 %	40 %	20 %	40 %	116329872
78	NC_008510	ATTGT	2	10	96627	96636	20 %	60 %	20 %	0 %	116329872
79	NC_008510	GAAAA	2	10	99182	99191	80 %	0 %	20 %	0 %	116329873
80	NC_008510	TCAAA	2	10	99296	99305	60 %	20 %	0 %	20 %	116329873
81	NC_008510	GAATG	2	10	99330	99339	40 %	20 %	40 %	0 %	116329873
82	NC_008510	GCCGC	2	10	102709	102718	0 %	0 %	40 %	60 %	116329874
83	NC_008510	TGAAA	2	10	103678	103687	60 %	20 %	20 %	0 %	116329875
84	NC_008510	ACCCC	2	10	103736	103745	20 %	0 %	0 %	80 %	116329875
85	NC_008510	TTTTC	2	10	103927	103936	0 %	80 %	0 %	20 %	116329875
86	NC_008510	CGTTT	2	10	104910	104919	0 %	60 %	20 %	20 %	116329876
87	NC_008510	GAAAT	2	10	105211	105220	60 %	20 %	20 %	0 %	116329876
88	NC_008510	ATTGC	2	10	105648	105657	20 %	40 %	20 %	20 %	116329876
89	NC_008510	GAATC	2	10	106039	106048	40 %	20 %	20 %	20 %	116329876
90	NC_008510	GGAAA	2	10	108111	108120	60 %	0 %	40 %	0 %	116329877
91	NC_008510	AATTT	2	10	108757	108766	40 %	60 %	0 %	0 %	116329877
92	NC_008510	CGATC	2	10	115315	115324	20 %	20 %	20 %	40 %	116329882
93	NC_008510	TCGAT	2	10	119028	119037	20 %	40 %	20 %	20 %	116329886
94	NC_008510	AAAGG	2	10	119856	119865	60 %	0 %	40 %	0 %	116329887
95	NC_008510	GAAAA	2	10	120233	120242	80 %	0 %	20 %	0 %	116329888
96	NC_008510	AAAAT	2	10	120995	121004	80 %	20 %	0 %	0 %	116329889
97	NC_008510	AGCGC	2	10	121873	121882	20 %	0 %	40 %	40 %	116329889
98	NC_008510	ATTTT	2	10	122454	122463	20 %	80 %	0 %	0 %	116329890
99	NC_008510	CAATG	2	10	124484	124493	40 %	20 %	20 %	20 %	116329891
100	NC_008510	AAAGT	2	10	124627	124636	60 %	20 %	20 %	0 %	116329891
101	NC_008510	CGCTT	2	10	125735	125744	0 %	40 %	20 %	40 %	116329892
102	NC_008510	TCGGA	2	10	126781	126790	20 %	20 %	40 %	20 %	116329893
103	NC_008510	GAATT	2	10	127346	127355	40 %	40 %	20 %	0 %	116329893
104	NC_008510	GAGTT	2	10	127520	127529	20 %	40 %	40 %	0 %	116329894
105	NC_008510	AATCA	2	10	127915	127924	60 %	20 %	0 %	20 %	116329894
106	NC_008510	AACTC	2	10	128934	128943	40 %	20 %	0 %	40 %	116329894
107	NC_008510	AAGTA	2	10	129757	129766	60 %	20 %	20 %	0 %	116329895
108	NC_008510	AAAAG	2	10	130568	130577	80 %	0 %	20 %	0 %	116329896
109	NC_008510	GCTCG	2	10	131052	131061	0 %	20 %	40 %	40 %	116329896
110	NC_008510	CATTC	2	10	133263	133272	20 %	40 %	0 %	40 %	116329897
111	NC_008510	TTTGA	2	10	133297	133306	20 %	60 %	20 %	0 %	116329897
112	NC_008510	CTTTT	2	10	133410	133419	0 %	80 %	0 %	20 %	116329897
113	NC_008510	TTTCC	2	10	137488	137497	0 %	60 %	0 %	40 %	116329900
114	NC_008510	GATCA	2	10	138364	138373	40 %	20 %	20 %	20 %	116329900
115	NC_008510	AAAGA	2	10	138557	138566	80 %	0 %	20 %	0 %	116329900
116	NC_008510	TCGGA	2	10	140178	140187	20 %	20 %	40 %	20 %	116329902
117	NC_008510	GAAAT	2	10	140704	140713	60 %	20 %	20 %	0 %	116329902
118	NC_008510	TGAAA	2	10	141744	141753	60 %	20 %	20 %	0 %	116329903
119	NC_008510	TTCCT	2	10	143548	143557	0 %	60 %	0 %	40 %	116329904
120	NC_008510	CGATT	2	10	143652	143661	20 %	40 %	20 %	20 %	116329904
121	NC_008510	GAGAG	2	10	143734	143743	40 %	0 %	60 %	0 %	116329904
122	NC_008510	ATATC	2	10	143828	143837	40 %	40 %	0 %	20 %	116329905
123	NC_008510	ATTTC	2	10	145175	145184	20 %	60 %	0 %	20 %	116329905
124	NC_008510	CGTAT	2	10	148106	148115	20 %	40 %	20 %	20 %	116329906
125	NC_008510	CGAAA	2	10	148297	148306	60 %	0 %	20 %	20 %	116329906
126	NC_008510	AAAAT	2	10	148408	148417	80 %	20 %	0 %	0 %	116329907
127	NC_008510	GATTC	2	10	148705	148714	20 %	40 %	20 %	20 %	116329907
128	NC_008510	GAAAA	2	10	149496	149505	80 %	0 %	20 %	0 %	116329908
129	NC_008510	TCAAA	2	10	149610	149619	60 %	20 %	0 %	20 %	116329908
130	NC_008510	GAATG	2	10	149644	149653	40 %	20 %	40 %	0 %	116329908
131	NC_008510	TCCCT	2	10	153101	153110	0 %	40 %	0 %	60 %	116329912
132	NC_008510	TTCCA	2	10	153260	153269	20 %	40 %	0 %	40 %	116329912
133	NC_008510	GAATC	2	10	154083	154092	40 %	20 %	20 %	20 %	116329912
134	NC_008510	GGAAT	2	10	158842	158851	40 %	20 %	40 %	0 %	116329914
135	NC_008510	CGAAC	2	10	160055	160064	40 %	0 %	20 %	40 %	116329916
136	NC_008510	TCCAA	2	10	160806	160815	40 %	20 %	0 %	40 %	116329916
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197	NC_008510	TTTTG	2	10	222963	222972	0 %	80 %	20 %	0 %	116329966
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253	NC_008510	AAGGA	2	10	294113	294122	60 %	0 %	40 %	0 %	116330022
254	NC_008510	GAATT	2	10	294692	294701	40 %	40 %	20 %	0 %	116330022
255	NC_008510	ATCCA	2	10	295216	295225	40 %	20 %	0 %	40 %	116330023
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261	NC_008510	CTTGA	2	10	305603	305612	20 %	40 %	20 %	20 %	116330031
262	NC_008510	TTCCG	2	10	306806	306815	0 %	40 %	20 %	40 %	116330031
263	NC_008510	ACGAT	2	10	315443	315452	40 %	20 %	20 %	20 %	116330036
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