MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 chromosome 1

Total Repeats: 2803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008510	AAAT	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008510	TAAT	2	8	4011	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008510	TCAT	2	8	4113	4120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008510	TTGA	2	8	4165	4172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008510	TAAA	2	8	6458	6465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008510	ATTT	2	8	6646	6653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008510	AACG	2	8	14873	14880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008510	AGTC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008510	GATT	2	8	25761	25768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008510	ATAA	2	8	26586	26593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008510	ACCG	2	8	26620	26627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008510	AAAT	2	8	27004	27011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008510	CCCG	2	8	27324	27331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008510	GTTC	2	8	29064	29071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008510	AAAC	2	8	29123	29130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008510	TATG	2	8	29912	29919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008510	AAAT	2	8	30033	30040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008510	TAAA	2	8	34772	34779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008510	ATTC	2	8	34915	34922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008510	TGAC	2	8	35925	35932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008510	GATT	2	8	36032	36039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008510	AAGT	2	8	36128	36135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008510	GTAA	2	8	36546	36553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008510	AAAG	2	8	36659	36666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008510	TGAT	2	8	37216	37223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008510	TCAA	2	8	37808	37815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008510	ATTT	2	8	40312	40319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008510	TAAA	2	8	40523	40530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008510	CCGC	2	8	40618	40625	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_008510	GATC	2	8	41433	41440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008510	TAGG	2	8	41621	41628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008510	CTTT	2	8	41789	41796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008510	TTCT	2	8	41981	41988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008510	AAAT	2	8	45471	45478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008510	AAAT	2	8	45583	45590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008510	GTAA	2	8	45697	45704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008510	ATTA	2	8	46013	46020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008510	TATT	2	8	46108	46115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008510	GAAT	2	8	49846	49853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008510	AAAT	2	8	57191	57198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008510	TGTT	2	8	59359	59366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008510	GAAC	2	8	59419	59426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008510	TTTC	2	8	60372	60379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008510	TTCC	2	8	60449	60456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008510	TGAT	2	8	63923	63930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008510	ATTT	2	8	64129	64136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008510	AATT	2	8	64335	64342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008510	CGTT	2	8	64451	64458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008510	TCTT	2	8	65266	65273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008510	GAAA	2	8	65419	65426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008510	AAAG	2	8	74944	74951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008510	GTAA	2	8	78750	78757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008510	GTTC	2	8	80947	80954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008510	TTTA	2	8	88252	88259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008510	TAGT	2	8	88705	88712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008510	ATTG	2	8	89906	89913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008510	ATGT	2	8	90208	90215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008510	ATTC	2	8	90802	90809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008510	AAGG	2	8	90868	90875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008510	TTCT	2	8	92247	92254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008510	ACTC	2	8	92687	92694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008510	AATT	2	8	97226	97233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008510	ATTT	2	8	97351	97358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008510	ATTC	2	8	97763	97770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008510	GAAA	2	8	97903	97910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008510	TGAA	2	8	97919	97926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008510	GTTC	2	8	98311	98318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008510	AGGA	2	8	98508	98515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008510	GTAA	2	8	98740	98747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008510	GAAG	2	8	98835	98842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008510	GCGA	2	8	99078	99085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008510	TCAA	2	8	103043	103050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008510	TCTT	2	8	103199	103206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008510	AAAC	2	8	106568	106575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008510	ATCG	2	8	108924	108931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008510	ATGG	2	8	108948	108955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008510	AATT	2	8	108958	108965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008510	GAAA	2	8	109179	109186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008510	GATC	2	8	110899	110906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008510	TGAA	2	8	112008	112015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008510	TAAA	2	8	112863	112870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008510	GGTT	2	8	116275	116282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008510	CTTT	2	8	117928	117935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008510	AATT	2	8	118151	118158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008510	AGTA	2	8	118304	118311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008510	CATC	2	8	118662	118669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008510	ATTT	2	8	118754	118761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008510	TCAT	2	8	118896	118903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008510	AATT	2	8	123021	123028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008510	TCAC	2	8	123217	123224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008510	GAAA	2	8	123360	123367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008510	TTGT	2	8	131463	131470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008510	GCTC	2	8	131773	131780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008510	TATT	2	8	133796	133803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008510	CGAC	2	8	134880	134887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008510	TAGT	2	8	136305	136312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008510	ATTT	2	8	140998	141005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008510	AATT	2	8	147632	147639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008510	TTCG	2	8	151078	151085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008510	ATAA	2	8	154915	154922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008510	TTTA	2	8	157124	157131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008510	GATT	2	8	157722	157729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008510	GACA	2	8	163996	164003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008510	TTTC	2	8	164721	164728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008510	ATAA	2	8	164868	164875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008510	CTTT	2	8	166475	166482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008510	TTCA	2	8	167710	167717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008510	AATT	2	8	167761	167768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008510	TTCT	2	8	170139	170146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008510	CGGT	2	8	170310	170317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008510	TGCT	2	8	170587	170594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008510	CTGT	2	8	170948	170955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008510	TCAA	2	8	171368	171375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008510	GTTT	2	8	171377	171384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008510	GAAT	2	8	171555	171562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008510	AGGT	2	8	171674	171681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008510	AAAT	2	8	171692	171699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008510	AAAT	2	8	174655	174662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008510	AATT	2	8	177092	177099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008510	TGGA	2	8	177394	177401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008510	GTCT	2	8	177607	177614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008510	AGAA	2	8	177837	177844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008510	AGGA	2	8	178532	178539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008510	TTCT	2	8	184526	184533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008510	GGTA	2	8	184686	184693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008510	GGAA	2	8	184761	184768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008510	GAAT	2	8	184946	184953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008510	TCTT	2	8	185135	185142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008510	GTTC	2	8	185302	185309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008510	AGTA	2	8	185568	185575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008510	TATG	2	8	192792	192799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008510	ATCC	2	8	192826	192833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008510	TGCT	2	8	192955	192962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008510	ATTT	2	8	193879	193886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008510	TTTC	2	8	194480	194487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008510	TTTC	2	8	199034	199041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008510	AGGA	2	8	199088	199095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008510	ATCC	2	8	200237	200244	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008510	ATCT	2	8	211811	211818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008510	TGTC	2	8	211867	211874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008510	GCAA	2	8	212271	212278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008510	ATTG	2	8	212313	212320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008510	ATAA	2	8	212527	212534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008510	TCAA	2	8	213232	213239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008510	GAAA	2	8	213489	213496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008510	TTTG	2	8	214332	214339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008510	CTTT	2	8	214478	214485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008510	CTTT	2	8	216911	216918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008510	TAAT	2	8	217057	217064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008510	ATCT	2	8	221983	221990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008510	AGAA	2	8	224320	224327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_008510	AATT	2	8	232127	232134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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