MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	AATC	2	8	642	649	50 %	25 %	0 %	25 %	116329557
2	NC_008509	CCAA	2	8	1054	1061	50 %	0 %	0 %	50 %	116329558
3	NC_008509	ATTT	2	8	1473	1480	25 %	75 %	0 %	0 %	116329558
4	NC_008509	TACA	2	8	1764	1771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008509	GAAA	2	8	2088	2095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008509	TTCC	2	8	2468	2475	0 %	50 %	0 %	50 %	116329559
7	NC_008509	TGAA	2	8	3011	3018	50 %	25 %	25 %	0 %	116329560
8	NC_008509	TTTC	2	8	3223	3230	0 %	75 %	0 %	25 %	116329560
9	NC_008509	ATGG	2	8	3257	3264	25 %	25 %	50 %	0 %	116329560
10	NC_008509	GATC	2	8	3502	3509	25 %	25 %	25 %	25 %	116329560
11	NC_008509	TATT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	116329560
12	NC_008509	CGTT	2	8	3763	3770	0 %	50 %	25 %	25 %	116329560
13	NC_008509	CGCC	2	8	3784	3791	0 %	0 %	25 %	75 %	116329560
14	NC_008509	CCTT	2	8	3898	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	116329560
15	NC_008509	GGAG	2	8	3961	3968	25 %	0 %	75 %	0 %	116329560
16	NC_008509	TTCC	2	8	5031	5038	0 %	50 %	0 %	50 %	116329560
17	NC_008509	TTGG	2	8	5314	5321	0 %	50 %	50 %	0 %	116329560
18	NC_008509	GGAC	2	8	6058	6065	25 %	0 %	50 %	25 %	116329561
19	NC_008509	TTCG	2	8	6199	6206	0 %	50 %	25 %	25 %	116329561
20	NC_008509	TTGC	2	8	6321	6328	0 %	50 %	25 %	25 %	116329561
21	NC_008509	AATC	2	8	6363	6370	50 %	25 %	0 %	25 %	116329561
22	NC_008509	GTCT	2	8	6431	6438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008509	ACTT	2	8	6480	6487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008509	TTTC	2	8	6636	6643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008509	TTTC	2	8	7011	7018	0 %	75 %	0 %	25 %	116329562
26	NC_008509	AAAG	2	8	7421	7428	75 %	0 %	25 %	0 %	116329562
27	NC_008509	TATC	2	8	7718	7725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008509	TGTT	2	8	7827	7834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008509	ACGA	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	116329563
30	NC_008509	GAAA	2	8	8869	8876	75 %	0 %	25 %	0 %	116329564
31	NC_008509	GTTT	2	8	9039	9046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008509	AATA	2	8	9453	9460	75 %	25 %	0 %	0 %	116329565
33	NC_008509	TGAT	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	116329565
34	NC_008509	TCTT	2	8	9668	9675	0 %	75 %	0 %	25 %	116329565
35	NC_008509	ATTT	2	8	9887	9894	25 %	75 %	0 %	0 %	116329565
36	NC_008509	CGAA	2	8	10494	10501	50 %	0 %	25 %	25 %	116329566
37	NC_008509	TAAG	2	8	10662	10669	50 %	25 %	25 %	0 %	116329566
38	NC_008509	GAAA	2	8	10697	10704	75 %	0 %	25 %	0 %	116329566
39	NC_008509	CAAA	2	8	10903	10910	75 %	0 %	0 %	25 %	116329566
40	NC_008509	ATCC	2	8	11043	11050	25 %	25 %	0 %	50 %	116329566
41	NC_008509	CAAA	2	8	11519	11526	75 %	0 %	0 %	25 %	116329566
42	NC_008509	TCAC	2	8	11856	11863	25 %	25 %	0 %	50 %	116329567
43	NC_008509	CGGA	2	8	11893	11900	25 %	0 %	50 %	25 %	116329567
44	NC_008509	AAAG	2	8	13146	13153	75 %	0 %	25 %	0 %	116329568
45	NC_008509	GATC	2	8	13606	13613	25 %	25 %	25 %	25 %	116329568
46	NC_008509	TCAT	2	8	14177	14184	25 %	50 %	0 %	25 %	116329569
47	NC_008509	TTTC	2	8	14299	14306	0 %	75 %	0 %	25 %	116329569
48	NC_008509	ATTC	2	8	14989	14996	25 %	50 %	0 %	25 %	116329570
49	NC_008509	GAAA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	25 %	0 %	116329570
50	NC_008509	AAGG	2	8	15308	15315	50 %	0 %	50 %	0 %	116329570
51	NC_008509	AGGC	2	8	15444	15451	25 %	0 %	50 %	25 %	116329571
52	NC_008509	GAAT	2	8	15884	15891	50 %	25 %	25 %	0 %	116329571
53	NC_008509	TTGG	2	8	16300	16307	0 %	50 %	50 %	0 %	116329571
54	NC_008509	TTCG	2	8	16524	16531	0 %	50 %	25 %	25 %	116329572
55	NC_008509	AGAA	2	8	16789	16796	75 %	0 %	25 %	0 %	116329572
56	NC_008509	CTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
57	NC_008509	AACA	2	8	17804	17811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008509	ATTT	2	8	19786	19793	25 %	75 %	0 %	0 %	116329574
59	NC_008509	ATCA	2	8	19898	19905	50 %	25 %	0 %	25 %	116329574
60	NC_008509	GGAA	2	8	20005	20012	50 %	0 %	50 %	0 %	116329574
61	NC_008509	GATT	2	8	21164	21171	25 %	50 %	25 %	0 %	116329575
62	NC_008509	TCAA	2	8	21241	21248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008509	TCCC	2	8	22009	22016	0 %	25 %	0 %	75 %	116329576
64	NC_008509	GGGA	2	8	22313	22320	25 %	0 %	75 %	0 %	116329576
65	NC_008509	ACTT	2	8	22407	22414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008509	GTTT	2	8	22839	22846	0 %	75 %	25 %	0 %	116329577
67	NC_008509	GATT	2	8	23161	23168	25 %	50 %	25 %	0 %	116329577
68	NC_008509	ATTG	2	8	23180	23187	25 %	50 %	25 %	0 %	116329577
69	NC_008509	TCAA	2	8	23317	23324	50 %	25 %	0 %	25 %	116329577
70	NC_008509	AGAT	2	8	23817	23824	50 %	25 %	25 %	0 %	116329578
71	NC_008509	ACTT	2	8	24150	24157	25 %	50 %	0 %	25 %	116329578
72	NC_008509	TCAG	2	8	24295	24302	25 %	25 %	25 %	25 %	116329579
73	NC_008509	TAAT	2	8	24970	24977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008509	ATTT	2	8	25051	25058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008509	AGAA	2	8	26258	26265	75 %	0 %	25 %	0 %	116329580
76	NC_008509	TTTG	2	8	26519	26526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008509	GATC	2	8	26552	26559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008509	TTTG	2	8	26636	26643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008509	CGAA	2	8	26790	26797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008509	TCGG	2	8	26812	26819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008509	TAAA	2	8	28728	28735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008509	CAAT	2	8	28980	28987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008509	TAAT	2	8	29541	29548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008509	TAAA	2	8	29560	29567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008509	TGGC	2	8	29643	29650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008509	ATAG	2	8	29700	29707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008509	AGGA	2	8	29848	29855	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
88	NC_008509	TGGA	2	8	29950	29957	25 %	25 %	50 %	0 %	116329582
89	NC_008509	AAAT	2	8	30003	30010	75 %	25 %	0 %	0 %	116329582
90	NC_008509	AAAC	2	8	30060	30067	75 %	0 %	0 %	25 %	116329582
91	NC_008509	TCGA	2	8	30308	30315	25 %	25 %	25 %	25 %	116329582
92	NC_008509	AAAG	2	8	31015	31022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008509	ATGT	2	8	31111	31118	25 %	50 %	25 %	0 %	116329583
94	NC_008509	AAAT	2	8	31826	31833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008509	AAGT	2	8	31859	31866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008509	TTCG	2	8	32173	32180	0 %	50 %	25 %	25 %	116329584
97	NC_008509	TGTT	2	8	32690	32697	0 %	75 %	25 %	0 %	116329585
98	NC_008509	CGAT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	25 %	25 %	116329586
99	NC_008509	TTAC	2	8	33812	33819	25 %	50 %	0 %	25 %	116329586
100	NC_008509	GGTT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	50 %	0 %	116329586
101	NC_008509	CTTC	2	8	34899	34906	0 %	50 %	0 %	50 %	116329587
102	NC_008509	CCGA	2	8	35586	35593	25 %	0 %	25 %	50 %	116329588
103	NC_008509	CTAT	2	8	35758	35765	25 %	50 %	0 %	25 %	116329588
104	NC_008509	AAGG	2	8	36345	36352	50 %	0 %	50 %	0 %	116329589
105	NC_008509	AAAG	2	8	37031	37038	75 %	0 %	25 %	0 %	116329590
106	NC_008509	CTTT	2	8	37134	37141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008509	AAGA	2	8	37786	37793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008509	GAAA	2	8	37978	37985	75 %	0 %	25 %	0 %	116329591
109	NC_008509	CCTA	2	8	38147	38154	25 %	25 %	0 %	50 %	116329591
110	NC_008509	GATC	2	8	38335	38342	25 %	25 %	25 %	25 %	116329591
111	NC_008509	TCTT	2	8	39486	39493	0 %	75 %	0 %	25 %	116329592
112	NC_008509	CGGT	2	8	39914	39921	0 %	25 %	50 %	25 %	116329592
113	NC_008509	ACTT	2	8	39983	39990	25 %	50 %	0 %	25 %	116329592
114	NC_008509	TTGT	2	8	40012	40019	0 %	75 %	25 %	0 %	116329592
115	NC_008509	GATT	2	8	40471	40478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008509	GGAA	2	8	40873	40880	50 %	0 %	50 %	0 %	116329593
117	NC_008509	ACGA	2	8	41685	41692	50 %	0 %	25 %	25 %	116329593
118	NC_008509	GTAA	2	8	41935	41942	50 %	25 %	25 %	0 %	116329593
119	NC_008509	AGCG	2	8	41995	42002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008509	AAAC	2	8	42177	42184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008509	GTTA	2	8	42681	42688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008509	TCGA	2	8	42833	42840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008509	AAGT	2	8	42954	42961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008509	TCGA	2	8	43161	43168	25 %	25 %	25 %	25 %	116329594
125	NC_008509	ATTT	2	8	43998	44005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008509	CAAT	2	8	45308	45315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008509	CGAT	2	8	45858	45865	25 %	25 %	25 %	25 %	116329595
128	NC_008509	TGAT	2	8	46538	46545	25 %	50 %	25 %	0 %	116329596
129	NC_008509	AAAG	2	8	46600	46607	75 %	0 %	25 %	0 %	116329596
130	NC_008509	AAAT	2	8	47012	47019	75 %	25 %	0 %	0 %	116329596
131	NC_008509	TTAC	2	8	47283	47290	25 %	50 %	0 %	25 %	116329597
132	NC_008509	GAAA	2	8	47436	47443	75 %	0 %	25 %	0 %	116329597
133	NC_008509	GAAC	2	8	47786	47793	50 %	0 %	25 %	25 %	116329597
134	NC_008509	AAAG	2	8	48316	48323	75 %	0 %	25 %	0 %	116329598
135	NC_008509	GCTC	2	8	48626	48633	0 %	25 %	25 %	50 %	116329598
136	NC_008509	TCGA	2	8	48863	48870	25 %	25 %	25 %	25 %	116329598
137	NC_008509	GCAA	2	8	49314	49321	50 %	0 %	25 %	25 %	116329599
138	NC_008509	GACG	2	8	49599	49606	25 %	0 %	50 %	25 %	116329599
139	NC_008509	TTCT	2	8	49889	49896	0 %	75 %	0 %	25 %	116329599
140	NC_008509	TTTC	2	8	51145	51152	0 %	75 %	0 %	25 %	116329601
141	NC_008509	ACGT	2	8	51270	51277	25 %	25 %	25 %	25 %	116329601
142	NC_008509	TCAA	2	8	53192	53199	50 %	25 %	0 %	25 %	116329602
143	NC_008509	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	116329602
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145	NC_008509	GGAC	2	8	53859	53866	25 %	0 %	50 %	25 %	116329602
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