MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	TACA	2	8	1764	1771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008509	GAAA	2	8	2088	2095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008509	GTCT	2	8	6431	6438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008509	ACTT	2	8	6480	6487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008509	TTTC	2	8	6636	6643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008509	TATC	2	8	7718	7725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008509	TGTT	2	8	7827	7834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008509	GTTT	2	8	9039	9046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008509	AACA	2	8	17804	17811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008509	TCAA	2	8	21241	21248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008509	ACTT	2	8	22407	22414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008509	TAAT	2	8	24970	24977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008509	ATTT	2	8	25051	25058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008509	TTTG	2	8	26519	26526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008509	GATC	2	8	26552	26559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008509	TTTG	2	8	26636	26643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008509	CGAA	2	8	26790	26797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008509	TCGG	2	8	26812	26819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008509	TAAA	2	8	28728	28735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008509	CAAT	2	8	28980	28987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008509	TAAT	2	8	29541	29548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008509	TAAA	2	8	29560	29567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008509	TGGC	2	8	29643	29650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008509	ATAG	2	8	29700	29707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008509	AAAG	2	8	31015	31022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008509	AAAT	2	8	31826	31833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008509	AAGT	2	8	31859	31866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008509	CTTT	2	8	37134	37141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008509	AAGA	2	8	37786	37793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008509	GATT	2	8	40471	40478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008509	AGCG	2	8	41995	42002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008509	AAAC	2	8	42177	42184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008509	GTTA	2	8	42681	42688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008509	TCGA	2	8	42833	42840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008509	AAGT	2	8	42954	42961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008509	ATTT	2	8	43998	44005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008509	CAAT	2	8	45308	45315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008509	ACCT	2	8	55411	55418	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008509	TTCT	2	8	57099	57106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008509	ATTT	2	8	57584	57591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008509	TTGT	2	8	58166	58173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008509	TTCC	2	8	58359	58366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008509	TCAA	2	8	58389	58396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008509	AAAG	2	8	59123	59130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008509	TTTC	2	8	59233	59240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008509	TCGT	2	8	62000	62007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008509	AGGA	2	8	62220	62227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008509	AGCA	2	8	62491	62498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008509	TTGC	2	8	63131	63138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008509	AAAT	2	8	64089	64096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008509	ATGA	2	8	65008	65015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008509	ACTG	2	8	70494	70501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008509	GGTT	2	8	70795	70802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008509	TTTG	2	8	72685	72692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008509	TTGT	2	8	72890	72897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008509	GTAT	2	8	73516	73523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008509	ATTC	2	8	77025	77032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008509	GATT	2	8	78161	78168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008509	ACTC	2	8	80627	80634	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008509	TCGT	2	8	80657	80664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008509	AGAT	2	8	80676	80683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008509	TATT	2	8	80730	80737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008509	TGAT	2	8	80769	80776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008509	TATT	2	8	80790	80797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008509	AACC	2	8	80963	80970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008509	GTTA	2	8	81148	81155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008509	TTGT	2	8	83366	83373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008509	ACTA	2	8	83802	83809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008509	ACAA	2	8	84390	84397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008509	CATT	2	8	84905	84912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008509	TTGG	2	8	84923	84930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008509	TCTT	2	8	85187	85194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008509	AATT	2	8	86651	86658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008509	ATTT	2	8	86746	86753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008509	ATTT	2	8	86841	86848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008509	ACCG	2	8	87074	87081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008509	ATTT	2	8	87469	87476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008509	GATG	2	8	87911	87918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008509	TTTA	2	8	88019	88026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008509	ATTT	2	8	88080	88087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008509	TCAA	2	8	88141	88148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008509	AAAT	2	8	88526	88533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008509	GTTT	2	8	88812	88819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008509	TGTT	2	8	89553	89560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008509	GAAC	2	8	89613	89620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008509	TTCC	2	8	89944	89951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008509	AATC	2	8	90990	90997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008509	TGGA	2	8	91027	91034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008509	TTTA	2	8	91520	91527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008509	GCGA	2	8	91579	91586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008509	AGGA	2	8	91637	91644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008509	CGGT	2	8	91927	91934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008509	TCTT	2	8	92061	92068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008509	AGTT	2	8	92186	92193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008509	TATT	2	8	92397	92404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008509	CGTT	2	8	92409	92416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008509	TTGT	2	8	92498	92505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008509	TTGT	2	8	96957	96964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008509	TGTT	2	8	97156	97163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008509	ATAG	2	8	97220	97227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008509	CTGT	2	8	97422	97429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008509	TGAT	2	8	97538	97545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008509	CTTT	2	8	98422	98429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008509	CTTT	2	8	99305	99312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008509	TTTC	2	8	99353	99360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008509	TTCA	2	8	100031	100038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008509	AGAA	2	8	100240	100247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008509	GACC	2	8	100310	100317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008509	ATTG	2	8	100445	100452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008509	TGGA	2	8	100874	100881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008509	ATCG	2	8	100940	100947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008509	GCGG	2	8	101085	101092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008509	TCTT	2	8	101286	101293	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008509	CTTT	2	8	101778	101785	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008509	AATT	2	8	103225	103232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008509	CCAA	2	8	105643	105650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008509	CGAG	2	8	106148	106155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008509	GAAC	2	8	106901	106908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008509	CTTT	2	8	107259	107266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008509	CGTT	2	8	107546	107553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008509	TCAG	2	8	107782	107789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008509	CAAA	2	8	107843	107850	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008509	GATC	2	8	108359	108366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008509	CTTT	2	8	108436	108443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008509	TGAG	2	8	108880	108887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008509	GATC	2	8	109400	109407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008509	GAAG	2	8	109515	109522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008509	AACG	2	8	109646	109653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008509	TGAA	2	8	115906	115913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008509	CATT	2	8	116025	116032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008509	CGTC	2	8	126433	126440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008509	GGAA	2	8	132500	132507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008509	TCCG	2	8	133160	133167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008509	GTCG	2	8	133246	133253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008509	ATCG	2	8	135185	135192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008509	GAGG	2	8	135232	135239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008509	ATCT	2	8	135694	135701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008509	AAAT	2	8	135929	135936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008509	TTAT	2	8	135957	135964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008509	ATAA	2	8	137697	137704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008509	TTAC	2	8	138266	138273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008509	TTTA	2	8	150085	150092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008509	TTTC	2	8	153405	153412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008509	ATTT	2	8	159776	159783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008509	GAAT	2	8	159911	159918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008509	GTTT	2	8	159988	159995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008509	TCGG	2	8	167248	167255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008509	AATT	2	8	169564	169571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008509	TTTC	2	8	169818	169825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008509	AAAC	2	8	169888	169895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008509	TTCT	2	8	169956	169963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008509	TTAC	2	8	170318	170325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008509	TTTC	2	8	170825	170832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008509	AATT	2	8	171834	171841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.