MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	CT	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	116329557
2	NC_008509	GA	3	6	456	461	50 %	0 %	50 %	0 %	116329557
3	NC_008509	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	116329557
4	NC_008509	CT	3	6	901	906	0 %	50 %	0 %	50 %	116329558
5	NC_008509	CT	3	6	1311	1316	0 %	50 %	0 %	50 %	116329558
6	NC_008509	TA	3	6	1714	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	116329558
7	NC_008509	TC	3	6	6231	6236	0 %	50 %	0 %	50 %	116329561
8	NC_008509	AT	3	6	8294	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	116329563
9	NC_008509	TC	3	6	8417	8422	0 %	50 %	0 %	50 %	116329563
10	NC_008509	TG	3	6	8498	8503	0 %	50 %	50 %	0 %	116329563
11	NC_008509	CA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	0 %	50 %	116329564
12	NC_008509	TA	3	6	8905	8910	50 %	50 %	0 %	0 %	116329564
13	NC_008509	GA	3	6	8993	8998	50 %	0 %	50 %	0 %	116329564
14	NC_008509	AG	3	6	9096	9101	50 %	0 %	50 %	0 %	116329565
15	NC_008509	GT	3	6	9598	9603	0 %	50 %	50 %	0 %	116329565
16	NC_008509	AC	3	6	11207	11212	50 %	0 %	0 %	50 %	116329566
17	NC_008509	CT	3	6	12775	12780	0 %	50 %	0 %	50 %	116329568
18	NC_008509	CG	3	6	12881	12886	0 %	0 %	50 %	50 %	116329568
19	NC_008509	TA	3	6	14590	14595	50 %	50 %	0 %	0 %	116329569
20	NC_008509	AG	3	6	15918	15923	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
21	NC_008509	TC	3	6	15928	15933	0 %	50 %	0 %	50 %	116329571
22	NC_008509	AG	3	6	16292	16297	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
23	NC_008509	AG	3	6	16380	16385	50 %	0 %	50 %	0 %	116329571
24	NC_008509	TC	3	6	16695	16700	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
25	NC_008509	GA	3	6	16754	16759	50 %	0 %	50 %	0 %	116329572
26	NC_008509	TC	3	6	16823	16828	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
27	NC_008509	AG	3	6	17216	17221	50 %	0 %	50 %	0 %	116329572
28	NC_008509	CT	3	6	17633	17638	0 %	50 %	0 %	50 %	116329572
29	NC_008509	CT	3	6	18336	18341	0 %	50 %	0 %	50 %	116329573
30	NC_008509	TA	3	6	18383	18388	50 %	50 %	0 %	0 %	116329573
31	NC_008509	AC	3	6	20600	20605	50 %	0 %	0 %	50 %	116329575
32	NC_008509	GA	4	8	21378	21385	50 %	0 %	50 %	0 %	116329576
33	NC_008509	GA	3	6	21847	21852	50 %	0 %	50 %	0 %	116329576
34	NC_008509	AT	3	6	23129	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	116329577
35	NC_008509	TC	3	6	23292	23297	0 %	50 %	0 %	50 %	116329577
36	NC_008509	GA	3	6	23405	23410	50 %	0 %	50 %	0 %	116329577
37	NC_008509	GA	3	6	23505	23510	50 %	0 %	50 %	0 %	116329577
38	NC_008509	GA	3	6	24165	24170	50 %	0 %	50 %	0 %	116329578
39	NC_008509	AT	3	6	24250	24255	50 %	50 %	0 %	0 %	116329579
40	NC_008509	AG	3	6	24788	24793	50 %	0 %	50 %	0 %	116329579
41	NC_008509	TC	3	6	25924	25929	0 %	50 %	0 %	50 %	116329580
42	NC_008509	AC	3	6	25971	25976	50 %	0 %	0 %	50 %	116329580
43	NC_008509	CT	3	6	25990	25995	0 %	50 %	0 %	50 %	116329580
44	NC_008509	AT	3	6	27789	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	116329581
45	NC_008509	TC	3	6	27985	27990	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
46	NC_008509	CT	3	6	28089	28094	0 %	50 %	0 %	50 %	116329581
47	NC_008509	TA	3	6	28813	28818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008509	GC	3	6	28947	28952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008509	AT	3	6	29250	29255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008509	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	116329582
51	NC_008509	GT	3	6	30873	30878	0 %	50 %	50 %	0 %	116329582
52	NC_008509	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	116329582
53	NC_008509	AT	3	6	32516	32521	50 %	50 %	0 %	0 %	116329584
54	NC_008509	CT	3	6	33136	33141	0 %	50 %	0 %	50 %	116329585
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56	NC_008509	CG	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	116329586
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60	NC_008509	GT	3	6	35314	35319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008509	TC	3	6	37049	37054	0 %	50 %	0 %	50 %	116329590
62	NC_008509	TC	3	6	37169	37174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008509	TC	3	6	37508	37513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008509	CG	3	6	37850	37855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008509	TA	3	6	37954	37959	50 %	50 %	0 %	0 %	116329591
66	NC_008509	TA	3	6	38112	38117	50 %	50 %	0 %	0 %	116329591
67	NC_008509	CT	3	6	38828	38833	0 %	50 %	0 %	50 %	116329591
68	NC_008509	AG	3	6	41509	41514	50 %	0 %	50 %	0 %	116329593
69	NC_008509	TA	3	6	42392	42397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008509	AT	3	6	42855	42860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008509	AT	3	6	42873	42878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008509	GT	3	6	43618	43623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008509	AT	3	6	46628	46633	50 %	50 %	0 %	0 %	116329596
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82	NC_008509	TA	3	6	53624	53629	50 %	50 %	0 %	0 %	116329602
83	NC_008509	AT	3	6	54627	54632	50 %	50 %	0 %	0 %	116329603
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89	NC_008509	TA	3	6	57888	57893	50 %	50 %	0 %	0 %	116329607
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91	NC_008509	AG	3	6	58032	58037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008509	TC	3	6	58660	58665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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107	NC_008509	TG	3	6	67919	67924	0 %	50 %	50 %	0 %	116329614
108	NC_008509	TC	3	6	68620	68625	0 %	50 %	0 %	50 %	116329615
109	NC_008509	TA	3	6	68887	68892	50 %	50 %	0 %	0 %	116329615
110	NC_008509	GA	3	6	69648	69653	50 %	0 %	50 %	0 %	116329616
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112	NC_008509	AT	6	12	71185	71196	50 %	50 %	0 %	0 %	116329617
113	NC_008509	AT	3	6	71567	71572	50 %	50 %	0 %	0 %	116329617
114	NC_008509	AT	3	6	71593	71598	50 %	50 %	0 %	0 %	116329617
115	NC_008509	AG	3	6	72513	72518	50 %	0 %	50 %	0 %	116329617
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118	NC_008509	AT	3	6	73451	73456	50 %	50 %	0 %	0 %	116329618
119	NC_008509	AT	3	6	75851	75856	50 %	50 %	0 %	0 %	116329620
120	NC_008509	TA	3	6	75861	75866	50 %	50 %	0 %	0 %	116329620
121	NC_008509	AT	3	6	76604	76609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008509	AG	3	6	76976	76981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008509	GA	3	6	77185	77190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008509	GA	3	6	78978	78983	50 %	0 %	50 %	0 %	116329621
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126	NC_008509	GA	3	6	79773	79778	50 %	0 %	50 %	0 %	116329622
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131	NC_008509	AT	3	6	83312	83317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008509	AG	3	6	85206	85211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008509	GA	3	6	85337	85342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_008509	AT	3	6	88542	88547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_008509	GA	3	6	89400	89405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008509	TC	3	6	89717	89722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_008509	GA	3	6	90850	90855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008509	AG	3	6	91592	91597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.