MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008509	TA	3	6	28813	28818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008509	GC	3	6	28947	28952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008509	AT	3	6	29250	29255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008509	GT	3	6	35314	35319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008509	TC	3	6	37169	37174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008509	TC	3	6	37508	37513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008509	CG	3	6	37850	37855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008509	TA	3	6	42392	42397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008509	AT	3	6	42855	42860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008509	AT	3	6	42873	42878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008509	GT	3	6	43618	43623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008509	AG	3	6	57977	57982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008509	AG	3	6	58032	58037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008509	TC	3	6	58660	58665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008509	CG	3	6	60921	60926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008509	TA	3	6	62742	62747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008509	AG	3	6	62822	62827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008509	CT	3	6	70412	70417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008509	GT	3	6	72743	72748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008509	AC	3	6	72762	72767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008509	AT	3	6	76604	76609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008509	AG	3	6	76976	76981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008509	GA	3	6	77185	77190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008509	AT	3	6	83312	83317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008509	AG	3	6	85206	85211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008509	GA	3	6	85337	85342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008509	AG	3	6	87339	87344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008509	AG	3	6	87829	87834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008509	AT	3	6	88542	88547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008509	TA	3	6	88720	88725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008509	CT	3	6	89322	89327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008509	GA	3	6	89400	89405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008509	TC	3	6	89717	89722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008509	AT	3	6	90207	90212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008509	GA	3	6	90850	90855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008509	AG	3	6	91592	91597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008509	CT	3	6	91775	91780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008509	AG	3	6	91875	91880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008509	TG	3	6	92268	92273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008509	AT	4	8	96740	96747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008509	TA	3	6	96978	96983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008509	TG	3	6	97197	97202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008509	AG	3	6	98057	98062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008509	AT	3	6	98706	98711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008509	AG	3	6	99556	99561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008509	TA	3	6	99803	99808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008509	TA	4	8	101168	101175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008509	AT	3	6	101346	101351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008509	CA	3	6	101404	101409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008509	AG	3	6	105923	105928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008509	CG	3	6	108833	108838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008509	TG	3	6	109347	109352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008509	TA	3	6	114693	114698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008509	GA	3	6	115979	115984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008509	GA	3	6	116285	116290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008509	TG	3	6	124987	124992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008509	AG	3	6	129285	129290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008509	GA	3	6	135385	135390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008509	AT	3	6	141714	141719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008509	TC	3	6	145720	145725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008509	AT	3	6	145726	145731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008509	AG	3	6	150466	150471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008509	TA	3	6	160181	160186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008509	AT	3	6	174643	174648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008509	TC	3	6	178973	178978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008509	CT	3	6	179405	179410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008509	AG	3	6	180020	180025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008509	GA	3	6	181705	181710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008509	AT	3	6	195749	195754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008509	GA	4	8	199118	199125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008509	CA	3	6	216599	216604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008509	TA	3	6	236392	236397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008509	GA	3	6	241929	241934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008509	TC	3	6	242246	242251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008509	AG	3	6	242324	242329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008509	AT	4	8	245004	245011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008509	GT	3	6	245403	245408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008509	TC	3	6	247557	247562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008509	TC	3	6	247790	247795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008509	GA	3	6	250065	250070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008509	GA	3	6	250095	250100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008509	AG	3	6	250600	250605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008509	GA	3	6	251652	251657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008509	GT	3	6	254220	254225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008509	AC	3	6	255018	255023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008509	TC	3	6	258501	258506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008509	CG	3	6	258981	258986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008509	CT	3	6	260873	260878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008509	GT	3	6	265189	265194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008509	TG	3	6	266310	266315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008509	AG	3	6	270804	270809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008509	AG	3	6	271113	271118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008509	AT	3	6	272423	272428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008509	CT	3	6	278884	278889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008509	TC	3	6	279591	279596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008509	AG	3	6	279763	279768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008509	GA	3	6	288758	288763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008509	CA	3	6	289496	289501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008509	GA	3	6	293876	293881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008509	GA	3	6	298333	298338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008509	TA	3	6	299478	299483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008509	TC	3	6	300253	300258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008509	TA	3	6	301592	301597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008509	TA	3	6	301833	301838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008509	GT	3	6	311797	311802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008509	AT	3	6	312847	312852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008509	TA	4	8	312928	312935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008509	AT	3	6	312936	312941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.