MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116326853
2	NC_008508	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008508	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116326854
4	NC_008508	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116326854
5	NC_008508	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116326854
6	NC_008508	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116326854
7	NC_008508	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116326855
8	NC_008508	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116326855
9	NC_008508	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116326856
10	NC_008508	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116326857
11	NC_008508	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116326858
12	NC_008508	TCGAT	2	10	9068	9077	20 %	40 %	20 %	20 %	116326859
13	NC_008508	GGATG	2	10	14292	14301	20 %	20 %	60 %	0 %	116326862
14	NC_008508	CAGCC	2	10	16439	16448	20 %	0 %	20 %	60 %	116326864
15	NC_008508	GATCG	2	10	16741	16750	20 %	20 %	40 %	20 %	116326864
16	NC_008508	TCTTT	2	10	16806	16815	0 %	80 %	0 %	20 %	116326864
17	NC_008508	AATCC	2	10	17160	17169	40 %	20 %	0 %	40 %	116326864
18	NC_008508	TATTT	2	10	18233	18242	20 %	80 %	0 %	0 %	116326865
19	NC_008508	TTTAG	2	10	19318	19327	20 %	60 %	20 %	0 %	116326866
20	NC_008508	TAAAG	2	10	19960	19969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008508	TTTGA	2	10	21614	21623	20 %	60 %	20 %	0 %	116326868
22	NC_008508	CTTTT	2	10	21727	21736	0 %	80 %	0 %	20 %	116326868
23	NC_008508	ATTTC	2	10	22055	22064	20 %	60 %	0 %	20 %	116326869
24	NC_008508	CGGAT	2	10	22283	22292	20 %	20 %	40 %	20 %	116326869
25	NC_008508	CGTAT	2	10	23559	23568	20 %	40 %	20 %	20 %	116326869
26	NC_008508	CTTGC	2	10	23762	23771	0 %	40 %	20 %	40 %	116326869
27	NC_008508	TTTTC	2	10	23865	23874	0 %	80 %	0 %	20 %	116326869
28	NC_008508	CAAAA	2	10	28276	28285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008508	GAAAA	2	10	28308	28317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008508	TCAAA	2	10	28422	28431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008508	TACTT	2	10	30211	30220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008508	CGAGC	2	10	30469	30478	20 %	0 %	40 %	40 %	116326872
33	NC_008508	CTTTT	2	10	30953	30962	0 %	80 %	0 %	20 %	116326872
34	NC_008508	TTTTG	2	10	31710	31719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008508	TTACT	2	10	31763	31772	20 %	60 %	0 %	20 %	116326873
36	NC_008508	AATTC	2	10	34175	34184	40 %	40 %	0 %	20 %	116326875
37	NC_008508	TCCGA	2	10	34740	34749	20 %	20 %	20 %	40 %	116326875
38	NC_008508	AAGCG	2	10	35786	35795	40 %	0 %	40 %	20 %	116326876
39	NC_008508	TAATA	2	10	36118	36127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008508	AAAGT	2	10	36208	36217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008508	CATTG	2	10	37037	37046	20 %	40 %	20 %	20 %	116326877
42	NC_008508	ATTTT	2	10	38072	38081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008508	TAATA	2	10	38397	38406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008508	AATTT	2	10	38724	38733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008508	GCGCT	2	10	39648	39657	0 %	20 %	40 %	40 %	116326879
46	NC_008508	ATTTT	2	10	40526	40535	20 %	80 %	0 %	0 %	116326879
47	NC_008508	GAAAA	2	10	40607	40616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	TTTTC	2	10	41288	41297	0 %	80 %	0 %	20 %	116326880
49	NC_008508	CCTTT	2	10	41665	41674	0 %	60 %	0 %	40 %	116326881
50	NC_008508	ATCGA	2	10	42493	42502	40 %	20 %	20 %	20 %	116326882
51	NC_008508	GATCG	2	10	46206	46215	20 %	20 %	40 %	20 %	116326886
52	NC_008508	ATTTT	2	10	48601	48610	20 %	80 %	0 %	0 %	116326887
53	NC_008508	AAAGG	2	10	49500	49509	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008508	TAAAT	2	10	52763	52772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	TTTCC	2	10	53410	53419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008508	GAAAG	2	10	54728	54737	60 %	0 %	40 %	0 %	116326891
57	NC_008508	GATTC	2	10	55485	55494	20 %	40 %	20 %	20 %	116326892
58	NC_008508	GCAAT	2	10	55876	55885	40 %	20 %	20 %	20 %	116326892
59	NC_008508	ATTTC	2	10	56313	56322	20 %	60 %	0 %	20 %	116326892
60	NC_008508	AAACG	2	10	56614	56623	60 %	0 %	20 %	20 %	116326892
61	NC_008508	TTTCC	2	10	56969	56978	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008508	GAAAA	2	10	57597	57606	80 %	0 %	20 %	0 %	116326893
63	NC_008508	TTTCA	2	10	57846	57855	20 %	60 %	0 %	20 %	116326893
64	NC_008508	GCACC	2	10	58453	58462	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_008508	TTTGA	2	10	62222	62231	20 %	60 %	20 %	0 %	116326896
66	NC_008508	CTTTT	2	10	62335	62344	0 %	80 %	0 %	20 %	116326896
67	NC_008508	TTAAT	2	10	63302	63311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008508	ATATA	2	10	63728	63737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008508	CGGAA	2	10	65023	65032	40 %	0 %	40 %	20 %	116326897
70	NC_008508	TGGTT	2	10	66260	66269	0 %	60 %	40 %	0 %	116326898
71	NC_008508	ATCTT	2	10	66298	66307	20 %	60 %	0 %	20 %	116326898
72	NC_008508	CATTC	2	10	68373	68382	20 %	40 %	0 %	40 %	116326900
73	NC_008508	TTTGA	2	10	68407	68416	20 %	60 %	20 %	0 %	116326900
74	NC_008508	CTTTT	2	10	68520	68529	0 %	80 %	0 %	20 %	116326900
75	NC_008508	TTGAA	2	10	68738	68747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	CAAGG	2	10	69816	69825	40 %	0 %	40 %	20 %	116326901
77	NC_008508	TTCAA	2	10	70635	70644	40 %	40 %	0 %	20 %	116326902
78	NC_008508	GAATT	2	10	73388	73397	40 %	40 %	20 %	0 %	116326905
79	NC_008508	TCAAA	2	10	73731	73740	60 %	20 %	0 %	20 %	116326905
80	NC_008508	ATAAA	2	10	74124	74133	80 %	20 %	0 %	0 %	116326906
81	NC_008508	TCATT	2	10	74576	74585	20 %	60 %	0 %	20 %	116326907
82	NC_008508	GAAGT	2	10	76158	76167	40 %	20 %	40 %	0 %	116326908
83	NC_008508	AAATC	2	10	76732	76741	60 %	20 %	0 %	20 %	116326909
84	NC_008508	AAGTA	2	10	76829	76838	60 %	20 %	20 %	0 %	116326909
85	NC_008508	TAAAA	2	10	78478	78487	80 %	20 %	0 %	0 %	116326910
86	NC_008508	GAAAA	2	10	79368	79377	80 %	0 %	20 %	0 %	116326911
87	NC_008508	TCAAA	2	10	79482	79491	60 %	20 %	0 %	20 %	116326911
88	NC_008508	CATTC	2	10	81179	81188	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008508	TTTGA	2	10	81213	81222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008508	CTTTT	2	10	81326	81335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008508	CGAAA	2	10	81514	81523	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008508	TATAA	2	10	83679	83688	60 %	40 %	0 %	0 %	116326912
93	NC_008508	ATCTT	2	10	83711	83720	20 %	60 %	0 %	20 %	116326912
94	NC_008508	TCGGA	2	10	85657	85666	20 %	20 %	40 %	20 %	116326913
95	NC_008508	CCTGT	2	10	86011	86020	0 %	40 %	20 %	40 %	116326913
96	NC_008508	TTTCC	2	10	86252	86261	0 %	60 %	0 %	40 %	116326913
97	NC_008508	TTTGA	2	10	87108	87117	20 %	60 %	20 %	0 %	116326913
98	NC_008508	GTTTT	3	15	87437	87451	0 %	80 %	20 %	0 %	116326913
99	NC_008508	TTGAT	2	10	89413	89422	20 %	60 %	20 %	0 %	116326916
100	NC_008508	ATTCC	2	10	90420	90429	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_008508	CAAAC	2	10	90745	90754	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008508	CCGTG	2	10	91037	91046	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008508	AGAAA	2	10	93762	93771	80 %	0 %	20 %	0 %	116326918
104	NC_008508	TTTTG	2	10	93842	93851	0 %	80 %	20 %	0 %	116326918
105	NC_008508	CAAGA	2	10	94485	94494	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008508	GGAAT	2	10	95887	95896	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008508	TTTTC	2	10	96114	96123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008508	GTTCA	2	10	96445	96454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008508	TTCAA	2	10	98199	98208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008508	TTTGC	2	10	98260	98269	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008508	ATTTT	2	10	101279	101288	20 %	80 %	0 %	0 %	116326925
112	NC_008508	GAAGA	2	10	101496	101505	60 %	0 %	40 %	0 %	116326925
113	NC_008508	ATCTT	2	10	101756	101765	20 %	60 %	0 %	20 %	116326925
114	NC_008508	ACAAA	2	10	102314	102323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008508	AATGA	2	10	102607	102616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008508	AAAGA	2	10	103476	103485	80 %	0 %	20 %	0 %	116326928
117	NC_008508	AAAAT	2	10	104917	104926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008508	CAATT	2	10	104993	105002	40 %	40 %	0 %	20 %	116326930
119	NC_008508	GAAAA	2	10	107687	107696	80 %	0 %	20 %	0 %	116326931
120	NC_008508	TTCGG	2	10	108283	108292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008508	TTAAA	2	10	109066	109075	60 %	40 %	0 %	0 %	116326932
122	NC_008508	GGATC	2	10	111517	111526	20 %	20 %	40 %	20 %	116326934
123	NC_008508	CTTTC	2	10	112805	112814	0 %	60 %	0 %	40 %	116326935
124	NC_008508	ATTCT	2	10	115882	115891	20 %	60 %	0 %	20 %	116326937
125	NC_008508	TCGAT	2	10	116205	116214	20 %	40 %	20 %	20 %	116326937
126	NC_008508	AAAAG	2	10	116458	116467	80 %	0 %	20 %	0 %	116326937
127	NC_008508	TTTTC	2	10	117049	117058	0 %	80 %	0 %	20 %	116326938
128	NC_008508	GATAA	2	10	118574	118583	60 %	20 %	20 %	0 %	116326938
129	NC_008508	TCATT	2	10	119248	119257	20 %	60 %	0 %	20 %	116326939
130	NC_008508	GTAGA	2	10	119657	119666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008508	AATGA	2	10	119680	119689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008508	AAATT	2	10	119729	119738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008508	TCATA	2	10	120258	120267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008508	TTGAA	2	10	121018	121027	40 %	40 %	20 %	0 %	116326942
135	NC_008508	AAAAT	2	10	121583	121592	80 %	20 %	0 %	0 %	116326942
136	NC_008508	ATCGA	2	10	121790	121799	40 %	20 %	20 %	20 %	116326942
137	NC_008508	TTCTT	2	10	122111	122120	0 %	80 %	0 %	20 %	116326943
138	NC_008508	AATCC	2	10	122473	122482	40 %	20 %	0 %	40 %	116326944
139	NC_008508	TTCGT	2	10	124429	124438	0 %	60 %	20 %	20 %	116326945
140	NC_008508	TGATC	2	10	125720	125729	20 %	40 %	20 %	20 %	116326945
141	NC_008508	ATTCT	2	10	129180	129189	20 %	60 %	0 %	20 %	116326947
142	NC_008508	CAAAA	2	10	129996	130005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008508	GAAAA	2	10	130028	130037	80 %	0 %	20 %	0 %	116326948
144	NC_008508	TCAAA	2	10	130142	130151	60 %	20 %	0 %	20 %	116326948
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148	NC_008508	AAAGA	2	10	135764	135773	80 %	0 %	20 %	0 %	116326952
149	NC_008508	TTCAC	2	10	135781	135790	20 %	40 %	0 %	40 %	116326952
150	NC_008508	GAGAT	2	10	136594	136603	40 %	20 %	40 %	0 %	116326953
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152	NC_008508	ATAGA	2	10	137515	137524	60 %	20 %	20 %	0 %	116326954
153	NC_008508	CCAAG	2	10	138136	138145	40 %	0 %	20 %	40 %	116326954
154	NC_008508	ATTCA	2	10	138827	138836	40 %	40 %	0 %	20 %	116326955
155	NC_008508	TCGAA	2	10	138884	138893	40 %	20 %	20 %	20 %	116326955
156	NC_008508	AAAAT	2	10	140605	140614	80 %	20 %	0 %	0 %	116326955
157	NC_008508	GTTCT	2	10	140800	140809	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_008508	AAAGT	2	10	142352	142361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008508	CATTC	2	10	144230	144239	20 %	40 %	0 %	40 %	116326957
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161	NC_008508	CTTTT	2	10	144377	144386	0 %	80 %	0 %	20 %	116326957
162	NC_008508	TTTTC	2	10	146636	146645	0 %	80 %	0 %	20 %	116326959
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167	NC_008508	TTACT	2	10	153540	153549	20 %	60 %	0 %	20 %	116326966
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171	NC_008508	GTTTT	2	10	159261	159270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_008508	CTTTT	2	10	160778	160787	0 %	80 %	0 %	20 %	116326971
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184	NC_008508	TCATA	2	10	170158	170167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_008508	TAGAG	2	10	170389	170398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_008508	ATTTT	2	10	250370	250379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_008508	TGGAT	2	10	252818	252827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
249	NC_008508	AAAAT	2	10	252949	252958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_008508	CGATC	2	10	259631	259640	20 %	20 %	20 %	40 %	116327043
254	NC_008508	CTATT	2	10	261926	261935	20 %	60 %	0 %	20 %	116327044
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256	NC_008508	TTCGA	2	10	263277	263286	20 %	40 %	20 %	20 %	116327046
257	NC_008508	GTTTT	2	10	264851	264860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_008508	CAAAA	2	10	265657	265666	80 %	0 %	0 %	20 %	116327048
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262	NC_008508	TTCCC	2	10	267957	267966	0 %	40 %	0 %	60 %	116327050
263	NC_008508	AAGAC	2	10	268997	269006	60 %	0 %	20 %	20 %	116327052
264	NC_008508	ATTAA	2	10	270579	270588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008508	TAGAG	2	10	270998	271007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
266	NC_008508	GATTG	2	10	271050	271059	20 %	40 %	40 %	0 %	116327053
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269	NC_008508	GAAAA	2	10	273038	273047	80 %	0 %	20 %	0 %	116327054
270	NC_008508	TAAAA	2	10	273344	273353	80 %	20 %	0 %	0 %	116327054
271	NC_008508	ATTCG	2	10	273435	273444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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