MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	AGATG	2	10	1945	1954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008508	TAAAG	2	10	19960	19969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008508	CAAAA	2	10	28276	28285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008508	GAAAA	2	10	28308	28317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008508	TCAAA	2	10	28422	28431	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008508	TACTT	2	10	30211	30220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008508	TTTTG	2	10	31710	31719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008508	TAATA	2	10	36118	36127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008508	AAAGT	2	10	36208	36217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008508	ATTTT	2	10	38072	38081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	TAATA	2	10	38397	38406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008508	AATTT	2	10	38724	38733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008508	GAAAA	2	10	40607	40616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008508	AAAGG	2	10	49500	49509	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008508	TAAAT	2	10	52763	52772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008508	TTTCC	2	10	53410	53419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008508	TTTCC	2	10	56969	56978	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008508	GCACC	2	10	58453	58462	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008508	TTAAT	2	10	63302	63311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008508	ATATA	2	10	63728	63737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008508	TTGAA	2	10	68738	68747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008508	CATTC	2	10	81179	81188	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008508	TTTGA	2	10	81213	81222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008508	CTTTT	2	10	81326	81335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008508	CGAAA	2	10	81514	81523	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008508	ATTCC	2	10	90420	90429	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008508	CAAAC	2	10	90745	90754	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008508	CCGTG	2	10	91037	91046	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008508	CAAGA	2	10	94485	94494	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008508	GGAAT	2	10	95887	95896	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008508	TTTTC	2	10	96114	96123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008508	GTTCA	2	10	96445	96454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008508	TTCAA	2	10	98199	98208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008508	TTTGC	2	10	98260	98269	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008508	ACAAA	2	10	102314	102323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008508	AATGA	2	10	102607	102616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008508	AAAAT	2	10	104917	104926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008508	TTCGG	2	10	108283	108292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008508	GTAGA	2	10	119657	119666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008508	AATGA	2	10	119680	119689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008508	AAATT	2	10	119729	119738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008508	TCATA	2	10	120258	120267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008508	CAAAA	2	10	129996	130005	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008508	GTTCT	2	10	140800	140809	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008508	AAAGT	2	10	142352	142361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008508	AAAAG	2	10	153487	153496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008508	GTTTT	2	10	159261	159270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	GATCC	2	10	159363	159372	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008508	TTAAA	2	10	165191	165200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008508	GTTTT	2	10	170058	170067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008508	TCATA	2	10	170158	170167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_008508	TAGAG	2	10	170389	170398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008508	GGAAG	2	10	172180	172189	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008508	GAAAA	2	10	175763	175772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	TGATA	2	10	179061	179070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008508	ATTTT	2	10	195087	195096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008508	TTTGA	2	10	196921	196930	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008508	CTTTC	2	10	216288	216297	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008508	GGACT	2	10	216402	216411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008508	GAAAA	2	10	224265	224274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008508	TAGAA	2	10	241885	241894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008508	GGTTA	2	10	242010	242019	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008508	GAAAT	2	10	245465	245474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008508	GATGT	2	10	248995	249004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008508	ATATT	2	10	250342	250351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008508	ATTTT	2	10	250370	250379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008508	TCGGT	2	10	252807	252816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008508	TGGAT	2	10	252818	252827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008508	AAAAT	2	10	252949	252958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008508	GTTTT	2	10	264851	264860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008508	ATTAA	2	10	270579	270588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008508	TAGAG	2	10	270998	271007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008508	TAAAA	2	10	272262	272271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008508	ATTCG	2	10	273435	273444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008508	AATTT	2	10	274729	274738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	TAAAA	2	10	275578	275587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008508	TAAAA	2	10	317582	317591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008508	ATTTT	2	10	318224	318233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008508	AGCGA	2	10	320661	320670	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008508	ATTTT	2	10	321250	321259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008508	TAAAA	2	10	329557	329566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008508	TTATA	2	10	334846	334855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008508	TTGAA	2	10	344283	344292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008508	ATTTT	2	10	351084	351093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008508	TTTAA	2	10	353304	353313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008508	AAATA	2	10	356555	356564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008508	AGAAT	2	10	378272	378281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008508	CTATT	2	10	382357	382366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008508	CAATT	2	10	385809	385818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008508	TTTTA	2	10	385846	385855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008508	AGAAT	2	10	385899	385908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008508	TATTT	2	10	387268	387277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008508	AACAT	2	10	388211	388220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008508	CAAGA	2	10	390300	390309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008508	TTTTG	2	10	394026	394035	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008508	ATTTT	2	10	396271	396280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008508	CTTTA	2	10	396399	396408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008508	ATTTT	2	10	403980	403989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008508	GTTTT	2	10	406479	406488	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008508	GAGTA	2	10	413202	413211	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008508	CAGGG	2	10	430949	430958	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008508	TTTCT	2	10	434088	434097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008508	CATTC	2	10	434417	434426	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008508	ATTTG	2	10	434471	434480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008508	ATTCT	2	10	435301	435310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008508	CAAAA	2	10	438236	438245	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008508	GCAAC	2	10	443717	443726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008508	GTTGC	2	10	443770	443779	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008508	TAAAT	2	10	447857	447866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008508	CAAAA	2	10	448017	448026	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008508	GAAAA	2	10	448049	448058	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008508	TCAAA	2	10	448163	448172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008508	CGAAT	2	10	455590	455599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008508	ATCAT	2	10	466052	466061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008508	GTAAA	2	10	475121	475130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008508	CTTTT	2	10	475835	475844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008508	ACTTT	2	10	499328	499337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008508	AGTAT	2	10	503000	503009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008508	AGTAA	2	10	505052	505061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008508	ACTTT	2	10	528615	528624	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008508	AGTAT	2	10	532287	532296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008508	AGTAA	2	10	534342	534351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008508	TCTTT	2	10	535058	535067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008508	TTCAG	2	10	535385	535394	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008508	ATCGG	2	10	539859	539868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008508	TGAAA	2	10	542555	542564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008508	GGAAA	2	10	544221	544230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008508	CAAAA	2	10	550818	550827	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008508	AAAAC	2	10	556182	556191	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008508	CCGAT	2	10	557292	557301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008508	AATTT	2	10	570948	570957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008508	CAAAA	2	10	572494	572503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008508	ACAAT	2	10	573945	573954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008508	GGCTG	2	10	579652	579661	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008508	AACAT	2	10	584159	584168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008508	TATAA	2	10	595353	595362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008508	TGACT	2	10	600684	600693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008508	ACTTT	2	10	604160	604169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008508	AATTT	2	10	614025	614034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008508	TTTTC	2	10	617508	617517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008508	TTATA	2	10	618370	618379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008508	ATATT	2	10	630832	630841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008508	TATTT	2	10	635368	635377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008508	ATGGA	2	10	639276	639285	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008508	TTTTC	2	10	643438	643447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008508	GATTG	2	10	651431	651440	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008508	GAAAC	2	10	651460	651469	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008508	GGTTC	2	10	654678	654687	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_008508	AAAAC	2	10	668456	668465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_008508	CTTTA	2	10	668887	668896	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008508	ATTTT	2	10	669138	669147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_008508	AATTG	2	10	678681	678690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008508	ATTAT	2	10	691290	691299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_008508	GAAAA	2	10	711258	711267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008508	TCAAA	2	10	711372	711381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_008508	AAGGG	2	10	726322	726331	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
172	NC_008508	ATAGA	2	10	727476	727485	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_008508	GAAAA	2	10	769720	769729	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_008508	CTTTT	2	10	832982	832991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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