MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 10376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	TCGA	2	8	1049	1056	25 %	25 %	25 %	25 %	116326853
2	NC_008508	CCTC	2	8	1701	1708	0 %	25 %	0 %	75 %	116326853
3	NC_008508	AAAT	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008508	CGGA	2	8	3097	3104	25 %	0 %	50 %	25 %	116326855
5	NC_008508	GTTG	2	8	3295	3302	0 %	50 %	50 %	0 %	116326855
6	NC_008508	TTCG	2	8	3304	3311	0 %	50 %	25 %	25 %	116326855
7	NC_008508	GAAA	2	8	3722	3729	75 %	0 %	25 %	0 %	116326855
8	NC_008508	TAAT	2	8	4011	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008508	TCAT	2	8	4113	4120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008508	TTGA	2	8	4165	4172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	GAAA	2	8	4407	4414	75 %	0 %	25 %	0 %	116326856
12	NC_008508	AAAT	2	8	4645	4652	75 %	25 %	0 %	0 %	116326856
13	NC_008508	ATGA	2	8	4773	4780	50 %	25 %	25 %	0 %	116326856
14	NC_008508	GAAA	2	8	4935	4942	75 %	0 %	25 %	0 %	116326856
15	NC_008508	ATTT	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	116326856
16	NC_008508	TAAA	2	8	6458	6465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008508	ATTT	2	8	6646	6653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008508	TTTC	2	8	6805	6812	0 %	75 %	0 %	25 %	116326857
19	NC_008508	ACGG	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	116326857
20	NC_008508	CTTC	2	8	7249	7256	0 %	50 %	0 %	50 %	116326857
21	NC_008508	TCCG	2	8	7752	7759	0 %	25 %	25 %	50 %	116326857
22	NC_008508	GGAA	2	8	7898	7905	50 %	0 %	50 %	0 %	116326858
23	NC_008508	TCAA	2	8	8095	8102	50 %	25 %	0 %	25 %	116326858
24	NC_008508	ATTG	2	8	8708	8715	25 %	50 %	25 %	0 %	116326858
25	NC_008508	GAAA	2	8	9022	9029	75 %	0 %	25 %	0 %	116326859
26	NC_008508	TCGT	2	8	9183	9190	0 %	50 %	25 %	25 %	116326859
27	NC_008508	TTTC	2	8	10112	10119	0 %	75 %	0 %	25 %	116326860
28	NC_008508	CAAA	2	8	10447	10454	75 %	0 %	0 %	25 %	116326860
29	NC_008508	GAAC	2	8	11589	11596	50 %	0 %	25 %	25 %	116326861
30	NC_008508	ATTG	2	8	11736	11743	25 %	50 %	25 %	0 %	116326861
31	NC_008508	GAAA	2	8	11994	12001	75 %	0 %	25 %	0 %	116326861
32	NC_008508	CGAT	2	8	12002	12009	25 %	25 %	25 %	25 %	116326861
33	NC_008508	TTGT	2	8	12830	12837	0 %	75 %	25 %	0 %	116326861
34	NC_008508	AAAG	2	8	12875	12882	75 %	0 %	25 %	0 %	116326861
35	NC_008508	CGAT	2	8	12995	13002	25 %	25 %	25 %	25 %	116326861
36	NC_008508	AACG	2	8	14873	14880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008508	AGTC	2	8	15047	15054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008508	TTGT	2	8	15705	15712	0 %	75 %	25 %	0 %	116326863
39	NC_008508	TCCA	2	8	16157	16164	25 %	25 %	0 %	50 %	116326863
40	NC_008508	ATTT	2	8	16415	16422	25 %	75 %	0 %	0 %	116326864
41	NC_008508	CGAT	2	8	16822	16829	25 %	25 %	25 %	25 %	116326864
42	NC_008508	AAAC	2	8	16867	16874	75 %	0 %	0 %	25 %	116326864
43	NC_008508	AATT	2	8	16907	16914	50 %	50 %	0 %	0 %	116326864
44	NC_008508	GGAA	2	8	17025	17032	50 %	0 %	50 %	0 %	116326864
45	NC_008508	CGTT	2	8	17152	17159	0 %	50 %	25 %	25 %	116326864
46	NC_008508	GTTT	2	8	17240	17247	0 %	75 %	25 %	0 %	116326864
47	NC_008508	ATTT	2	8	17434	17441	25 %	75 %	0 %	0 %	116326864
48	NC_008508	CGGA	2	8	17795	17802	25 %	0 %	50 %	25 %	116326864
49	NC_008508	TTAT	2	8	18077	18084	25 %	75 %	0 %	0 %	116326865
50	NC_008508	GTTT	2	8	18112	18119	0 %	75 %	25 %	0 %	116326865
51	NC_008508	GAAA	2	8	18434	18441	75 %	0 %	25 %	0 %	116326865
52	NC_008508	CCGT	2	8	18612	18619	0 %	25 %	25 %	50 %	116326865
53	NC_008508	CGAA	2	8	19003	19010	50 %	0 %	25 %	25 %	116326866
54	NC_008508	CTTT	2	8	19126	19133	0 %	75 %	0 %	25 %	116326866
55	NC_008508	GAAA	2	8	19141	19148	75 %	0 %	25 %	0 %	116326866
56	NC_008508	GAGG	2	8	19354	19361	25 %	0 %	75 %	0 %	116326866
57	NC_008508	ATAA	2	8	19651	19658	75 %	25 %	0 %	0 %	116326866
58	NC_008508	GAAT	2	8	20136	20143	50 %	25 %	25 %	0 %	116326867
59	NC_008508	TGAT	2	8	20190	20197	25 %	50 %	25 %	0 %	116326867
60	NC_008508	TGTT	2	8	20918	20925	0 %	75 %	25 %	0 %	116326868
61	NC_008508	GAAC	2	8	20978	20985	50 %	0 %	25 %	25 %	116326868
62	NC_008508	TTCC	2	8	21309	21316	0 %	50 %	0 %	50 %	116326868
63	NC_008508	TCGA	2	8	22594	22601	25 %	25 %	25 %	25 %	116326869
64	NC_008508	AGAT	2	8	22763	22770	50 %	25 %	25 %	0 %	116326869
65	NC_008508	AATA	2	8	23049	23056	75 %	25 %	0 %	0 %	116326869
66	NC_008508	ATAC	2	8	23133	23140	50 %	25 %	0 %	25 %	116326869
67	NC_008508	TCTT	2	8	23345	23352	0 %	75 %	0 %	25 %	116326869
68	NC_008508	AAAT	2	8	23925	23932	75 %	25 %	0 %	0 %	116326869
69	NC_008508	TTTC	2	8	24818	24825	0 %	75 %	0 %	25 %	116326870
70	NC_008508	AAGA	2	8	24957	24964	75 %	0 %	25 %	0 %	116326870
71	NC_008508	GTTC	2	8	24987	24994	0 %	50 %	25 %	25 %	116326870
72	NC_008508	GTTT	2	8	25351	25358	0 %	75 %	25 %	0 %	116326870
73	NC_008508	GATT	2	8	25756	25763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008508	TTTC	2	8	26190	26197	0 %	75 %	0 %	25 %	116326871
75	NC_008508	ATAA	2	8	26581	26588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	ACCG	2	8	26615	26622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008508	AAAT	2	8	26999	27006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008508	CCCG	2	8	27319	27326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008508	ACTG	2	8	27434	27441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008508	AGGA	2	8	28728	28735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008508	GTTC	2	8	29061	29068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008508	AAAC	2	8	29120	29127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008508	TTTA	2	8	31101	31108	25 %	75 %	0 %	0 %	116326872
84	NC_008508	GAAA	2	8	31350	31357	75 %	0 %	25 %	0 %	116326872
85	NC_008508	TGGA	2	8	31451	31458	25 %	25 %	50 %	0 %	116326872
86	NC_008508	ATTT	2	8	31635	31642	25 %	75 %	0 %	0 %	116326872
87	NC_008508	TAAA	2	8	31666	31673	75 %	25 %	0 %	0 %	116326872
88	NC_008508	CGTT	2	8	32157	32164	0 %	50 %	25 %	25 %	116326873
89	NC_008508	CAAG	2	8	32343	32350	50 %	0 %	25 %	25 %	116326873
90	NC_008508	GTTC	2	8	33028	33035	0 %	50 %	25 %	25 %	116326874
91	NC_008508	CCGA	2	8	33455	33462	25 %	0 %	25 %	50 %	116326874
92	NC_008508	AGGT	2	8	33549	33556	25 %	25 %	50 %	0 %	116326874
93	NC_008508	CAAG	2	8	33868	33875	50 %	0 %	25 %	25 %	116326874
94	NC_008508	AAGT	2	8	34012	34019	50 %	25 %	25 %	0 %	116326874
95	NC_008508	ATTT	2	8	34050	34057	25 %	75 %	0 %	0 %	116326875
96	NC_008508	GTTC	2	8	34079	34086	0 %	50 %	25 %	25 %	116326875
97	NC_008508	CGAA	2	8	34217	34224	50 %	0 %	25 %	25 %	116326875
98	NC_008508	AAAG	2	8	34470	34477	75 %	0 %	25 %	0 %	116326875
99	NC_008508	CTTG	2	8	34809	34816	0 %	50 %	25 %	25 %	116326875
100	NC_008508	TTGG	2	8	35077	35084	0 %	50 %	50 %	0 %	116326876
101	NC_008508	GAAG	2	8	35274	35281	50 %	0 %	50 %	0 %	116326876
102	NC_008508	GAAA	2	8	35435	35442	75 %	0 %	25 %	0 %	116326876
103	NC_008508	TTCC	2	8	35500	35507	0 %	50 %	0 %	50 %	116326876
104	NC_008508	TTTA	2	8	35578	35585	25 %	75 %	0 %	0 %	116326876
105	NC_008508	ATTC	2	8	35610	35617	25 %	50 %	0 %	25 %	116326876
106	NC_008508	TTTA	2	8	35726	35733	25 %	75 %	0 %	0 %	116326876
107	NC_008508	GATT	2	8	35926	35933	25 %	50 %	25 %	0 %	116326876
108	NC_008508	TCCT	2	8	37020	37027	0 %	50 %	0 %	50 %	116326877
109	NC_008508	GATT	2	8	37053	37060	25 %	50 %	25 %	0 %	116326877
110	NC_008508	GGAT	2	8	37277	37284	25 %	25 %	50 %	0 %	116326877
111	NC_008508	TCGA	2	8	37296	37303	25 %	25 %	25 %	25 %	116326877
112	NC_008508	GATC	2	8	37323	37330	25 %	25 %	25 %	25 %	116326877
113	NC_008508	CGAA	2	8	37375	37382	50 %	0 %	25 %	25 %	116326877
114	NC_008508	AAAG	2	8	37704	37711	75 %	0 %	25 %	0 %	116326877
115	NC_008508	TTTC	2	8	38163	38170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008508	AATT	2	8	38502	38509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008508	TAGG	2	8	38918	38925	25 %	25 %	50 %	0 %	116326878
118	NC_008508	TGAT	2	8	39338	39345	25 %	50 %	25 %	0 %	116326879
119	NC_008508	AATT	2	8	39435	39442	50 %	50 %	0 %	0 %	116326879
120	NC_008508	ATTT	2	8	39624	39631	25 %	75 %	0 %	0 %	116326879
121	NC_008508	TGCA	2	8	39797	39804	25 %	25 %	25 %	25 %	116326879
122	NC_008508	GAAA	2	8	40190	40197	75 %	0 %	25 %	0 %	116326879
123	NC_008508	CCGA	2	8	40445	40452	25 %	0 %	25 %	50 %	116326879
124	NC_008508	CTTT	2	8	40996	41003	0 %	75 %	0 %	25 %	116326880
125	NC_008508	ATGA	2	8	41372	41379	50 %	25 %	25 %	0 %	116326881
126	NC_008508	ATCG	2	8	41798	41805	25 %	25 %	25 %	25 %	116326881
127	NC_008508	GAAT	2	8	41955	41962	50 %	25 %	25 %	0 %	116326881
128	NC_008508	GGAA	2	8	42013	42020	50 %	0 %	50 %	0 %	116326882
129	NC_008508	AAAG	2	8	42179	42186	75 %	0 %	25 %	0 %	116326882
130	NC_008508	TACC	2	8	42245	42252	25 %	25 %	0 %	50 %	116326882
131	NC_008508	TTTC	2	8	42557	42564	0 %	75 %	0 %	25 %	116326882
132	NC_008508	AATG	2	8	42626	42633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008508	AAAT	2	8	42769	42776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008508	CGAG	2	8	42806	42813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008508	ATGG	2	8	42858	42865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008508	TACT	2	8	43219	43226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008508	AATT	2	8	43372	43379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008508	AAAG	2	8	43595	43602	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008508	TTCT	2	8	44069	44076	0 %	75 %	0 %	25 %	116326883
140	NC_008508	GAAA	2	8	44817	44824	75 %	0 %	25 %	0 %	116326884
141	NC_008508	AACC	2	8	45248	45255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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143	NC_008508	ATCG	2	8	46020	46027	25 %	25 %	25 %	25 %	116326886
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