MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 9246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	ACA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008508	GGA	2	6	4244	4249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008508	ATT	2	6	5918	5923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008508	TTA	2	6	6206	6211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008508	AAT	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008508	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008508	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008508	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008508	TAA	2	6	6427	6432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008508	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008508	TAC	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008508	TAA	3	9	6635	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008508	TAA	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008508	TGA	2	6	9364	9369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008508	ATT	2	6	14829	14834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008508	TCT	2	6	14846	14851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008508	ATT	2	6	14907	14912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008508	GAA	2	6	14956	14961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008508	GAA	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008508	GAT	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008508	CGA	2	6	15247	15252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008508	CTT	2	6	15426	15431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008508	GAA	2	6	15498	15503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008508	GGC	2	6	15545	15550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008508	CTA	2	6	16281	16286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008508	GAA	2	6	19949	19954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008508	TAT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008508	GAA	2	6	20294	20299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008508	AAT	2	6	20426	20431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008508	CGA	2	6	20457	20462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008508	CAA	2	6	20574	20579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008508	TCC	2	6	20584	20589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008508	TCT	2	6	20601	20606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008508	ATT	2	6	20619	20624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008508	CGA	3	9	21976	21984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008508	AAG	2	6	24310	24315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008508	CTT	2	6	25477	25482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008508	ACT	2	6	25518	25523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008508	CCT	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008508	GGA	2	6	25722	25727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008508	TAT	2	6	25775	25780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008508	AAG	2	6	25792	25797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008508	CTT	2	6	25857	25862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008508	TTC	2	6	26054	26059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008508	AGA	2	6	26097	26102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008508	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008508	AAT	2	6	26126	26131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	AAG	2	6	26828	26833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008508	CAG	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008508	TTG	2	6	27263	27268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008508	ACG	2	6	27510	27515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008508	ACC	2	6	27569	27574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008508	CAA	2	6	27584	27589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008508	AAG	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	TCC	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008508	TAA	2	6	28061	28066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008508	AAC	2	6	28397	28402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008508	TCA	2	6	28436	28441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008508	TGT	2	6	28474	28479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008508	ATT	2	6	28691	28696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008508	TGA	2	6	28748	28753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008508	TTA	2	6	28759	28764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008508	AAC	2	6	28840	28845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008508	ATT	2	6	28871	28876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008508	AAG	2	6	28895	28900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008508	GAG	2	6	28988	28993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008508	CTC	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008508	TGA	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008508	GGC	2	6	29377	29382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008508	AAT	2	6	29422	29427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008508	AGA	2	6	29440	29445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008508	AGG	2	6	29456	29461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008508	TTG	2	6	29467	29472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008508	TCG	2	6	29584	29589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008508	ATT	2	6	29615	29620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008508	GTA	2	6	29690	29695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008508	TTA	2	6	30192	30197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008508	GTT	2	6	30360	30365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008508	GGA	2	6	30387	30392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008508	CGT	2	6	31685	31690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008508	GAC	2	6	31701	31706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008508	AGA	2	6	36145	36150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008508	TGA	2	6	36152	36157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008508	TGA	2	6	38431	38436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008508	GTT	2	6	38492	38497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008508	CTG	2	6	38522	38527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008508	CAA	2	6	38580	38585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008508	CAA	2	6	38604	38609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008508	CAT	2	6	38637	38642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008508	CTT	2	6	42757	42762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008508	AAC	2	6	42778	42783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008508	AAG	2	6	42832	42837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008508	ACG	2	6	42905	42910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008508	CTT	2	6	42934	42939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008508	GAT	2	6	42973	42978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008508	TCT	2	6	43122	43127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008508	TCT	2	6	43327	43332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008508	ATA	2	6	43354	43359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008508	GTT	2	6	43362	43367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008508	AAT	2	6	45107	45112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008508	GTA	2	6	45117	45122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008508	CGA	2	6	45139	45144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008508	AAC	2	6	45192	45197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008508	ATC	2	6	45343	45348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008508	ATT	2	6	46875	46880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008508	CGA	2	6	46948	46953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008508	TAC	2	6	47049	47054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008508	CTT	2	6	47149	47154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008508	CTT	2	6	47227	47232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008508	AGC	2	6	47282	47287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008508	CTT	2	6	48865	48870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008508	CGA	2	6	50620	50625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008508	GCA	2	6	52190	52195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008508	TCT	2	6	52255	52260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008508	TCA	2	6	52287	52292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008508	CTC	2	6	52310	52315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008508	ATT	2	6	52432	52437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008508	ACA	3	9	52544	52552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008508	TTA	2	6	52617	52622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008508	CAA	2	6	52643	52648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008508	TCA	2	6	52664	52669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008508	TCA	2	6	52700	52705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008508	GTT	2	6	52848	52853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008508	TGA	2	6	53360	53365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008508	AAG	2	6	53443	53448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008508	AGA	2	6	53470	53475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008508	TAA	2	6	53670	53675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008508	AAT	2	6	53819	53824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008508	GAT	2	6	53832	53837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008508	GAA	2	6	53930	53935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008508	TTC	2	6	53967	53972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008508	TTC	2	6	53979	53984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008508	GAA	2	6	56821	56826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008508	GAA	2	6	56830	56835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008508	ATC	2	6	57140	57145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008508	AGA	2	6	57204	57209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008508	GAA	2	6	57301	57306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008508	ATA	2	6	57335	57340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008508	ACT	2	6	60666	60671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008508	TTG	2	6	60733	60738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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