MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 28843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	CTT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
2	NC_008508	ACA	2	6	45	50	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326853
3	NC_008508	TTC	2	6	206	211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
4	NC_008508	CGA	2	6	516	521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326853
5	NC_008508	TCA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
6	NC_008508	GAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326853
7	NC_008508	TCG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326853
8	NC_008508	ACA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326853
9	NC_008508	TTC	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
10	NC_008508	GAA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326853
11	NC_008508	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
12	NC_008508	TCT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
13	NC_008508	CTT	2	6	933	938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
14	NC_008508	ACC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326853
15	NC_008508	TCT	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
16	NC_008508	TTC	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
17	NC_008508	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326853
18	NC_008508	CCG	2	6	1685	1690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326853
19	NC_008508	GCC	2	6	1729	1734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326853
20	NC_008508	CTC	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326853
21	NC_008508	CTA	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
22	NC_008508	ATC	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
23	NC_008508	ACC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326854
24	NC_008508	GGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326854
25	NC_008508	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326854
26	NC_008508	ATA	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326854
27	NC_008508	AGA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
28	NC_008508	ACG	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326854
29	NC_008508	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
30	NC_008508	GAT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326854
31	NC_008508	CGG	2	6	2531	2536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326854
32	NC_008508	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326854
33	NC_008508	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
34	NC_008508	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
35	NC_008508	TTC	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
36	NC_008508	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
37	NC_008508	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326855
38	NC_008508	TCC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326855
39	NC_008508	TCT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
40	NC_008508	TTA	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
41	NC_008508	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
42	NC_008508	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
43	NC_008508	TTA	2	6	3399	3404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
44	NC_008508	GAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
45	NC_008508	CAT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326855
46	NC_008508	AGG	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326855
47	NC_008508	AAG	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
48	NC_008508	TCT	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
49	NC_008508	TCT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
50	NC_008508	GGA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326856
51	NC_008508	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
52	NC_008508	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326856
53	NC_008508	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
54	NC_008508	TCT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
55	NC_008508	TCT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
56	NC_008508	GAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326856
57	NC_008508	CTT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
58	NC_008508	CAA	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326856
59	NC_008508	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326856
60	NC_008508	CTT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
61	NC_008508	ATT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
62	NC_008508	ACA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326856
63	NC_008508	GAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326856
64	NC_008508	CTT	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
65	NC_008508	TAT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326857
66	NC_008508	GAA	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
67	NC_008508	AAC	2	6	6893	6898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326857
68	NC_008508	AGA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
69	NC_008508	GAA	2	6	7039	7044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
70	NC_008508	GAT	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326857
71	NC_008508	GAA	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
72	NC_008508	GCG	2	6	7516	7521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326857
73	NC_008508	GAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
74	NC_008508	CGA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326857
75	NC_008508	GAA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326858
76	NC_008508	TCT	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326858
77	NC_008508	ATT	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326858
78	NC_008508	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326858
79	NC_008508	TTA	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326858
80	NC_008508	GGC	2	6	8184	8189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
81	NC_008508	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
82	NC_008508	ATA	2	6	8266	8271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326858
83	NC_008508	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326858
84	NC_008508	GCG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
85	NC_008508	GAT	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326858
86	NC_008508	AAG	2	6	8633	8638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326858
87	NC_008508	ATG	2	6	8716	8721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326858
88	NC_008508	ACA	2	6	8799	8804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326858
89	NC_008508	CAA	2	6	8868	8873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326858
90	NC_008508	AGA	2	6	8899	8904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326859
91	NC_008508	ACT	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326859
92	NC_008508	ATC	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326859
93	NC_008508	AAC	2	6	9217	9222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326859
94	NC_008508	AGA	2	6	9277	9282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326859
95	NC_008508	TTC	2	6	9342	9347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326859
96	NC_008508	GGT	2	6	9555	9560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326860
97	NC_008508	AAT	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326860
98	NC_008508	ATC	2	6	9631	9636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326860
99	NC_008508	TTC	2	6	9719	9724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326860
100	NC_008508	GGT	2	6	9730	9735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326860
101	NC_008508	ACG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326860
102	NC_008508	GTA	2	6	9793	9798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326860
103	NC_008508	TCA	2	6	9831	9836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326860
104	NC_008508	TTC	2	6	9906	9911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326860
105	NC_008508	CTA	2	6	9947	9952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326860
106	NC_008508	TCT	2	6	10074	10079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326860
107	NC_008508	GAC	2	6	10183	10188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326860
108	NC_008508	AAC	2	6	10252	10257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326860
109	NC_008508	AAC	2	6	10264	10269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326860
110	NC_008508	AAG	2	6	10391	10396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326860
111	NC_008508	GAA	2	6	10622	10627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326860
112	NC_008508	AGG	3	9	10641	10649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326860
113	NC_008508	GGT	2	6	10729	10734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326860
114	NC_008508	TTC	2	6	10772	10777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326860
115	NC_008508	GAA	2	6	10837	10842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326860
116	NC_008508	CTT	2	6	10972	10977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326860
117	NC_008508	TTA	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326860
118	NC_008508	ATT	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326860
119	NC_008508	GAA	2	6	11112	11117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326860
120	NC_008508	AAC	2	6	11177	11182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326860
121	NC_008508	GAA	2	6	11254	11259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326860
122	NC_008508	TGA	2	6	11280	11285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326860
123	NC_008508	GCC	2	6	11320	11325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326860
124	NC_008508	AAG	2	6	11486	11491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326861
125	NC_008508	AGA	2	6	11569	11574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326861
126	NC_008508	GAA	2	6	11827	11832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326861
127	NC_008508	GAT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326861
128	NC_008508	ACA	2	6	11892	11897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326861
129	NC_008508	CGA	2	6	11969	11974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326861
130	NC_008508	TCC	2	6	11979	11984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326861
131	NC_008508	ATT	2	6	12064	12069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326861
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