MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008507	TTG	2	6	31	36	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008507	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008507	ATT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008507	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008507	GTA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008507	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008507	AGA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008507	TCT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008507	TCG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008507	AAT	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008507	TGA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008507	GAG	2	6	719	724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008507	GTA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008507	ATA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008507	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326646
16	NC_008507	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
17	NC_008507	TCA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326646
18	NC_008507	CAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
19	NC_008507	ATG	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326646
20	NC_008507	TGT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326646
21	NC_008507	CAA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326646
22	NC_008507	GAA	2	6	1719	1724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
23	NC_008507	AAT	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326646
24	NC_008507	GAA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326646
25	NC_008507	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326646
26	NC_008507	CCT	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326647
27	NC_008507	GAT	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326647
28	NC_008507	ATA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326647
29	NC_008507	TCA	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326647
30	NC_008507	TGT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326647
31	NC_008507	TAT	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326647
32	NC_008507	TCC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008507	TTA	2	6	2461	2466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
34	NC_008507	TGA	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326648
35	NC_008507	TTA	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326648
36	NC_008507	TTC	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
37	NC_008507	AAG	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326648
38	NC_008507	TCA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
39	NC_008507	CAT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
40	NC_008507	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326648
41	NC_008507	ATC	2	6	2815	2820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326648
42	NC_008507	TCT	2	6	2886	2891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326648
43	NC_008507	CAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008507	ATA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008507	AAT	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008507	CAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008507	AGA	2	6	3311	3316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
48	NC_008507	ATT	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
49	NC_008507	TTA	2	6	3400	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
50	NC_008507	TAA	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
51	NC_008507	TAA	2	6	3632	3637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
52	NC_008507	AAT	2	6	3648	3653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
53	NC_008507	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
54	NC_008507	GAA	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
55	NC_008507	ACA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326649
56	NC_008507	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
57	NC_008507	GTT	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326649
58	NC_008507	ATA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326649
59	NC_008507	CTA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
60	NC_008507	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326649
61	NC_008507	ATG	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326649
62	NC_008507	CTA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326649
63	NC_008507	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326649
64	NC_008507	ATT	2	6	4152	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008507	TTA	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008507	TTA	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008507	TAA	3	9	4271	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008507	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326650
69	NC_008507	ATT	2	6	4381	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
70	NC_008507	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
71	NC_008507	ACC	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326650
72	NC_008507	CAG	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326650
73	NC_008507	TTC	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326650
74	NC_008507	GAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326650
75	NC_008507	AAT	2	6	4741	4746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326650
76	NC_008507	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
77	NC_008507	TCC	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326650
78	NC_008507	ATT	2	6	5026	5031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
79	NC_008507	TTG	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326650
80	NC_008507	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326650
81	NC_008507	CTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008507	TGG	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326651
83	NC_008507	TCA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
84	NC_008507	TAA	2	6	5290	5295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
85	NC_008507	TAG	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
86	NC_008507	ATC	2	6	5327	5332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
87	NC_008507	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
88	NC_008507	AAT	2	6	5396	5401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
89	NC_008507	AAC	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326651
90	NC_008507	AAT	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
91	NC_008507	TCT	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
92	NC_008507	GTT	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326651
93	NC_008507	ATA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
94	NC_008507	ATC	3	9	5741	5749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
95	NC_008507	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
96	NC_008507	ATA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
97	NC_008507	CAG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326651
98	NC_008507	TCA	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
99	NC_008507	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
100	NC_008507	TAG	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
101	NC_008507	TCT	3	9	6297	6305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
102	NC_008507	AAT	2	6	6325	6330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
103	NC_008507	TTA	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
104	NC_008507	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
105	NC_008507	TAA	2	6	6465	6470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
106	NC_008507	ATC	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
107	NC_008507	TAA	2	6	6496	6501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
108	NC_008507	TTC	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
109	NC_008507	CTG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326651
110	NC_008507	ACT	2	6	6770	6775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
111	NC_008507	AAT	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
112	NC_008507	TAT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
113	NC_008507	GGA	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326651
114	NC_008507	ATA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
115	NC_008507	CTT	2	6	6910	6915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
116	NC_008507	CAT	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
117	NC_008507	ATC	3	9	6953	6961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
118	NC_008507	TCA	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
119	NC_008507	CAT	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
120	NC_008507	GAA	2	6	7379	7384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326651
121	NC_008507	AAT	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
122	NC_008507	TCT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
123	NC_008507	TCA	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
124	NC_008507	TGT	2	6	7665	7670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326651
125	NC_008507	ATG	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
126	NC_008507	AGT	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326651
127	NC_008507	ATA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326651
128	NC_008507	AAG	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326651
129	NC_008507	TCA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
130	NC_008507	TTA	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326651
131	NC_008507	ACT	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
132	NC_008507	TTC	2	6	8441	8446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326651
133	NC_008507	CAT	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
134	NC_008507	CAT	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
135	NC_008507	CAT	2	6	8569	8574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326651
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.