MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	TGCAA	2	10	1980	1989	40 %	20 %	20 %	20 %	116326611
2	NC_008506	TCTCT	2	10	2117	2126	0 %	60 %	0 %	40 %	116326611
3	NC_008506	TCTGT	2	10	3122	3131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326612
4	NC_008506	CTCTA	2	10	7598	7607	20 %	40 %	0 %	40 %	116326618
5	NC_008506	ATTTC	2	10	9896	9905	20 %	60 %	0 %	20 %	116326619
6	NC_008506	TGCTT	2	10	13441	13450	0 %	60 %	20 %	20 %	116326621
7	NC_008506	AAAGT	2	10	13971	13980	60 %	20 %	20 %	0 %	116326621
8	NC_008506	ACTAC	2	10	20029	20038	40 %	20 %	0 %	40 %	116326624
9	NC_008506	ATTAT	2	10	27097	27106	40 %	60 %	0 %	0 %	116326631
10	NC_008506	CTGTT	2	10	31255	31264	0 %	60 %	20 %	20 %	116326632
11	NC_008506	ATCTT	2	10	31681	31690	20 %	60 %	0 %	20 %	116326633
12	NC_008506	TTTTA	2	10	32256	32265	20 %	80 %	0 %	0 %	116326634
13	NC_008506	ATTTT	2	10	32363	32372	20 %	80 %	0 %	0 %	116326634
14	NC_008506	CATGG	2	10	32449	32458	20 %	20 %	40 %	20 %	116326634
15	NC_008506	AAAGA	2	10	32608	32617	80 %	0 %	20 %	0 %	116326634
16	NC_008506	AAAGA	2	10	32920	32929	80 %	0 %	20 %	0 %	116326634
17	NC_008506	GATTG	2	10	36721	36730	20 %	40 %	40 %	0 %	116326636
18	NC_008506	ATAAA	2	10	41014	41023	80 %	20 %	0 %	0 %	116326641
19	NC_008506	TAAGA	2	10	41354	41363	60 %	20 %	20 %	0 %	116326641
20	NC_008506	AAGTG	2	10	44707	44716	40 %	20 %	40 %	0 %	116326643
21	NC_008506	AAAAT	2	10	47177	47186	80 %	20 %	0 %	0 %	116326644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.