MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	GCAA	2	8	364	371	50 %	0 %	25 %	25 %	116326610
2	NC_008506	GTTT	2	8	531	538	0 %	75 %	25 %	0 %	116326610
3	NC_008506	CAAT	2	8	926	933	50 %	25 %	0 %	25 %	116326610
4	NC_008506	GATT	2	8	1185	1192	25 %	50 %	25 %	0 %	116326610
5	NC_008506	AGGT	2	8	1518	1525	25 %	25 %	50 %	0 %	116326610
6	NC_008506	AGAT	2	8	1682	1689	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
7	NC_008506	AGAT	2	8	1741	1748	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
8	NC_008506	ATTA	2	8	1810	1817	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
9	NC_008506	GAGC	2	8	2068	2075	25 %	0 %	50 %	25 %	116326611
10	NC_008506	CAAT	2	8	4187	4194	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
11	NC_008506	TCAT	2	8	4249	4256	25 %	50 %	0 %	25 %	116326614
12	NC_008506	TTTA	2	8	4371	4378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326614
13	NC_008506	ATAC	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
14	NC_008506	ATAG	2	8	4467	4474	50 %	25 %	25 %	0 %	116326614
15	NC_008506	GTAC	2	8	4483	4490	25 %	25 %	25 %	25 %	116326614
16	NC_008506	TTTA	2	8	4888	4895	25 %	75 %	0 %	0 %	116326615
17	NC_008506	GTCC	2	8	4935	4942	0 %	25 %	25 %	50 %	116326615
18	NC_008506	CAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008506	GTTT	2	8	5419	5426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008506	TTGT	2	8	5437	5444	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008506	GAAA	2	8	5515	5522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008506	AAGG	2	8	6099	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	116326616
23	NC_008506	TCGA	2	8	6172	6179	25 %	25 %	25 %	25 %	116326616
24	NC_008506	AGGG	2	8	6553	6560	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008506	AGTG	2	8	7728	7735	25 %	25 %	50 %	0 %	116326618
26	NC_008506	CATC	2	8	7840	7847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008506	ATTT	2	8	8449	8456	25 %	75 %	0 %	0 %	116326619
28	NC_008506	TGGT	2	8	8710	8717	0 %	50 %	50 %	0 %	116326619
29	NC_008506	TGAT	2	8	9637	9644	25 %	50 %	25 %	0 %	116326619
30	NC_008506	GTCT	2	8	9787	9794	0 %	50 %	25 %	25 %	116326619
31	NC_008506	TCAT	3	12	9981	9992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008506	AAGT	2	8	10152	10159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008506	TAAA	2	8	10398	10405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008506	GGAT	2	8	10847	10854	25 %	25 %	50 %	0 %	116326620
35	NC_008506	CTTG	2	8	11837	11844	0 %	50 %	25 %	25 %	116326621
36	NC_008506	CCAA	2	8	12026	12033	50 %	0 %	0 %	50 %	116326621
37	NC_008506	TTGG	2	8	12086	12093	0 %	50 %	50 %	0 %	116326621
38	NC_008506	TTAC	2	8	12118	12125	25 %	50 %	0 %	25 %	116326621
39	NC_008506	ATTT	2	8	12404	12411	25 %	75 %	0 %	0 %	116326621
40	NC_008506	TGAA	2	8	12435	12442	50 %	25 %	25 %	0 %	116326621
41	NC_008506	TTAC	2	8	12602	12609	25 %	50 %	0 %	25 %	116326621
42	NC_008506	GGAA	2	8	13096	13103	50 %	0 %	50 %	0 %	116326621
43	NC_008506	CAAT	2	8	13151	13158	50 %	25 %	0 %	25 %	116326621
44	NC_008506	AATT	2	8	13518	13525	50 %	50 %	0 %	0 %	116326621
45	NC_008506	TTGT	2	8	13545	13552	0 %	75 %	25 %	0 %	116326621
46	NC_008506	GCAA	2	8	13753	13760	50 %	0 %	25 %	25 %	116326621
47	NC_008506	GTCA	2	8	13792	13799	25 %	25 %	25 %	25 %	116326621
48	NC_008506	TTTA	2	8	14032	14039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008506	AAAT	2	8	14343	14350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008506	TTTG	2	8	14879	14886	0 %	75 %	25 %	0 %	116326622
51	NC_008506	AATC	2	8	15859	15866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008506	TGAT	2	8	15940	15947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008506	ATTC	2	8	15997	16004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008506	AAAT	2	8	16090	16097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008506	AAAG	2	8	16457	16464	75 %	0 %	25 %	0 %	116326623
56	NC_008506	TTAA	2	8	17448	17455	50 %	50 %	0 %	0 %	116326623
57	NC_008506	CTTG	2	8	17913	17920	0 %	50 %	25 %	25 %	116326623
58	NC_008506	GTAG	2	8	17976	17983	25 %	25 %	50 %	0 %	116326623
59	NC_008506	CTGT	2	8	19774	19781	0 %	50 %	25 %	25 %	116326624
60	NC_008506	CTTG	2	8	20100	20107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008506	AAGA	2	8	20372	20379	75 %	0 %	25 %	0 %	116326625
62	NC_008506	TTGA	2	8	21014	21021	25 %	50 %	25 %	0 %	116326625
63	NC_008506	TGTT	2	8	21391	21398	0 %	75 %	25 %	0 %	116326626
64	NC_008506	AAGT	2	8	21419	21426	50 %	25 %	25 %	0 %	116326626
65	NC_008506	TAAG	2	8	21700	21707	50 %	25 %	25 %	0 %	116326626
66	NC_008506	ATAA	2	8	21980	21987	75 %	25 %	0 %	0 %	116326626
67	NC_008506	CGAG	2	8	23108	23115	25 %	0 %	50 %	25 %	116326628
68	NC_008506	AAAT	2	8	23116	23123	75 %	25 %	0 %	0 %	116326628
69	NC_008506	AGTG	2	8	23677	23684	25 %	25 %	50 %	0 %	116326628
70	NC_008506	ATAA	2	8	24203	24210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008506	TTTA	2	8	24297	24304	25 %	75 %	0 %	0 %	116326629
72	NC_008506	GTCA	2	8	24852	24859	25 %	25 %	25 %	25 %	116326629
73	NC_008506	TTTA	2	8	25402	25409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008506	GAAA	2	8	25451	25458	75 %	0 %	25 %	0 %	116326630
75	NC_008506	AAGG	2	8	25483	25490	50 %	0 %	50 %	0 %	116326630
76	NC_008506	AGCT	2	8	25557	25564	25 %	25 %	25 %	25 %	116326630
77	NC_008506	AAAT	2	8	26112	26119	75 %	25 %	0 %	0 %	116326630
78	NC_008506	AGAA	2	8	26603	26610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008506	TTAT	2	8	27048	27055	25 %	75 %	0 %	0 %	116326631
80	NC_008506	AAAT	2	8	27476	27483	75 %	25 %	0 %	0 %	116326631
81	NC_008506	GTAG	2	8	27924	27931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008506	CCCT	2	8	28313	28320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008506	CTTT	2	8	28516	28523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008506	AACA	2	8	29162	29169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008506	GAAA	2	8	29633	29640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008506	TTGA	2	8	30003	30010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008506	AGTA	2	8	30063	30070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008506	TACT	2	8	30202	30209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008506	AGTA	2	8	30474	30481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008506	CTAC	2	8	30705	30712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008506	CAAA	2	8	31039	31046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008506	TTTA	2	8	31222	31229	25 %	75 %	0 %	0 %	116326632
93	NC_008506	AATT	2	8	31321	31328	50 %	50 %	0 %	0 %	116326632
94	NC_008506	TCTT	2	8	31420	31427	0 %	75 %	0 %	25 %	116326632
95	NC_008506	AAAG	2	8	32086	32093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008506	GAAA	2	8	32771	32778	75 %	0 %	25 %	0 %	116326634
97	NC_008506	ACAA	2	8	32891	32898	75 %	0 %	0 %	25 %	116326634
98	NC_008506	CAAA	2	8	32932	32939	75 %	0 %	0 %	25 %	116326634
99	NC_008506	TAAA	2	8	33170	33177	75 %	25 %	0 %	0 %	116326634
100	NC_008506	AAAG	2	8	33466	33473	75 %	0 %	25 %	0 %	116326634
101	NC_008506	AGCA	2	8	33610	33617	50 %	0 %	25 %	25 %	116326634
102	NC_008506	TGAA	2	8	33620	33627	50 %	25 %	25 %	0 %	116326634
103	NC_008506	GCTT	2	8	33749	33756	0 %	50 %	25 %	25 %	116326634
104	NC_008506	CACT	2	8	33780	33787	25 %	25 %	0 %	50 %	116326634
105	NC_008506	AATG	2	8	33844	33851	50 %	25 %	25 %	0 %	116326634
106	NC_008506	GCAA	2	8	33881	33888	50 %	0 %	25 %	25 %	116326634
107	NC_008506	TTTC	2	8	34544	34551	0 %	75 %	0 %	25 %	116326635
108	NC_008506	ATTC	2	8	35179	35186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008506	AAGG	2	8	35306	35313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008506	AGTC	2	8	35339	35346	25 %	25 %	25 %	25 %	116326636
111	NC_008506	TATT	2	8	35549	35556	25 %	75 %	0 %	0 %	116326636
112	NC_008506	CGAG	2	8	35657	35664	25 %	0 %	50 %	25 %	116326636
113	NC_008506	TTTA	2	8	35760	35767	25 %	75 %	0 %	0 %	116326636
114	NC_008506	TGTT	2	8	35901	35908	0 %	75 %	25 %	0 %	116326636
115	NC_008506	ATTC	2	8	36421	36428	25 %	50 %	0 %	25 %	116326636
116	NC_008506	AATT	2	8	36882	36889	50 %	50 %	0 %	0 %	116326636
117	NC_008506	AAGC	2	8	36994	37001	50 %	0 %	25 %	25 %	116326637
118	NC_008506	ACAA	2	8	37130	37137	75 %	0 %	0 %	25 %	116326637
119	NC_008506	TTTC	2	8	37820	37827	0 %	75 %	0 %	25 %	116326638
120	NC_008506	AAAT	2	8	38383	38390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008506	TGAC	2	8	39842	39849	25 %	25 %	25 %	25 %	116326640
122	NC_008506	TAAA	2	8	40397	40404	75 %	25 %	0 %	0 %	116326640
123	NC_008506	TTAT	2	8	40491	40498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008506	TTTA	2	8	40528	40535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008506	ATTT	2	8	40719	40726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008506	AATT	2	8	40766	40773	50 %	50 %	0 %	0 %	116326641
127	NC_008506	ATAG	2	8	41000	41007	50 %	25 %	25 %	0 %	116326641
128	NC_008506	ATAA	2	8	41336	41343	75 %	25 %	0 %	0 %	116326641
129	NC_008506	TGAC	2	8	42075	42082	25 %	25 %	25 %	25 %	116326642
130	NC_008506	TAAA	2	8	42630	42637	75 %	25 %	0 %	0 %	116326642
131	NC_008506	TTAT	2	8	42724	42731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008506	ATGT	2	8	43600	43607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008506	TCAG	2	8	44121	44128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008506	ATTT	2	8	44185	44192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008506	TTTA	2	8	44582	44589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008506	TTAA	2	8	44611	44618	50 %	50 %	0 %	0 %	116326643
137	NC_008506	AATG	2	8	44743	44750	50 %	25 %	25 %	0 %	116326643
138	NC_008506	TCTT	2	8	45310	45317	0 %	75 %	0 %	25 %	116326643
139	NC_008506	CTTT	2	8	45520	45527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008506	ATAA	2	8	46159	46166	75 %	25 %	0 %	0 %	116326644
141	NC_008506	ACCA	2	8	46693	46700	50 %	0 %	0 %	50 %	116326644
142	NC_008506	TGAA	2	8	46834	46841	50 %	25 %	25 %	0 %	116326644

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.